More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2658 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_2658  glucose-methanol-choline oxidoreductase  100 
 
 
553 aa  1150    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1923  glucose-methanol-choline oxidoreductase  41.47 
 
 
550 aa  374  1e-102  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2179  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  37.27 
 
 
549 aa  332  1e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2705  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.66 
 
 
522 aa  322  9.999999999999999e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.815552  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0945  putative 2-keto-gluconate dehydrogenase  35.13 
 
 
522 aa  312  9e-84  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0109  hypothetical protein  34.5 
 
 
573 aa  310  4e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3202  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  35.67 
 
 
522 aa  308  2.0000000000000002e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0960335 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2930  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.62 
 
 
527 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0259797  normal  0.914708 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1914  glucose-methanol-choline oxidoreductase  37.7 
 
 
553 aa  298  1e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.33952  normal  0.193822 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1705  oxidoreductase  34.83 
 
 
522 aa  296  5e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.318945 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3542  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.09 
 
 
563 aa  293  6e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3053  putative oxidoreductase  35.26 
 
 
528 aa  290  4e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2999  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  33.63 
 
 
561 aa  290  5.0000000000000004e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.634456  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2120  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  33.21 
 
 
522 aa  289  9e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2534  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  33.21 
 
 
522 aa  289  9e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1641  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.98 
 
 
522 aa  289  1e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.235132 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4095  putative gluconate dehydrogenase  33.56 
 
 
594 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6210  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  33.56 
 
 
594 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.1943  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0230  putative dehydrogenase  33.67 
 
 
591 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5253  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.33 
 
 
522 aa  282  1e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.789001  decreased coverage  0.00462633 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2982  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.27 
 
 
572 aa  280  4e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4710  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.46 
 
 
526 aa  280  4e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.467902  normal  0.0104534 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0665  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.03 
 
 
534 aa  280  6e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4480  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.19 
 
 
527 aa  274  3e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.36342 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0464  oxidoreductase, putative  32.69 
 
 
573 aa  273  4.0000000000000004e-72  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2015  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  31.31 
 
 
592 aa  273  4.0000000000000004e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0874518 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0439  oxidoreductase, putative  33.04 
 
 
573 aa  271  2e-71  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.483432  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0060  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.58 
 
 
523 aa  271  2.9999999999999997e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1401  putative 2-keto-gluconate dehydrogenase  31.88 
 
 
528 aa  268  1e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0383061  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2072  putative Gluconate 2-dehydrogenase flavoprotein  32.65 
 
 
523 aa  269  1e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0728  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.2 
 
 
518 aa  268  2.9999999999999995e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.568898  normal  0.0737373 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2722  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.16 
 
 
528 aa  267  5e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3608  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  31.31 
 
 
589 aa  265  1e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0579552  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3383  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  32.36 
 
 
594 aa  265  2e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.597308 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0227  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  30 
 
 
592 aa  264  3e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2376  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  32.19 
 
 
594 aa  264  3e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.406153  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2975  gluconate dehydrogenase  31.01 
 
 
591 aa  260  4e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.299078  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35290  gluconate dehydrogenase  31.01 
 
 
591 aa  260  4e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0685157  normal  0.495861 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00900  gluconate dehydrogenase flavoprotein subunit  31.13 
 
 
591 aa  260  5.0000000000000005e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.687718  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1314  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  32.47 
 
 
589 aa  259  7e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5469  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  32.79 
 
 
526 aa  258  2e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2562  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  32.19 
 
 
594 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0936094 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2503  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.3 
 
 
591 aa  256  7e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.809457  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2137  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  30.73 
 
 
593 aa  256  8e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.610724 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0085  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.02 
 
 
594 aa  251  2e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1164  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  29.73 
 
 
594 aa  251  3e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2565  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  31.39 
 
 
594 aa  248  2e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.339235  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33650  dehydrogenase flavoprotein subunit  29.64 
 
 
596 aa  247  4e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4244  putative gluconate dehydrogenase  30.66 
 
 
588 aa  247  4.9999999999999997e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.659751  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4639  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  29.67 
 
 
592 aa  247  4.9999999999999997e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0418  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.36 
 
 
573 aa  246  6.999999999999999e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4381  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  30.19 
 
 
592 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7243  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.82 
 
 
547 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146808  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1288  putative dehydrogenase  33.82 
 
 
547 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.478643 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4120  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  30.37 
 
 
592 aa  244  3.9999999999999997e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4037  hypothetical protein  32.5 
 
 
549 aa  243  6e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.677701 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3646  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.37 
 
 
592 aa  243  7e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0467  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.64 
 
 
548 aa  243  9e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1793  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.37 
 
 
592 aa  243  9e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.345818  normal  0.124135 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4202  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  30.61 
 
 
590 aa  242  1e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.494803  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1737  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.94 
 
 
573 aa  242  1e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.170374  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3895  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  30.81 
 
 
594 aa  242  1e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.241761 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1801  GMC oxidoreductase family protein  32.18 
 
 
549 aa  242  1e-62  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000289048  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1598  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.26 
 
 
586 aa  242  1e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.26779 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3293  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  30.19 
 
 
592 aa  239  8e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.517523  normal  0.855973 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4142  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.19 
 
 
592 aa  239  8e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00267636  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4224  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.19 
 
 
592 aa  239  8e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.477307  normal  0.178232 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6389  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.91 
 
 
547 aa  238  3e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1858  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.14 
 
 
755 aa  237  4e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.184483  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5399  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  29.51 
 
 
586 aa  237  5.0000000000000005e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.690827  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2085  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34 
 
 
573 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.024834 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1871  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.03 
 
 
545 aa  232  2e-59  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.176173  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3371  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.65 
 
 
698 aa  231  2e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.261547  normal  0.556381 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6279  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.85 
 
 
556 aa  230  4e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00998076 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5509  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.97 
 
 
556 aa  230  5e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0807117  normal  0.364058 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0664  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  32.26 
 
 
515 aa  230  6e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.414473  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6565  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.27 
 
 
526 aa  229  1e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.417903  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4194  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.18 
 
 
548 aa  228  2e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0165  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.69 
 
 
531 aa  226  1e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2790  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  32.94 
 
 
578 aa  223  8e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1738  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.02 
 
 
572 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0256675  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0819  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.52 
 
 
579 aa  221  3e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.157641  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3683  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.96 
 
 
556 aa  220  5e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.642564  normal  0.0444916 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0788  GMC oxidoreductase  33.03 
 
 
563 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.310504  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2378  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.13 
 
 
533 aa  215  9.999999999999999e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0950  putative glucose dehydrogenase  33.03 
 
 
563 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.263554  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0776  GMC oxidoreductase  33.03 
 
 
563 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3360  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.59 
 
 
545 aa  214  4.9999999999999996e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0587927 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3694  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.11 
 
 
566 aa  206  7e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.257564  normal  0.232243 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0719  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.84 
 
 
536 aa  206  1e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.407783 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4426  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.38 
 
 
579 aa  204  3e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3801  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.32 
 
 
545 aa  202  9e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.382943 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4678  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.81 
 
 
545 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0230  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.21 
 
 
579 aa  201  3e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.118413  normal  0.242955 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0789  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.77 
 
 
540 aa  199  9e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.211025  normal  0.372024 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6549  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.22 
 
 
539 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.374556 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3815  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.39 
 
 
539 aa  197  6e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.583014  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4553  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.39 
 
 
539 aa  197  6e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.940882 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5751  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.39 
 
 
539 aa  197  6e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1371  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.89 
 
 
584 aa  196  8.000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.122275  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>