259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1314 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_1314  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  100 
 
 		 589 aa  1216    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0464  oxidoreductase, putative  49.91 
 
 		 573 aa  591  1e-167  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0439  oxidoreductase, putative  49.74 
 
 		 573 aa  590  1e-167  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.483432  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2015  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  49.23 
 
 		 592 aa  588  1e-166  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0874518 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4244  putative gluconate dehydrogenase  50.45 
 
 		 588 aa  584  1.0000000000000001e-165  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.659751  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0230  putative dehydrogenase  47.95 
 
 		 591 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2503  glucose-methanol-choline oxidoreductase  47.8 
 
 		 591 aa  566  1e-160  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.809457  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5399  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  47.02 
 
 		 586 aa  565  1e-160  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.690827  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3895  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  49.32 
 
 		 594 aa  558  1e-158  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.241761 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4095  putative gluconate dehydrogenase  48.38 
 
 		 594 aa  554  1e-156  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6210  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  48.29 
 
 		 594 aa  550  1e-155  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.1943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1598  glucose-methanol-choline oxidoreductase  45.41 
 
 		 586 aa  546  1e-154  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.26779 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4381  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  45.78 
 
 		 592 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0227  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  45.35 
 
 		 592 aa  538  1e-151  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3646  glucose-methanol-choline oxidoreductase  45.61 
 
 		 592 aa  533  1e-150  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4120  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  45.61 
 
 		 592 aa  533  1e-150  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3383  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  45.62 
 
 		 594 aa  530  1e-149  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.597308 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0085  glucose-methanol-choline oxidoreductase  45.96 
 
 		 594 aa  529  1e-149  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2376  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  45.45 
 
 		 594 aa  529  1e-149  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.406153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4639  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  44.52 
 
 		 592 aa  529  1e-149  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3293  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  44.93 
 
 		 592 aa  526  1e-148  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.517523  normal  0.855973 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1793  glucose-methanol-choline oxidoreductase  44.93 
 
 		 592 aa  528  1e-148  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.345818  normal  0.124135 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4142  glucose-methanol-choline oxidoreductase  44.93 
 
 		 592 aa  526  1e-148  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00267636  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35290  gluconate dehydrogenase  45.01 
 
 		 591 aa  527  1e-148  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0685157  normal  0.495861 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4224  glucose-methanol-choline oxidoreductase  44.93 
 
 		 592 aa  526  1e-148  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.477307  normal  0.178232 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2975  gluconate dehydrogenase  45.01 
 
 		 591 aa  527  1e-148  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.299078  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3608  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  44.48 
 
 		 589 aa  527  1e-148  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0579552  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33650  dehydrogenase flavoprotein subunit  43.9 
 
 		 596 aa  525  1e-147  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2137  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  44.43 
 
 		 593 aa  523  1e-147  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.610724 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00900  gluconate dehydrogenase flavoprotein subunit  44.33 
 
 		 591 aa  523  1e-147  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.687718  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2562  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  45.29 
 
 		 594 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0936094 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2565  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  44.95 
 
 		 594 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.339235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1164  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  42.61 
 
 		 594 aa  485  1e-136  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4202  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  42.83 
 
 		 590 aa  484  1e-135  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.494803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2658  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.93 
 
 		 553 aa  253  7e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1858  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.86 
 
 		 755 aa  233  6e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.184483  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1923  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.64 
 
 		 550 aa  189  2e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1737  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.34 
 
 		 573 aa  184  6e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.170374  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1401  putative 2-keto-gluconate dehydrogenase  28.75 
 
 		 528 aa  178  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0383061  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2722  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.09 
 
 		 528 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0945  putative 2-keto-gluconate dehydrogenase  29.32 
 
 		 522 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4480  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.04 
 
 		 527 aa  174  5.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.36342 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2179  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  29.1 
 
 		 549 aa  172  2e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2999  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  26.04 
 
 		 561 aa  172  2e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.634456  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2120  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  28.22 
 
 		 522 aa  169  1e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1738  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.83 
 
 		 572 aa  169  1e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0256675  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2534  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  28.22 
 
 		 522 aa  169  1e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3542  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.25 
 
 		 563 aa  168  2.9999999999999998e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0109  hypothetical protein  26.21 
 
 		 573 aa  168  2.9999999999999998e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2930  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.74 
 
 		 527 aa  168  2.9999999999999998e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0259797  normal  0.914708 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3645  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.35 
 
 		 567 aa  167  5e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.948951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2705  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.51 
 
 		 522 aa  167  5.9999999999999996e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.815552  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1967  hypothetical protein  25.5 
 
 		 558 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.929106  hitchhiker  0.0000146847 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1033  putative oxidoreductase chain  26.37 
 
 		 574 aa  165  3e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0731446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3202  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  29.32 
 
 		 522 aa  164  4.0000000000000004e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0960335 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5620  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.49 
 
 		 579 aa  162  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2474  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.37 
 
 		 566 aa  162  2e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.826754 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4690  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.12 
 
 		 570 aa  162  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.02417 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4710  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.29 
 
 		 526 aa  162  2e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.467902  normal  0.0104534 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4714  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.92 
 
 		 570 aa  161  3e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.688275  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1042  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.68 
 
 		 561 aa  161  3e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.535763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1641  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.42 
 
 		 522 aa  161  3e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.235132 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0060  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.39 
 
 		 523 aa  161  4e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3694  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.41 
 
 		 566 aa  160  5e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.257564  normal  0.232243 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4606  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.31 
 
 		 582 aa  160  5e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.159853 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3053  putative oxidoreductase  27.16 
 
 		 528 aa  160  7e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5253  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.37 
 
 		 522 aa  159  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.789001  decreased coverage  0.00462633 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5416  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.84 
 
 		 565 aa  159  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.133389 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0330  oxidoreductase  26.19 
 
 		 570 aa  158  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0122567 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0230  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.59 
 
 		 579 aa  159  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.118413  normal  0.242955 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2017  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.4 
 
 		 581 aa  157  4e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.422222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00434  oxidoreductase  26.92 
 
 		 561 aa  157  4e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2072  putative Gluconate 2-dehydrogenase flavoprotein  28.85 
 
 		 523 aa  157  6e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1705  oxidoreductase  28.37 
 
 		 522 aa  157  6e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.318945 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0819  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.64 
 
 		 579 aa  157  6e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.157641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5806  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.9 
 
 		 570 aa  156  9e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.10388  normal  0.882961 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2609  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.49 
 
 		 578 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00973308  normal  0.475535 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2790  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  28.2 
 
 		 578 aa  154  5e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2686  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.59 
 
 		 561 aa  154  5.9999999999999996e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.50945  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3371  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.66 
 
 		 698 aa  153  8.999999999999999e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.261547  normal  0.556381 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3164  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.94 
 
 		 563 aa  150  7e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.115784  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1371  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.4 
 
 		 584 aa  148  3e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.122275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5415  choline dehydrogenase  25.04 
 
 		 565 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.188636 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1871  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.06 
 
 		 545 aa  146  1e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.176173  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1891  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.08 
 
 		 570 aa  146  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.969458 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2494  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.46 
 
 		 572 aa  145  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.314394 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5079  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.32 
 
 		 569 aa  145  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.623805 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0367  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.22 
 
 		 565 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1632  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.44 
 
 		 560 aa  141  3e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1208  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.01 
 
 		 559 aa  140  4.999999999999999e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.397312  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1894  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.91 
 
 		 562 aa  140  7e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.474294  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01675  putative dehydrogenase oxidoreductase protein  26.06 
 
 		 647 aa  139  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.871194 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0419  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.23 
 
 		 563 aa  139  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2982  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.16 
 
 		 572 aa  139  1e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6563  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.59 
 
 		 569 aa  139  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0955213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5724  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.51 
 
 		 573 aa  139  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.526246 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0728  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.61 
 
 		 518 aa  138  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.568898  normal  0.0737373 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5469  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  27.5 
 
 		 526 aa  136  9e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0665  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.41 
 
 		 534 aa  133  6.999999999999999e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0454  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.05 
 
 		 570 aa  133  7.999999999999999e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.219134  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>