152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0263 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_0263  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
513 aa  1037    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2146  FAD dependent oxidoreductase  54.37 
 
 
505 aa  497  1e-139  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.220753  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5019  hypothetical protein  51.53 
 
 
516 aa  455  1e-127  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.579081 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6398  amine oxidase  53.86 
 
 
504 aa  450  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0647051 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1339  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  51.53 
 
 
523 aa  429  1e-119  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.575389  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8148  FAD dependent oxidoreductase  48.47 
 
 
557 aa  430  1e-119  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10916  oxidoreductase  49.05 
 
 
535 aa  423  1e-117  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2257  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  47.32 
 
 
520 aa  424  1e-117  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1160  FAD dependent oxidoreductase  50.68 
 
 
516 aa  419  1e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4868  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  48.65 
 
 
517 aa  419  1e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1732  hypothetical protein  50.67 
 
 
520 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.589428 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0674  phytoene dehydrogenase  49.81 
 
 
529 aa  412  1e-114  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4452  hypothetical protein  50.97 
 
 
499 aa  390  1e-107  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.985838  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4539  hypothetical protein  50.97 
 
 
499 aa  390  1e-107  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.773013  normal  0.693092 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4834  hypothetical protein  50.97 
 
 
499 aa  390  1e-107  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.18285 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1434  FAD dependent oxidoreductase  43.78 
 
 
522 aa  362  1e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1270  FAD dependent oxidoreductase  30.33 
 
 
555 aa  169  1e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0308  FAD dependent oxidoreductase  29.72 
 
 
547 aa  162  2e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.733784  normal  0.0218745 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1978  FAD dependent oxidoreductase  30.6 
 
 
534 aa  158  3e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.413393  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2878  amine oxidase  29.22 
 
 
527 aa  148  2.0000000000000003e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.700832  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1673  FAD dependent oxidoreductase  26.51 
 
 
537 aa  142  1.9999999999999998e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.0012513  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3288  FAD dependent oxidoreductase  29.07 
 
 
537 aa  138  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6157  putative phytoene dehydrogenase family protein  29.47 
 
 
533 aa  137  4e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.375282  normal  0.113405 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3492  FAD dependent oxidoreductase  29.71 
 
 
536 aa  134  3e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0226  FAD dependent oxidoreductase  26.02 
 
 
518 aa  134  3.9999999999999996e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3166  FAD dependent oxidoreductase  27.56 
 
 
539 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0537  FAD dependent oxidoreductase  27.54 
 
 
533 aa  130  6e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0939614  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3375  FAD dependent oxidoreductase  29.34 
 
 
536 aa  129  9.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0710471  hitchhiker  0.0059341 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3444  amine oxidase  30.2 
 
 
532 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1278  FAD dependent oxidoreductase  30.07 
 
 
523 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3380  amine oxidase  30.02 
 
 
532 aa  129  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0635  FAD dependent oxidoreductase  24.77 
 
 
516 aa  125  1e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.470789 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3934  FAD dependent oxidoreductase  27.32 
 
 
549 aa  125  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.217875  normal  0.113832 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2014  FAD dependent oxidoreductase  28.94 
 
 
552 aa  125  3e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.166375  normal  0.451875 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4029  FAD dependent oxidoreductase  28.75 
 
 
536 aa  123  8e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.150408  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1331  FAD dependent oxidoreductase  29.26 
 
 
531 aa  122  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1505  FAD dependent oxidoreductase  31.2 
 
 
527 aa  122  1.9999999999999998e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00846828  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3302  FAD dependent oxidoreductase  29.32 
 
 
532 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1271  amine oxidase  26.25 
 
 
530 aa  119  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0948  FAD dependent oxidoreductase  28.23 
 
 
536 aa  113  9e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2744  FAD dependent oxidoreductase  28.91 
 
 
535 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.294261  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2365  FAD dependent oxidoreductase  27.44 
 
 
535 aa  109  1e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0283536  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2105  FAD dependent oxidoreductase  27.47 
 
 
554 aa  103  6e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3854  FAD dependent oxidoreductase  24.39 
 
 
530 aa  102  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3475  FAD dependent oxidoreductase  27.39 
 
 
559 aa  99.8  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.621036  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2541  putative phytoene dehydrogenase  25.9 
 
 
530 aa  98.2  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.553028 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2838  FAD dependent oxidoreductase  27.03 
 
 
531 aa  97.4  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.320797  normal  0.430895 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3650  FAD dependent oxidoreductase  25.59 
 
 
547 aa  96.7  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3530  oxidoreductase  26.98 
 
 
531 aa  96.7  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0345  hypothetical protein  25 
 
 
421 aa  96.7  1e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1486  FAD dependent oxidoreductase  26.65 
 
 
554 aa  95.9  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.975068 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3174  FAD dependent oxidoreductase  26.77 
 
 
531 aa  93.2  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.919135 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2157  FAD dependent oxidoreductase  22.61 
 
 
430 aa  92.4  2e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3042  FAD dependent oxidoreductase  28.62 
 
 
530 aa  91.3  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.261396  normal  0.193129 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1736  FAD dependent oxidoreductase  24.54 
 
 
556 aa  89.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00685325  normal  0.215441 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1581  FAD dependent oxidoreductase  24.09 
 
 
565 aa  89  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.135472  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5057  FAD dependent oxidoreductase  24.46 
 
 
564 aa  89  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0735  FAD dependent oxidoreductase  25.04 
 
 
563 aa  89  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3026  FAD dependent oxidoreductase  28.39 
 
 
530 aa  87.8  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3085  FAD dependent oxidoreductase  28.39 
 
 
530 aa  87.8  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.214734  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3030  FAD dependent oxidoreductase  26.85 
 
 
551 aa  84.3  0.000000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.788741  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1607  FAD dependent oxidoreductase  25.48 
 
 
510 aa  84  0.000000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0416  FAD dependent oxidoreductase  25.18 
 
 
561 aa  84  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.839972 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0947  FAD dependent oxidoreductase  26.72 
 
 
532 aa  82.8  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.239668  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4024  FAD dependent oxidoreductase  25.61 
 
 
547 aa  83.2  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.411315  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5076  FAD dependent oxidoreductase  25.18 
 
 
520 aa  81.6  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2949  FAD dependent oxidoreductase  26.57 
 
 
517 aa  79.3  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1677  FAD dependent oxidoreductase  24.49 
 
 
519 aa  78.2  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0006  amine oxidase  24.58 
 
 
556 aa  77  0.0000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4888  FAD dependent oxidoreductase  27.04 
 
 
520 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.162383 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7299  FAD dependent oxidoreductase  26.35 
 
 
528 aa  75.5  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1487  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  25.36 
 
 
510 aa  75.9  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000619668 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4505  FAD dependent oxidoreductase  26 
 
 
520 aa  73.9  0.000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.145075  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4592  FAD dependent oxidoreductase  26 
 
 
520 aa  73.9  0.000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353805  normal  0.593862 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2310  FAD dependent oxidoreductase  25.44 
 
 
514 aa  73.6  0.000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.6902  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04210  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  25 
 
 
527 aa  72.8  0.00000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.507647  normal  0.876413 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1935  FAD dependent oxidoreductase  25.11 
 
 
521 aa  73.2  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.790128  normal  0.638974 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1063  FAD dependent oxidoreductase  25.97 
 
 
545 aa  72.8  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.164132  normal  0.870572 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3290  amine oxidase  27.35 
 
 
545 aa  71.2  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4289  FAD dependent oxidoreductase  27.24 
 
 
528 aa  70.9  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.366851  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0637  putative dehydrogenase  25.98 
 
 
548 aa  70.9  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0715988 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20120  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  26.78 
 
 
545 aa  67.8  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.191581  hitchhiker  0.00297894 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0381  amine oxidase  25 
 
 
510 aa  65.1  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1960  FAD dependent oxidoreductase  26.65 
 
 
523 aa  63.9  0.000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13863  dehydrogenase  23.55 
 
 
536 aa  63.9  0.000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2659  beta-carotene ketolase  25.97 
 
 
526 aa  63.5  0.000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1758  FAD dependent oxidoreductase  27.62 
 
 
534 aa  61.6  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.396799 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1363  FAD dependent oxidoreductase  22.66 
 
 
420 aa  60.8  0.00000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3180  FAD dependent oxidoreductase  24.69 
 
 
478 aa  60.5  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.882146 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3431  amine oxidase  26.45 
 
 
529 aa  58.9  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1744  FAD dependent oxidoreductase  28.19 
 
 
534 aa  58.5  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0167987 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4519  FAD dependent oxidoreductase  23.86 
 
 
506 aa  58.2  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.962314  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0342  FAD dependent oxidoreductase  26.21 
 
 
531 aa  57.8  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2815  FAD dependent oxidoreductase  67.57 
 
 
522 aa  57  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000107827  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3691  FAD dependent oxidoreductase  28.69 
 
 
481 aa  56.2  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0128787  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1238  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  29.31 
 
 
472 aa  54.3  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.690842  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31610  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  27.74 
 
 
503 aa  54.3  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.911892  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1069  FAD dependent oxidoreductase  27.01 
 
 
496 aa  52.8  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.302171  hitchhiker  0.00376489 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2736  FAD dependent oxidoreductase  23.57 
 
 
484 aa  52.4  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118695  hitchhiker  0.0000199916 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2057  FAD dependent oxidoreductase  25.7 
 
 
487 aa  52.8  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.548507  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>