251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_2098 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_2098  putative dehydrogenase large subunit protein  100 
 
 		 612 aa  1258    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4186  glucose-methanol-choline oxidoreductase  41.91 
 
 		 614 aa  492  9.999999999999999e-139  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00132881 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2982  putative dehydrogenase protein  40.66 
 
 		 607 aa  468  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.244285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3137  dehydrogenase subunit  40.49 
 
 		 607 aa  465  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5986  putative dehydrogenase large subunit protein  41.75 
 
 		 623 aa  461  9.999999999999999e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.420299 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4057  glucose-methanol-choline oxidoreductase  38.27 
 
 		 752 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.566614  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1661  dehydrogenase subunit, putative  37.64 
 
 		 752 aa  372  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.796434 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3988  glucose-methanol-choline oxidoreductase  37.33 
 
 		 752 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2343  FAD dependent oxidoreductase  33.48 
 
 		 662 aa  311  2e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.513301  normal  0.220367 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1981  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.48 
 
 		 662 aa  311  2.9999999999999997e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1996  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.33 
 
 		 662 aa  307  3e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2044  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.48 
 
 		 662 aa  306  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.854186  normal  0.0386059 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2086  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.85 
 
 		 538 aa  259  9e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.879766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4263  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.91 
 
 		 544 aa  240  5e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.157361  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6549  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31 
 
 		 539 aa  238  3e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.374556 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0789  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.68 
 
 		 540 aa  237  5.0000000000000005e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.211025  normal  0.372024 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0771  putative transmembrane dehydrogenase (large subunit) oxidoreductase protein  32.68 
 
 		 539 aa  236  9e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0952307  normal  0.0474982 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5751  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.5 
 
 		 539 aa  234  3e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1415  hypothetical protein  31.29 
 
 		 537 aa  234  3e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3815  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.5 
 
 		 539 aa  234  3e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.583014  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4553  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.5 
 
 		 539 aa  234  3e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.940882 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0719  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.02 
 
 		 536 aa  234  5e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.407783 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3801  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.67 
 
 		 545 aa  233  7.000000000000001e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.382943 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4094  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.78 
 
 		 539 aa  227  6e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2589  glucose dehydrogenase  30.78 
 
 		 537 aa  224  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1434  glucose dehydrogenase, alpha subunit  30.78 
 
 		 537 aa  224  3e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1349  glucose dehydrogenase, alpha subunit  30.78 
 
 		 537 aa  224  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1245  hypothetical protein  30.61 
 
 		 537 aa  223  6e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.904528  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0216  hypothetical protein  30.61 
 
 		 537 aa  223  6e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0489  hypothetical protein  30.61 
 
 		 537 aa  223  6e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.143088  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1083  hypothetical protein  30.61 
 
 		 537 aa  223  6e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0832661  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4442  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.93 
 
 		 539 aa  223  9e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.795175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6818  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.16 
 
 		 533 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.242551 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3978  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.93 
 
 		 539 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.500166  normal  0.0737697 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1808  putative dehydrogenase subunit  30.62 
 
 		 551 aa  221  3e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000111783  hitchhiker  0.0000501686 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1293  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.44 
 
 		 539 aa  220  6e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.898836  normal  0.776794 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2333  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.5 
 
 		 534 aa  219  1e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000292297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3758  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.6 
 
 		 533 aa  217  5e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4610  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.6 
 
 		 533 aa  217  5e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0233056 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5694  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.6 
 
 		 533 aa  216  9e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00839978 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7345  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.98 
 
 		 550 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.421505  normal  0.897172 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1160  putative glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.94 
 
 		 552 aa  196  7e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0165  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.39 
 
 		 531 aa  148  3e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1871  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.17 
 
 		 545 aa  146  9e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.176173  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4690  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.79 
 
 		 570 aa  131  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.02417 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2378  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.34 
 
 		 533 aa  128  4.0000000000000003e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2494  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.76 
 
 		 572 aa  123  8e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.314394 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3164  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.71 
 
 		 563 aa  120  7e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.115784  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3694  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.41 
 
 		 566 aa  116  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.257564  normal  0.232243 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1771  GMC oxidoreductase  26.24 
 
 		 539 aa  115  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0767108 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6279  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.82 
 
 		 556 aa  115  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00998076 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6565  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.63 
 
 		 526 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.417903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5509  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.95 
 
 		 556 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0807117  normal  0.364058 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1064  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.13 
 
 		 525 aa  111  5e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.113781 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1967  hypothetical protein  24.13 
 
 		 558 aa  110  9.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.929106  hitchhiker  0.0000146847 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2686  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.52 
 
 		 561 aa  109  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.50945  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6563  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.32 
 
 		 569 aa  108  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0955213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2474  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.13 
 
 		 566 aa  104  6e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.826754 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1977  2-keto-gluconate dehydrogenase subunit  22.94 
 
 		 480 aa  104  6e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000336524 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5806  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.71 
 
 		 570 aa  103  7e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.10388  normal  0.882961 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3371  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.61 
 
 		 698 aa  103  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.261547  normal  0.556381 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5469  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  23.92 
 
 		 526 aa  102  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0154  2-keto-gluconate dehydrogenase subunit-like  22.88 
 
 		 475 aa  102  3e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5620  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.32 
 
 		 579 aa  102  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2705  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.67 
 
 		 522 aa  98.6  3e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.815552  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0230  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.1 
 
 		 579 aa  98.2  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.118413  normal  0.242955 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00434  oxidoreductase  24.01 
 
 		 561 aa  97.4  6e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4606  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.84 
 
 		 582 aa  97.1  9e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.159853 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3683  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.05 
 
 		 556 aa  95.9  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.642564  normal  0.0444916 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0439  oxidoreductase, putative  23.54 
 
 		 573 aa  95.5  2e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.483432  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0464  oxidoreductase, putative  23.38 
 
 		 573 aa  95.1  3e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5416  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.42 
 
 		 565 aa  95.1  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.133389 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1891  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.59 
 
 		 570 aa  94.7  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.969458 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2658  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.29 
 
 		 553 aa  94.7  5e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3452  hypothetical protein  25.25 
 
 		 480 aa  94.7  5e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0700524  normal  0.443587 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0945  putative 2-keto-gluconate dehydrogenase  23.06 
 
 		 522 aa  94  7e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2179  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  27.02 
 
 		 549 aa  93.6  9e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3718  hypothetical protein  25.08 
 
 		 483 aa  93.6  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4480  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.52 
 
 		 527 aa  92.4  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.36342 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5079  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.31 
 
 		 569 aa  92  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.623805 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3645  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.92 
 
 		 567 aa  92.4  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.948951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0367  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.4 
 
 		 565 aa  92.4  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0454  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.78 
 
 		 570 aa  92  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.219134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1705  oxidoreductase  22.71 
 
 		 522 aa  92  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.318945 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2722  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.4 
 
 		 528 aa  91.7  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4670  choline dehydrogenase-like flavoprotein  25.41 
 
 		 478 aa  91.3  5e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0703924  normal  0.59002 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0788  GMC oxidoreductase  24.42 
 
 		 563 aa  90.5  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.310504  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1042  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.25 
 
 		 561 aa  90.5  8e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.535763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0950  putative glucose dehydrogenase  24.42 
 
 		 563 aa  90.5  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.263554  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0776  GMC oxidoreductase  24.42 
 
 		 563 aa  90.5  9e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3542  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.23 
 
 		 563 aa  90.1  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1914  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.9 
 
 		 553 aa  90.1  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.33952  normal  0.193822 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0419  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.2 
 
 		 563 aa  89.4  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0060  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.34 
 
 		 523 aa  88.2  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1738  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.91 
 
 		 572 aa  88.2  5e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0256675  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5253  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.59 
 
 		 522 aa  87.4  6e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.789001  decreased coverage  0.00462633 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2017  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.14 
 
 		 581 aa  87.4  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.422222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1208  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.39 
 
 		 559 aa  87.4  7e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.397312  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3248  hypothetical protein  24.84 
 
 		 480 aa  87.4  7e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.713925  normal  0.212703 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1737  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.48 
 
 		 573 aa  87  8e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.170374  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>