253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0230 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0230  putative dehydrogenase  100 
 
 
591 aa  1217    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2015  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  47.8 
 
 
592 aa  585  1.0000000000000001e-165  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0874518 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4095  putative gluconate dehydrogenase  49.16 
 
 
594 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6210  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  49.07 
 
 
594 aa  575  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.1943  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1314  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  47.95 
 
 
589 aa  561  1e-158  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4244  putative gluconate dehydrogenase  47.45 
 
 
588 aa  549  1e-155  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.659751  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2503  glucose-methanol-choline oxidoreductase  46.89 
 
 
591 aa  548  1e-155  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.809457  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5399  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  46.4 
 
 
586 aa  546  1e-154  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.690827  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3608  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  44.41 
 
 
589 aa  544  1e-153  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0579552  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3895  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  46.26 
 
 
594 aa  530  1e-149  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.241761 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0227  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  45.61 
 
 
592 aa  530  1e-149  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1598  glucose-methanol-choline oxidoreductase  43.88 
 
 
586 aa  517  1.0000000000000001e-145  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.26779 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2137  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  43.65 
 
 
593 aa  515  1e-144  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.610724 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00900  gluconate dehydrogenase flavoprotein subunit  44.46 
 
 
591 aa  507  9.999999999999999e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.687718  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3383  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  43.95 
 
 
594 aa  505  1e-141  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.597308 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2376  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  43.78 
 
 
594 aa  503  1e-141  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.406153  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4639  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  42.57 
 
 
592 aa  505  1e-141  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0085  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42.98 
 
 
594 aa  499  1e-140  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2975  gluconate dehydrogenase  44.2 
 
 
591 aa  499  1e-140  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.299078  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35290  gluconate dehydrogenase  44.2 
 
 
591 aa  499  1e-140  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0685157  normal  0.495861 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2565  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  43.46 
 
 
594 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.339235  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0439  oxidoreductase, putative  43.64 
 
 
573 aa  491  1e-137  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.483432  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4381  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  42.28 
 
 
592 aa  490  1e-137  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0464  oxidoreductase, putative  43.3 
 
 
573 aa  488  1e-136  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2562  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  43.44 
 
 
594 aa  488  1e-136  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0936094 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4120  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  42.61 
 
 
592 aa  488  1e-136  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1793  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42.61 
 
 
592 aa  487  1e-136  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.345818  normal  0.124135 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3646  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42.61 
 
 
592 aa  488  1e-136  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3293  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  42.28 
 
 
592 aa  484  1e-135  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.517523  normal  0.855973 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4142  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42.28 
 
 
592 aa  484  1e-135  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00267636  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4224  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42.28 
 
 
592 aa  484  1e-135  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.477307  normal  0.178232 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4202  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  43.78 
 
 
590 aa  476  1e-133  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.494803  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33650  dehydrogenase flavoprotein subunit  42.86 
 
 
596 aa  468  9.999999999999999e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1164  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  41.21 
 
 
594 aa  462  1e-129  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2658  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.67 
 
 
553 aa  268  2.9999999999999995e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1923  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.11 
 
 
550 aa  190  5.999999999999999e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1858  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.25 
 
 
755 aa  184  3e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.184483  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0945  putative 2-keto-gluconate dehydrogenase  30.24 
 
 
522 aa  175  2.9999999999999996e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2179  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  27.88 
 
 
549 aa  168  2.9999999999999998e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1738  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.14 
 
 
572 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0256675  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3202  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  29.48 
 
 
522 aa  164  5.0000000000000005e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0960335 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1737  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.65 
 
 
573 aa  163  8.000000000000001e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.170374  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2930  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.11 
 
 
527 aa  162  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0259797  normal  0.914708 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2534  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  28.85 
 
 
522 aa  160  5e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2120  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  28.85 
 
 
522 aa  160  5e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3053  putative oxidoreductase  28.27 
 
 
528 aa  157  5.0000000000000005e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4710  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.09 
 
 
526 aa  157  5.0000000000000005e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.467902  normal  0.0104534 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2705  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.87 
 
 
522 aa  157  7e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.815552  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5469  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  29.93 
 
 
526 aa  156  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0109  hypothetical protein  25.62 
 
 
573 aa  155  2e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1705  oxidoreductase  29.42 
 
 
522 aa  154  4e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.318945 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1891  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.83 
 
 
570 aa  153  7e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.969458 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2072  putative Gluconate 2-dehydrogenase flavoprotein  28.8 
 
 
523 aa  152  2e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5416  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.53 
 
 
565 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.133389 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1641  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.75 
 
 
522 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.235132 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5253  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.2 
 
 
522 aa  147  6e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.789001  decreased coverage  0.00462633 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1042  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.16 
 
 
561 aa  145  2e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.535763  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4714  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.55 
 
 
570 aa  140  4.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.688275  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5620  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.46 
 
 
579 aa  140  4.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2686  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.16 
 
 
561 aa  140  7.999999999999999e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.50945  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5415  choline dehydrogenase  25.58 
 
 
565 aa  139  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.188636 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0060  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.52 
 
 
523 aa  138  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2999  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  24.21 
 
 
561 aa  139  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.634456  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3645  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.88 
 
 
567 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.948951  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2474  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.17 
 
 
566 aa  138  4e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.826754 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4480  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.37 
 
 
527 aa  137  5e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.36342 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0664  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  28.4 
 
 
515 aa  137  5e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.414473  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1914  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.17 
 
 
553 aa  136  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.33952  normal  0.193822 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3164  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.43 
 
 
563 aa  135  1.9999999999999998e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.115784  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5079  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.47 
 
 
569 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.623805 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2982  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.49 
 
 
572 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2494  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.42 
 
 
572 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.314394 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3542  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.29 
 
 
563 aa  134  5e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1033  putative oxidoreductase chain  25.21 
 
 
574 aa  134  5e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0731446  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0819  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.8 
 
 
579 aa  134  6e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.157641  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2017  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.77 
 
 
581 aa  133  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.422222  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5806  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.46 
 
 
570 aa  133  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.10388  normal  0.882961 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2722  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.65 
 
 
528 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0330  oxidoreductase  26.04 
 
 
570 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0122567 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1401  putative 2-keto-gluconate dehydrogenase  27.85 
 
 
528 aa  131  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0383061  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0728  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.16 
 
 
518 aa  130  6e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.568898  normal  0.0737373 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3694  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.87 
 
 
566 aa  130  6e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.257564  normal  0.232243 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5724  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.6 
 
 
573 aa  130  7.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.526246 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00434  oxidoreductase  25.33 
 
 
561 aa  129  1.0000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1025  choline dehydrogenase  25.75 
 
 
573 aa  129  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6279  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.44 
 
 
556 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00998076 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4606  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.36 
 
 
582 aa  129  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.159853 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0788  GMC oxidoreductase  29.37 
 
 
563 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.310504  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0950  putative glucose dehydrogenase  29.44 
 
 
563 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.263554  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0776  GMC oxidoreductase  29.44 
 
 
563 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5509  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.44 
 
 
556 aa  128  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0807117  normal  0.364058 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1967  hypothetical protein  23.01 
 
 
558 aa  127  5e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.929106  hitchhiker  0.0000146847 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6565  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.78 
 
 
526 aa  126  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.417903  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1871  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.42 
 
 
545 aa  125  2e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.176173  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1208  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.18 
 
 
559 aa  125  2e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.397312  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4037  hypothetical protein  27.36 
 
 
549 aa  125  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.677701 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1894  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.88 
 
 
562 aa  124  4e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.474294  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3371  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.06 
 
 
698 aa  124  4e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.261547  normal  0.556381 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1288  putative dehydrogenase  28.32 
 
 
547 aa  124  5e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.478643 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4678  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.23 
 
 
545 aa  124  6e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>