More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1871 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2378  glucose-methanol-choline oxidoreductase  67.23 
 
 
533 aa  716    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0165  glucose-methanol-choline oxidoreductase  67.1 
 
 
531 aa  747    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1871  glucose-methanol-choline oxidoreductase  100 
 
 
545 aa  1107    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.176173  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0771  putative transmembrane dehydrogenase (large subunit) oxidoreductase protein  36.01 
 
 
539 aa  296  4e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0952307  normal  0.0474982 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0719  glucose-methanol-choline oxidoreductase  36.5 
 
 
536 aa  296  9e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.407783 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0789  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.61 
 
 
540 aa  292  1e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.211025  normal  0.372024 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5751  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.2 
 
 
539 aa  286  8e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3815  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.2 
 
 
539 aa  286  8e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.583014  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4553  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.2 
 
 
539 aa  286  8e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.940882 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6549  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.28 
 
 
539 aa  280  4e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.374556 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4263  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.63 
 
 
544 aa  276  6e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.157361  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4094  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.26 
 
 
539 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6818  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.21 
 
 
533 aa  271  2e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.242551 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3978  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.51 
 
 
539 aa  268  1e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.500166  normal  0.0737697 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4442  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.13 
 
 
539 aa  266  8e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.795175  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1415  hypothetical protein  34.64 
 
 
537 aa  265  2e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1808  putative dehydrogenase subunit  32.85 
 
 
551 aa  263  4.999999999999999e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000111783  hitchhiker  0.0000501686 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1245  hypothetical protein  34.64 
 
 
537 aa  263  6.999999999999999e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.904528  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2589  glucose dehydrogenase  34.64 
 
 
537 aa  263  6.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1434  glucose dehydrogenase, alpha subunit  34.64 
 
 
537 aa  263  6.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1083  hypothetical protein  34.64 
 
 
537 aa  263  6.999999999999999e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0832661  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1293  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.76 
 
 
539 aa  263  6.999999999999999e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.898836  normal  0.776794 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1349  glucose dehydrogenase, alpha subunit  34.64 
 
 
537 aa  263  6.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0489  hypothetical protein  34.64 
 
 
537 aa  263  6.999999999999999e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.143088  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0216  hypothetical protein  34.64 
 
 
537 aa  263  6.999999999999999e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3801  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.69 
 
 
545 aa  255  1.0000000000000001e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.382943 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7345  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.76 
 
 
550 aa  254  3e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.421505  normal  0.897172 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1160  putative glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.53 
 
 
552 aa  248  2e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2086  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.18 
 
 
538 aa  248  3e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.879766  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2930  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.94 
 
 
527 aa  246  6e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0259797  normal  0.914708 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4037  hypothetical protein  35.71 
 
 
549 aa  242  1e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.677701 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1914  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.35 
 
 
553 aa  236  9e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.33952  normal  0.193822 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3202  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  33.21 
 
 
522 aa  234  4.0000000000000004e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0960335 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3053  putative oxidoreductase  33.27 
 
 
528 aa  232  2e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0945  putative 2-keto-gluconate dehydrogenase  32.24 
 
 
522 aa  228  2e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1641  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.96 
 
 
522 aa  226  6e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.235132 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2120  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  32.6 
 
 
522 aa  226  8e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2534  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  32.6 
 
 
522 aa  226  8e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5509  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.15 
 
 
556 aa  224  3e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0807117  normal  0.364058 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1771  GMC oxidoreductase  35.38 
 
 
539 aa  224  4e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0767108 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2705  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.03 
 
 
522 aa  223  4.9999999999999996e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.815552  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0467  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.2 
 
 
548 aa  223  8e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3683  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.17 
 
 
556 aa  223  9e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.642564  normal  0.0444916 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5694  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.21 
 
 
533 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00839978 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6279  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.33 
 
 
556 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00998076 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1705  oxidoreductase  31.59 
 
 
522 aa  221  3e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.318945 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0060  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.21 
 
 
523 aa  219  1e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3758  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.03 
 
 
533 aa  219  1e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4610  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.03 
 
 
533 aa  219  1e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0233056 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0728  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.38 
 
 
518 aa  218  2e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.568898  normal  0.0737373 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2658  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.45 
 
 
553 aa  218  2e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6565  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.97 
 
 
526 aa  218  2e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.417903  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4710  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.71 
 
 
526 aa  218  2e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.467902  normal  0.0104534 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0665  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.88 
 
 
534 aa  216  7e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0664  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  34.21 
 
 
515 aa  211  2e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.414473  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5253  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.34 
 
 
522 aa  211  2e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.789001  decreased coverage  0.00462633 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2085  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.65 
 
 
573 aa  210  5e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.024834 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5469  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  31.32 
 
 
526 aa  208  2e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4194  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.5 
 
 
548 aa  208  2e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4186  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.41 
 
 
614 aa  207  3e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00132881 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1288  putative dehydrogenase  31.31 
 
 
547 aa  206  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.478643 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2333  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.29 
 
 
534 aa  206  1e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000292297  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0950  putative glucose dehydrogenase  32.29 
 
 
563 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.263554  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0776  GMC oxidoreductase  32.29 
 
 
563 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0788  GMC oxidoreductase  32.29 
 
 
563 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.310504  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0418  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.92 
 
 
573 aa  201  3e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6389  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.98 
 
 
547 aa  201  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2072  putative Gluconate 2-dehydrogenase flavoprotein  30.87 
 
 
523 aa  201  3.9999999999999996e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4480  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.55 
 
 
527 aa  200  5e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.36342 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1661  dehydrogenase subunit, putative  28.34 
 
 
752 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.796434 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7243  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.17 
 
 
547 aa  194  4e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146808  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1923  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.3 
 
 
550 aa  193  7e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3988  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.25 
 
 
752 aa  192  9e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4057  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.18 
 
 
752 aa  193  9e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.566614  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1064  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.35 
 
 
525 aa  192  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.113781 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2790  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  31.68 
 
 
578 aa  191  4e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4678  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.94 
 
 
545 aa  189  9e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2722  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.85 
 
 
528 aa  189  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1401  putative 2-keto-gluconate dehydrogenase  29.64 
 
 
528 aa  189  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0383061  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2179  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  32.75 
 
 
549 aa  186  8e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0819  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28 
 
 
579 aa  184  5.0000000000000004e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.157641  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3542  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.51 
 
 
563 aa  179  8e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0367  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.47 
 
 
565 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0109  hypothetical protein  28.79 
 
 
573 aa  171  2e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2017  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.67 
 
 
581 aa  171  3e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.422222  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0230  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.94 
 
 
579 aa  170  5e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.118413  normal  0.242955 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1854  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.07 
 
 
534 aa  170  5e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.138166  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2999  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  29.03 
 
 
561 aa  170  6e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.634456  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3452  hypothetical protein  31.66 
 
 
480 aa  168  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0700524  normal  0.443587 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3718  hypothetical protein  31.47 
 
 
483 aa  167  5e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1981  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.86 
 
 
662 aa  166  9e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2609  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.83 
 
 
578 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00973308  normal  0.475535 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2343  FAD dependent oxidoreductase  26.86 
 
 
662 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.513301  normal  0.220367 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3248  hypothetical protein  31.1 
 
 
480 aa  164  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.713925  normal  0.212703 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1996  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.86 
 
 
662 aa  164  3e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2044  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.71 
 
 
662 aa  164  3e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.854186  normal  0.0386059 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1371  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.35 
 
 
584 aa  164  5.0000000000000005e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.122275  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1632  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.96 
 
 
560 aa  163  8.000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1858  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.42 
 
 
755 aa  162  1e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.184483  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1738  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.57 
 
 
572 aa  161  2e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0256675  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>