More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1858 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_1858  glucose-methanol-choline oxidoreductase  100 
 
 
755 aa  1540    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.184483  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6210  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  30.22 
 
 
594 aa  226  1e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.1943  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2503  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.07 
 
 
591 aa  223  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.809457  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2658  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.14 
 
 
553 aa  221  3e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1314  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  31.03 
 
 
589 aa  221  3e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4095  putative gluconate dehydrogenase  30.05 
 
 
594 aa  221  3.9999999999999997e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2015  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  30.64 
 
 
592 aa  221  3.9999999999999997e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0874518 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0439  oxidoreductase, putative  29.58 
 
 
573 aa  218  2.9999999999999998e-55  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.483432  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3542  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.28 
 
 
563 aa  218  5e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0464  oxidoreductase, putative  29.58 
 
 
573 aa  217  5.9999999999999996e-55  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33650  dehydrogenase flavoprotein subunit  29.48 
 
 
596 aa  214  4.9999999999999996e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3383  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  28.74 
 
 
594 aa  212  2e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.597308 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3646  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.41 
 
 
592 aa  211  5e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4381  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  28.75 
 
 
592 aa  211  5e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2179  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  32.41 
 
 
549 aa  211  6e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4120  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  29.41 
 
 
592 aa  210  6e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4244  putative gluconate dehydrogenase  30.3 
 
 
588 aa  210  9e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.659751  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2562  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  28.4 
 
 
594 aa  209  1e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0936094 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2376  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  28.57 
 
 
594 aa  209  1e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.406153  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2565  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  29.12 
 
 
594 aa  209  2e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.339235  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2975  gluconate dehydrogenase  29.64 
 
 
591 aa  209  2e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.299078  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35290  gluconate dehydrogenase  29.64 
 
 
591 aa  209  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0685157  normal  0.495861 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0085  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.82 
 
 
594 aa  208  3e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4202  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  30.52 
 
 
590 aa  207  5e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.494803  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2999  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  28.47 
 
 
561 aa  207  5e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.634456  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1793  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.41 
 
 
592 aa  207  6e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.345818  normal  0.124135 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00900  gluconate dehydrogenase flavoprotein subunit  29.21 
 
 
591 aa  205  2e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.687718  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2930  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.91 
 
 
527 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0259797  normal  0.914708 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2137  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  27.24 
 
 
593 aa  203  9.999999999999999e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.610724 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4142  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.7 
 
 
592 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00267636  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3293  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  28.7 
 
 
592 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.517523  normal  0.855973 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4224  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.7 
 
 
592 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.477307  normal  0.178232 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0227  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  28.99 
 
 
592 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4639  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  28.22 
 
 
592 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2982  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.83 
 
 
572 aa  190  8e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1923  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.96 
 
 
550 aa  189  2e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0665  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.9 
 
 
534 aa  187  5e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0945  putative 2-keto-gluconate dehydrogenase  27.45 
 
 
522 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0230  putative dehydrogenase  28.25 
 
 
591 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3053  putative oxidoreductase  28.44 
 
 
528 aa  184  5.0000000000000004e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1641  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.03 
 
 
522 aa  183  1e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.235132 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3202  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  28.37 
 
 
522 aa  181  4e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0960335 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3895  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  27.36 
 
 
594 aa  181  7e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.241761 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0109  hypothetical protein  26.66 
 
 
573 aa  180  9e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3608  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  27.8 
 
 
589 aa  179  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0579552  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2534  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  27.83 
 
 
522 aa  178  4e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2120  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  27.83 
 
 
522 aa  178  4e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4480  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.58 
 
 
527 aa  177  5e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.36342 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1164  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  26.59 
 
 
594 aa  174  5.999999999999999e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2705  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.26 
 
 
522 aa  173  1e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.815552  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2722  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.78 
 
 
528 aa  172  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5399  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  25.22 
 
 
586 aa  172  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.690827  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0728  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.45 
 
 
518 aa  172  3e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.568898  normal  0.0737373 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1705  oxidoreductase  27.75 
 
 
522 aa  171  6e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.318945 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2072  putative Gluconate 2-dehydrogenase flavoprotein  28.62 
 
 
523 aa  169  2e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1914  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.72 
 
 
553 aa  168  4e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.33952  normal  0.193822 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5253  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.19 
 
 
522 aa  163  1e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.789001  decreased coverage  0.00462633 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4710  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.43 
 
 
526 aa  163  1e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.467902  normal  0.0104534 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4678  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.03 
 
 
545 aa  162  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1401  putative 2-keto-gluconate dehydrogenase  26.26 
 
 
528 aa  162  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0383061  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0060  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.06 
 
 
523 aa  156  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4194  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.04 
 
 
548 aa  156  1e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5509  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.11 
 
 
556 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0807117  normal  0.364058 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0467  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.45 
 
 
548 aa  154  5e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6279  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.11 
 
 
556 aa  154  8e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00998076 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1871  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.2 
 
 
545 aa  153  1e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.176173  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2378  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.42 
 
 
533 aa  151  4e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7243  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.75 
 
 
547 aa  151  5e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146808  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6389  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.49 
 
 
547 aa  150  6e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5694  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.15 
 
 
533 aa  150  7e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00839978 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6565  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.93 
 
 
526 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.417903  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5469  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  26.69 
 
 
526 aa  149  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1598  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.74 
 
 
586 aa  149  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.26779 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1064  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.88 
 
 
525 aa  148  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.113781 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3683  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.12 
 
 
556 aa  147  5e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.642564  normal  0.0444916 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3758  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.98 
 
 
533 aa  147  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4610  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.98 
 
 
533 aa  147  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0233056 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0418  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.19 
 
 
573 aa  145  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1288  putative dehydrogenase  28.8 
 
 
547 aa  145  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.478643 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0950  putative glucose dehydrogenase  29.18 
 
 
563 aa  144  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.263554  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0776  GMC oxidoreductase  29.18 
 
 
563 aa  144  4e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0788  GMC oxidoreductase  29.18 
 
 
563 aa  144  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.310504  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3694  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.96 
 
 
566 aa  143  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.257564  normal  0.232243 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1808  putative dehydrogenase subunit  27.26 
 
 
551 aa  141  3.9999999999999997e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000111783  hitchhiker  0.0000501686 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2790  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  26.57 
 
 
578 aa  141  4.999999999999999e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3371  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.42 
 
 
698 aa  141  4.999999999999999e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.261547  normal  0.556381 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3360  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.53 
 
 
545 aa  141  6e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0587927 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0165  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.76 
 
 
531 aa  140  1e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3645  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.68 
 
 
567 aa  137  9e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.948951  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4263  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.33 
 
 
544 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.157361  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4606  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.38 
 
 
582 aa  135  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.159853 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4037  hypothetical protein  27.5 
 
 
549 aa  133  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.677701 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1208  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.44 
 
 
559 aa  132  2.0000000000000002e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.397312  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6563  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.58 
 
 
569 aa  132  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0955213  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1738  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.77 
 
 
572 aa  131  4.0000000000000003e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0256675  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2085  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.8 
 
 
573 aa  131  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.024834 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2017  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.23 
 
 
581 aa  131  4.0000000000000003e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.422222  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1632  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.5 
 
 
560 aa  131  5.0000000000000004e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1967  hypothetical protein  26.55 
 
 
558 aa  130  7.000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.929106  hitchhiker  0.0000146847 
 
 
-
 
NC_003296  RS01675  putative dehydrogenase oxidoreductase protein  24.92 
 
 
647 aa  130  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.871194 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>