250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_2982 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5986  putative dehydrogenase large subunit protein  52.33 
 
 		 623 aa  649    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.420299 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4186  glucose-methanol-choline oxidoreductase  66.06 
 
 		 614 aa  847    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00132881 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2982  putative dehydrogenase protein  100 
 
 		 607 aa  1271    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.244285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3137  dehydrogenase subunit  99.51 
 
 		 607 aa  1266    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2098  putative dehydrogenase large subunit protein  40.66 
 
 		 612 aa  464  1e-129  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1661  dehydrogenase subunit, putative  37.4 
 
 		 752 aa  362  8e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.796434 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3988  glucose-methanol-choline oxidoreductase  36.74 
 
 		 752 aa  360  4e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4057  glucose-methanol-choline oxidoreductase  37.09 
 
 		 752 aa  359  7e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.566614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2343  FAD dependent oxidoreductase  34.1 
 
 		 662 aa  347  4e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.513301  normal  0.220367 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1981  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.24 
 
 		 662 aa  345  1e-93  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2044  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.96 
 
 		 662 aa  342  1e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.854186  normal  0.0386059 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1996  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.81 
 
 		 662 aa  341  2e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2086  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.4 
 
 		 538 aa  251  2e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.879766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3815  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.75 
 
 		 539 aa  249  2e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.583014  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5751  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.75 
 
 		 539 aa  249  2e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4553  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.75 
 
 		 539 aa  249  2e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.940882 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6549  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.52 
 
 		 539 aa  246  8e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.374556 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6818  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.2 
 
 		 533 aa  243  5e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.242551 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0719  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32 
 
 		 536 aa  242  2e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.407783 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0789  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.8 
 
 		 540 aa  241  2e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.211025  normal  0.372024 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3801  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.63 
 
 		 545 aa  242  2e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.382943 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0771  putative transmembrane dehydrogenase (large subunit) oxidoreductase protein  31.91 
 
 		 539 aa  238  2e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0952307  normal  0.0474982 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1415  hypothetical protein  32.21 
 
 		 537 aa  238  2e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2589  glucose dehydrogenase  31.88 
 
 		 537 aa  234  5e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1434  glucose dehydrogenase, alpha subunit  31.88 
 
 		 537 aa  234  5e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1349  glucose dehydrogenase, alpha subunit  31.88 
 
 		 537 aa  234  5e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1245  hypothetical protein  31.55 
 
 		 537 aa  233  6e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.904528  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0216  hypothetical protein  31.55 
 
 		 537 aa  233  6e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0489  hypothetical protein  31.55 
 
 		 537 aa  233  6e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.143088  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1083  hypothetical protein  31.55 
 
 		 537 aa  233  6e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0832661  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3978  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.2 
 
 		 539 aa  229  1e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.500166  normal  0.0737697 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4442  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.27 
 
 		 539 aa  228  2e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.795175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1293  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.81 
 
 		 539 aa  227  6e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.898836  normal  0.776794 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4094  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.62 
 
 		 539 aa  227  6e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2333  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.99 
 
 		 534 aa  225  2e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000292297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3758  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.65 
 
 		 533 aa  224  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4610  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.65 
 
 		 533 aa  224  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0233056 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5694  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.65 
 
 		 533 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00839978 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1808  putative dehydrogenase subunit  29.28 
 
 		 551 aa  219  7.999999999999999e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000111783  hitchhiker  0.0000501686 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4263  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.73 
 
 		 544 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.157361  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1160  putative glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.45 
 
 		 552 aa  206  1e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7345  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.18 
 
 		 550 aa  203  9e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.421505  normal  0.897172 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1871  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.97 
 
 		 545 aa  149  1.0000000000000001e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.176173  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0165  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.93 
 
 		 531 aa  148  4.0000000000000006e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2378  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.84 
 
 		 533 aa  146  1e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1771  GMC oxidoreductase  24 
 
 		 539 aa  122  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0767108 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0464  oxidoreductase, putative  23.5 
 
 		 573 aa  108  2e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0439  oxidoreductase, putative  23.5 
 
 		 573 aa  108  4e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.483432  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2686  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.8 
 
 		 561 aa  107  6e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.50945  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5509  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.99 
 
 		 556 aa  106  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0807117  normal  0.364058 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3694  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.64 
 
 		 566 aa  106  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.257564  normal  0.232243 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1632  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.25 
 
 		 560 aa  105  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3053  putative oxidoreductase  23.88 
 
 		 528 aa  104  4e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1064  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.22 
 
 		 525 aa  104  5e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.113781 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6279  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.61 
 
 		 556 aa  104  5e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00998076 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6565  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.42 
 
 		 526 aa  104  6e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.417903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5469  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  22.79 
 
 		 526 aa  103  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3164  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.23 
 
 		 563 aa  102  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.115784  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2017  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.39 
 
 		 581 aa  101  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.422222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2930  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.76 
 
 		 527 aa  101  4e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0259797  normal  0.914708 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0109  hypothetical protein  24.07 
 
 		 573 aa  100  9e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1208  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.73 
 
 		 559 aa  100  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.397312  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4670  choline dehydrogenase-like flavoprotein  24.04 
 
 		 478 aa  99  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0703924  normal  0.59002 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2609  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.38 
 
 		 578 aa  99.4  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00973308  normal  0.475535 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2658  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.14 
 
 		 553 aa  98.6  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2179  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  25.05 
 
 		 549 aa  98.6  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0728  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.4 
 
 		 518 aa  98.2  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.568898  normal  0.0737373 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5806  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.77 
 
 		 570 aa  98.2  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.10388  normal  0.882961 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0819  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.48 
 
 		 579 aa  97.4  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.157641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0230  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.68 
 
 		 579 aa  97.4  6e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.118413  normal  0.242955 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3718  hypothetical protein  23.75 
 
 		 483 aa  95.9  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7243  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.5 
 
 		 547 aa  95.5  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0367  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.94 
 
 		 565 aa  95.5  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6563  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.14 
 
 		 569 aa  95.1  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0955213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2705  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.39 
 
 		 522 aa  95.5  3e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.815552  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3452  hypothetical protein  23.75 
 
 		 480 aa  95.5  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0700524  normal  0.443587 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0788  GMC oxidoreductase  23.03 
 
 		 563 aa  95.1  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.310504  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0418  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.89 
 
 		 573 aa  94.4  5e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2120  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  23.28 
 
 		 522 aa  94.4  6e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0950  putative glucose dehydrogenase  23.08 
 
 		 563 aa  94.4  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.263554  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2534  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  23.28 
 
 		 522 aa  94.4  6e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0776  GMC oxidoreductase  23.08 
 
 		 563 aa  94.4  6e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1288  putative dehydrogenase  23.24 
 
 		 547 aa  94  8e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.478643 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0154  2-keto-gluconate dehydrogenase subunit-like  23.31 
 
 		 475 aa  93.6  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2790  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  23.92 
 
 		 578 aa  92.4  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3248  hypothetical protein  23.54 
 
 		 480 aa  91.7  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.713925  normal  0.212703 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1914  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.82 
 
 		 553 aa  91.3  5e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.33952  normal  0.193822 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1042  glucose-methanol-choline oxidoreductase  21.71 
 
 		 561 aa  90.9  5e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.535763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0419  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.51 
 
 		 563 aa  90.9  6e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1894  glucose-methanol-choline oxidoreductase  21.33 
 
 		 562 aa  90.9  7e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.474294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4690  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.68 
 
 		 570 aa  90.5  7e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.02417 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2474  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.05 
 
 		 566 aa  90.5  9e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.826754 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4194  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.81 
 
 		 548 aa  90.1  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4480  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.44 
 
 		 527 aa  90.1  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.36342 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3360  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.63 
 
 		 545 aa  89.4  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0587927 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6389  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.35 
 
 		 547 aa  89.4  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2494  glucose-methanol-choline oxidoreductase  21.36 
 
 		 572 aa  89  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.314394 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1314  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  23.96 
 
 		 589 aa  88.2  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4678  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.51 
 
 		 545 aa  87.4  7e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0467  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.61 
 
 		 548 aa  87  8e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>