194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1602 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1602  UDP-galactopyranose mutase  100 
 
 		 369 aa  753    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0347601  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14591  UDP-galactopyranose mutase  42.62 
 
 		 394 aa  257  3e-67  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2040  UDP-galactopyranose mutase  26.44 
 
 		 366 aa  102  1e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00394808  normal  0.0793604 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2530  UDP-galactopyranose mutase  27.84 
 
 		 399 aa  99.8  8e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2020  UDP-galactopyranose mutase  26.85 
 
 		 814 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.843123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1454  UDP-galactopyranose mutase  24.32 
 
 		 370 aa  96.3  7e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0516  UDP-galactopyranose mutase  28.42 
 
 		 383 aa  94.7  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0049322  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1741  UDP-galactopyranose mutase  28.18 
 
 		 391 aa  95.1  2e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3361  UDP-galactopyranose mutase  25.34 
 
 		 368 aa  95.1  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.509275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4165  UDP-galactopyranose mutase  26.6 
 
 		 373 aa  94.4  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.367331 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5059  UDP-galactopyranose mutase  26.68 
 
 		 367 aa  94  4e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1621  UDP-galactopyranose mutase  26.53 
 
 		 367 aa  93.2  7e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0464676  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0851  UDP-galactopyranose mutase  25.33 
 
 		 363 aa  92.8  8e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.435235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1076  UDP-galactopyranose mutase  25 
 
 		 370 aa  92.4  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0717  UDP-galactopyranose mutase  25.79 
 
 		 365 aa  92  1e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3214  UDP-galactopyranose mutase  26.75 
 
 		 386 aa  89.7  7e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0088  UDP-galactopyranose mutase  26.58 
 
 		 390 aa  89.7  7e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.616523  normal  0.0498418 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0219  UDP-galactopyranose mutase  28.42 
 
 		 380 aa  89.4  9e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1305  UDP-galactopyranose mutase  26.06 
 
 		 377 aa  89  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.36953  normal  0.672952 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2898  UDP-galactopyranose mutase  25.53 
 
 		 393 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373026  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2341  UDP-galactopyranose mutase  26.68 
 
 		 398 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0445173  normal  0.0301397 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08860  UDP-galactopyranose mutase  25.65 
 
 		 395 aa  85.5  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.271109 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1143  UDP-galactopyranose mutase  27.37 
 
 		 372 aa  85.9  0.000000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000571156  hitchhiker  0.00000314352 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2888  UDP-galactopyranose mutase  25.32 
 
 		 364 aa  85.9  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.656694  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3088  UDP-galactopyranose mutase  25.53 
 
 		 367 aa  84.7  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.552299  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5685  UDP-galactopyranose mutase  25.89 
 
 		 783 aa  83.6  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.649144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1402  UDP-galactopyranose mutase  25.77 
 
 		 396 aa  82.8  0.000000000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1194  UDP-galactopyranose mutase  25.61 
 
 		 379 aa  82.8  0.000000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.886744  normal  0.725852 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1566  UDP-galactopyranose mutase  27.2 
 
 		 382 aa  81.6  0.00000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00174985  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4014  UDP-galactopyranose mutase  24.42 
 
 		 376 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1727  UDP-galactopyranose mutase  25.43 
 
 		 404 aa  79.7  0.00000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0324536  normal  0.111313 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2694  UDP-galactopyranose mutase  25.84 
 
 		 395 aa  79.3  0.00000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.42371  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4106  UDP-galactopyranose mutase  23.9 
 
 		 376 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1401  UDP-galactopyranose mutase  24.48 
 
 		 395 aa  79  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0635  UDP-galactopyranose mutase  25.39 
 
 		 389 aa  78.6  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1374  UDP-galactopyranose mutase  25.94 
 
 		 372 aa  78.2  0.0000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3903  UDP-galactopyranose mutase  24.26 
 
 		 369 aa  78.2  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01310  UDP-galactopyranose mutase  25.96 
 
 		 415 aa  78.2  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.18508  normal  0.915549 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2702  UDP-galactopyranose mutase  25.46 
 
 		 393 aa  76.6  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.601095  normal  0.0699705 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3621  UDP-galactopyranose mutase  24.74 
 
 		 372 aa  76.6  0.0000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.585126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13843  UDP-galactopyranose mutase glf  25 
 
 		 399 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.286421 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2424  UDP-galactopyranose mutase  25.77 
 
 		 409 aa  74.7  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0628072 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0608  UDP-galactopyranose mutase  25.61 
 
 		 381 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0876  UDP-galactopyranose mutase  22.86 
 
 		 383 aa  73.9  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.1789 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0779  UDP-galactopyranose mutase  22.86 
 
 		 383 aa  73.9  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.110856  normal  0.152549 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0842  UDP-galactopyranose mutase  22.86 
 
 		 383 aa  73.9  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000837318 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3019  UDP-galactopyranose mutase  26.54 
 
 		 381 aa  73.6  0.000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.195146  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14770  UDP-galactopyranose mutase  23.16 
 
 		 370 aa  73.6  0.000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0269497 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5610  UDP-galactopyranose mutase  25.47 
 
 		 783 aa  73.6  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00502091 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2533  UDP-galactopyranose mutase  22.14 
 
 		 381 aa  73.6  0.000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1556  UDP-galactopyranose mutase  24.87 
 
 		 383 aa  73.2  0.000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5043  UDP-galactopyranose mutase  24.74 
 
 		 381 aa  72.8  0.000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0204  UDP-galactopyranose mutase  24.36 
 
 		 398 aa  72.4  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.255316  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2265  UDP-galactopyranose mutase  23.39 
 
 		 384 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2575  UDP-galactopyranose mutase  24.42 
 
 		 395 aa  72  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1179  UDP-galactopyranose mutase  23.65 
 
 		 413 aa  71.6  0.00000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1171  UDP-galactopyranose mutase  24.48 
 
 		 395 aa  71.2  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0707003  normal  0.958151 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3894  UDP-galactopyranose mutase  23.31 
 
 		 391 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3069  UDP-galactopyranose mutase  23.6 
 
 		 391 aa  70.1  0.00000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.998088  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5650  UDP-galactopyranose mutase  24.94 
 
 		 413 aa  70.5  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.463461  normal  0.994274 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0128  UDP-galactopyranose mutase  25.26 
 
 		 394 aa  69.7  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2236  hypothetical protein  21.61 
 
 		 500 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0391032 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4319  UDP-galactopyranose mutase  23.83 
 
 		 395 aa  68.6  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.591076  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0647  UDP-galactopyranose mutase  24.94 
 
 		 400 aa  67.8  0.0000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000447576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1159  UDP-galactopyranose mutase  24.55 
 
 		 425 aa  67  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.183925  normal  0.0936925 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08330  UDP-galactopyranose mutase  22.01 
 
 		 371 aa  66.6  0.0000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0799137  normal  0.20676 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4186  UDP-galactopyranose mutase  23.75 
 
 		 399 aa  65.9  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5440  UDP-galactopyranose mutase  22.77 
 
 		 369 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.214475 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1579  UDP-galactopyranose mutase  23.7 
 
 		 392 aa  65.1  0.000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5020  UDP-galactopyranose mutase  23.91 
 
 		 428 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5108  UDP-galactopyranose mutase  23.91 
 
 		 399 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.302478 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5401  UDP-galactopyranose mutase  23.91 
 
 		 399 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.379754 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4000  hypothetical protein  23.48 
 
 		 383 aa  63.9  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0161  UDP-galactopyranose mutase  23.39 
 
 		 402 aa  63.2  0.000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3888  UDP-galactopyranose mutase  23.32 
 
 		 395 aa  62.4  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00485328 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2024  UDP-galactopyranose mutase  26.04 
 
 		 375 aa  60.1  0.00000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0064  hypothetical protein  29.17 
 
 		 549 aa  59.7  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2744  UDP-galactopyranose mutase  24.67 
 
 		 373 aa  59.7  0.00000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42228  predicted protein  23.44 
 
 		 460 aa  59.3  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4465  amine oxidase  26.75 
 
 		 480 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1637  UDP-galactopyranose mutase  22.42 
 
 		 383 aa  57.8  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.56586 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2934  hypothetical protein  29.67 
 
 		 538 aa  57.4  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4196  amine oxidase  26.99 
 
 		 496 aa  57  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0045  hypothetical protein  27.61 
 
 		 472 aa  56.2  0.0000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00889429  hitchhiker  0.00142526 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0984  amine oxidase  25.28 
 
 		 520 aa  56.2  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1072  hypothetical protein  27.88 
 
 		 421 aa  55.1  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00830956 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20850  UDP-galactopyranose mutase  23.26 
 
 		 386 aa  55.1  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0374  hypothetical protein  25.15 
 
 		 500 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.10021  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1142  amine oxidase  24.14 
 
 		 428 aa  55.5  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2861  hypothetical protein  26.83 
 
 		 511 aa  54.3  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.245537 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_4114  predicted protein  23.29 
 
 		 391 aa  54.7  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.718701  normal  0.169117 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3095  hypothetical protein  25.15 
 
 		 500 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3497  amine oxidase  26.64 
 
 		 507 aa  53.5  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.281636  normal  0.0813869 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1201  hypothetical protein  25.65 
 
 		 537 aa  52  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0031  Protoporphyrinogen oxidase-like protein  27.92 
 
 		 1033 aa  51.6  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000538665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0109  FAD dependent oxidoreductase  25.13 
 
 		 539 aa  51.6  0.00002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1366  protoporphyrinogen oxidase  44.07 
 
 		 482 aa  51.2  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.409095  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0956  amine oxidase  44.64 
 
 		 434 aa  51.2  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.618507  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1076  amine oxidase  25.61 
 
 		 437 aa  50.4  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5286  amine oxidase  50 
 
 		 592 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.456502  normal  0.921895 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>