142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1374 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_1143  UDP-galactopyranose mutase  81.89 
 
 		 372 aa  640    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000571156  hitchhiker  0.00000314352 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1374  UDP-galactopyranose mutase  100 
 
 		 372 aa  769    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5059  UDP-galactopyranose mutase  68.29 
 
 		 367 aa  528  1e-149  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1741  UDP-galactopyranose mutase  66.31 
 
 		 391 aa  525  1e-148  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0219  UDP-galactopyranose mutase  67.74 
 
 		 380 aa  519  1e-146  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2040  UDP-galactopyranose mutase  63.22 
 
 		 366 aa  501  1e-140  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00394808  normal  0.0793604 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3361  UDP-galactopyranose mutase  63.34 
 
 		 368 aa  499  1e-140  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.509275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1402  UDP-galactopyranose mutase  62.77 
 
 		 396 aa  492  9.999999999999999e-139  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1621  UDP-galactopyranose mutase  58.27 
 
 		 367 aa  464  9.999999999999999e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0464676  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14770  UDP-galactopyranose mutase  60.38 
 
 		 370 aa  467  9.999999999999999e-131  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0269497 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0717  UDP-galactopyranose mutase  59.24 
 
 		 365 aa  466  9.999999999999999e-131  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1076  UDP-galactopyranose mutase  58.76 
 
 		 370 aa  465  9.999999999999999e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08330  UDP-galactopyranose mutase  58.54 
 
 		 371 aa  453  1.0000000000000001e-126  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0799137  normal  0.20676 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0128  UDP-galactopyranose mutase  47.61 
 
 		 394 aa  345  8.999999999999999e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1579  UDP-galactopyranose mutase  46.58 
 
 		 392 aa  341  1e-92  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0635  UDP-galactopyranose mutase  47.99 
 
 		 389 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20850  UDP-galactopyranose mutase  45.29 
 
 		 386 aa  335  7.999999999999999e-91  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0204  UDP-galactopyranose mutase  46.32 
 
 		 398 aa  333  3e-90  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.255316  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0161  UDP-galactopyranose mutase  47.06 
 
 		 402 aa  330  3e-89  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4319  UDP-galactopyranose mutase  47.28 
 
 		 395 aa  330  3e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.591076  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01310  UDP-galactopyranose mutase  46.28 
 
 		 415 aa  329  4e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.18508  normal  0.915549 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1179  UDP-galactopyranose mutase  45.04 
 
 		 413 aa  327  2.0000000000000001e-88  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08860  UDP-galactopyranose mutase  44.71 
 
 		 395 aa  327  2.0000000000000001e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.271109 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1171  UDP-galactopyranose mutase  44.56 
 
 		 395 aa  325  6e-88  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0707003  normal  0.958151 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2694  UDP-galactopyranose mutase  44.56 
 
 		 395 aa  322  6e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.42371  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2424  UDP-galactopyranose mutase  45.55 
 
 		 409 aa  320  1.9999999999999998e-86  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0628072 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2575  UDP-galactopyranose mutase  43.5 
 
 		 395 aa  320  3e-86  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5650  UDP-galactopyranose mutase  45.68 
 
 		 413 aa  320  3e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.463461  normal  0.994274 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2533  UDP-galactopyranose mutase  43.09 
 
 		 381 aa  317  2e-85  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5020  UDP-galactopyranose mutase  45.16 
 
 		 428 aa  316  4e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5108  UDP-galactopyranose mutase  45.16 
 
 		 399 aa  316  5e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.302478 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5401  UDP-galactopyranose mutase  45.16 
 
 		 399 aa  316  5e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.379754 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1159  UDP-galactopyranose mutase  45.14 
 
 		 425 aa  313  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.183925  normal  0.0936925 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13843  UDP-galactopyranose mutase glf  44.74 
 
 		 399 aa  312  6.999999999999999e-84  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.286421 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3888  UDP-galactopyranose mutase  43.77 
 
 		 395 aa  311  1e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00485328 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1637  UDP-galactopyranose mutase  41.98 
 
 		 383 aa  303  4.0000000000000003e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.56586 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1401  UDP-galactopyranose mutase  43.21 
 
 		 395 aa  297  2e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3088  UDP-galactopyranose mutase  44.11 
 
 		 367 aa  295  8e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.552299  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0779  UDP-galactopyranose mutase  42.08 
 
 		 383 aa  292  6e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.110856  normal  0.152549 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4186  UDP-galactopyranose mutase  42.63 
 
 		 399 aa  292  8e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0842  UDP-galactopyranose mutase  41.35 
 
 		 383 aa  292  8e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000837318 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1556  UDP-galactopyranose mutase  45 
 
 		 383 aa  291  1e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3019  UDP-galactopyranose mutase  43.21 
 
 		 381 aa  290  2e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.195146  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2265  UDP-galactopyranose mutase  42.13 
 
 		 384 aa  291  2e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0876  UDP-galactopyranose mutase  41.8 
 
 		 383 aa  290  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.1789 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0608  UDP-galactopyranose mutase  42.54 
 
 		 381 aa  290  4e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3894  UDP-galactopyranose mutase  42.28 
 
 		 391 aa  288  1e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5043  UDP-galactopyranose mutase  42.94 
 
 		 381 aa  284  2.0000000000000002e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4000  hypothetical protein  42.82 
 
 		 383 aa  277  2e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2898  UDP-galactopyranose mutase  40.93 
 
 		 393 aa  276  3e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373026  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4165  UDP-galactopyranose mutase  41.58 
 
 		 373 aa  273  3e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.367331 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2702  UDP-galactopyranose mutase  40.38 
 
 		 393 aa  269  5e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.601095  normal  0.0699705 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4106  UDP-galactopyranose mutase  40.05 
 
 		 376 aa  267  2e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4014  UDP-galactopyranose mutase  40.05 
 
 		 376 aa  266  5.999999999999999e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1194  UDP-galactopyranose mutase  39.57 
 
 		 379 aa  261  1e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.886744  normal  0.725852 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0851  UDP-galactopyranose mutase  41.58 
 
 		 363 aa  259  4e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.435235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0088  UDP-galactopyranose mutase  38.32 
 
 		 390 aa  259  6e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.616523  normal  0.0498418 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2020  UDP-galactopyranose mutase  38.81 
 
 		 814 aa  256  4e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.843123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1454  UDP-galactopyranose mutase  40.43 
 
 		 370 aa  256  6e-67  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2530  UDP-galactopyranose mutase  39.78 
 
 		 399 aa  255  1.0000000000000001e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2341  UDP-galactopyranose mutase  40.54 
 
 		 398 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0445173  normal  0.0301397 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5685  UDP-galactopyranose mutase  40.11 
 
 		 783 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.649144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3069  UDP-galactopyranose mutase  38.3 
 
 		 391 aa  253  3e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.998088  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3903  UDP-galactopyranose mutase  40.28 
 
 		 369 aa  253  5.000000000000001e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0516  UDP-galactopyranose mutase  39.25 
 
 		 383 aa  252  6e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0049322  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3621  UDP-galactopyranose mutase  38.98 
 
 		 372 aa  249  5e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.585126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3214  UDP-galactopyranose mutase  39.8 
 
 		 386 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2744  UDP-galactopyranose mutase  37.9 
 
 		 373 aa  239  8e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5440  UDP-galactopyranose mutase  37.77 
 
 		 369 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.214475 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5610  UDP-galactopyranose mutase  40.27 
 
 		 783 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00502091 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1305  UDP-galactopyranose mutase  37.13 
 
 		 377 aa  230  3e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.36953  normal  0.672952 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1566  UDP-galactopyranose mutase  36.65 
 
 		 382 aa  227  3e-58  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00174985  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42228  predicted protein  36.08 
 
 		 460 aa  223  3e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_4114  predicted protein  36.36 
 
 		 391 aa  223  6e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.718701  normal  0.169117 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2888  UDP-galactopyranose mutase  35.83 
 
 		 364 aa  218  1e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.656694  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1727  UDP-galactopyranose mutase  36.06 
 
 		 404 aa  206  7e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0324536  normal  0.111313 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2024  UDP-galactopyranose mutase  36.1 
 
 		 375 aa  205  1e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0647  UDP-galactopyranose mutase  34.29 
 
 		 400 aa  186  6e-46  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000447576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1602  UDP-galactopyranose mutase  25.94 
 
 		 369 aa  78.2  0.0000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0347601  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2861  hypothetical protein  29.65 
 
 		 511 aa  64.7  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.245537 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14591  UDP-galactopyranose mutase  23.77 
 
 		 394 aa  63.2  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1072  hypothetical protein  22.54 
 
 		 421 aa  60.1  0.00000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00830956 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1637  hypothetical protein  28.05 
 
 		 516 aa  58.2  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.252141 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4898  hypothetical protein  27.59 
 
 		 494 aa  56.2  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00550747  normal  0.0440629 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2236  hypothetical protein  30.54 
 
 		 500 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0391032 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3185  hypothetical protein  50 
 
 		 245 aa  55.1  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29229  hitchhiker  0.00171019 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0374  hypothetical protein  29.34 
 
 		 500 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.10021  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3374  amine oxidase  29.48 
 
 		 512 aa  54.7  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2880  hypothetical protein  28.14 
 
 		 511 aa  55.1  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0436694 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3017  hypothetical protein  48.28 
 
 		 484 aa  54.7  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.191221  normal  0.019056 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4465  amine oxidase  28.07 
 
 		 480 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2043  amine oxidase  44.44 
 
 		 476 aa  53.9  0.000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0112057  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0204  amine oxidase  26.35 
 
 		 435 aa  54.3  0.000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.420312  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4196  amine oxidase  26.95 
 
 		 496 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2649  hypothetical protein  26.04 
 
 		 498 aa  53.9  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0340038  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3095  hypothetical protein  27.71 
 
 		 500 aa  53.1  0.000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0942  amine oxidase  25.62 
 
 		 449 aa  50.1  0.00006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.15931  normal  0.877558 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1076  amine oxidase  25.76 
 
 		 437 aa  49.7  0.00009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05910  amine oxidase, putative  38.98 
 
 		 537 aa  48.9  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0298175  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8013  hypothetical protein  28.31 
 
 		 524 aa  48.9  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>