180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_4106 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_4014  UDP-galactopyranose mutase  97.34 
 
 		 376 aa  766    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4106  UDP-galactopyranose mutase  100 
 
 		 376 aa  783    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42228  predicted protein  52.67 
 
 		 460 aa  380  1e-104  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2341  UDP-galactopyranose mutase  49.33 
 
 		 398 aa  370  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0445173  normal  0.0301397 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2020  UDP-galactopyranose mutase  49.6 
 
 		 814 aa  369  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.843123  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1305  UDP-galactopyranose mutase  50.13 
 
 		 377 aa  365  1e-100  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.36953  normal  0.672952 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_4114  predicted protein  51.53 
 
 		 391 aa  363  3e-99  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.718701  normal  0.169117 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4165  UDP-galactopyranose mutase  48.66 
 
 		 373 aa  361  1e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.367331 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0516  UDP-galactopyranose mutase  48.53 
 
 		 383 aa  361  1e-98  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0049322  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2530  UDP-galactopyranose mutase  48.65 
 
 		 399 aa  360  2e-98  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0088  UDP-galactopyranose mutase  47.98 
 
 		 390 aa  355  1e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.616523  normal  0.0498418 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1194  UDP-galactopyranose mutase  47.3 
 
 		 379 aa  350  3e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.886744  normal  0.725852 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3621  UDP-galactopyranose mutase  46.76 
 
 		 372 aa  343  2e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.585126  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2898  UDP-galactopyranose mutase  45.7 
 
 		 393 aa  342  5.999999999999999e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373026  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5685  UDP-galactopyranose mutase  45.95 
 
 		 783 aa  338  8e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.649144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0851  UDP-galactopyranose mutase  47.67 
 
 		 363 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.435235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2702  UDP-galactopyranose mutase  44.32 
 
 		 393 aa  334  2e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.601095  normal  0.0699705 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2888  UDP-galactopyranose mutase  44.86 
 
 		 364 aa  330  3e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.656694  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5610  UDP-galactopyranose mutase  46.09 
 
 		 783 aa  328  9e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00502091 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1454  UDP-galactopyranose mutase  46.59 
 
 		 370 aa  320  3.9999999999999996e-86  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2024  UDP-galactopyranose mutase  46.98 
 
 		 375 aa  318  1e-85  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3214  UDP-galactopyranose mutase  44.19 
 
 		 386 aa  311  1e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3903  UDP-galactopyranose mutase  44.02 
 
 		 369 aa  311  2e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3069  UDP-galactopyranose mutase  42.93 
 
 		 391 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.998088  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1566  UDP-galactopyranose mutase  41.25 
 
 		 382 aa  302  5.000000000000001e-81  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00174985  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2744  UDP-galactopyranose mutase  42.86 
 
 		 373 aa  298  1e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0635  UDP-galactopyranose mutase  44.77 
 
 		 389 aa  293  5e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01310  UDP-galactopyranose mutase  44.03 
 
 		 415 aa  292  6e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.18508  normal  0.915549 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0128  UDP-galactopyranose mutase  43.73 
 
 		 394 aa  288  8e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1401  UDP-galactopyranose mutase  43.73 
 
 		 395 aa  284  2.0000000000000002e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2424  UDP-galactopyranose mutase  42.78 
 
 		 409 aa  282  7.000000000000001e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0628072 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3361  UDP-galactopyranose mutase  42.2 
 
 		 368 aa  280  3e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.509275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2040  UDP-galactopyranose mutase  41.71 
 
 		 366 aa  279  4e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00394808  normal  0.0793604 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2694  UDP-galactopyranose mutase  41.99 
 
 		 395 aa  278  8e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.42371  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1171  UDP-galactopyranose mutase  43.35 
 
 		 395 aa  277  2e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0707003  normal  0.958151 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4319  UDP-galactopyranose mutase  43.35 
 
 		 395 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.591076  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1143  UDP-galactopyranose mutase  41.69 
 
 		 372 aa  274  2.0000000000000002e-72  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000571156  hitchhiker  0.00000314352 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0204  UDP-galactopyranose mutase  42.01 
 
 		 398 aa  274  2.0000000000000002e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.255316  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5059  UDP-galactopyranose mutase  40.87 
 
 		 367 aa  273  3e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0161  UDP-galactopyranose mutase  42.22 
 
 		 402 aa  273  4.0000000000000004e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14770  UDP-galactopyranose mutase  40.32 
 
 		 370 aa  273  4.0000000000000004e-72  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0269497 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5108  UDP-galactopyranose mutase  40.87 
 
 		 399 aa  270  2e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.302478 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5650  UDP-galactopyranose mutase  41.3 
 
 		 413 aa  271  2e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.463461  normal  0.994274 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5401  UDP-galactopyranose mutase  40.87 
 
 		 399 aa  270  2e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.379754 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5020  UDP-galactopyranose mutase  40.87 
 
 		 428 aa  270  4e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08860  UDP-galactopyranose mutase  41.91 
 
 		 395 aa  269  7e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.271109 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0219  UDP-galactopyranose mutase  39.95 
 
 		 380 aa  268  8.999999999999999e-71  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1637  UDP-galactopyranose mutase  38.48 
 
 		 383 aa  268  1e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.56586 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3888  UDP-galactopyranose mutase  41.53 
 
 		 395 aa  268  1e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00485328 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1374  UDP-galactopyranose mutase  40.05 
 
 		 372 aa  267  2e-70  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1159  UDP-galactopyranose mutase  40.83 
 
 		 425 aa  266  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.183925  normal  0.0936925 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3019  UDP-galactopyranose mutase  41.44 
 
 		 381 aa  266  4e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.195146  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13843  UDP-galactopyranose mutase glf  41.39 
 
 		 399 aa  266  4e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.286421 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20850  UDP-galactopyranose mutase  41.05 
 
 		 386 aa  266  5e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2533  UDP-galactopyranose mutase  41.18 
 
 		 381 aa  264  2e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1741  UDP-galactopyranose mutase  40.11 
 
 		 391 aa  263  4e-69  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0608  UDP-galactopyranose mutase  38.25 
 
 		 381 aa  263  4e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1076  UDP-galactopyranose mutase  39.25 
 
 		 370 aa  263  4.999999999999999e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2575  UDP-galactopyranose mutase  41.38 
 
 		 395 aa  263  4.999999999999999e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5440  UDP-galactopyranose mutase  39.47 
 
 		 369 aa  262  8e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.214475 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08330  UDP-galactopyranose mutase  39.4 
 
 		 371 aa  261  1e-68  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0799137  normal  0.20676 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4000  hypothetical protein  39.67 
 
 		 383 aa  261  2e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1621  UDP-galactopyranose mutase  40.76 
 
 		 367 aa  258  1e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0464676  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0717  UDP-galactopyranose mutase  38.8 
 
 		 365 aa  258  1e-67  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1579  UDP-galactopyranose mutase  37.63 
 
 		 392 aa  253  3e-66  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0647  UDP-galactopyranose mutase  38.22 
 
 		 400 aa  253  3e-66  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000447576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1402  UDP-galactopyranose mutase  38.34 
 
 		 396 aa  253  5.000000000000001e-66  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3088  UDP-galactopyranose mutase  40 
 
 		 367 aa  250  3e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.552299  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2265  UDP-galactopyranose mutase  38.98 
 
 		 384 aa  249  4e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4186  UDP-galactopyranose mutase  39.95 
 
 		 399 aa  248  1e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0842  UDP-galactopyranose mutase  37.37 
 
 		 383 aa  247  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000837318 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0779  UDP-galactopyranose mutase  37.1 
 
 		 383 aa  245  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.110856  normal  0.152549 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0876  UDP-galactopyranose mutase  36.83 
 
 		 383 aa  243  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.1789 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5043  UDP-galactopyranose mutase  37.77 
 
 		 381 aa  243  3e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1179  UDP-galactopyranose mutase  35.44 
 
 		 413 aa  243  3.9999999999999997e-63  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3894  UDP-galactopyranose mutase  39.13 
 
 		 391 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1727  UDP-galactopyranose mutase  38.23 
 
 		 404 aa  239  4e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0324536  normal  0.111313 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1556  UDP-galactopyranose mutase  38.75 
 
 		 383 aa  236  4e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14591  UDP-galactopyranose mutase  25.07 
 
 		 394 aa  80.5  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1602  UDP-galactopyranose mutase  23.9 
 
 		 369 aa  78.6  0.0000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0347601  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3185  hypothetical protein  64.29 
 
 		 245 aa  59.7  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29229  hitchhiker  0.00171019 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3017  hypothetical protein  61.9 
 
 		 484 aa  58.5  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.191221  normal  0.019056 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4465  amine oxidase  24.43 
 
 		 480 aa  57.4  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2043  amine oxidase  54.76 
 
 		 476 aa  55.5  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0112057  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1072  hypothetical protein  23.35 
 
 		 421 aa  55.1  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00830956 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4196  amine oxidase  31.1 
 
 		 496 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0942  amine oxidase  21.09 
 
 		 449 aa  51.2  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.15931  normal  0.877558 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0183  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.51 
 
 		 467 aa  50.8  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1637  hypothetical protein  29.34 
 
 		 516 aa  50.4  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.252141 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05276  Putative monoamine oxidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B2F4]  38.36 
 
 		 492 aa  48.9  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3431  amine oxidase  58.54 
 
 		 529 aa  48.9  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2262  amine oxidase  40.32 
 
 		 436 aa  48.9  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0239134  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2205  phytoene dehydrogenase related enzyme  40.32 
 
 		 436 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0074  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.71 
 
 		 462 aa  48.1  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.490103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2305  glycosyl transferase family 2  19.49 
 
 		 722 aa  47.8  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0138852  normal  0.273361 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3492  FAD dependent oxidoreductase  41.79 
 
 		 536 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2410  hypothetical protein  38.71 
 
 		 436 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2550  hypothetical protein  38.71 
 
 		 436 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0551  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.68 
 
 		 464 aa  47.4  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4610  FAD dependent oxidoreductase  52.5 
 
 		 409 aa  47.4  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>