198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3374 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3374  amine oxidase  100 
 
 		 512 aa  1059    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2649  hypothetical protein  70.9 
 
 		 498 aa  734    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0340038  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8013  hypothetical protein  67.62 
 
 		 524 aa  675    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1637  hypothetical protein  64.44 
 
 		 516 aa  648    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.252141 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4898  hypothetical protein  69.06 
 
 		 494 aa  713    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00550747  normal  0.0440629 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3497  amine oxidase  51.08 
 
 		 507 aa  488  1e-137  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.281636  normal  0.0813869 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4196  amine oxidase  49.9 
 
 		 496 aa  479  1e-134  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2861  hypothetical protein  51.64 
 
 		 511 aa  472  1e-132  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.245537 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3095  hypothetical protein  49.13 
 
 		 500 aa  472  1e-132  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2236  hypothetical protein  49.71 
 
 		 500 aa  462  1e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0391032 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0374  hypothetical protein  49.71 
 
 		 500 aa  462  1e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.10021  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4465  amine oxidase  48.21 
 
 		 480 aa  457  1e-127  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2880  hypothetical protein  50.4 
 
 		 511 aa  455  1e-127  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0436694 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0984  amine oxidase  47.14 
 
 		 520 aa  439  9.999999999999999e-123  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0991  hypothetical protein  42.26 
 
 		 519 aa  387  1e-106  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.97338  hitchhiker  0.00393632 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0064  hypothetical protein  40.44 
 
 		 549 aa  382  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0045  hypothetical protein  39.48 
 
 		 472 aa  383  1e-105  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00889429  hitchhiker  0.00142526 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0031  Protoporphyrinogen oxidase-like protein  38.66 
 
 		 1033 aa  352  1e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000538665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2934  hypothetical protein  38.57 
 
 		 538 aa  350  4e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0109  FAD dependent oxidoreductase  38.96 
 
 		 539 aa  328  1.0000000000000001e-88  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1201  hypothetical protein  38.63 
 
 		 537 aa  316  6e-85  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4750  hypothetical protein  37.45 
 
 		 436 aa  276  5e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1706  hypothetical protein  35.58 
 
 		 465 aa  271  2e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.186838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3582  hypothetical protein  37.78 
 
 		 463 aa  268  2e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.932394  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3655  hypothetical protein  37.78 
 
 		 463 aa  268  2e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3587  hypothetical protein  37.58 
 
 		 463 aa  267  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.584997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1418  FAD dependent oxidoreductase  34.65 
 
 		 450 aa  263  4.999999999999999e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.804281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0902  hypothetical protein  26.45 
 
 		 465 aa  171  4e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.787196  normal  0.0359011 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0942  amine oxidase  27.95 
 
 		 449 aa  141  3e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.15931  normal  0.877558 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7546  FAD dependent oxidoreductase  28.69 
 
 		 489 aa  132  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.50279 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1446  amine oxidase  25.67 
 
 		 446 aa  132  2.0000000000000002e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.14723  normal  0.0175327 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0966  UDP-galactopyranose mutase  25.53 
 
 		 447 aa  131  4.0000000000000003e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1076  amine oxidase  27.99 
 
 		 437 aa  127  5e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2036  amine oxidase, flavin-containing  23.73 
 
 		 459 aa  125  1e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0065  protoporphyrinogen oxidase  23.31 
 
 		 459 aa  120  4.9999999999999996e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0121  amine oxidase  26.61 
 
 		 436 aa  117  3e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.406547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8137  Protoporphyrinogen oxidase-like protein  28.42 
 
 		 491 aa  118  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.163406  normal  0.434149 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2305  glycosyl transferase family 2  23.27 
 
 		 722 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0138852  normal  0.273361 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0375  hypothetical protein  26.72 
 
 		 428 aa  117  6.9999999999999995e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.427757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2101  amine oxidase  25 
 
 		 452 aa  114  3e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0204  amine oxidase  27.06 
 
 		 435 aa  114  6e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.420312  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2937  amine oxidase  28.69 
 
 		 448 aa  112  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2150  amine oxidase  23.51 
 
 		 1293 aa  103  5e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.017557  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1512  amine oxidase, flavin-containing  23.16 
 
 		 454 aa  99  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.118585  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00060  conserved expressed protein  24.21 
 
 		 538 aa  92.8  1e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0591276  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0481  hypothetical protein  23.93 
 
 		 450 aa  91.3  4e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.0000175856  decreased coverage  0.00000000723889 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0893  amine oxidase  22.13 
 
 		 431 aa  89  2e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000373233 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1142  amine oxidase  20.47 
 
 		 428 aa  85.9  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1928  FAD dependent oxidoreductase  23.73 
 
 		 460 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03112  conserved hypothetical protein  22.5 
 
 		 532 aa  78.6  0.0000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.630535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0862  UDP-galactopyranose mutase  28.84 
 
 		 424 aa  75.9  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.804118  normal  0.0706079 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1072  hypothetical protein  30.22 
 
 		 421 aa  73.6  0.000000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00830956 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0216  UDP-galactopyranose mutase  24.06 
 
 		 452 aa  69.3  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2685  amine oxidase, flavin-containing  28.42 
 
 		 449 aa  68.2  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.327813  normal  0.0635309 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1552  hypothetical protein  25.34 
 
 		 435 aa  65.1  0.000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.113177  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4100  Protoporphyrinogen oxidase-like protein  20.58 
 
 		 467 aa  64.7  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.105834  normal  0.0160826 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2149  hypothetical protein  26.92 
 
 		 429 aa  62.8  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.226037  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1885  protoporphyrinogen oxidase  20.17 
 
 		 466 aa  61.2  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000633111  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1919  protoporphyrinogen oxidase  20.17 
 
 		 466 aa  61.2  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00206772  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0544  amine oxidase  27.73 
 
 		 525 aa  60.5  0.00000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00189501  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0404  FAD dependent oxidoreductase  24.35 
 
 		 443 aa  60.1  0.00000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0826  protoporphyrinogen oxidase  22.9 
 
 		 473 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.981055  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0140  hypothetical protein  23.19 
 
 		 432 aa  57.4  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.63632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4795  hypothetical protein  22.82 
 
 		 419 aa  57.4  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173425  normal  0.558478 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0501  hypothetical protein  19.55 
 
 		 437 aa  57  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4557  hypothetical protein  21.02 
 
 		 447 aa  56.6  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.159105  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2159  protoporphyrinogen oxidase  24.51 
 
 		 465 aa  55.1  0.000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1402  UDP-galactopyranose mutase  28.81 
 
 		 396 aa  55.1  0.000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3088  UDP-galactopyranose mutase  28.82 
 
 		 367 aa  55.1  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.552299  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2286  protoporphyrinogen oxidase  25.59 
 
 		 509 aa  54.7  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.932472  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1374  UDP-galactopyranose mutase  29.48 
 
 		 372 aa  54.7  0.000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2486  protoporphyrinogen oxidase  27.07 
 
 		 462 aa  54.3  0.000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.493936 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0608  UDP-galactopyranose mutase  28.24 
 
 		 381 aa  54.3  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1893  protoporphyrinogen oxidase  39.13 
 
 		 421 aa  53.5  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5059  UDP-galactopyranose mutase  27.17 
 
 		 367 aa  52.8  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2040  UDP-galactopyranose mutase  26.74 
 
 		 366 aa  52.4  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00394808  normal  0.0793604 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2901  hypothetical protein  18.74 
 
 		 427 aa  52.4  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000885481  normal  0.0535803 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1366  protoporphyrinogen oxidase  24.43 
 
 		 482 aa  52  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.409095  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2574  amine oxidase  48.39 
 
 		 455 aa  51.6  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.278816  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1143  UDP-galactopyranose mutase  27.53 
 
 		 372 aa  52  0.00003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000571156  hitchhiker  0.00000314352 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1586  protoporphyrinogen oxidase  25.3 
 
 		 482 aa  51.6  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.149602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3047  O-antigen synthesis protein WbyH  19.02 
 
 		 427 aa  52  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0665883  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0088  hypothetical protein  37.23 
 
 		 448 aa  51.2  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.220394  normal  0.164147 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5174  protoporphyrinogen oxidase  24.4 
 
 		 470 aa  51.6  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00221395  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1621  UDP-galactopyranose mutase  27.33 
 
 		 367 aa  50.8  0.00005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0464676  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1169  protoporphyrinogen oxidase  21.28 
 
 		 473 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0991  protoporphyrinogen oxidase  19.83 
 
 		 473 aa  51.2  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1001  protoporphyrinogen oxidase  21.4 
 
 		 473 aa  50.8  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000915854  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0986  protoporphyrinogen oxidase  21.4 
 
 		 473 aa  50.8  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0988  protoporphyrinogen oxidase  21.4 
 
 		 473 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000269776  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1556  UDP-galactopyranose mutase  29.41 
 
 		 383 aa  51.2  0.00005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1232  protoporphyrinogen oxidase  21.81 
 
 		 473 aa  51.2  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08330  UDP-galactopyranose mutase  28.31 
 
 		 371 aa  50.8  0.00006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0799137  normal  0.20676 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1144  protoporphyrinogen oxidase  19.78 
 
 		 441 aa  50.8  0.00006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0219  UDP-galactopyranose mutase  28.74 
 
 		 380 aa  50.4  0.00007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4165  UDP-galactopyranose mutase  24.35 
 
 		 373 aa  50.4  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.367331 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0717  UDP-galactopyranose mutase  27.88 
 
 		 365 aa  50.1  0.00009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2218  protoporphyrinogen oxidase  22.55 
 
 		 482 aa  49.7  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.184801 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6497  protoporphyrinogen oxidase  26.25 
 
 		 442 aa  49.7  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.56742 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2030  phytoene desaturase  30.84 
 
 		 501 aa  48.9  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>