More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_0950 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6389  glucose-methanol-choline oxidoreductase  80.93 
 
 
547 aa  882    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7243  glucose-methanol-choline oxidoreductase  80.92 
 
 
547 aa  880    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146808  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0950  putative glucose dehydrogenase  100 
 
 
563 aa  1146    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.263554  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0467  glucose-methanol-choline oxidoreductase  76.89 
 
 
548 aa  834    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0776  GMC oxidoreductase  100 
 
 
563 aa  1146    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5509  glucose-methanol-choline oxidoreductase  83.72 
 
 
556 aa  930    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0807117  normal  0.364058 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0788  GMC oxidoreductase  99.82 
 
 
563 aa  1144    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.310504  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0418  glucose-methanol-choline oxidoreductase  75.49 
 
 
573 aa  837    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1288  putative dehydrogenase  81.1 
 
 
547 aa  879    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.478643 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4194  glucose-methanol-choline oxidoreductase  75.86 
 
 
548 aa  827    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2085  glucose-methanol-choline oxidoreductase  76.21 
 
 
573 aa  832    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.024834 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6279  glucose-methanol-choline oxidoreductase  83.51 
 
 
556 aa  924    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00998076 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6565  glucose-methanol-choline oxidoreductase  85.01 
 
 
526 aa  891    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.417903  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1914  glucose-methanol-choline oxidoreductase  44.49 
 
 
553 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.33952  normal  0.193822 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3683  glucose-methanol-choline oxidoreductase  45.42 
 
 
556 aa  397  1e-109  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.642564  normal  0.0444916 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5469  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  43.7 
 
 
526 aa  397  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0664  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  44.55 
 
 
515 aa  368  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.414473  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2930  glucose-methanol-choline oxidoreductase  36.8 
 
 
527 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0259797  normal  0.914708 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2705  glucose-methanol-choline oxidoreductase  38.45 
 
 
522 aa  266  8e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.815552  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4480  glucose-methanol-choline oxidoreductase  36.79 
 
 
527 aa  260  6e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.36342 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3053  putative oxidoreductase  37.52 
 
 
528 aa  255  1.0000000000000001e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1401  putative 2-keto-gluconate dehydrogenase  35.89 
 
 
528 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0383061  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4710  glucose-methanol-choline oxidoreductase  38.33 
 
 
526 aa  251  3e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.467902  normal  0.0104534 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2722  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.37 
 
 
528 aa  250  4e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0728  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.44 
 
 
518 aa  249  7e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.568898  normal  0.0737373 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0945  putative 2-keto-gluconate dehydrogenase  35.7 
 
 
522 aa  246  6.999999999999999e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1705  oxidoreductase  36.79 
 
 
522 aa  243  6e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.318945 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2072  putative Gluconate 2-dehydrogenase flavoprotein  37.48 
 
 
523 aa  237  4e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0060  glucose-methanol-choline oxidoreductase  36.51 
 
 
523 aa  236  6e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3202  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  36.24 
 
 
522 aa  236  8e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0960335 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0665  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.1 
 
 
534 aa  231  3e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2120  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  35.51 
 
 
522 aa  231  3e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2534  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  35.51 
 
 
522 aa  231  3e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5253  glucose-methanol-choline oxidoreductase  36.58 
 
 
522 aa  229  7e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.789001  decreased coverage  0.00462633 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1641  glucose-methanol-choline oxidoreductase  37.16 
 
 
522 aa  227  4e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.235132 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1923  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.14 
 
 
550 aa  219  7e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4678  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.03 
 
 
545 aa  219  1e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0165  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.8 
 
 
531 aa  216  5.9999999999999996e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2658  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.03 
 
 
553 aa  214  1.9999999999999998e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2378  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.57 
 
 
533 aa  213  4.9999999999999996e-54  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1064  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.93 
 
 
525 aa  209  8e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.113781 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4037  hypothetical protein  32.12 
 
 
549 aa  207  5e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.677701 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1871  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.35 
 
 
545 aa  204  3e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.176173  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3815  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.78 
 
 
539 aa  184  3e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.583014  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4553  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.78 
 
 
539 aa  184  3e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.940882 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5751  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.78 
 
 
539 aa  184  3e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0109  hypothetical protein  30.65 
 
 
573 aa  184  4.0000000000000006e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6549  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.4 
 
 
539 aa  180  7e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.374556 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0719  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.24 
 
 
536 aa  179  1e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.407783 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3542  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.29 
 
 
563 aa  177  5e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4263  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.12 
 
 
544 aa  176  9e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.157361  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0789  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.41 
 
 
540 aa  176  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.211025  normal  0.372024 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4442  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.07 
 
 
539 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.795175  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2999  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  28.8 
 
 
561 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.634456  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2982  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.07 
 
 
572 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0771  putative transmembrane dehydrogenase (large subunit) oxidoreductase protein  29.91 
 
 
539 aa  172  1e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0952307  normal  0.0474982 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3978  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.85 
 
 
539 aa  172  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.500166  normal  0.0737697 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2086  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.42 
 
 
538 aa  171  4e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.879766  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3758  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.02 
 
 
533 aa  167  4e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4610  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.02 
 
 
533 aa  167  4e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0233056 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1293  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.11 
 
 
539 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.898836  normal  0.776794 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2179  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  31.21 
 
 
549 aa  164  3e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5694  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.84 
 
 
533 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00839978 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1801  GMC oxidoreductase family protein  29.48 
 
 
549 aa  163  6e-39  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000289048  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4094  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.02 
 
 
539 aa  163  9e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3801  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.11 
 
 
545 aa  162  1e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.382943 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6818  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.31 
 
 
533 aa  158  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.242551 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1415  hypothetical protein  28.35 
 
 
537 aa  158  3e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3360  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.26 
 
 
545 aa  158  3e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0587927 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3164  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.09 
 
 
563 aa  158  3e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.115784  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1808  putative dehydrogenase subunit  28.36 
 
 
551 aa  157  5.0000000000000005e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000111783  hitchhiker  0.0000501686 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1858  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.18 
 
 
755 aa  157  7e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.184483  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2333  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.89 
 
 
534 aa  154  2.9999999999999998e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000292297  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2589  glucose dehydrogenase  28.68 
 
 
537 aa  154  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1349  glucose dehydrogenase, alpha subunit  28.68 
 
 
537 aa  154  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1434  glucose dehydrogenase, alpha subunit  28.68 
 
 
537 aa  154  4e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2015  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  27.5 
 
 
592 aa  153  7e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0874518 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1245  hypothetical protein  29.07 
 
 
537 aa  153  8.999999999999999e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.904528  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0489  hypothetical protein  29.07 
 
 
537 aa  153  8.999999999999999e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.143088  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1083  hypothetical protein  29.07 
 
 
537 aa  153  8.999999999999999e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0832661  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0216  hypothetical protein  29.07 
 
 
537 aa  153  8.999999999999999e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7345  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.13 
 
 
550 aa  150  6e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.421505  normal  0.897172 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3645  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.07 
 
 
567 aa  150  9e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.948951  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1160  putative glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.19 
 
 
552 aa  148  2.0000000000000003e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2017  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.49 
 
 
581 aa  148  3e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.422222  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1840  GMC oxidoreductase  28.6 
 
 
534 aa  147  5e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000489986  normal  0.328535 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2790  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  29.28 
 
 
578 aa  147  7.0000000000000006e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1738  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.6 
 
 
572 aa  145  2e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0256675  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2474  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.99 
 
 
566 aa  144  4e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.826754 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1086  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.73 
 
 
501 aa  143  7e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0367  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.19 
 
 
565 aa  143  8e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0230  putative dehydrogenase  29.44 
 
 
591 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1363  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.61 
 
 
511 aa  140  6e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1967  hypothetical protein  25.64 
 
 
558 aa  139  1e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.929106  hitchhiker  0.0000146847 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0439  oxidoreductase, putative  27.34 
 
 
573 aa  139  1e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.483432  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1520  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.71 
 
 
534 aa  139  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1737  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.39 
 
 
573 aa  138  2e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.170374  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6309  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.71 
 
 
534 aa  139  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.448971  normal  0.597714 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0464  oxidoreductase, putative  27.16 
 
 
573 aa  138  3.0000000000000003e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6104  dehydrogenase  29.82 
 
 
521 aa  138  3.0000000000000003e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>