92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3621 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_3621  UDP-galactopyranose mutase  100 
 
 
372 aa  774    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.585126  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2020  UDP-galactopyranose mutase  69.81 
 
 
814 aa  553  1e-156  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.843123  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2530  UDP-galactopyranose mutase  70.64 
 
 
399 aa  546  1e-154  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0516  UDP-galactopyranose mutase  68.42 
 
 
383 aa  541  1e-153  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0049322  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4165  UDP-galactopyranose mutase  66.11 
 
 
373 aa  533  1e-150  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.367331 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1194  UDP-galactopyranose mutase  67.57 
 
 
379 aa  526  1e-148  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.886744  normal  0.725852 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0088  UDP-galactopyranose mutase  68.06 
 
 
390 aa  518  1e-146  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.616523  normal  0.0498418 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2341  UDP-galactopyranose mutase  65.15 
 
 
398 aa  513  1e-144  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0445173  normal  0.0301397 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1305  UDP-galactopyranose mutase  66.67 
 
 
377 aa  511  1e-144  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.36953  normal  0.672952 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2702  UDP-galactopyranose mutase  63.71 
 
 
393 aa  488  1e-137  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.601095  normal  0.0699705 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2898  UDP-galactopyranose mutase  65.47 
 
 
393 aa  490  1e-137  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373026  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5685  UDP-galactopyranose mutase  62.73 
 
 
783 aa  480  1e-134  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.649144  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0851  UDP-galactopyranose mutase  62.26 
 
 
363 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.435235  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5610  UDP-galactopyranose mutase  60.66 
 
 
783 aa  444  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00502091 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3903  UDP-galactopyranose mutase  56.59 
 
 
369 aa  416  9.999999999999999e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2888  UDP-galactopyranose mutase  50.28 
 
 
364 aa  406  1.0000000000000001e-112  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.656694  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2744  UDP-galactopyranose mutase  52.43 
 
 
373 aa  388  1e-107  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3214  UDP-galactopyranose mutase  49.74 
 
 
386 aa  380  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2024  UDP-galactopyranose mutase  50.81 
 
 
375 aa  376  1e-103  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5440  UDP-galactopyranose mutase  49.18 
 
 
369 aa  360  2e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.214475 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1566  UDP-galactopyranose mutase  46.17 
 
 
382 aa  358  9.999999999999999e-98  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00174985  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4106  UDP-galactopyranose mutase  46.76 
 
 
376 aa  343  2e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4014  UDP-galactopyranose mutase  46.76 
 
 
376 aa  344  2e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3069  UDP-galactopyranose mutase  42.04 
 
 
391 aa  329  4e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.998088  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1454  UDP-galactopyranose mutase  41.11 
 
 
370 aa  314  1.9999999999999998e-84  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1727  UDP-galactopyranose mutase  42.93 
 
 
404 aa  313  3.9999999999999997e-84  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0324536  normal  0.111313 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01310  UDP-galactopyranose mutase  42.16 
 
 
415 aa  295  1e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.18508  normal  0.915549 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0128  UDP-galactopyranose mutase  42.16 
 
 
394 aa  292  5e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4319  UDP-galactopyranose mutase  43.01 
 
 
395 aa  292  7e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.591076  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0635  UDP-galactopyranose mutase  41.48 
 
 
389 aa  290  4e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2265  UDP-galactopyranose mutase  42.78 
 
 
384 aa  287  2e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0647  UDP-galactopyranose mutase  39.74 
 
 
400 aa  286  2.9999999999999996e-76  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000447576  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0842  UDP-galactopyranose mutase  41.55 
 
 
383 aa  285  8e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000837318 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3019  UDP-galactopyranose mutase  40.7 
 
 
381 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.195146  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0779  UDP-galactopyranose mutase  41.27 
 
 
383 aa  283  4.0000000000000003e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.110856  normal  0.152549 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0876  UDP-galactopyranose mutase  41 
 
 
383 aa  281  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.1789 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4000  hypothetical protein  42.3 
 
 
383 aa  280  4e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_4114  predicted protein  40.57 
 
 
391 aa  279  6e-74  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.718701  normal  0.169117 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0608  UDP-galactopyranose mutase  39.66 
 
 
381 aa  276  5e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1171  UDP-galactopyranose mutase  39.89 
 
 
395 aa  273  2.0000000000000002e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0707003  normal  0.958151 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1401  UDP-galactopyranose mutase  38.56 
 
 
395 aa  273  3e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0717  UDP-galactopyranose mutase  42.66 
 
 
365 aa  272  6e-72  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3361  UDP-galactopyranose mutase  40.33 
 
 
368 aa  272  9e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.509275  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5059  UDP-galactopyranose mutase  40.97 
 
 
367 aa  272  9e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2533  UDP-galactopyranose mutase  39.26 
 
 
381 aa  268  8e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2424  UDP-galactopyranose mutase  40 
 
 
409 aa  268  1e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0628072 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5108  UDP-galactopyranose mutase  38.73 
 
 
399 aa  266  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.302478 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5401  UDP-galactopyranose mutase  38.73 
 
 
399 aa  266  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.379754 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1579  UDP-galactopyranose mutase  39.1 
 
 
392 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2040  UDP-galactopyranose mutase  39.73 
 
 
366 aa  266  4e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00394808  normal  0.0793604 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0161  UDP-galactopyranose mutase  39.04 
 
 
402 aa  266  4e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5020  UDP-galactopyranose mutase  38.73 
 
 
428 aa  266  5e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1159  UDP-galactopyranose mutase  39.79 
 
 
425 aa  266  5.999999999999999e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.183925  normal  0.0936925 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2694  UDP-galactopyranose mutase  39.73 
 
 
395 aa  265  8e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.42371  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1556  UDP-galactopyranose mutase  38.94 
 
 
383 aa  264  2e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1621  UDP-galactopyranose mutase  38.98 
 
 
367 aa  263  3e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0464676  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42228  predicted protein  39.74 
 
 
460 aa  263  4e-69  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3888  UDP-galactopyranose mutase  38.77 
 
 
395 aa  263  4e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00485328 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3894  UDP-galactopyranose mutase  37.47 
 
 
391 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0204  UDP-galactopyranose mutase  39.11 
 
 
398 aa  262  8e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.255316  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13843  UDP-galactopyranose mutase glf  37.5 
 
 
399 aa  261  8.999999999999999e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.286421 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3088  UDP-galactopyranose mutase  39.02 
 
 
367 aa  261  1e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.552299  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08860  UDP-galactopyranose mutase  38.38 
 
 
395 aa  260  2e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.271109 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20850  UDP-galactopyranose mutase  38.54 
 
 
386 aa  260  3e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0219  UDP-galactopyranose mutase  38.27 
 
 
380 aa  259  4e-68  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5650  UDP-galactopyranose mutase  38.3 
 
 
413 aa  259  4e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.463461  normal  0.994274 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1076  UDP-galactopyranose mutase  39.84 
 
 
370 aa  259  5.0000000000000005e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1143  UDP-galactopyranose mutase  38.95 
 
 
372 aa  259  6e-68  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000571156  hitchhiker  0.00000314352 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5043  UDP-galactopyranose mutase  39.61 
 
 
381 aa  258  1e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1637  UDP-galactopyranose mutase  37.87 
 
 
383 aa  258  1e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.56586 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1179  UDP-galactopyranose mutase  36.64 
 
 
413 aa  255  9e-67  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2575  UDP-galactopyranose mutase  38.01 
 
 
395 aa  254  2.0000000000000002e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1402  UDP-galactopyranose mutase  38.24 
 
 
396 aa  254  2.0000000000000002e-66  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4186  UDP-galactopyranose mutase  40.11 
 
 
399 aa  253  3e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1741  UDP-galactopyranose mutase  38.21 
 
 
391 aa  252  6e-66  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14770  UDP-galactopyranose mutase  38.29 
 
 
370 aa  251  2e-65  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0269497 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1374  UDP-galactopyranose mutase  38.98 
 
 
372 aa  249  5e-65  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08330  UDP-galactopyranose mutase  38.12 
 
 
371 aa  235  8e-61  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0799137  normal  0.20676 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14591  UDP-galactopyranose mutase  26.32 
 
 
394 aa  99  1e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1602  UDP-galactopyranose mutase  24.74 
 
 
369 aa  76.6  0.0000000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0347601  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0902  hypothetical protein  26.2 
 
 
465 aa  51.6  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.787196  normal  0.0359011 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1072  hypothetical protein  26.9 
 
 
421 aa  49.7  0.00009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00830956 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0064  hypothetical protein  23.47 
 
 
549 aa  48.9  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0862  UDP-galactopyranose mutase  25.82 
 
 
424 aa  47.4  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.804118  normal  0.0706079 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2036  amine oxidase, flavin-containing  25.57 
 
 
459 aa  46.2  0.0008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3582  hypothetical protein  27.32 
 
 
463 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.932394  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3587  hypothetical protein  27.32 
 
 
463 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.584997  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3655  hypothetical protein  27.32 
 
 
463 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0374  hypothetical protein  25.44 
 
 
500 aa  45.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.10021  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2861  hypothetical protein  26.16 
 
 
511 aa  45.4  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.245537 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1512  amine oxidase, flavin-containing  24.6 
 
 
454 aa  43.5  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.118585  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0065  protoporphyrinogen oxidase  25 
 
 
459 aa  43.1  0.007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>