89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3888 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3888  UDP-galactopyranose mutase  100 
 
 		 395 aa  815    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00485328 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1171  UDP-galactopyranose mutase  74.3 
 
 		 395 aa  616  1e-175  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0707003  normal  0.958151 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0635  UDP-galactopyranose mutase  73.67 
 
 		 389 aa  612  9.999999999999999e-175  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08860  UDP-galactopyranose mutase  72.66 
 
 		 395 aa  613  9.999999999999999e-175  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.271109 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2575  UDP-galactopyranose mutase  72.91 
 
 		 395 aa  594  1e-169  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2694  UDP-galactopyranose mutase  69.62 
 
 		 395 aa  594  1e-169  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.42371  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01310  UDP-galactopyranose mutase  71.21 
 
 		 415 aa  591  1e-168  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.18508  normal  0.915549 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4319  UDP-galactopyranose mutase  72.42 
 
 		 395 aa  589  1e-167  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.591076  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2424  UDP-galactopyranose mutase  69.9 
 
 		 409 aa  588  1e-167  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0628072 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1401  UDP-galactopyranose mutase  70.74 
 
 		 395 aa  578  1e-164  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0128  UDP-galactopyranose mutase  70.44 
 
 		 394 aa  567  1e-160  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0204  UDP-galactopyranose mutase  69.05 
 
 		 398 aa  559  1e-158  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.255316  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0161  UDP-galactopyranose mutase  67.95 
 
 		 402 aa  552  1e-156  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5650  UDP-galactopyranose mutase  67.95 
 
 		 413 aa  550  1e-155  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.463461  normal  0.994274 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5020  UDP-galactopyranose mutase  68.12 
 
 		 428 aa  545  1e-154  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13843  UDP-galactopyranose mutase glf  66.75 
 
 		 399 aa  546  1e-154  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.286421 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5108  UDP-galactopyranose mutase  68.12 
 
 		 399 aa  546  1e-154  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.302478 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5401  UDP-galactopyranose mutase  68.12 
 
 		 399 aa  546  1e-154  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.379754 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20850  UDP-galactopyranose mutase  68.88 
 
 		 386 aa  543  1e-153  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1159  UDP-galactopyranose mutase  66.67 
 
 		 425 aa  540  9.999999999999999e-153  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.183925  normal  0.0936925 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2533  UDP-galactopyranose mutase  67.02 
 
 		 381 aa  533  1e-150  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4186  UDP-galactopyranose mutase  63.52 
 
 		 399 aa  505  9.999999999999999e-143  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1637  UDP-galactopyranose mutase  63.47 
 
 		 383 aa  503  1e-141  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.56586 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1579  UDP-galactopyranose mutase  57.44 
 
 		 392 aa  449  1e-125  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1179  UDP-galactopyranose mutase  54.39 
 
 		 413 aa  434  1e-120  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2265  UDP-galactopyranose mutase  45.89 
 
 		 384 aa  342  5.999999999999999e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4000  hypothetical protein  46.46 
 
 		 383 aa  332  8e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1556  UDP-galactopyranose mutase  44.29 
 
 		 383 aa  330  2e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2040  UDP-galactopyranose mutase  42.93 
 
 		 366 aa  328  1.0000000000000001e-88  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00394808  normal  0.0793604 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0608  UDP-galactopyranose mutase  44.12 
 
 		 381 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3088  UDP-galactopyranose mutase  45.41 
 
 		 367 aa  327  3e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.552299  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3894  UDP-galactopyranose mutase  43.16 
 
 		 391 aa  323  3e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1143  UDP-galactopyranose mutase  45.38 
 
 		 372 aa  323  3e-87  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000571156  hitchhiker  0.00000314352 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3019  UDP-galactopyranose mutase  43.47 
 
 		 381 aa  322  6e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.195146  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5043  UDP-galactopyranose mutase  44.8 
 
 		 381 aa  321  9.999999999999999e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0779  UDP-galactopyranose mutase  44.12 
 
 		 383 aa  320  3e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.110856  normal  0.152549 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0842  UDP-galactopyranose mutase  43.85 
 
 		 383 aa  320  3e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000837318 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5059  UDP-galactopyranose mutase  43.35 
 
 		 367 aa  319  3.9999999999999996e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0876  UDP-galactopyranose mutase  43.85 
 
 		 383 aa  318  1e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.1789 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1621  UDP-galactopyranose mutase  42.67 
 
 		 367 aa  311  1e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0464676  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1374  UDP-galactopyranose mutase  43.77 
 
 		 372 aa  311  2e-83  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1076  UDP-galactopyranose mutase  42.13 
 
 		 370 aa  310  2.9999999999999997e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0219  UDP-galactopyranose mutase  41.93 
 
 		 380 aa  303  3.0000000000000004e-81  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14770  UDP-galactopyranose mutase  44 
 
 		 370 aa  298  8e-80  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0269497 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3361  UDP-galactopyranose mutase  41.78 
 
 		 368 aa  290  2e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.509275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0717  UDP-galactopyranose mutase  39.47 
 
 		 365 aa  290  3e-77  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2020  UDP-galactopyranose mutase  42.16 
 
 		 814 aa  286  2.9999999999999996e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.843123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2341  UDP-galactopyranose mutase  41.87 
 
 		 398 aa  286  5e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0445173  normal  0.0301397 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1741  UDP-galactopyranose mutase  41.18 
 
 		 391 aa  283  4.0000000000000003e-75  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2702  UDP-galactopyranose mutase  39.73 
 
 		 393 aa  278  1e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.601095  normal  0.0699705 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1305  UDP-galactopyranose mutase  39.36 
 
 		 377 aa  277  2e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.36953  normal  0.672952 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2898  UDP-galactopyranose mutase  40 
 
 		 393 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373026  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5685  UDP-galactopyranose mutase  40.05 
 
 		 783 aa  273  4.0000000000000004e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.649144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08330  UDP-galactopyranose mutase  40.69 
 
 		 371 aa  272  8.000000000000001e-72  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0799137  normal  0.20676 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1194  UDP-galactopyranose mutase  39.3 
 
 		 379 aa  271  1e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.886744  normal  0.725852 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0516  UDP-galactopyranose mutase  39.89 
 
 		 383 aa  270  2.9999999999999997e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0049322  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1402  UDP-galactopyranose mutase  38.58 
 
 		 396 aa  268  1e-70  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4106  UDP-galactopyranose mutase  41.53 
 
 		 376 aa  268  1e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4014  UDP-galactopyranose mutase  41.53 
 
 		 376 aa  266  5e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2530  UDP-galactopyranose mutase  39.3 
 
 		 399 aa  266  5e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4165  UDP-galactopyranose mutase  38.46 
 
 		 373 aa  263  3e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.367331 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3621  UDP-galactopyranose mutase  38.77 
 
 		 372 aa  263  4.999999999999999e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.585126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2888  UDP-galactopyranose mutase  35.9 
 
 		 364 aa  263  6e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.656694  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3903  UDP-galactopyranose mutase  41.94 
 
 		 369 aa  259  5.0000000000000005e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42228  predicted protein  39.46 
 
 		 460 aa  258  1e-67  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5610  UDP-galactopyranose mutase  40.37 
 
 		 783 aa  258  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00502091 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0088  UDP-galactopyranose mutase  39.02 
 
 		 390 aa  251  1e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.616523  normal  0.0498418 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0851  UDP-galactopyranose mutase  39.1 
 
 		 363 aa  249  6e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.435235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_4114  predicted protein  38.17 
 
 		 391 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.718701  normal  0.169117 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2744  UDP-galactopyranose mutase  35.09 
 
 		 373 aa  243  3e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1566  UDP-galactopyranose mutase  33.51 
 
 		 382 aa  236  6e-61  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00174985  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1454  UDP-galactopyranose mutase  36.8 
 
 		 370 aa  234  2.0000000000000002e-60  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3214  UDP-galactopyranose mutase  35.92 
 
 		 386 aa  234  3e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3069  UDP-galactopyranose mutase  33.59 
 
 		 391 aa  231  1e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.998088  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2024  UDP-galactopyranose mutase  33.86 
 
 		 375 aa  223  4e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0647  UDP-galactopyranose mutase  34.95 
 
 		 400 aa  212  9e-54  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000447576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1727  UDP-galactopyranose mutase  35.52 
 
 		 404 aa  210  3e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0324536  normal  0.111313 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5440  UDP-galactopyranose mutase  33.95 
 
 		 369 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.214475 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1602  UDP-galactopyranose mutase  23.32 
 
 		 369 aa  62.4  0.00000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0347601  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0862  UDP-galactopyranose mutase  27.93 
 
 		 424 aa  56.2  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.804118  normal  0.0706079 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14591  UDP-galactopyranose mutase  21.64 
 
 		 394 aa  55.5  0.000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4196  amine oxidase  26.44 
 
 		 496 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0065  protoporphyrinogen oxidase  23.46 
 
 		 459 aa  48.5  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4465  amine oxidase  23.38 
 
 		 480 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05276  Putative monoamine oxidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B2F4]  38.36 
 
 		 492 aa  48.9  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3508  amine oxidase  34.48 
 
 		 435 aa  47  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2036  amine oxidase, flavin-containing  23.46 
 
 		 459 aa  47  0.0006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1637  hypothetical protein  30.05 
 
 		 516 aa  44.7  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.252141 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08359  flavin containing amine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G01470)  37.5 
 
 		 378 aa  44.3  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>