161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_1621 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_1621  UDP-galactopyranose mutase  100 
 
 		 367 aa  759    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0464676  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2040  UDP-galactopyranose mutase  72.1 
 
 		 366 aa  548  1e-155  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00394808  normal  0.0793604 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5059  UDP-galactopyranose mutase  66.57 
 
 		 367 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3361  UDP-galactopyranose mutase  64.72 
 
 		 368 aa  507  9.999999999999999e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.509275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1076  UDP-galactopyranose mutase  60.66 
 
 		 370 aa  494  9.999999999999999e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1143  UDP-galactopyranose mutase  61.92 
 
 		 372 aa  483  1e-135  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000571156  hitchhiker  0.00000314352 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1374  UDP-galactopyranose mutase  58.27 
 
 		 372 aa  464  9.999999999999999e-131  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14770  UDP-galactopyranose mutase  57.3 
 
 		 370 aa  450  1e-125  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0269497 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0219  UDP-galactopyranose mutase  58.24 
 
 		 380 aa  442  1e-123  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08330  UDP-galactopyranose mutase  58.22 
 
 		 371 aa  440  9.999999999999999e-123  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0799137  normal  0.20676 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0717  UDP-galactopyranose mutase  57.42 
 
 		 365 aa  441  9.999999999999999e-123  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1741  UDP-galactopyranose mutase  57.53 
 
 		 391 aa  432  1e-120  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1402  UDP-galactopyranose mutase  54.79 
 
 		 396 aa  416  9.999999999999999e-116  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0204  UDP-galactopyranose mutase  44.33 
 
 		 398 aa  332  7.000000000000001e-90  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.255316  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2575  UDP-galactopyranose mutase  43.5 
 
 		 395 aa  331  1e-89  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08860  UDP-galactopyranose mutase  43.5 
 
 		 395 aa  331  1e-89  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.271109 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4319  UDP-galactopyranose mutase  44.77 
 
 		 395 aa  330  2e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.591076  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0635  UDP-galactopyranose mutase  45.41 
 
 		 389 aa  330  2e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01310  UDP-galactopyranose mutase  45.45 
 
 		 415 aa  329  4e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.18508  normal  0.915549 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20850  UDP-galactopyranose mutase  43.5 
 
 		 386 aa  328  7e-89  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0161  UDP-galactopyranose mutase  45.5 
 
 		 402 aa  325  5e-88  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2694  UDP-galactopyranose mutase  43.05 
 
 		 395 aa  319  5e-86  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.42371  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0128  UDP-galactopyranose mutase  44.3 
 
 		 394 aa  318  7e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1401  UDP-galactopyranose mutase  43.85 
 
 		 395 aa  318  1e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13843  UDP-galactopyranose mutase glf  43.54 
 
 		 399 aa  317  1e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.286421 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2424  UDP-galactopyranose mutase  42.09 
 
 		 409 aa  316  4e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0628072 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5108  UDP-galactopyranose mutase  43.39 
 
 		 399 aa  315  8e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.302478 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5401  UDP-galactopyranose mutase  43.39 
 
 		 399 aa  315  8e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.379754 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5020  UDP-galactopyranose mutase  43.39 
 
 		 428 aa  315  9.999999999999999e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1179  UDP-galactopyranose mutase  41.03 
 
 		 413 aa  313  2.9999999999999996e-84  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1159  UDP-galactopyranose mutase  43.65 
 
 		 425 aa  313  3.9999999999999997e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.183925  normal  0.0936925 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3888  UDP-galactopyranose mutase  42.67 
 
 		 395 aa  311  1e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00485328 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2533  UDP-galactopyranose mutase  40.37 
 
 		 381 aa  311  1e-83  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5650  UDP-galactopyranose mutase  42.33 
 
 		 413 aa  310  2e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.463461  normal  0.994274 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1637  UDP-galactopyranose mutase  42.71 
 
 		 383 aa  310  2.9999999999999997e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.56586 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1579  UDP-galactopyranose mutase  43.13 
 
 		 392 aa  309  4e-83  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1171  UDP-galactopyranose mutase  41.38 
 
 		 395 aa  307  2.0000000000000002e-82  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0707003  normal  0.958151 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0608  UDP-galactopyranose mutase  44.72 
 
 		 381 aa  301  1e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3088  UDP-galactopyranose mutase  44.35 
 
 		 367 aa  300  3e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.552299  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1556  UDP-galactopyranose mutase  44.41 
 
 		 383 aa  299  6e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3894  UDP-galactopyranose mutase  43.96 
 
 		 391 aa  288  7e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4186  UDP-galactopyranose mutase  42.02 
 
 		 399 aa  288  9e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3019  UDP-galactopyranose mutase  44.96 
 
 		 381 aa  288  1e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.195146  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1194  UDP-galactopyranose mutase  42.11 
 
 		 379 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.886744  normal  0.725852 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5043  UDP-galactopyranose mutase  39.89 
 
 		 381 aa  283  2.0000000000000002e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4000  hypothetical protein  41.74 
 
 		 383 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0779  UDP-galactopyranose mutase  39.83 
 
 		 383 aa  274  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.110856  normal  0.152549 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2020  UDP-galactopyranose mutase  39.4 
 
 		 814 aa  273  3e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.843123  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2898  UDP-galactopyranose mutase  39.34 
 
 		 393 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373026  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0876  UDP-galactopyranose mutase  39.55 
 
 		 383 aa  272  7e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.1789 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0842  UDP-galactopyranose mutase  39.28 
 
 		 383 aa  271  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000837318 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2702  UDP-galactopyranose mutase  39.06 
 
 		 393 aa  267  2e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.601095  normal  0.0699705 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2265  UDP-galactopyranose mutase  39.62 
 
 		 384 aa  267  2e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0851  UDP-galactopyranose mutase  40.61 
 
 		 363 aa  264  2e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.435235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4165  UDP-galactopyranose mutase  39.41 
 
 		 373 aa  263  3e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.367331 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3621  UDP-galactopyranose mutase  38.98 
 
 		 372 aa  263  3e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.585126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1454  UDP-galactopyranose mutase  41.1 
 
 		 370 aa  262  6e-69  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2341  UDP-galactopyranose mutase  37.85 
 
 		 398 aa  261  2e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0445173  normal  0.0301397 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0088  UDP-galactopyranose mutase  38.69 
 
 		 390 aa  261  2e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.616523  normal  0.0498418 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2530  UDP-galactopyranose mutase  39.45 
 
 		 399 aa  260  3e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0516  UDP-galactopyranose mutase  40.55 
 
 		 383 aa  260  3e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0049322  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3214  UDP-galactopyranose mutase  39.74 
 
 		 386 aa  259  5.0000000000000005e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5685  UDP-galactopyranose mutase  38.54 
 
 		 783 aa  259  6e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.649144  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4106  UDP-galactopyranose mutase  40.76 
 
 		 376 aa  258  9e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4014  UDP-galactopyranose mutase  40.76 
 
 		 376 aa  257  2e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1305  UDP-galactopyranose mutase  37.87 
 
 		 377 aa  249  4e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.36953  normal  0.672952 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2744  UDP-galactopyranose mutase  37.6 
 
 		 373 aa  246  6e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3903  UDP-galactopyranose mutase  37.11 
 
 		 369 aa  241  1e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3069  UDP-galactopyranose mutase  35.98 
 
 		 391 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.998088  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1566  UDP-galactopyranose mutase  36.7 
 
 		 382 aa  239  5e-62  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00174985  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5610  UDP-galactopyranose mutase  37.74 
 
 		 783 aa  237  3e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00502091 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_4114  predicted protein  35.99 
 
 		 391 aa  235  7e-61  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.718701  normal  0.169117 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2888  UDP-galactopyranose mutase  38.33 
 
 		 364 aa  234  2.0000000000000002e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.656694  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42228  predicted protein  36.9 
 
 		 460 aa  229  6e-59  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5440  UDP-galactopyranose mutase  34.76 
 
 		 369 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.214475 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2024  UDP-galactopyranose mutase  36.16 
 
 		 375 aa  221  1.9999999999999999e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1727  UDP-galactopyranose mutase  34.29 
 
 		 404 aa  209  9e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0324536  normal  0.111313 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0647  UDP-galactopyranose mutase  32.55 
 
 		 400 aa  181  1e-44  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000447576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1602  UDP-galactopyranose mutase  26.53 
 
 		 369 aa  93.2  7e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0347601  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14591  UDP-galactopyranose mutase  25.55 
 
 		 394 aa  65.1  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4465  amine oxidase  31.98 
 
 		 480 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2861  hypothetical protein  25 
 
 		 511 aa  60.5  0.00000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.245537 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4196  amine oxidase  28.57 
 
 		 496 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2036  amine oxidase, flavin-containing  29.12 
 
 		 459 aa  53.9  0.000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3017  hypothetical protein  47.27 
 
 		 484 aa  51.6  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.191221  normal  0.019056 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4574  HI0933-like protein  29.79 
 
 		 359 aa  52  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3374  amine oxidase  27.33 
 
 		 512 aa  50.8  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1866  amine oxidase  32.31 
 
 		 447 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.591896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3185  hypothetical protein  45.45 
 
 		 245 aa  50.4  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29229  hitchhiker  0.00171019 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0065  protoporphyrinogen oxidase  28.57 
 
 		 459 aa  50.4  0.00005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1545  putative flavocytochrome c flavin subunit  40.28 
 
 		 447 aa  49.7  0.00007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2649  hypothetical protein  25.15 
 
 		 498 aa  49.7  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0340038  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4898  hypothetical protein  26.79 
 
 		 494 aa  49.7  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00550747  normal  0.0440629 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0942  amine oxidase  25.12 
 
 		 449 aa  48.9  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.15931  normal  0.877558 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4702  glutathione reductase  37.66 
 
 		 451 aa  48.5  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2043  amine oxidase  41.38 
 
 		 476 aa  48.1  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0112057  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3938  glutathione reductase  37.66 
 
 		 451 aa  48.5  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4054  glutathione reductase  37.66 
 
 		 451 aa  48.5  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2074  amine oxidase  40.35 
 
 		 479 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0121  glutathione reductase  36.36 
 
 		 451 aa  47.8  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.848122  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>