116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3361 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3361  UDP-galactopyranose mutase  100 
 
 		 368 aa  763    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.509275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1076  UDP-galactopyranose mutase  71.2 
 
 		 370 aa  566  1e-160  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5059  UDP-galactopyranose mutase  72.58 
 
 		 367 aa  558  1e-158  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2040  UDP-galactopyranose mutase  67.5 
 
 		 366 aa  525  1e-148  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00394808  normal  0.0793604 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1621  UDP-galactopyranose mutase  64.72 
 
 		 367 aa  507  9.999999999999999e-143  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0464676  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1143  UDP-galactopyranose mutase  63.22 
 
 		 372 aa  499  1e-140  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000571156  hitchhiker  0.00000314352 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1374  UDP-galactopyranose mutase  63.34 
 
 		 372 aa  499  1e-140  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0717  UDP-galactopyranose mutase  63.97 
 
 		 365 aa  494  1e-139  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14770  UDP-galactopyranose mutase  61.75 
 
 		 370 aa  497  1e-139  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0269497 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0219  UDP-galactopyranose mutase  60.98 
 
 		 380 aa  478  1e-134  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08330  UDP-galactopyranose mutase  61.67 
 
 		 371 aa  478  1e-134  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0799137  normal  0.20676 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1741  UDP-galactopyranose mutase  59.19 
 
 		 391 aa  465  9.999999999999999e-131  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1402  UDP-galactopyranose mutase  58.4 
 
 		 396 aa  461  9.999999999999999e-129  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2694  UDP-galactopyranose mutase  43.72 
 
 		 395 aa  322  6e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.42371  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1579  UDP-galactopyranose mutase  44.74 
 
 		 392 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1179  UDP-galactopyranose mutase  43.22 
 
 		 413 aa  320  3e-86  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2424  UDP-galactopyranose mutase  43.46 
 
 		 409 aa  318  1e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0628072 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0128  UDP-galactopyranose mutase  44.29 
 
 		 394 aa  317  1e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2575  UDP-galactopyranose mutase  43.94 
 
 		 395 aa  316  4e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0635  UDP-galactopyranose mutase  44.15 
 
 		 389 aa  315  5e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0204  UDP-galactopyranose mutase  44.89 
 
 		 398 aa  316  5e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.255316  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01310  UDP-galactopyranose mutase  44.47 
 
 		 415 aa  315  5e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.18508  normal  0.915549 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08860  UDP-galactopyranose mutase  43.13 
 
 		 395 aa  315  8e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.271109 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0161  UDP-galactopyranose mutase  44.92 
 
 		 402 aa  310  2e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5020  UDP-galactopyranose mutase  44.24 
 
 		 428 aa  310  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5108  UDP-galactopyranose mutase  44.24 
 
 		 399 aa  310  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.302478 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5650  UDP-galactopyranose mutase  44.74 
 
 		 413 aa  310  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.463461  normal  0.994274 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5401  UDP-galactopyranose mutase  44.24 
 
 		 399 aa  310  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.379754 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20850  UDP-galactopyranose mutase  42.78 
 
 		 386 aa  310  2.9999999999999997e-83  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1401  UDP-galactopyranose mutase  44.03 
 
 		 395 aa  308  8e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1171  UDP-galactopyranose mutase  42.97 
 
 		 395 aa  307  2.0000000000000002e-82  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0707003  normal  0.958151 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13843  UDP-galactopyranose mutase glf  44.62 
 
 		 399 aa  306  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.286421 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1159  UDP-galactopyranose mutase  44.32 
 
 		 425 aa  305  6e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.183925  normal  0.0936925 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4319  UDP-galactopyranose mutase  44.29 
 
 		 395 aa  305  7e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.591076  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2533  UDP-galactopyranose mutase  41.67 
 
 		 381 aa  300  3e-80  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4165  UDP-galactopyranose mutase  43.84 
 
 		 373 aa  298  7e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.367331 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3888  UDP-galactopyranose mutase  41.78 
 
 		 395 aa  290  2e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00485328 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3894  UDP-galactopyranose mutase  43.58 
 
 		 391 aa  290  3e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1637  UDP-galactopyranose mutase  41.4 
 
 		 383 aa  289  5.0000000000000004e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.56586 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0779  UDP-galactopyranose mutase  38.87 
 
 		 383 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.110856  normal  0.152549 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0842  UDP-galactopyranose mutase  38.54 
 
 		 383 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000837318 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1194  UDP-galactopyranose mutase  41.83 
 
 		 379 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.886744  normal  0.725852 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1556  UDP-galactopyranose mutase  42.98 
 
 		 383 aa  284  2.0000000000000002e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0876  UDP-galactopyranose mutase  38.61 
 
 		 383 aa  283  4.0000000000000003e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.1789 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0608  UDP-galactopyranose mutase  40.82 
 
 		 381 aa  281  9e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4106  UDP-galactopyranose mutase  42.2 
 
 		 376 aa  280  3e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2265  UDP-galactopyranose mutase  39.47 
 
 		 384 aa  280  4e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0088  UDP-galactopyranose mutase  41.64 
 
 		 390 aa  279  4e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.616523  normal  0.0498418 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4014  UDP-galactopyranose mutase  41.89 
 
 		 376 aa  280  4e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3088  UDP-galactopyranose mutase  42.62 
 
 		 367 aa  278  8e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.552299  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2341  UDP-galactopyranose mutase  40.66 
 
 		 398 aa  278  9e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0445173  normal  0.0301397 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5043  UDP-galactopyranose mutase  39.84 
 
 		 381 aa  278  2e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3019  UDP-galactopyranose mutase  43.3 
 
 		 381 aa  276  3e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.195146  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2898  UDP-galactopyranose mutase  40.44 
 
 		 393 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373026  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4000  hypothetical protein  39.62 
 
 		 383 aa  273  3e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3621  UDP-galactopyranose mutase  40.33 
 
 		 372 aa  272  9e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.585126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0851  UDP-galactopyranose mutase  40.88 
 
 		 363 aa  271  1e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.435235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4186  UDP-galactopyranose mutase  40.53 
 
 		 399 aa  271  1e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2020  UDP-galactopyranose mutase  40.93 
 
 		 814 aa  267  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.843123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2702  UDP-galactopyranose mutase  38.89 
 
 		 393 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.601095  normal  0.0699705 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2530  UDP-galactopyranose mutase  39.29 
 
 		 399 aa  260  2e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0516  UDP-galactopyranose mutase  39.78 
 
 		 383 aa  258  8e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0049322  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3214  UDP-galactopyranose mutase  39.68 
 
 		 386 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5685  UDP-galactopyranose mutase  37.5 
 
 		 783 aa  250  3e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.649144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3903  UDP-galactopyranose mutase  39.38 
 
 		 369 aa  249  4e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1454  UDP-galactopyranose mutase  39.57 
 
 		 370 aa  249  5e-65  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1305  UDP-galactopyranose mutase  38.13 
 
 		 377 aa  249  7e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.36953  normal  0.672952 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2888  UDP-galactopyranose mutase  39.55 
 
 		 364 aa  245  8e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.656694  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3069  UDP-galactopyranose mutase  36.46 
 
 		 391 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.998088  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5610  UDP-galactopyranose mutase  37.98 
 
 		 783 aa  238  8e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00502091 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1566  UDP-galactopyranose mutase  36.7 
 
 		 382 aa  238  1e-61  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00174985  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_4114  predicted protein  36.36 
 
 		 391 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.718701  normal  0.169117 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42228  predicted protein  37.11 
 
 		 460 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5440  UDP-galactopyranose mutase  37.47 
 
 		 369 aa  231  1e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.214475 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2744  UDP-galactopyranose mutase  36.99 
 
 		 373 aa  231  2e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2024  UDP-galactopyranose mutase  38.48 
 
 		 375 aa  229  6e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1727  UDP-galactopyranose mutase  37.47 
 
 		 404 aa  219  6e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0324536  normal  0.111313 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0647  UDP-galactopyranose mutase  36.79 
 
 		 400 aa  199  7e-50  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000447576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1602  UDP-galactopyranose mutase  25.34 
 
 		 369 aa  95.1  2e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0347601  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0204  amine oxidase  25.86 
 
 		 435 aa  57  0.0000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.420312  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4465  amine oxidase  26.17 
 
 		 480 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14591  UDP-galactopyranose mutase  22.01 
 
 		 394 aa  53.9  0.000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3017  hypothetical protein  38.46 
 
 		 484 aa  53.5  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.191221  normal  0.019056 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3185  hypothetical protein  38.46 
 
 		 245 aa  52.8  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29229  hitchhiker  0.00171019 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4196  amine oxidase  23.95 
 
 		 496 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0942  amine oxidase  23.87 
 
 		 449 aa  49.7  0.00007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.15931  normal  0.877558 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2043  amine oxidase  32.47 
 
 		 476 aa  49.7  0.00008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0112057  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1072  hypothetical protein  21.45 
 
 		 421 aa  49.3  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00830956 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1076  amine oxidase  26.19 
 
 		 437 aa  48.5  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2861  hypothetical protein  23.53 
 
 		 511 aa  47.8  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.245537 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0264  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  50 
 
 		 174 aa  47.8  0.0003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0862  UDP-galactopyranose mutase  25.32 
 
 		 424 aa  47  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.804118  normal  0.0706079 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0369  geranylgeranyl reductase  42.11 
 
 		 408 aa  46.2  0.0008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0683691  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01400  conserved hypothetical protein  46.34 
 
 		 470 aa  45.8  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0413  HI0933-like protein  26.32 
 
 		 392 aa  45.4  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0650019  normal  0.0294705 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1556  amine oxidase (flavin-containing)  39.68 
 
 		 450 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1580  amine oxidase (flavin-containing)  39.68 
 
 		 450 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0966  UDP-galactopyranose mutase  24.84 
 
 		 447 aa  46.2  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3374  amine oxidase  27.01 
 
 		 512 aa  44.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2649  hypothetical protein  27.06 
 
 		 498 aa  44.7  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0340038  normal  0.0581443 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>