283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1808 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_1808  putative dehydrogenase subunit  100 
 
 		 551 aa  1151    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000111783  hitchhiker  0.0000501686 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7345  glucose-methanol-choline oxidoreductase  80.47 
 
 		 550 aa  918    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.421505  normal  0.897172 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1160  putative glucose-methanol-choline oxidoreductase  72.03 
 
 		 552 aa  832    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6818  glucose-methanol-choline oxidoreductase  50.56 
 
 		 533 aa  528  1e-148  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.242551 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6549  glucose-methanol-choline oxidoreductase  46.47 
 
 		 539 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.374556 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3815  glucose-methanol-choline oxidoreductase  46.28 
 
 		 539 aa  489  1e-137  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.583014  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5751  glucose-methanol-choline oxidoreductase  46.28 
 
 		 539 aa  489  1e-137  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4553  glucose-methanol-choline oxidoreductase  46.28 
 
 		 539 aa  489  1e-137  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.940882 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4263  glucose-methanol-choline oxidoreductase  45.76 
 
 		 544 aa  483  1e-135  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.157361  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0771  putative transmembrane dehydrogenase (large subunit) oxidoreductase protein  45.62 
 
 		 539 aa  479  1e-134  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0952307  normal  0.0474982 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0789  glucose-methanol-choline oxidoreductase  45.25 
 
 		 540 aa  479  1e-134  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.211025  normal  0.372024 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1415  hypothetical protein  46.2 
 
 		 537 aa  475  1e-133  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0719  glucose-methanol-choline oxidoreductase  44.88 
 
 		 536 aa  475  1e-133  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.407783 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4094  glucose-methanol-choline oxidoreductase  45.9 
 
 		 539 aa  475  1e-133  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4442  glucose-methanol-choline oxidoreductase  45.71 
 
 		 539 aa  473  1e-132  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.795175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3801  glucose-methanol-choline oxidoreductase  44.69 
 
 		 545 aa  473  1e-132  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.382943 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3978  glucose-methanol-choline oxidoreductase  45.71 
 
 		 539 aa  473  1e-132  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.500166  normal  0.0737697 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1245  hypothetical protein  46.01 
 
 		 537 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.904528  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2589  glucose dehydrogenase  46.01 
 
 		 537 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1293  glucose-methanol-choline oxidoreductase  45.71 
 
 		 539 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.898836  normal  0.776794 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1349  glucose dehydrogenase, alpha subunit  46.01 
 
 		 537 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0216  hypothetical protein  46.01 
 
 		 537 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1083  hypothetical protein  46.01 
 
 		 537 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0832661  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2086  glucose-methanol-choline oxidoreductase  44.63 
 
 		 538 aa  469  1.0000000000000001e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.879766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0489  hypothetical protein  46.01 
 
 		 537 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.143088  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1434  glucose dehydrogenase, alpha subunit  46.01 
 
 		 537 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3758  glucose-methanol-choline oxidoreductase  45.12 
 
 		 533 aa  444  1e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4610  glucose-methanol-choline oxidoreductase  45.12 
 
 		 533 aa  444  1e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0233056 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5694  glucose-methanol-choline oxidoreductase  45.12 
 
 		 533 aa  444  1e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00839978 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2333  glucose-methanol-choline oxidoreductase  44.12 
 
 		 534 aa  433  1e-120  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000292297  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0165  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.48 
 
 		 531 aa  261  3e-68  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1871  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.85 
 
 		 545 aa  256  6e-67  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.176173  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4186  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.76 
 
 		 614 aa  255  2.0000000000000002e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00132881 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1996  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.48 
 
 		 662 aa  248  3e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2044  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.33 
 
 		 662 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.854186  normal  0.0386059 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2343  FAD dependent oxidoreductase  31.47 
 
 		 662 aa  245  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.513301  normal  0.220367 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1981  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.41 
 
 		 662 aa  245  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2378  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.83 
 
 		 533 aa  243  7.999999999999999e-63  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3988  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.63 
 
 		 752 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1661  dehydrogenase subunit, putative  31.18 
 
 		 752 aa  239  6.999999999999999e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.796434 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4057  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.12 
 
 		 752 aa  239  6.999999999999999e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.566614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2982  putative dehydrogenase protein  29.28 
 
 		 607 aa  219  7e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.244285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3137  dehydrogenase subunit  29.76 
 
 		 607 aa  219  7.999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2098  putative dehydrogenase large subunit protein  30.62 
 
 		 612 aa  215  1.9999999999999998e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5986  putative dehydrogenase large subunit protein  30.24 
 
 		 623 aa  214  3.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.420299 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1914  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.69 
 
 		 553 aa  194  5e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.33952  normal  0.193822 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2120  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  28.52 
 
 		 522 aa  191  4e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2534  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  28.52 
 
 		 522 aa  191  4e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0945  putative 2-keto-gluconate dehydrogenase  28.93 
 
 		 522 aa  187  4e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4480  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.93 
 
 		 527 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.36342 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2705  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.75 
 
 		 522 aa  184  4.0000000000000006e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.815552  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4037  hypothetical protein  30.35 
 
 		 549 aa  183  7e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.677701 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2930  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29 
 
 		 527 aa  182  1e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0259797  normal  0.914708 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0665  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.49 
 
 		 534 aa  176  9.999999999999999e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0109  hypothetical protein  27.57 
 
 		 573 aa  176  9.999999999999999e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3053  putative oxidoreductase  28.94 
 
 		 528 aa  172  1e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0060  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.26 
 
 		 523 aa  171  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3164  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.23 
 
 		 563 aa  171  4e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.115784  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0154  2-keto-gluconate dehydrogenase subunit-like  27.15 
 
 		 475 aa  171  4e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2658  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.5 
 
 		 553 aa  169  1e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1401  putative 2-keto-gluconate dehydrogenase  28.31 
 
 		 528 aa  169  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0383061  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2722  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.93 
 
 		 528 aa  168  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5469  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  30.25 
 
 		 526 aa  167  2.9999999999999998e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3683  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.52 
 
 		 556 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.642564  normal  0.0444916 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4690  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.08 
 
 		 570 aa  166  9e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.02417 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1705  oxidoreductase  28.3 
 
 		 522 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.318945 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3202  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  27.96 
 
 		 522 aa  164  3e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0960335 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4606  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.16 
 
 		 582 aa  162  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.159853 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7243  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.13 
 
 		 547 aa  162  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6563  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.76 
 
 		 569 aa  162  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0955213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0728  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.84 
 
 		 518 aa  160  6e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.568898  normal  0.0737373 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6279  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.57 
 
 		 556 aa  159  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00998076 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4710  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.49 
 
 		 526 aa  159  1e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.467902  normal  0.0104534 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0367  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.25 
 
 		 565 aa  159  1e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1801  GMC oxidoreductase family protein  27.24 
 
 		 549 aa  157  3e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000289048  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1641  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.44 
 
 		 522 aa  158  3e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.235132 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5509  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.21 
 
 		 556 aa  157  6e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0807117  normal  0.364058 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1064  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.7 
 
 		 525 aa  156  7e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.113781 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1923  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.07 
 
 		 550 aa  155  1e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4678  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.39 
 
 		 545 aa  154  5e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6565  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.37 
 
 		 526 aa  153  8e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.417903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2494  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.42 
 
 		 572 aa  153  8.999999999999999e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.314394 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0467  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.07 
 
 		 548 aa  151  3e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1086  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.23 
 
 		 501 aa  151  3e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5724  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.47 
 
 		 573 aa  150  5e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.526246 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4949  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.54 
 
 		 574 aa  150  5e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0418  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.12 
 
 		 573 aa  149  9e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3542  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.81 
 
 		 563 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5253  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.16 
 
 		 522 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.789001  decreased coverage  0.00462633 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0419  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.08 
 
 		 563 aa  149  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2982  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.13 
 
 		 572 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1288  putative dehydrogenase  29.91 
 
 		 547 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.478643 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2999  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  26.15 
 
 		 561 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.634456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6389  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.44 
 
 		 547 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1854  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.87 
 
 		 534 aa  147  4.0000000000000006e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.138166  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3694  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.06 
 
 		 566 aa  145  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.257564  normal  0.232243 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1771  GMC oxidoreductase  26.49 
 
 		 539 aa  146  1e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0767108 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3718  hypothetical protein  27.1 
 
 		 483 aa  145  3e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2072  putative Gluconate 2-dehydrogenase flavoprotein  28.73 
 
 		 523 aa  145  3e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0776  GMC oxidoreductase  28.36 
 
 		 563 aa  144  6e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>