More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10247_A1083 on replicon NC_009079
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003295  RSc0771  putative transmembrane dehydrogenase (large subunit) oxidoreductase protein  83.49 
 
 
539 aa  954    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0952307  normal  0.0474982 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1245  hypothetical protein  100 
 
 
537 aa  1122    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.904528  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0719  glucose-methanol-choline oxidoreductase  84.7 
 
 
536 aa  970    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.407783 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2589  glucose dehydrogenase  99.81 
 
 
537 aa  1120    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6549  glucose-methanol-choline oxidoreductase  89.16 
 
 
539 aa  1020    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.374556 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1349  glucose dehydrogenase, alpha subunit  99.81 
 
 
537 aa  1120    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1293  glucose-methanol-choline oxidoreductase  89.16 
 
 
539 aa  991    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.898836  normal  0.776794 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1415  hypothetical protein  96.65 
 
 
537 aa  1062    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1083  hypothetical protein  100 
 
 
537 aa  1122    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0832661  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4094  glucose-methanol-choline oxidoreductase  92.34 
 
 
539 aa  1017    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1434  glucose dehydrogenase, alpha subunit  99.81 
 
 
537 aa  1120    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3815  glucose-methanol-choline oxidoreductase  90.09 
 
 
539 aa  1026    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.583014  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4442  glucose-methanol-choline oxidoreductase  90.09 
 
 
539 aa  996    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.795175  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3978  glucose-methanol-choline oxidoreductase  90.47 
 
 
539 aa  998    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.500166  normal  0.0737697 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0789  glucose-methanol-choline oxidoreductase  84.4 
 
 
540 aa  962    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.211025  normal  0.372024 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6818  glucose-methanol-choline oxidoreductase  64.43 
 
 
533 aa  707    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.242551 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4553  glucose-methanol-choline oxidoreductase  90.09 
 
 
539 aa  1026    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.940882 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0216  hypothetical protein  100 
 
 
537 aa  1122    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5751  glucose-methanol-choline oxidoreductase  90.09 
 
 
539 aa  1026    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0489  hypothetical protein  100 
 
 
537 aa  1122    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.143088  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2086  glucose-methanol-choline oxidoreductase  49.44 
 
 
538 aa  540  9.999999999999999e-153  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.879766  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3801  glucose-methanol-choline oxidoreductase  51.02 
 
 
545 aa  536  1e-151  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.382943 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4263  glucose-methanol-choline oxidoreductase  47.09 
 
 
544 aa  496  1e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.157361  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1160  putative glucose-methanol-choline oxidoreductase  47.25 
 
 
552 aa  498  1e-139  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1808  putative dehydrogenase subunit  46.38 
 
 
551 aa  489  1e-137  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000111783  hitchhiker  0.0000501686 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7345  glucose-methanol-choline oxidoreductase  45.06 
 
 
550 aa  474  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.421505  normal  0.897172 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2333  glucose-methanol-choline oxidoreductase  46.45 
 
 
534 aa  466  9.999999999999999e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000292297  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5694  glucose-methanol-choline oxidoreductase  44.53 
 
 
533 aa  449  1e-125  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00839978 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3758  glucose-methanol-choline oxidoreductase  44.34 
 
 
533 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4610  glucose-methanol-choline oxidoreductase  44.34 
 
 
533 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0233056 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1661  dehydrogenase subunit, putative  33.81 
 
 
752 aa  296  7e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.796434 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4057  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.65 
 
 
752 aa  296  7e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.566614  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3988  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.33 
 
 
752 aa  293  5e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0165  glucose-methanol-choline oxidoreductase  36.7 
 
 
531 aa  288  2e-76  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4186  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.78 
 
 
614 aa  282  1e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00132881 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2378  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.09 
 
 
533 aa  271  2e-71  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1871  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.15 
 
 
545 aa  267  5e-70  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.176173  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5986  putative dehydrogenase large subunit protein  31.34 
 
 
623 aa  263  4e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.420299 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3137  dehydrogenase subunit  32.57 
 
 
607 aa  255  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2982  putative dehydrogenase protein  32.41 
 
 
607 aa  253  6e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.244285  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1981  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.02 
 
 
662 aa  251  2e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2343  FAD dependent oxidoreductase  30.72 
 
 
662 aa  248  1e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.513301  normal  0.220367 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1996  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.87 
 
 
662 aa  249  1e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2044  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.72 
 
 
662 aa  248  3e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.854186  normal  0.0386059 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2098  putative dehydrogenase large subunit protein  31.02 
 
 
612 aa  235  1.0000000000000001e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2930  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.01 
 
 
527 aa  189  1e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0259797  normal  0.914708 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1914  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.33 
 
 
553 aa  188  2e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.33952  normal  0.193822 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3053  putative oxidoreductase  30.6 
 
 
528 aa  182  2e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0109  hypothetical protein  27.42 
 
 
573 aa  179  1e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1771  GMC oxidoreductase  29.87 
 
 
539 aa  179  1e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0767108 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1064  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.5 
 
 
525 aa  177  4e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.113781 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2658  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.75 
 
 
553 aa  177  4e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4037  hypothetical protein  30.28 
 
 
549 aa  176  9e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.677701 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3202  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  29.4 
 
 
522 aa  173  5.999999999999999e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0960335 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5469  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  29.17 
 
 
526 aa  173  5.999999999999999e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0418  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.76 
 
 
573 aa  171  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3683  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.89 
 
 
556 aa  170  5e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.642564  normal  0.0444916 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2120  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  27.03 
 
 
522 aa  167  5.9999999999999996e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2534  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  27.03 
 
 
522 aa  167  5.9999999999999996e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0945  putative 2-keto-gluconate dehydrogenase  28.05 
 
 
522 aa  167  5.9999999999999996e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7243  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.99 
 
 
547 aa  166  9e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146808  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2085  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.66 
 
 
573 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.024834 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1801  GMC oxidoreductase family protein  28.7 
 
 
549 aa  166  1.0000000000000001e-39  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000289048  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6389  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.39 
 
 
547 aa  164  3e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1288  putative dehydrogenase  28.36 
 
 
547 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.478643 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4194  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.6 
 
 
548 aa  163  7e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3164  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.22 
 
 
563 aa  163  8.000000000000001e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.115784  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0728  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.63 
 
 
518 aa  161  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.568898  normal  0.0737373 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0060  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.51 
 
 
523 aa  161  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1086  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.16 
 
 
501 aa  162  2e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4710  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.89 
 
 
526 aa  161  3e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.467902  normal  0.0104534 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2705  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.16 
 
 
522 aa  159  1e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.815552  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5509  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.78 
 
 
556 aa  159  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0807117  normal  0.364058 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3360  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.33 
 
 
545 aa  158  2e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0587927 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4480  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.34 
 
 
527 aa  159  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.36342 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6279  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28 
 
 
556 aa  157  3e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00998076 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1641  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.7 
 
 
522 aa  156  7e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.235132 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0467  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.68 
 
 
548 aa  156  1e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1923  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.55 
 
 
550 aa  155  1e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6565  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.34 
 
 
526 aa  155  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.417903  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1705  oxidoreductase  29.68 
 
 
522 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.318945 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0950  putative glucose dehydrogenase  28.65 
 
 
563 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.263554  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1738  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.61 
 
 
572 aa  155  2.9999999999999998e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0256675  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0788  GMC oxidoreductase  28.65 
 
 
563 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.310504  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0776  GMC oxidoreductase  28.65 
 
 
563 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2474  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.19 
 
 
566 aa  152  1e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.826754 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2179  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  28.52 
 
 
549 aa  151  3e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0154  2-keto-gluconate dehydrogenase subunit-like  26.51 
 
 
475 aa  150  4e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1840  GMC oxidoreductase  26.51 
 
 
534 aa  150  7e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000489986  normal  0.328535 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4678  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.4 
 
 
545 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3166  putative dehydrogenase transmembrane protein  27.07 
 
 
506 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.689634  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0665  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.14 
 
 
534 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1894  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.03 
 
 
562 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.474294  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3248  hypothetical protein  28.25 
 
 
480 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.713925  normal  0.212703 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3542  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.98 
 
 
563 aa  147  6e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2017  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.94 
 
 
581 aa  147  7.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.422222  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2982  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.17 
 
 
572 aa  144  4e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2722  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.87 
 
 
528 aa  144  4e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4606  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.53 
 
 
582 aa  144  4e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.159853 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1042  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.87 
 
 
561 aa  143  6e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.535763  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>