100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0204 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_13843  UDP-galactopyranose mutase glf  80.81 
 
 		 399 aa  665    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.286421 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5108  UDP-galactopyranose mutase  82.99 
 
 		 399 aa  689    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.302478 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5650  UDP-galactopyranose mutase  84.69 
 
 		 413 aa  693    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.463461  normal  0.994274 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5401  UDP-galactopyranose mutase  82.99 
 
 		 399 aa  689    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.379754 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5020  UDP-galactopyranose mutase  82.16 
 
 		 428 aa  687    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1159  UDP-galactopyranose mutase  82.23 
 
 		 425 aa  684    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.183925  normal  0.0936925 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0161  UDP-galactopyranose mutase  83.67 
 
 		 402 aa  703    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0204  UDP-galactopyranose mutase  100 
 
 		 398 aa  820    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.255316  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0128  UDP-galactopyranose mutase  77.1 
 
 		 394 aa  631  1e-180  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01310  UDP-galactopyranose mutase  76.98 
 
 		 415 aa  626  1e-178  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.18508  normal  0.915549 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4319  UDP-galactopyranose mutase  71.83 
 
 		 395 aa  593  1e-168  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.591076  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0635  UDP-galactopyranose mutase  72.61 
 
 		 389 aa  576  1.0000000000000001e-163  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3888  UDP-galactopyranose mutase  69.05 
 
 		 395 aa  559  1e-158  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00485328 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1171  UDP-galactopyranose mutase  67.87 
 
 		 395 aa  542  1e-153  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0707003  normal  0.958151 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08860  UDP-galactopyranose mutase  66.07 
 
 		 395 aa  538  9.999999999999999e-153  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.271109 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2575  UDP-galactopyranose mutase  67.35 
 
 		 395 aa  539  9.999999999999999e-153  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1401  UDP-galactopyranose mutase  66.58 
 
 		 395 aa  536  1e-151  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2694  UDP-galactopyranose mutase  64.54 
 
 		 395 aa  525  1e-148  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.42371  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2424  UDP-galactopyranose mutase  64.03 
 
 		 409 aa  520  1e-146  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0628072 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20850  UDP-galactopyranose mutase  65.62 
 
 		 386 aa  518  1e-146  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2533  UDP-galactopyranose mutase  62.11 
 
 		 381 aa  488  1e-136  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4186  UDP-galactopyranose mutase  61.54 
 
 		 399 aa  467  9.999999999999999e-131  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1637  UDP-galactopyranose mutase  60.21 
 
 		 383 aa  461  1e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.56586 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1579  UDP-galactopyranose mutase  57.07 
 
 		 392 aa  455  1e-127  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1179  UDP-galactopyranose mutase  54.7 
 
 		 413 aa  444  1e-123  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2040  UDP-galactopyranose mutase  45.48 
 
 		 366 aa  341  1e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00394808  normal  0.0793604 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1143  UDP-galactopyranose mutase  47.35 
 
 		 372 aa  337  1.9999999999999998e-91  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000571156  hitchhiker  0.00000314352 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5059  UDP-galactopyranose mutase  45 
 
 		 367 aa  335  1e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1374  UDP-galactopyranose mutase  46.32 
 
 		 372 aa  333  3e-90  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1621  UDP-galactopyranose mutase  44.33 
 
 		 367 aa  332  7.000000000000001e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0464676  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14770  UDP-galactopyranose mutase  46.01 
 
 		 370 aa  320  3e-86  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0269497 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0219  UDP-galactopyranose mutase  44.68 
 
 		 380 aa  318  1e-85  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2265  UDP-galactopyranose mutase  44.24 
 
 		 384 aa  318  1e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3361  UDP-galactopyranose mutase  44.89 
 
 		 368 aa  316  5e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.509275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1076  UDP-galactopyranose mutase  44.18 
 
 		 370 aa  312  6.999999999999999e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1556  UDP-galactopyranose mutase  42.78 
 
 		 383 aa  312  7.999999999999999e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1741  UDP-galactopyranose mutase  43.24 
 
 		 391 aa  311  9e-84  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0717  UDP-galactopyranose mutase  41.53 
 
 		 365 aa  303  3.0000000000000004e-81  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08330  UDP-galactopyranose mutase  43.93 
 
 		 371 aa  303  5.000000000000001e-81  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0799137  normal  0.20676 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4000  hypothetical protein  44.44 
 
 		 383 aa  298  1e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3894  UDP-galactopyranose mutase  41.04 
 
 		 391 aa  295  7e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3088  UDP-galactopyranose mutase  41.87 
 
 		 367 aa  295  1e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.552299  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3019  UDP-galactopyranose mutase  42.01 
 
 		 381 aa  292  8e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.195146  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1402  UDP-galactopyranose mutase  40.84 
 
 		 396 aa  291  2e-77  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0608  UDP-galactopyranose mutase  42.12 
 
 		 381 aa  290  2e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5043  UDP-galactopyranose mutase  42.82 
 
 		 381 aa  290  4e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0842  UDP-galactopyranose mutase  40.37 
 
 		 383 aa  281  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000837318 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2020  UDP-galactopyranose mutase  40.21 
 
 		 814 aa  281  2e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.843123  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0779  UDP-galactopyranose mutase  40.37 
 
 		 383 aa  280  4e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.110856  normal  0.152549 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0876  UDP-galactopyranose mutase  40.11 
 
 		 383 aa  278  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.1789 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1194  UDP-galactopyranose mutase  40.42 
 
 		 379 aa  275  9e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.886744  normal  0.725852 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4106  UDP-galactopyranose mutase  42.01 
 
 		 376 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4014  UDP-galactopyranose mutase  41.75 
 
 		 376 aa  273  3e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2702  UDP-galactopyranose mutase  38.5 
 
 		 393 aa  271  1e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.601095  normal  0.0699705 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2898  UDP-galactopyranose mutase  38.34 
 
 		 393 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373026  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2341  UDP-galactopyranose mutase  39.58 
 
 		 398 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0445173  normal  0.0301397 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4165  UDP-galactopyranose mutase  38.8 
 
 		 373 aa  268  8.999999999999999e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.367331 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0516  UDP-galactopyranose mutase  39.57 
 
 		 383 aa  264  3e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0049322  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3621  UDP-galactopyranose mutase  39.11 
 
 		 372 aa  262  8.999999999999999e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.585126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2888  UDP-galactopyranose mutase  37.33 
 
 		 364 aa  260  2e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.656694  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5685  UDP-galactopyranose mutase  38.54 
 
 		 783 aa  258  1e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.649144  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1305  UDP-galactopyranose mutase  37.77 
 
 		 377 aa  253  4.0000000000000004e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.36953  normal  0.672952 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2530  UDP-galactopyranose mutase  38.68 
 
 		 399 aa  250  3e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0851  UDP-galactopyranose mutase  40.43 
 
 		 363 aa  247  2e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.435235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0088  UDP-galactopyranose mutase  37.2 
 
 		 390 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.616523  normal  0.0498418 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1454  UDP-galactopyranose mutase  36.19 
 
 		 370 aa  244  1.9999999999999999e-63  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42228  predicted protein  39.07 
 
 		 460 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5610  UDP-galactopyranose mutase  37.25 
 
 		 783 aa  239  4e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00502091 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3214  UDP-galactopyranose mutase  35.93 
 
 		 386 aa  238  1e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2744  UDP-galactopyranose mutase  35.71 
 
 		 373 aa  236  7e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_4114  predicted protein  37.28 
 
 		 391 aa  233  3e-60  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.718701  normal  0.169117 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3069  UDP-galactopyranose mutase  34.6 
 
 		 391 aa  230  3e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.998088  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3903  UDP-galactopyranose mutase  37.29 
 
 		 369 aa  224  2e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1566  UDP-galactopyranose mutase  32.56 
 
 		 382 aa  223  4e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00174985  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2024  UDP-galactopyranose mutase  35.79 
 
 		 375 aa  217  4e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1727  UDP-galactopyranose mutase  35.15 
 
 		 404 aa  206  4e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0324536  normal  0.111313 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5440  UDP-galactopyranose mutase  34.4 
 
 		 369 aa  206  7e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.214475 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0647  UDP-galactopyranose mutase  35.09 
 
 		 400 aa  205  1e-51  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000447576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1602  UDP-galactopyranose mutase  24.36 
 
 		 369 aa  72.4  0.00000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0347601  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0065  protoporphyrinogen oxidase  26.59 
 
 		 459 aa  51.6  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2146  FAD dependent oxidoreductase  37.08 
 
 		 505 aa  49.7  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.220753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1076  amine oxidase  26.21 
 
 		 437 aa  48.9  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03291  flavin-containing amine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00100)  34.95 
 
 		 457 aa  48.1  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0113455 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2036  amine oxidase, flavin-containing  26.01 
 
 		 459 aa  48.9  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3011  All-trans-retinol 13,14-reductase  39.47 
 
 		 544 aa  46.2  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2105  FAD dependent oxidoreductase  51.02 
 
 		 554 aa  45.1  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3185  hypothetical protein  50 
 
 		 245 aa  45.1  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29229  hitchhiker  0.00171019 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0862  UDP-galactopyranose mutase  24.85 
 
 		 424 aa  45.4  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.804118  normal  0.0706079 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4196  amine oxidase  26.67 
 
 		 496 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0637  putative dehydrogenase  28.78 
 
 		 548 aa  44.3  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0715988 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0121  amine oxidase  25.26 
 
 		 436 aa  44.3  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.406547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3017  hypothetical protein  50 
 
 		 484 aa  44.3  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.191221  normal  0.019056 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2043  amine oxidase  50 
 
 		 476 aa  43.9  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0112057  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2361  amine oxidase  46.94 
 
 		 419 aa  43.9  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000435651  normal  0.0173751 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3651  FAD dependent oxidoreductase  30.6 
 
 		 522 aa  43.5  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.993987 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0263  FAD dependent oxidoreductase  46.43 
 
 		 513 aa  43.9  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0276  flavocytochrome c  53.66 
 
 		 505 aa  43.5  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106606 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2174  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  41.89 
 
 		 457 aa  43.5  0.007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2861  hypothetical protein  25.45 
 
 		 511 aa  43.1  0.008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.245537 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05276  Putative monoamine oxidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B2F4]  33.77 
 
 		 492 aa  43.1  0.009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>