More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2179 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_2179  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  100 
 
 
549 aa  1134    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3371  glucose-methanol-choline oxidoreductase  43.61 
 
 
698 aa  395  1e-108  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.261547  normal  0.556381 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4426  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42.23 
 
 
579 aa  355  2e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2658  glucose-methanol-choline oxidoreductase  37.31 
 
 
553 aa  333  5e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1923  glucose-methanol-choline oxidoreductase  37.09 
 
 
550 aa  296  5e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2999  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  31.59 
 
 
561 aa  259  1e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.634456  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0109  hypothetical protein  30.65 
 
 
573 aa  256  6e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2930  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.08 
 
 
527 aa  253  6e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0259797  normal  0.914708 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3053  putative oxidoreductase  32.65 
 
 
528 aa  249  1e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3542  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.15 
 
 
563 aa  243  9e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0945  putative 2-keto-gluconate dehydrogenase  31.02 
 
 
522 aa  238  2e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2982  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.82 
 
 
572 aa  230  6e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3360  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.58 
 
 
545 aa  225  2e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0587927 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1858  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.8 
 
 
755 aa  225  2e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.184483  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1705  oxidoreductase  31.11 
 
 
522 aa  216  8e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.318945 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2705  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.02 
 
 
522 aa  215  1.9999999999999998e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.815552  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1801  GMC oxidoreductase family protein  31.02 
 
 
549 aa  213  5.999999999999999e-54  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000289048  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4710  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.34 
 
 
526 aa  211  2e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.467902  normal  0.0104534 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2534  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  29.51 
 
 
522 aa  211  3e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2120  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  29.51 
 
 
522 aa  211  3e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4381  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  29.67 
 
 
592 aa  209  8e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5253  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.22 
 
 
522 aa  209  2e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.789001  decreased coverage  0.00462633 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4480  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.35 
 
 
527 aa  208  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.36342 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0060  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.66 
 
 
523 aa  208  2e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3646  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.45 
 
 
592 aa  207  3e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4120  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  29.45 
 
 
592 aa  207  3e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2722  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.15 
 
 
528 aa  206  9e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1793  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.28 
 
 
592 aa  206  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.345818  normal  0.124135 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3293  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  29.12 
 
 
592 aa  205  1e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.517523  normal  0.855973 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4142  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.12 
 
 
592 aa  205  1e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00267636  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4224  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.12 
 
 
592 aa  205  1e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.477307  normal  0.178232 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3202  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  30.7 
 
 
522 aa  206  1e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0960335 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1401  putative 2-keto-gluconate dehydrogenase  29.74 
 
 
528 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0383061  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0665  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.18 
 
 
534 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1871  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.27 
 
 
545 aa  201  1.9999999999999998e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.176173  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4639  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  28.12 
 
 
592 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2376  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  28.48 
 
 
594 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.406153  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00900  gluconate dehydrogenase flavoprotein subunit  28.34 
 
 
591 aa  197  4.0000000000000005e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.687718  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1641  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.47 
 
 
522 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.235132 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1914  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.39 
 
 
553 aa  197  6e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.33952  normal  0.193822 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3383  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  27.96 
 
 
594 aa  195  2e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.597308 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1164  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  28.6 
 
 
594 aa  194  4e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2565  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  27.09 
 
 
594 aa  193  5e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.339235  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2562  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  28.26 
 
 
594 aa  194  5e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0936094 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2975  gluconate dehydrogenase  27.53 
 
 
591 aa  192  9e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.299078  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35290  gluconate dehydrogenase  27.53 
 
 
591 aa  192  9e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0685157  normal  0.495861 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2072  putative Gluconate 2-dehydrogenase flavoprotein  28.92 
 
 
523 aa  191  4e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0165  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.02 
 
 
531 aa  190  5e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1363  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.28 
 
 
511 aa  190  5e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1064  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.53 
 
 
525 aa  189  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.113781 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2015  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  27.03 
 
 
592 aa  189  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0874518 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2503  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.45 
 
 
591 aa  188  3e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.809457  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5399  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  27.03 
 
 
586 aa  186  7e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.690827  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2378  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.03 
 
 
533 aa  186  7e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0728  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.39 
 
 
518 aa  186  8e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.568898  normal  0.0737373 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4202  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  29.54 
 
 
590 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.494803  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2137  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  27.01 
 
 
593 aa  186  1.0000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.610724 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0230  putative dehydrogenase  28.71 
 
 
591 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0085  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.64 
 
 
594 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0464  oxidoreductase, putative  27.86 
 
 
573 aa  184  3e-45  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0439  oxidoreductase, putative  27.74 
 
 
573 aa  184  3e-45  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.483432  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1738  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.42 
 
 
572 aa  184  4.0000000000000006e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0256675  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0819  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.57 
 
 
579 aa  183  9.000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.157641  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3694  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.45 
 
 
566 aa  181  2.9999999999999997e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.257564  normal  0.232243 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3645  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.02 
 
 
567 aa  181  4e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.948951  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3164  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.13 
 
 
563 aa  180  4.999999999999999e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.115784  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33650  dehydrogenase flavoprotein subunit  27.9 
 
 
596 aa  180  5.999999999999999e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1314  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  29.24 
 
 
589 aa  179  8e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1042  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.33 
 
 
561 aa  178  3e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.535763  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1288  putative dehydrogenase  31.15 
 
 
547 aa  178  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.478643 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2474  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.5 
 
 
566 aa  178  3e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.826754 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4095  putative gluconate dehydrogenase  26.4 
 
 
594 aa  177  4e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5806  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.11 
 
 
570 aa  177  4e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.10388  normal  0.882961 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6389  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.01 
 
 
547 aa  176  7e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1737  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.55 
 
 
573 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.170374  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6967  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.4 
 
 
534 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0227  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  26.5 
 
 
592 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7243  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.48 
 
 
547 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146808  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1520  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.07 
 
 
534 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0418  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.3 
 
 
573 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6309  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.07 
 
 
534 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.448971  normal  0.597714 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6210  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  26.17 
 
 
594 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.1943  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3683  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.58 
 
 
556 aa  172  9e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.642564  normal  0.0444916 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3895  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  28.6 
 
 
594 aa  173  9e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.241761 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4263  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.61 
 
 
544 aa  172  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.157361  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1598  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.58 
 
 
586 aa  171  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.26779 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6279  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.15 
 
 
556 aa  171  4e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00998076 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4194  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.64 
 
 
548 aa  170  6e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1967  hypothetical protein  27.44 
 
 
558 aa  170  7e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.929106  hitchhiker  0.0000146847 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2085  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.35 
 
 
573 aa  169  8e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.024834 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5509  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.96 
 
 
556 aa  169  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0807117  normal  0.364058 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2086  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28 
 
 
538 aa  169  1e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.879766  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6563  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.97 
 
 
569 aa  169  1e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0955213  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4037  hypothetical protein  28.8 
 
 
549 aa  169  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.677701 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1572  dehydrogenase subunit-like protein  29.68 
 
 
528 aa  169  2e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.849895  normal  0.707104 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6565  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.96 
 
 
526 aa  168  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.417903  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5469  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  30.06 
 
 
526 aa  167  4e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5416  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.94 
 
 
565 aa  167  6.9999999999999995e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.133389 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0467  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.65 
 
 
548 aa  166  1.0000000000000001e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0950  putative glucose dehydrogenase  31.21 
 
 
563 aa  164  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.263554  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>