More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3651 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_3651  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
522 aa  1030    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.993987 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0029  FAD dependent oxidoreductase  56.31 
 
 
555 aa  528  1e-149  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3375  FAD dependent oxidoreductase  36.4 
 
 
537 aa  246  6e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0408  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, FAD-dependent  38.16 
 
 
545 aa  243  5e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0254  FAD dependent oxidoreductase  37.45 
 
 
546 aa  241  2.9999999999999997e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.626232  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1677  FAD dependent oxidoreductase  36.85 
 
 
516 aa  240  5e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000164822  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0811  FAD dependent oxidoreductase  36.51 
 
 
542 aa  238  1e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238426 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0378  FAD dependent oxidoreductase  35.45 
 
 
539 aa  238  2e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1671  FAD dependent oxidoreductase  34.87 
 
 
576 aa  237  3e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.80628 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2429  FAD dependent oxidoreductase  36.29 
 
 
519 aa  236  9e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.765246  hitchhiker  0.000212597 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0871  FAD dependent oxidoreductase  35.11 
 
 
537 aa  233  5e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.633579 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0471  FAD dependent oxidoreductase  35.45 
 
 
547 aa  231  2e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1508  FAD dependent oxidoreductase  37.52 
 
 
548 aa  229  7e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5801  FAD dependent oxidoreductase  36.42 
 
 
567 aa  229  7e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0315  FAD dependent oxidoreductase  37.4 
 
 
603 aa  229  8e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000259452 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0526  FAD dependent oxidoreductase  36.59 
 
 
543 aa  229  9e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0493  FAD dependent oxidoreductase  36.29 
 
 
574 aa  226  7e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0272  FAD dependent oxidoreductase  37.12 
 
 
639 aa  226  8e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.688812  normal  0.0156592 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3913  FAD dependent oxidoreductase  36.59 
 
 
543 aa  224  3e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490959  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2761  FAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit  36.1 
 
 
517 aa  224  4e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00308859  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2135  FAD dependent oxidoreductase  35.89 
 
 
519 aa  223  9.999999999999999e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.148047  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0027  FAD dependent oxidoreductase  37.48 
 
 
582 aa  222  1.9999999999999999e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2521  FAD dependent oxidoreductase  35.52 
 
 
519 aa  222  1.9999999999999999e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2819  FAD dependent oxidoreductase  35.63 
 
 
531 aa  221  1.9999999999999999e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.158053  normal  0.100824 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23030  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.52 
 
 
591 aa  219  1e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6411  FAD dependent oxidoreductase  35.04 
 
 
579 aa  217  5e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1009  FAD dependent oxidoreductase  36.08 
 
 
568 aa  216  9e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00611314 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4251  FAD dependent oxidoreductase  35.31 
 
 
577 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2873  FAD dependent oxidoreductase  34.53 
 
 
583 aa  214  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.186763  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0728  Glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.95 
 
 
530 aa  215  1.9999999999999998e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000166291 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01396  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial (AFU_orthologue; AFUA_1G08810)  33.9 
 
 
700 aa  212  1e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00220943 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5123  FAD dependent oxidoreductase  34.95 
 
 
600 aa  211  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2580  FAD dependent oxidoreductase  33.97 
 
 
579 aa  211  3e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000016538 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2890  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.43 
 
 
532 aa  209  7e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.152299 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2593  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.79 
 
 
605 aa  209  1e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2687  FAD dependent oxidoreductase  33.13 
 
 
518 aa  208  2e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.95747  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0265  FAD dependent oxidoreductase  34.91 
 
 
569 aa  207  3e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.339178  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0079  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 
545 aa  207  3e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.656011  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21330  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.63 
 
 
554 aa  207  5e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.609696  normal  0.519106 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0569  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 
536 aa  207  5e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4885  FAD dependent oxidoreductase  32.37 
 
 
525 aa  206  7e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158619  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0056  FAD dependent oxidoreductase  31.63 
 
 
564 aa  206  8e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0868  aerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase  29.8 
 
 
557 aa  206  9e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0953137  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0560  FAD dependent oxidoreductase  35.43 
 
 
603 aa  203  6e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000358551 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1173  FAD dependent oxidoreductase  34.97 
 
 
578 aa  203  6e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.994563  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1069  FAD dependent oxidoreductase  34.18 
 
 
556 aa  202  9.999999999999999e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0626  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.24 
 
 
567 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2437  FAD dependent oxidoreductase  34.99 
 
 
573 aa  201  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00112879 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5038  FAD dependent oxidoreductase  34.69 
 
 
575 aa  201  3e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.991443  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0527  FAD dependent oxidoreductase  31.68 
 
 
557 aa  201  3e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2088  FAD dependent oxidoreductase  33.42 
 
 
554 aa  200  6e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0044542  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0938  FAD dependent oxidoreductase  34.2 
 
 
595 aa  200  6e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00411841  normal  0.908691 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4361  FAD dependent oxidoreductase  35.38 
 
 
557 aa  199  7e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05790  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.55 
 
 
587 aa  199  1.0000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.837912  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06820  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.52 
 
 
585 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1006  FAD dependent oxidoreductase  34.25 
 
 
576 aa  198  3e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.194481  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1486  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  29.73 
 
 
525 aa  197  3e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0679435  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3955  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.89 
 
 
495 aa  196  6e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3289  FAD dependent oxidoreductase  33.07 
 
 
582 aa  196  6e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.398024  normal  0.023153 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1921  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein, N-terminal:FAD dependent oxidoreductase  35.11 
 
 
524 aa  196  7e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1363  FAD dependent oxidoreductase  33.99 
 
 
579 aa  196  7e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.890822 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6051  FAD dependent oxidoreductase  32.67 
 
 
552 aa  196  9e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4611  FAD dependent oxidoreductase  34.86 
 
 
574 aa  196  9e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.497063 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1386  aerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase  28.71 
 
 
557 aa  196  1e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.806879  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1360  aerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase  28.71 
 
 
573 aa  195  1e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000254105  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1250  FAD dependent oxidoreductase  33.54 
 
 
579 aa  195  1e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1267  FAD dependent oxidoreductase  33.54 
 
 
579 aa  195  1e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2616  FAD dependent oxidoreductase  31.7 
 
 
527 aa  195  1e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0248  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic  26.3 
 
 
520 aa  195  2e-48  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1277  FAD dependent oxidoreductase  33.54 
 
 
579 aa  194  3e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.214408 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4019  FAD dependent oxidoreductase  33.12 
 
 
573 aa  194  4e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147958  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2005  FAD dependent oxidoreductase  30.53 
 
 
543 aa  193  6e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.758416  normal  0.433601 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04310  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, putative  34.76 
 
 
798 aa  193  7e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1799  FAD dependent oxidoreductase  32.6 
 
 
582 aa  193  7e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1031  FAD dependent oxidoreductase  33.14 
 
 
529 aa  192  9e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.334153  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2333  FAD dependent oxidoreductase  31.93 
 
 
546 aa  192  1e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.489388  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5604  FAD dependent oxidoreductase  33.07 
 
 
593 aa  191  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.969598  hitchhiker  0.0026989 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29940  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.59 
 
 
583 aa  191  4e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2461  FAD dependent oxidoreductase  32.4 
 
 
559 aa  190  5e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0269  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.78 
 
 
503 aa  190  7e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3436  FAD dependent oxidoreductase  33.8 
 
 
536 aa  189  1e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0404922  hitchhiker  0.0000473208 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4821  FAD dependent oxidoreductase  33.07 
 
 
581 aa  189  1e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.929207  normal  0.0366818 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1120  FAD dependent oxidoreductase  33.53 
 
 
560 aa  189  1e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.917369 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3637  FAD dependent oxidoreductase  34.09 
 
 
584 aa  189  1e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.256736  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_1129  predicted protein  33.33 
 
 
562 aa  189  1e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0487  FAD dependent oxidoreductase  33.54 
 
 
582 aa  188  2e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0836475  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04320  conserved hypothetical protein  32.71 
 
 
668 aa  187  3e-46  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.931414  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2903  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.33 
 
 
503 aa  187  3e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3670  FAD dependent oxidoreductase  32.93 
 
 
566 aa  187  4e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.234288  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30486  predicted protein  32.52 
 
 
602 aa  187  5e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.349562  normal  0.801939 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1014  FAD dependent oxidoreductase  35.62 
 
 
552 aa  187  5e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.106527 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2179  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.73 
 
 
510 aa  187  5e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.873983  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5301  FAD dependent oxidoreductase  32.49 
 
 
572 aa  186  7e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6470  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.94 
 
 
504 aa  186  8e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.389192  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0382  FAD dependent oxidoreductase  35.1 
 
 
532 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.000000868135  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0391  FAD dependent oxidoreductase  33.76 
 
 
582 aa  185  2.0000000000000003e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.452734  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5746  FAD dependent oxidoreductase  38.13 
 
 
583 aa  185  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0411962  normal  0.0261037 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4065  FAD dependent oxidoreductase  33.66 
 
 
567 aa  184  3e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.783415 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2239  FAD dependent oxidoreductase  37 
 
 
546 aa  184  4.0000000000000006e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0659803 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1198  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.14 
 
 
551 aa  184  5.0000000000000004e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.46978 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>