298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2333 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_5694  glucose-methanol-choline oxidoreductase  71.72 
 
 
533 aa  833    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00839978 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3758  glucose-methanol-choline oxidoreductase  71.72 
 
 
533 aa  835    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4610  glucose-methanol-choline oxidoreductase  71.72 
 
 
533 aa  835    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0233056 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2333  glucose-methanol-choline oxidoreductase  100 
 
 
534 aa  1112    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000292297  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4263  glucose-methanol-choline oxidoreductase  47.71 
 
 
544 aa  503  1e-141  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.157361  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6818  glucose-methanol-choline oxidoreductase  48.52 
 
 
533 aa  480  1e-134  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.242551 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0719  glucose-methanol-choline oxidoreductase  45.79 
 
 
536 aa  461  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.407783 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0771  putative transmembrane dehydrogenase (large subunit) oxidoreductase protein  46.3 
 
 
539 aa  456  1e-127  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0952307  normal  0.0474982 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5751  glucose-methanol-choline oxidoreductase  45.29 
 
 
539 aa  457  1e-127  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3815  glucose-methanol-choline oxidoreductase  45.29 
 
 
539 aa  457  1e-127  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.583014  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4553  glucose-methanol-choline oxidoreductase  45.29 
 
 
539 aa  457  1e-127  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.940882 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0789  glucose-methanol-choline oxidoreductase  45.56 
 
 
540 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.211025  normal  0.372024 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6549  glucose-methanol-choline oxidoreductase  45.29 
 
 
539 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.374556 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1434  glucose dehydrogenase, alpha subunit  46.69 
 
 
537 aa  449  1e-125  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0489  hypothetical protein  46.69 
 
 
537 aa  449  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.143088  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1245  hypothetical protein  46.69 
 
 
537 aa  449  1e-125  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.904528  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2589  glucose dehydrogenase  46.69 
 
 
537 aa  449  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1415  hypothetical protein  46.49 
 
 
537 aa  449  1e-125  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4094  glucose-methanol-choline oxidoreductase  45.73 
 
 
539 aa  449  1e-125  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1349  glucose dehydrogenase, alpha subunit  46.69 
 
 
537 aa  449  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1083  hypothetical protein  46.69 
 
 
537 aa  449  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0832661  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0216  hypothetical protein  46.69 
 
 
537 aa  449  1e-125  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3978  glucose-methanol-choline oxidoreductase  45.54 
 
 
539 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.500166  normal  0.0737697 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4442  glucose-methanol-choline oxidoreductase  45.35 
 
 
539 aa  442  1e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.795175  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3801  glucose-methanol-choline oxidoreductase  44.38 
 
 
545 aa  442  1e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.382943 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1293  glucose-methanol-choline oxidoreductase  45.16 
 
 
539 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.898836  normal  0.776794 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1808  putative dehydrogenase subunit  44.12 
 
 
551 aa  433  1e-120  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000111783  hitchhiker  0.0000501686 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2086  glucose-methanol-choline oxidoreductase  41 
 
 
538 aa  421  1e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.879766  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1160  putative glucose-methanol-choline oxidoreductase  43.37 
 
 
552 aa  409  1e-113  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7345  glucose-methanol-choline oxidoreductase  41.67 
 
 
550 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.421505  normal  0.897172 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4186  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.81 
 
 
614 aa  247  4.9999999999999997e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00132881 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2343  FAD dependent oxidoreductase  30.99 
 
 
662 aa  234  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.513301  normal  0.220367 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1981  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.84 
 
 
662 aa  233  8.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1996  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.69 
 
 
662 aa  229  6e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5986  putative dehydrogenase large subunit protein  31.05 
 
 
623 aa  228  2e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.420299 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2044  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.69 
 
 
662 aa  227  4e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.854186  normal  0.0386059 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3137  dehydrogenase subunit  32.44 
 
 
607 aa  227  5.0000000000000005e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2982  putative dehydrogenase protein  31.99 
 
 
607 aa  225  2e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.244285  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0165  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.56 
 
 
531 aa  224  2e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1661  dehydrogenase subunit, putative  31.35 
 
 
752 aa  220  5e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.796434 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2098  putative dehydrogenase large subunit protein  30.67 
 
 
612 aa  218  2e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3988  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.37 
 
 
752 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4057  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.1 
 
 
752 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.566614  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2378  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.42 
 
 
533 aa  203  7e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1871  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.24 
 
 
545 aa  203  8e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.176173  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2534  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  30.3 
 
 
522 aa  185  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2120  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  30.3 
 
 
522 aa  185  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2930  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.69 
 
 
527 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0259797  normal  0.914708 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5469  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  31.92 
 
 
526 aa  183  6e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4678  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.49 
 
 
545 aa  180  5.999999999999999e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1771  GMC oxidoreductase  28.27 
 
 
539 aa  173  6.999999999999999e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0767108 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4037  hypothetical protein  28.44 
 
 
549 aa  171  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.677701 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3053  putative oxidoreductase  30.58 
 
 
528 aa  171  4e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0664  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  28.7 
 
 
515 aa  167  5e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.414473  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2705  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.19 
 
 
522 aa  166  6.9999999999999995e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.815552  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1914  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.53 
 
 
553 aa  164  3e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.33952  normal  0.193822 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7243  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.18 
 
 
547 aa  164  3e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146808  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1064  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.52 
 
 
525 aa  163  9e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.113781 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3202  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  28.83 
 
 
522 aa  162  2e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0960335 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0945  putative 2-keto-gluconate dehydrogenase  28.83 
 
 
522 aa  160  6e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0728  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.4 
 
 
518 aa  159  9e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.568898  normal  0.0737373 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0467  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.67 
 
 
548 aa  159  1e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0418  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.31 
 
 
573 aa  159  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1641  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.02 
 
 
522 aa  159  1e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.235132 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2085  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.6 
 
 
573 aa  159  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.024834 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6279  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.74 
 
 
556 aa  158  3e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00998076 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4710  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.7 
 
 
526 aa  157  3e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.467902  normal  0.0104534 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3360  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.35 
 
 
545 aa  157  6e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0587927 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4194  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.57 
 
 
548 aa  157  6e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0665  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.6 
 
 
534 aa  157  6e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0109  hypothetical protein  27.13 
 
 
573 aa  155  1e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2982  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.79 
 
 
572 aa  156  1e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4480  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.13 
 
 
527 aa  156  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.36342 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3542  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.27 
 
 
563 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5509  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.82 
 
 
556 aa  154  5e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0807117  normal  0.364058 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2658  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.54 
 
 
553 aa  153  8e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6565  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.74 
 
 
526 aa  152  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.417903  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1086  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.44 
 
 
501 aa  151  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0060  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.78 
 
 
523 aa  151  4e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2999  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  26.01 
 
 
561 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.634456  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1705  oxidoreductase  28.76 
 
 
522 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.318945 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1923  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.83 
 
 
550 aa  147  3e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2722  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.92 
 
 
528 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1288  putative dehydrogenase  27.58 
 
 
547 aa  145  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.478643 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6389  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.17 
 
 
547 aa  145  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2044  GMC family oxidoreductase  30.48 
 
 
494 aa  144  4e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.84528  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1801  GMC oxidoreductase family protein  26.94 
 
 
549 aa  143  8e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000289048  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1401  putative 2-keto-gluconate dehydrogenase  27.8 
 
 
528 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0383061  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0950  putative glucose dehydrogenase  27.84 
 
 
563 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.263554  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0776  GMC oxidoreductase  27.84 
 
 
563 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0788  GMC oxidoreductase  28.04 
 
 
563 aa  141  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.310504  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3718  hypothetical protein  28.6 
 
 
483 aa  141  3e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2072  putative Gluconate 2-dehydrogenase flavoprotein  28.96 
 
 
523 aa  141  3.9999999999999997e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3452  hypothetical protein  28.6 
 
 
480 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0700524  normal  0.443587 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3683  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.92 
 
 
556 aa  140  7.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.642564  normal  0.0444916 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5253  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.36 
 
 
522 aa  140  7.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.789001  decreased coverage  0.00462633 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2179  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  27.49 
 
 
549 aa  138  3.0000000000000003e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4606  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.39 
 
 
582 aa  137  7.000000000000001e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.159853 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4690  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.89 
 
 
570 aa  136  9e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.02417 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0419  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27 
 
 
563 aa  136  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>