172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CBUD_0065 on replicon NC_009727
Organism: Coxiella burnetii Dugway 5J108-111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009727  CBUD_0065  protoporphyrinogen oxidase  100 
 
 
459 aa  960    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2036  amine oxidase, flavin-containing  99.56 
 
 
459 aa  954    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4196  amine oxidase  26.52 
 
 
496 aa  163  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4465  amine oxidase  26.87 
 
 
480 aa  159  9e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0984  amine oxidase  26.41 
 
 
520 aa  150  6e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1201  hypothetical protein  26.4 
 
 
537 aa  144  4e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2861  hypothetical protein  25.65 
 
 
511 aa  138  2e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.245537 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8013  hypothetical protein  26.33 
 
 
524 aa  133  5e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0121  amine oxidase  25.58 
 
 
436 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.406547  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0045  hypothetical protein  23.24 
 
 
472 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00889429  hitchhiker  0.00142526 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3497  amine oxidase  23.81 
 
 
507 aa  130  4.0000000000000003e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.281636  normal  0.0813869 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4898  hypothetical protein  23.17 
 
 
494 aa  130  7.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00550747  normal  0.0440629 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2880  hypothetical protein  23.88 
 
 
511 aa  127  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0436694 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2236  hypothetical protein  24.3 
 
 
500 aa  126  7e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0391032 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2649  hypothetical protein  22.34 
 
 
498 aa  123  6e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0340038  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2305  glycosyl transferase family 2  23.35 
 
 
722 aa  123  7e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0138852  normal  0.273361 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3095  hypothetical protein  22.93 
 
 
500 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0902  hypothetical protein  25.37 
 
 
465 aa  121  3e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.787196  normal  0.0359011 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1637  hypothetical protein  23.33 
 
 
516 aa  120  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.252141 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3374  amine oxidase  23.31 
 
 
512 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1076  amine oxidase  26.27 
 
 
437 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0374  hypothetical protein  24.24 
 
 
500 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.10021  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0966  UDP-galactopyranose mutase  23.97 
 
 
447 aa  114  5e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0109  FAD dependent oxidoreductase  24.47 
 
 
539 aa  112  2.0000000000000002e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0064  hypothetical protein  22.29 
 
 
549 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0991  hypothetical protein  23.71 
 
 
519 aa  111  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.97338  hitchhiker  0.00393632 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0031  Protoporphyrinogen oxidase-like protein  22.13 
 
 
1033 aa  108  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000538665  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0942  amine oxidase  23.82 
 
 
449 aa  108  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.15931  normal  0.877558 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2934  hypothetical protein  22.96 
 
 
538 aa  99  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1446  amine oxidase  22.4 
 
 
446 aa  97.4  5e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.14723  normal  0.0175327 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1706  hypothetical protein  21.94 
 
 
465 aa  96.7  9e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.186838  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7546  FAD dependent oxidoreductase  21.54 
 
 
489 aa  95.1  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.50279 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3582  hypothetical protein  20.43 
 
 
463 aa  80.5  0.00000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.932394  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3655  hypothetical protein  20.43 
 
 
463 aa  80.5  0.00000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3587  hypothetical protein  20.22 
 
 
463 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.584997  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0375  hypothetical protein  23.87 
 
 
428 aa  77.8  0.0000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.427757  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03112  conserved hypothetical protein  22.57 
 
 
532 aa  77  0.0000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.630535  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2101  amine oxidase  22.81 
 
 
452 aa  73.9  0.000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0481  hypothetical protein  20.82 
 
 
450 aa  73.6  0.000000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.0000175856  decreased coverage  0.00000000723889 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1512  amine oxidase, flavin-containing  23.24 
 
 
454 aa  71.6  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.118585  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1155  hypothetical protein  24.48 
 
 
423 aa  70.5  0.00000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1928  FAD dependent oxidoreductase  23.5 
 
 
460 aa  70.5  0.00000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0204  amine oxidase  20.52 
 
 
435 aa  68.6  0.0000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.420312  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00060  conserved expressed protein  20.69 
 
 
538 aa  67.8  0.0000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0591276  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2150  amine oxidase  19.8 
 
 
1293 aa  67.4  0.0000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.017557  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4750  hypothetical protein  21.89 
 
 
436 aa  66.6  0.0000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2937  amine oxidase  21.57 
 
 
448 aa  65.5  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13546  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1142  amine oxidase  21.67 
 
 
428 aa  62.8  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8137  Protoporphyrinogen oxidase-like protein  27.08 
 
 
491 aa  62.4  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.163406  normal  0.434149 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2685  amine oxidase, flavin-containing  21.99 
 
 
449 aa  61.6  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.327813  normal  0.0635309 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1072  hypothetical protein  21.75 
 
 
421 aa  60.8  0.00000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00830956 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1556  UDP-galactopyranose mutase  26.64 
 
 
383 aa  58.9  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0216  UDP-galactopyranose mutase  23.11 
 
 
452 aa  59.3  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2265  UDP-galactopyranose mutase  26.77 
 
 
384 aa  58.2  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0893  amine oxidase  20.32 
 
 
431 aa  58.2  0.0000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000373233 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0501  hypothetical protein  23.96 
 
 
437 aa  57.4  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0862  UDP-galactopyranose mutase  22.22 
 
 
424 aa  57  0.0000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.804118  normal  0.0706079 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0325  hypothetical protein  25.68 
 
 
428 aa  57  0.0000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1418  FAD dependent oxidoreductase  22.44 
 
 
450 aa  57  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.804281  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0140  hypothetical protein  25 
 
 
432 aa  56.2  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.63632  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1401  UDP-galactopyranose mutase  25.82 
 
 
395 aa  55.8  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01310  UDP-galactopyranose mutase  26.86 
 
 
415 aa  56.2  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.18508  normal  0.915549 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5416  Protoporphyrinogen oxidase-like protein  23.09 
 
 
471 aa  56.2  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0286038 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1305  UDP-galactopyranose mutase  27.22 
 
 
377 aa  55.5  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.36953  normal  0.672952 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4319  UDP-galactopyranose mutase  25.26 
 
 
395 aa  55.5  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.591076  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3950  FAD dependent oxidoreductase  45.71 
 
 
330 aa  55.1  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3019  UDP-galactopyranose mutase  26.05 
 
 
381 aa  53.9  0.000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.195146  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2040  UDP-galactopyranose mutase  28.49 
 
 
366 aa  53.1  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00394808  normal  0.0793604 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3894  UDP-galactopyranose mutase  25.14 
 
 
391 aa  52  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2575  UDP-galactopyranose mutase  25.56 
 
 
395 aa  52.4  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0204  UDP-galactopyranose mutase  26.59 
 
 
398 aa  51.6  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.255316  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0635  UDP-galactopyranose mutase  25.14 
 
 
389 aa  51.6  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3903  UDP-galactopyranose mutase  24.86 
 
 
369 aa  51.2  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20850  UDP-galactopyranose mutase  23.2 
 
 
386 aa  50.8  0.00005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0893  hypothetical protein  22.86 
 
 
427 aa  50.4  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4000  hypothetical protein  25.84 
 
 
383 aa  50.4  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1621  UDP-galactopyranose mutase  28.57 
 
 
367 aa  50.4  0.00007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0464676  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1666  protoporphyrinogen oxidase  21.82 
 
 
469 aa  50.1  0.00008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2875  phytoene desaturase  25.08 
 
 
479 aa  50.1  0.00008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.202948  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0128  UDP-galactopyranose mutase  25.42 
 
 
394 aa  50.1  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1492  hypothetical protein  25.34 
 
 
436 aa  49.3  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0711656 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1159  UDP-galactopyranose mutase  25.73 
 
 
425 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.183925  normal  0.0936925 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1705  hypothetical protein  23.81 
 
 
436 aa  49.3  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.823957 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2694  UDP-galactopyranose mutase  26.11 
 
 
395 aa  48.9  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.42371  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0842  UDP-galactopyranose mutase  24.71 
 
 
383 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000837318 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3888  UDP-galactopyranose mutase  23.46 
 
 
395 aa  48.5  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00485328 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1454  UDP-galactopyranose mutase  22.29 
 
 
370 aa  48.9  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2424  UDP-galactopyranose mutase  26.09 
 
 
409 aa  49.3  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0628072 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13843  UDP-galactopyranose mutase glf  25.73 
 
 
399 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.286421 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08860  UDP-galactopyranose mutase  26.23 
 
 
395 aa  48.1  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.271109 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5128  zeta-phytoene desaturase  28.21 
 
 
506 aa  48.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.146602 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2901  hypothetical protein  20.25 
 
 
427 aa  48.1  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000885481  normal  0.0535803 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2020  UDP-galactopyranose mutase  25.97 
 
 
814 aa  47.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.843123  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2533  UDP-galactopyranose mutase  24.86 
 
 
381 aa  47.8  0.0004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2530  UDP-galactopyranose mutase  24.44 
 
 
399 aa  47.4  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0779  UDP-galactopyranose mutase  24.14 
 
 
383 aa  47.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.110856  normal  0.152549 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1179  UDP-galactopyranose mutase  22.73 
 
 
413 aa  47.8  0.0005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3047  O-antigen synthesis protein WbyH  20.25 
 
 
427 aa  47.4  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0665883  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0876  UDP-galactopyranose mutase  24.14 
 
 
383 aa  47.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.1789 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1366  amine oxidase  21.04 
 
 
523 aa  47  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00171854  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>