89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1637 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1637  UDP-galactopyranose mutase  100 
 
 		 383 aa  778    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.56586 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2533  UDP-galactopyranose mutase  67.55 
 
 		 381 aa  532  1e-150  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1171  UDP-galactopyranose mutase  65.6 
 
 		 395 aa  509  1e-143  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0707003  normal  0.958151 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08860  UDP-galactopyranose mutase  64.12 
 
 		 395 aa  509  1e-143  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.271109 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0635  UDP-galactopyranose mutase  67.29 
 
 		 389 aa  506  9.999999999999999e-143  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3888  UDP-galactopyranose mutase  63.47 
 
 		 395 aa  503  1e-141  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00485328 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2575  UDP-galactopyranose mutase  62.01 
 
 		 395 aa  483  1e-135  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0128  UDP-galactopyranose mutase  60.69 
 
 		 394 aa  475  1e-133  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2694  UDP-galactopyranose mutase  58.4 
 
 		 395 aa  476  1e-133  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.42371  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2424  UDP-galactopyranose mutase  57.87 
 
 		 409 aa  471  1e-132  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0628072 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01310  UDP-galactopyranose mutase  59.89 
 
 		 415 aa  469  1.0000000000000001e-131  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.18508  normal  0.915549 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4319  UDP-galactopyranose mutase  60.53 
 
 		 395 aa  467  9.999999999999999e-131  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.591076  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20850  UDP-galactopyranose mutase  58.98 
 
 		 386 aa  462  1e-129  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0204  UDP-galactopyranose mutase  60.21 
 
 		 398 aa  461  1e-129  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.255316  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4186  UDP-galactopyranose mutase  62.6 
 
 		 399 aa  462  1e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1159  UDP-galactopyranose mutase  59.42 
 
 		 425 aa  458  9.999999999999999e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.183925  normal  0.0936925 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0161  UDP-galactopyranose mutase  58.78 
 
 		 402 aa  458  9.999999999999999e-129  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13843  UDP-galactopyranose mutase glf  59.37 
 
 		 399 aa  457  1e-127  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.286421 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5650  UDP-galactopyranose mutase  59.63 
 
 		 413 aa  456  1e-127  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.463461  normal  0.994274 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1401  UDP-galactopyranose mutase  58.29 
 
 		 395 aa  454  1.0000000000000001e-126  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5108  UDP-galactopyranose mutase  58.05 
 
 		 399 aa  445  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.302478 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5401  UDP-galactopyranose mutase  58.05 
 
 		 399 aa  445  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.379754 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5020  UDP-galactopyranose mutase  58.05 
 
 		 428 aa  444  1e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1579  UDP-galactopyranose mutase  53.03 
 
 		 392 aa  414  1e-114  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1179  UDP-galactopyranose mutase  52.01 
 
 		 413 aa  410  1e-113  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2040  UDP-galactopyranose mutase  41.38 
 
 		 366 aa  316  5e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00394808  normal  0.0793604 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1621  UDP-galactopyranose mutase  42.71 
 
 		 367 aa  310  4e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0464676  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0219  UDP-galactopyranose mutase  42.18 
 
 		 380 aa  308  1.0000000000000001e-82  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5059  UDP-galactopyranose mutase  40.85 
 
 		 367 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1556  UDP-galactopyranose mutase  42.23 
 
 		 383 aa  305  1.0000000000000001e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1143  UDP-galactopyranose mutase  42.02 
 
 		 372 aa  304  2.0000000000000002e-81  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000571156  hitchhiker  0.00000314352 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3894  UDP-galactopyranose mutase  41.78 
 
 		 391 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3088  UDP-galactopyranose mutase  42.97 
 
 		 367 aa  303  3.0000000000000004e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.552299  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1374  UDP-galactopyranose mutase  41.98 
 
 		 372 aa  303  4.0000000000000003e-81  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3019  UDP-galactopyranose mutase  40.58 
 
 		 381 aa  302  7.000000000000001e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.195146  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0608  UDP-galactopyranose mutase  40.26 
 
 		 381 aa  300  3e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2265  UDP-galactopyranose mutase  40.94 
 
 		 384 aa  298  8e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1076  UDP-galactopyranose mutase  39.62 
 
 		 370 aa  292  5e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4000  hypothetical protein  43.13 
 
 		 383 aa  292  6e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5043  UDP-galactopyranose mutase  40.58 
 
 		 381 aa  291  2e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0717  UDP-galactopyranose mutase  39.52 
 
 		 365 aa  290  3e-77  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14770  UDP-galactopyranose mutase  42.59 
 
 		 370 aa  290  4e-77  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0269497 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3361  UDP-galactopyranose mutase  41.4 
 
 		 368 aa  289  5.0000000000000004e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.509275  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0779  UDP-galactopyranose mutase  40.27 
 
 		 383 aa  283  5.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.110856  normal  0.152549 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0842  UDP-galactopyranose mutase  40 
 
 		 383 aa  282  6.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000837318 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1741  UDP-galactopyranose mutase  39.68 
 
 		 391 aa  281  1e-74  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0876  UDP-galactopyranose mutase  40 
 
 		 383 aa  281  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.1789 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1305  UDP-galactopyranose mutase  38.5 
 
 		 377 aa  276  5e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.36953  normal  0.672952 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08330  UDP-galactopyranose mutase  39.78 
 
 		 371 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0799137  normal  0.20676 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4165  UDP-galactopyranose mutase  37.66 
 
 		 373 aa  272  7e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.367331 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2020  UDP-galactopyranose mutase  37.11 
 
 		 814 aa  269  5.9999999999999995e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.843123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2702  UDP-galactopyranose mutase  38.93 
 
 		 393 aa  268  8e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.601095  normal  0.0699705 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4106  UDP-galactopyranose mutase  38.48 
 
 		 376 aa  268  1e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1402  UDP-galactopyranose mutase  39.37 
 
 		 396 aa  267  2e-70  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2898  UDP-galactopyranose mutase  39.73 
 
 		 393 aa  267  2e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373026  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1194  UDP-galactopyranose mutase  38.56 
 
 		 379 aa  266  7e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.886744  normal  0.725852 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4014  UDP-galactopyranose mutase  37.7 
 
 		 376 aa  264  2e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0516  UDP-galactopyranose mutase  37.67 
 
 		 383 aa  263  4.999999999999999e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0049322  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2341  UDP-galactopyranose mutase  37.73 
 
 		 398 aa  258  9e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0445173  normal  0.0301397 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3621  UDP-galactopyranose mutase  37.87 
 
 		 372 aa  258  1e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.585126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2888  UDP-galactopyranose mutase  35.26 
 
 		 364 aa  254  2.0000000000000002e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.656694  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0088  UDP-galactopyranose mutase  38.5 
 
 		 390 aa  253  3e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.616523  normal  0.0498418 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5685  UDP-galactopyranose mutase  37.73 
 
 		 783 aa  250  3e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.649144  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5610  UDP-galactopyranose mutase  39.84 
 
 		 783 aa  248  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00502091 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0851  UDP-galactopyranose mutase  37.89 
 
 		 363 aa  248  1e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.435235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2530  UDP-galactopyranose mutase  37.34 
 
 		 399 aa  247  3e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42228  predicted protein  38.48 
 
 		 460 aa  246  4e-64  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3903  UDP-galactopyranose mutase  37.4 
 
 		 369 aa  231  2e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_4114  predicted protein  37.47 
 
 		 391 aa  230  4e-59  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.718701  normal  0.169117 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2744  UDP-galactopyranose mutase  36.13 
 
 		 373 aa  227  3e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1566  UDP-galactopyranose mutase  32.46 
 
 		 382 aa  224  2e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00174985  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3214  UDP-galactopyranose mutase  33.5 
 
 		 386 aa  223  6e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3069  UDP-galactopyranose mutase  32.14 
 
 		 391 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.998088  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1454  UDP-galactopyranose mutase  34.66 
 
 		 370 aa  214  9.999999999999999e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2024  UDP-galactopyranose mutase  33.5 
 
 		 375 aa  209  4e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5440  UDP-galactopyranose mutase  35.16 
 
 		 369 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.214475 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0647  UDP-galactopyranose mutase  32.83 
 
 		 400 aa  201  1.9999999999999998e-50  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000447576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1727  UDP-galactopyranose mutase  32.1 
 
 		 404 aa  190  2.9999999999999997e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0324536  normal  0.111313 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1602  UDP-galactopyranose mutase  22.42 
 
 		 369 aa  57.8  0.0000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0347601  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14591  UDP-galactopyranose mutase  19.75 
 
 		 394 aa  55.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0902  hypothetical protein  21.84 
 
 		 465 aa  46.6  0.0008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.787196  normal  0.0359011 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2278  amine oxidase  26.44 
 
 		 435 aa  45.8  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.682646 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3017  hypothetical protein  32.08 
 
 		 484 aa  46.2  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.191221  normal  0.019056 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3185  hypothetical protein  33.03 
 
 		 245 aa  44.7  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29229  hitchhiker  0.00171019 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1706  hypothetical protein  27.84 
 
 		 465 aa  43.9  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.186838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2361  amine oxidase  53.49 
 
 		 419 aa  43.5  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000435651  normal  0.0173751 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7245  amine oxidase, flavin-containing  38.81 
 
 		 392 aa  43.1  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147229  normal  0.232939 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0862  UDP-galactopyranose mutase  19.26 
 
 		 424 aa  43.1  0.009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.804118  normal  0.0706079 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05276  Putative monoamine oxidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B2F4]  34.02 
 
 		 492 aa  42.7  0.01  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>