More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_3758 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_5694  glucose-methanol-choline oxidoreductase  99.62 
 
 
533 aa  1090    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00839978 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3758  glucose-methanol-choline oxidoreductase  100 
 
 
533 aa  1098    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2333  glucose-methanol-choline oxidoreductase  71.72 
 
 
534 aa  835    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000292297  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4610  glucose-methanol-choline oxidoreductase  100 
 
 
533 aa  1098    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0233056 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4263  glucose-methanol-choline oxidoreductase  52.19 
 
 
544 aa  548  1e-154  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.157361  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2086  glucose-methanol-choline oxidoreductase  47.03 
 
 
538 aa  486  1e-136  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.879766  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6818  glucose-methanol-choline oxidoreductase  47.69 
 
 
533 aa  485  1e-136  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.242551 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0771  putative transmembrane dehydrogenase (large subunit) oxidoreductase protein  46.4 
 
 
539 aa  449  1e-125  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0952307  normal  0.0474982 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5751  glucose-methanol-choline oxidoreductase  43.85 
 
 
539 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3815  glucose-methanol-choline oxidoreductase  43.85 
 
 
539 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.583014  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4553  glucose-methanol-choline oxidoreductase  43.85 
 
 
539 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.940882 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0789  glucose-methanol-choline oxidoreductase  44.9 
 
 
540 aa  445  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.211025  normal  0.372024 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0719  glucose-methanol-choline oxidoreductase  44.04 
 
 
536 aa  444  1e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.407783 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3801  glucose-methanol-choline oxidoreductase  44.38 
 
 
545 aa  444  1e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.382943 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1808  putative dehydrogenase subunit  45.12 
 
 
551 aa  444  1e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000111783  hitchhiker  0.0000501686 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4094  glucose-methanol-choline oxidoreductase  45.25 
 
 
539 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6549  glucose-methanol-choline oxidoreductase  43.49 
 
 
539 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.374556 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1245  hypothetical protein  44.51 
 
 
537 aa  429  1e-119  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.904528  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2589  glucose dehydrogenase  44.51 
 
 
537 aa  429  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1434  glucose dehydrogenase, alpha subunit  44.51 
 
 
537 aa  429  1e-119  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1349  glucose dehydrogenase, alpha subunit  44.51 
 
 
537 aa  429  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3978  glucose-methanol-choline oxidoreductase  44.11 
 
 
539 aa  429  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.500166  normal  0.0737697 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1083  hypothetical protein  44.51 
 
 
537 aa  429  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0832661  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0489  hypothetical protein  44.51 
 
 
537 aa  429  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.143088  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0216  hypothetical protein  44.51 
 
 
537 aa  429  1e-119  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1415  hypothetical protein  44.51 
 
 
537 aa  426  1e-118  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1293  glucose-methanol-choline oxidoreductase  43.73 
 
 
539 aa  423  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.898836  normal  0.776794 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4442  glucose-methanol-choline oxidoreductase  43.73 
 
 
539 aa  423  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.795175  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7345  glucose-methanol-choline oxidoreductase  43.75 
 
 
550 aa  410  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.421505  normal  0.897172 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1160  putative glucose-methanol-choline oxidoreductase  43.67 
 
 
552 aa  409  1e-113  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4186  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.35 
 
 
614 aa  267  4e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00132881 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0165  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.01 
 
 
531 aa  244  3e-63  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3988  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.39 
 
 
752 aa  239  9e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1661  dehydrogenase subunit, putative  30.23 
 
 
752 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.796434 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4057  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.9 
 
 
752 aa  233  5e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.566614  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2343  FAD dependent oxidoreductase  31.16 
 
 
662 aa  232  1e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.513301  normal  0.220367 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1996  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.16 
 
 
662 aa  231  3e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1981  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.17 
 
 
662 aa  230  6e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2044  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.86 
 
 
662 aa  227  4e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.854186  normal  0.0386059 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2982  putative dehydrogenase protein  31.65 
 
 
607 aa  224  4e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.244285  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2378  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.51 
 
 
533 aa  223  4.9999999999999996e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3137  dehydrogenase subunit  31.71 
 
 
607 aa  223  9e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2098  putative dehydrogenase large subunit protein  30.6 
 
 
612 aa  217  2.9999999999999998e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5986  putative dehydrogenase large subunit protein  28.31 
 
 
623 aa  215  9.999999999999999e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.420299 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1871  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.85 
 
 
545 aa  213  5.999999999999999e-54  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.176173  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2930  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.3 
 
 
527 aa  196  7e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0259797  normal  0.914708 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5469  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  30.29 
 
 
526 aa  187  4e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4678  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.47 
 
 
545 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4037  hypothetical protein  30.3 
 
 
549 aa  183  6e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.677701 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1914  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.11 
 
 
553 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.33952  normal  0.193822 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2120  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  29.66 
 
 
522 aa  178  2e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2534  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  29.66 
 
 
522 aa  178  2e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0418  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.15 
 
 
573 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3053  putative oxidoreductase  30.64 
 
 
528 aa  173  9e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3542  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.76 
 
 
563 aa  171  2e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0728  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.24 
 
 
518 aa  172  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.568898  normal  0.0737373 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1771  GMC oxidoreductase  28.52 
 
 
539 aa  171  2e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0767108 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4480  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.98 
 
 
527 aa  171  4e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.36342 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2085  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.23 
 
 
573 aa  170  5e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.024834 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5509  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.17 
 
 
556 aa  170  6e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0807117  normal  0.364058 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2705  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.2 
 
 
522 aa  170  7e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.815552  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6279  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.06 
 
 
556 aa  169  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00998076 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0467  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.42 
 
 
548 aa  167  4e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6389  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.09 
 
 
547 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3360  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.53 
 
 
545 aa  165  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0587927 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7243  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.09 
 
 
547 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146808  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0664  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  32.13 
 
 
515 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.414473  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2982  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.39 
 
 
572 aa  163  9e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1064  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.21 
 
 
525 aa  162  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.113781 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1288  putative dehydrogenase  29.91 
 
 
547 aa  162  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.478643 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6565  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.64 
 
 
526 aa  162  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.417903  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2999  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  26.18 
 
 
561 aa  162  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.634456  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0945  putative 2-keto-gluconate dehydrogenase  28.39 
 
 
522 aa  161  3e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0109  hypothetical protein  27.57 
 
 
573 aa  160  4e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4194  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.26 
 
 
548 aa  160  5e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2658  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.44 
 
 
553 aa  160  6e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0950  putative glucose dehydrogenase  30.67 
 
 
563 aa  158  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.263554  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0776  GMC oxidoreductase  30.67 
 
 
563 aa  158  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1923  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.27 
 
 
550 aa  158  2e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0788  GMC oxidoreductase  30.67 
 
 
563 aa  158  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.310504  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0665  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.52 
 
 
534 aa  155  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2722  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.83 
 
 
528 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3202  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  27.06 
 
 
522 aa  154  4e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0960335 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0060  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.47 
 
 
523 aa  154  4e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1401  putative 2-keto-gluconate dehydrogenase  28.67 
 
 
528 aa  151  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0383061  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2686  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.06 
 
 
561 aa  151  2e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.50945  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1086  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.73 
 
 
501 aa  150  7e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0419  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.11 
 
 
563 aa  149  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1801  GMC oxidoreductase family protein  27.07 
 
 
549 aa  148  2.0000000000000003e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000289048  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4710  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.16 
 
 
526 aa  148  3e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.467902  normal  0.0104534 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1858  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.98 
 
 
755 aa  147  4.0000000000000006e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.184483  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00434  oxidoreductase  26.28 
 
 
561 aa  147  4.0000000000000006e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4690  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.67 
 
 
570 aa  147  6e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.02417 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1641  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.63 
 
 
522 aa  146  9e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.235132 
 
 
-
 
NC_004310  BR2044  GMC family oxidoreductase  27 
 
 
494 aa  146  1e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.84528  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1705  oxidoreductase  27.47 
 
 
522 aa  144  4e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.318945 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3164  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.85 
 
 
563 aa  143  7e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.115784  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3452  hypothetical protein  29.89 
 
 
480 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0700524  normal  0.443587 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1894  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.68 
 
 
562 aa  142  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.474294  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1632  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.88 
 
 
560 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>