More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6818 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008835  BMA10229_0489  hypothetical protein  64.29 
 
 		 537 aa  705    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.143088  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0771  putative transmembrane dehydrogenase (large subunit) oxidoreductase protein  65.23 
 
 		 539 aa  720    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0952307  normal  0.0474982 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1434  glucose dehydrogenase, alpha subunit  64.29 
 
 		 537 aa  705    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1245  hypothetical protein  64.29 
 
 		 537 aa  705    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.904528  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2589  glucose dehydrogenase  64.29 
 
 		 537 aa  705    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6549  glucose-methanol-choline oxidoreductase  62.99 
 
 		 539 aa  711    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.374556 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1293  glucose-methanol-choline oxidoreductase  62.55 
 
 		 539 aa  687    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.898836  normal  0.776794 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1415  hypothetical protein  64.48 
 
 		 537 aa  702    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1083  hypothetical protein  64.29 
 
 		 537 aa  705    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0832661  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6818  glucose-methanol-choline oxidoreductase  100 
 
 		 533 aa  1107    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.242551 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4442  glucose-methanol-choline oxidoreductase  61.97 
 
 		 539 aa  680    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.795175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1349  glucose dehydrogenase, alpha subunit  64.29 
 
 		 537 aa  705    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0719  glucose-methanol-choline oxidoreductase  64.18 
 
 		 536 aa  717    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.407783 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4094  glucose-methanol-choline oxidoreductase  62.93 
 
 		 539 aa  692    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3815  glucose-methanol-choline oxidoreductase  62.62 
 
 		 539 aa  708    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.583014  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5751  glucose-methanol-choline oxidoreductase  62.62 
 
 		 539 aa  708    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3978  glucose-methanol-choline oxidoreductase  61.97 
 
 		 539 aa  682    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.500166  normal  0.0737697 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0789  glucose-methanol-choline oxidoreductase  63.98 
 
 		 540 aa  712    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.211025  normal  0.372024 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4553  glucose-methanol-choline oxidoreductase  62.62 
 
 		 539 aa  708    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.940882 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0216  hypothetical protein  64.29 
 
 		 537 aa  705    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2086  glucose-methanol-choline oxidoreductase  51.88 
 
 		 538 aa  564  1.0000000000000001e-159  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.879766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4263  glucose-methanol-choline oxidoreductase  50.37 
 
 		 544 aa  556  1e-157  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.157361  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1808  putative dehydrogenase subunit  50.56 
 
 		 551 aa  550  1e-155  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000111783  hitchhiker  0.0000501686 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3801  glucose-methanol-choline oxidoreductase  52.24 
 
 		 545 aa  550  1e-155  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.382943 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1160  putative glucose-methanol-choline oxidoreductase  50.19 
 
 		 552 aa  532  1e-150  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7345  glucose-methanol-choline oxidoreductase  50.09 
 
 		 550 aa  521  1e-146  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.421505  normal  0.897172 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3758  glucose-methanol-choline oxidoreductase  47.69 
 
 		 533 aa  504  1e-141  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5694  glucose-methanol-choline oxidoreductase  47.69 
 
 		 533 aa  503  1e-141  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00839978 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4610  glucose-methanol-choline oxidoreductase  47.69 
 
 		 533 aa  504  1e-141  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0233056 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2333  glucose-methanol-choline oxidoreductase  48.52 
 
 		 534 aa  500  1e-140  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000292297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3988  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.13 
 
 		 752 aa  311  1e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4057  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.49 
 
 		 752 aa  306  7e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.566614  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1661  dehydrogenase subunit, putative  33.76 
 
 		 752 aa  306  8.000000000000001e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.796434 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4186  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34 
 
 		 614 aa  297  3e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00132881 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0165  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.22 
 
 		 531 aa  285  1.0000000000000001e-75  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1871  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.36 
 
 		 545 aa  280  6e-74  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.176173  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1996  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.67 
 
 		 662 aa  277  4e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2343  FAD dependent oxidoreductase  31.52 
 
 		 662 aa  276  8e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.513301  normal  0.220367 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1981  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.36 
 
 		 662 aa  276  9e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2044  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.06 
 
 		 662 aa  272  1e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.854186  normal  0.0386059 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2378  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.39 
 
 		 533 aa  270  4e-71  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2982  putative dehydrogenase protein  32.78 
 
 		 607 aa  263  4e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.244285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3137  dehydrogenase subunit  32.78 
 
 		 607 aa  263  6e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5986  putative dehydrogenase large subunit protein  33.17 
 
 		 623 aa  263  8e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.420299 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2098  putative dehydrogenase large subunit protein  30.51 
 
 		 612 aa  238  3e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2705  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.61 
 
 		 522 aa  204  3e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.815552  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5469  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  32.42 
 
 		 526 aa  202  9.999999999999999e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2930  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.14 
 
 		 527 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0259797  normal  0.914708 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3053  putative oxidoreductase  30.24 
 
 		 528 aa  199  2.0000000000000003e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2658  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.04 
 
 		 553 aa  194  2e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3202  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  31.18 
 
 		 522 aa  193  8e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0960335 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2120  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  30.22 
 
 		 522 aa  189  1e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2534  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  30.22 
 
 		 522 aa  189  1e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0109  hypothetical protein  27.27 
 
 		 573 aa  187  6e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3542  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.33 
 
 		 563 aa  183  8.000000000000001e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1288  putative dehydrogenase  32.43 
 
 		 547 aa  182  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.478643 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4480  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.84 
 
 		 527 aa  182  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.36342 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1914  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.15 
 
 		 553 aa  181  4e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.33952  normal  0.193822 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0418  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.71 
 
 		 573 aa  180  5.999999999999999e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4194  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.19 
 
 		 548 aa  179  1e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0945  putative 2-keto-gluconate dehydrogenase  30.47 
 
 		 522 aa  179  1e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1064  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.23 
 
 		 525 aa  178  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.113781 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1771  GMC oxidoreductase  29.08 
 
 		 539 aa  178  3e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0767108 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2085  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.59 
 
 		 573 aa  177  3e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.024834 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6389  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.68 
 
 		 547 aa  177  4e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2722  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.38 
 
 		 528 aa  177  5e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1641  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.17 
 
 		 522 aa  177  6e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.235132 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0467  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.13 
 
 		 548 aa  176  9e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0060  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.02 
 
 		 523 aa  176  9e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1401  putative 2-keto-gluconate dehydrogenase  28.94 
 
 		 528 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0383061  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4037  hypothetical protein  27.59 
 
 		 549 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.677701 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7243  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30 
 
 		 547 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4606  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.18 
 
 		 582 aa  170  5e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.159853 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6279  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.16 
 
 		 556 aa  170  5e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00998076 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2999  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  27.6 
 
 		 561 aa  170  6e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.634456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1086  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.11 
 
 		 501 aa  170  7e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5509  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.71 
 
 		 556 aa  169  8e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0807117  normal  0.364058 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3683  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.48 
 
 		 556 aa  169  9e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.642564  normal  0.0444916 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0728  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.34 
 
 		 518 aa  168  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.568898  normal  0.0737373 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6565  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.84 
 
 		 526 aa  167  5e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.417903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1801  GMC oxidoreductase family protein  27.48 
 
 		 549 aa  167  5.9999999999999996e-40  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000289048  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5253  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.47 
 
 		 522 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.789001  decreased coverage  0.00462633 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1705  oxidoreductase  28.85 
 
 		 522 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.318945 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3694  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.77 
 
 		 566 aa  166  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.257564  normal  0.232243 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5415  choline dehydrogenase  26.44 
 
 		 565 aa  165  2.0000000000000002e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.188636 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2982  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.24 
 
 		 572 aa  164  3e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1486  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.94 
 
 		 512 aa  162  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0109467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4710  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.79 
 
 		 526 aa  162  2e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.467902  normal  0.0104534 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4949  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.66 
 
 		 574 aa  162  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1382  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.42 
 
 		 512 aa  162  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0139738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0788  GMC oxidoreductase  29.39 
 
 		 563 aa  160  6e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.310504  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1840  GMC oxidoreductase  28.6 
 
 		 534 aa  160  6e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000489986  normal  0.328535 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2494  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.24 
 
 		 572 aa  160  6e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.314394 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3166  putative dehydrogenase transmembrane protein  26.76 
 
 		 506 aa  160  8e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.689634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0665  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.54 
 
 		 534 aa  159  9e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0950  putative glucose dehydrogenase  29.39 
 
 		 563 aa  159  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.263554  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4678  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.08 
 
 		 545 aa  159  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0776  GMC oxidoreductase  29.39 
 
 		 563 aa  159  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1923  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.76 
 
 		 550 aa  158  2e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2072  putative Gluconate 2-dehydrogenase flavoprotein  29.47 
 
 		 523 aa  158  3e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>