More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0665 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_5253  glucose-methanol-choline oxidoreductase  62.76 
 
 		 522 aa  678    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.789001  decreased coverage  0.00462633 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1641  glucose-methanol-choline oxidoreductase  63.57 
 
 		 522 aa  676    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.235132 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0060  glucose-methanol-choline oxidoreductase  62.38 
 
 		 523 aa  687    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2120  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  62 
 
 		 522 aa  696    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1401  putative 2-keto-gluconate dehydrogenase  60.96 
 
 		 528 aa  670    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0383061  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2534  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  62 
 
 		 522 aa  696    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0945  putative 2-keto-gluconate dehydrogenase  60.89 
 
 		 522 aa  684    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1705  oxidoreductase  62 
 
 		 522 aa  674    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.318945 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0665  glucose-methanol-choline oxidoreductase  100 
 
 		 534 aa  1107    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2722  glucose-methanol-choline oxidoreductase  61.54 
 
 		 528 aa  671    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4710  glucose-methanol-choline oxidoreductase  60.84 
 
 		 526 aa  648    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.467902  normal  0.0104534 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2705  glucose-methanol-choline oxidoreductase  62 
 
 		 522 aa  699    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.815552  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3202  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  63.11 
 
 		 522 aa  688    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0960335 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4480  glucose-methanol-choline oxidoreductase  61.73 
 
 		 527 aa  682    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.36342 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2072  putative Gluconate 2-dehydrogenase flavoprotein  64.04 
 
 		 523 aa  662    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2930  glucose-methanol-choline oxidoreductase  53.63 
 
 		 527 aa  584  1.0000000000000001e-165  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0259797  normal  0.914708 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3053  putative oxidoreductase  53.71 
 
 		 528 aa  569  1e-161  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0728  glucose-methanol-choline oxidoreductase  47.51 
 
 		 518 aa  470  1.0000000000000001e-131  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.568898  normal  0.0737373 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1914  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.53 
 
 		 553 aa  266  7e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.33952  normal  0.193822 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3683  glucose-methanol-choline oxidoreductase  36.06 
 
 		 556 aa  266  8e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.642564  normal  0.0444916 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2658  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.03 
 
 		 553 aa  263  6e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1923  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.08 
 
 		 550 aa  254  4.0000000000000004e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1288  putative dehydrogenase  36.23 
 
 		 547 aa  236  9e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.478643 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6389  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.63 
 
 		 547 aa  233  5e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7243  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.71 
 
 		 547 aa  230  4e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5469  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  30.71 
 
 		 526 aa  226  1e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4194  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.71 
 
 		 548 aa  223  4.9999999999999996e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0418  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.2 
 
 		 573 aa  218  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2085  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.86 
 
 		 573 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.024834 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0467  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.46 
 
 		 548 aa  214  2.9999999999999995e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0950  putative glucose dehydrogenase  35.13 
 
 		 563 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.263554  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0776  GMC oxidoreductase  35.13 
 
 		 563 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0664  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  32.3 
 
 		 515 aa  213  7.999999999999999e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.414473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0788  GMC oxidoreductase  35.13 
 
 		 563 aa  213  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.310504  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1871  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.02 
 
 		 545 aa  211  2e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.176173  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6279  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.15 
 
 		 556 aa  211  4e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00998076 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5509  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.96 
 
 		 556 aa  208  2e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0807117  normal  0.364058 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6565  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.27 
 
 		 526 aa  206  7e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.417903  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0165  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.14 
 
 		 531 aa  191  2.9999999999999997e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2378  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.32 
 
 		 533 aa  189  1e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1858  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.9 
 
 		 755 aa  187  3e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.184483  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2179  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  29.66 
 
 		 549 aa  185  2.0000000000000003e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1808  putative dehydrogenase subunit  27.49 
 
 		 551 aa  176  9.999999999999999e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000111783  hitchhiker  0.0000501686 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4037  hypothetical protein  27.86 
 
 		 549 aa  173  5.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.677701 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0109  hypothetical protein  27.53 
 
 		 573 aa  171  3e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3542  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.74 
 
 		 563 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3801  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.34 
 
 		 545 aa  167  4e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.382943 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2086  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.47 
 
 		 538 aa  164  5.0000000000000005e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.879766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2982  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.62 
 
 		 572 aa  162  1e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2790  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  28.97 
 
 		 578 aa  161  3e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2474  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.99 
 
 		 566 aa  161  3e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.826754 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4678  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.31 
 
 		 545 aa  159  8e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0789  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.39 
 
 		 540 aa  159  9e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.211025  normal  0.372024 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0367  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.56 
 
 		 565 aa  158  2e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2999  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  26.94 
 
 		 561 aa  158  3e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.634456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5416  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.81 
 
 		 565 aa  157  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.133389 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0719  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.89 
 
 		 536 aa  157  4e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.407783 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2333  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.6 
 
 		 534 aa  157  6e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000292297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1738  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.27 
 
 		 572 aa  156  7e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0256675  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5694  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.52 
 
 		 533 aa  155  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00839978 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3758  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.52 
 
 		 533 aa  155  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4610  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.52 
 
 		 533 aa  155  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0233056 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6549  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.15 
 
 		 539 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.374556 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3164  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.87 
 
 		 563 aa  154  2.9999999999999998e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.115784  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3694  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.5 
 
 		 566 aa  154  4e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.257564  normal  0.232243 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1737  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.66 
 
 		 573 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.170374  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0771  putative transmembrane dehydrogenase (large subunit) oxidoreductase protein  27.87 
 
 		 539 aa  152  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0952307  normal  0.0474982 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4263  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.54 
 
 		 544 aa  151  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.157361  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0819  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.42 
 
 		 579 aa  151  4e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.157641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6563  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.82 
 
 		 569 aa  150  5e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0955213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1042  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.35 
 
 		 561 aa  150  5e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.535763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5751  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.79 
 
 		 539 aa  150  6e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3815  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.79 
 
 		 539 aa  150  6e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.583014  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4553  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.79 
 
 		 539 aa  150  6e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.940882 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00434  oxidoreductase  26.96 
 
 		 561 aa  149  2.0000000000000003e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4949  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.4 
 
 		 574 aa  147  4.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5415  choline dehydrogenase  25.81 
 
 		 565 aa  147  5e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.188636 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3645  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.66 
 
 		 567 aa  147  5e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.948951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6818  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.57 
 
 		 533 aa  145  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.242551 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5724  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.38 
 
 		 573 aa  144  3e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.526246 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4095  putative gluconate dehydrogenase  26.34 
 
 		 594 aa  144  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5806  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.59 
 
 		 570 aa  144  5e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.10388  normal  0.882961 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6210  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  27.16 
 
 		 594 aa  143  6e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.1943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1293  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.85 
 
 		 539 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.898836  normal  0.776794 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0464  oxidoreductase, putative  26.42 
 
 		 573 aa  142  1.9999999999999998e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4606  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.24 
 
 		 582 aa  142  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.159853 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0439  oxidoreductase, putative  26.42 
 
 		 573 aa  142  1.9999999999999998e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.483432  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3360  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.15 
 
 		 545 aa  140  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0587927 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2503  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.32 
 
 		 591 aa  140  6e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.809457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2975  gluconate dehydrogenase  28.25 
 
 		 591 aa  140  7.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.299078  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35290  gluconate dehydrogenase  28.25 
 
 		 591 aa  140  7.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0685157  normal  0.495861 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1801  GMC oxidoreductase family protein  24.86 
 
 		 549 aa  140  7.999999999999999e-32  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000289048  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4442  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.5 
 
 		 539 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.795175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1160  putative glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.43 
 
 		 552 aa  139  1e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1415  hypothetical protein  27.22 
 
 		 537 aa  139  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5079  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.99 
 
 		 569 aa  139  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.623805 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4690  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.6 
 
 		 570 aa  139  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.02417 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2686  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.96 
 
 		 561 aa  139  2e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.50945  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2017  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.03 
 
 		 581 aa  138  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.422222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5620  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.46 
 
 		 579 aa  139  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>