138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1402 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_1402  UDP-galactopyranose mutase  100 
 
 
396 aa  822    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1741  UDP-galactopyranose mutase  75.06 
 
 
391 aa  614  1e-175  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0219  UDP-galactopyranose mutase  70.94 
 
 
380 aa  572  1.0000000000000001e-162  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1374  UDP-galactopyranose mutase  62.77 
 
 
372 aa  492  9.999999999999999e-139  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1143  UDP-galactopyranose mutase  63.1 
 
 
372 aa  489  1e-137  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000571156  hitchhiker  0.00000314352 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3361  UDP-galactopyranose mutase  58.4 
 
 
368 aa  461  9.999999999999999e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.509275  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5059  UDP-galactopyranose mutase  59.84 
 
 
367 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2040  UDP-galactopyranose mutase  55.53 
 
 
366 aa  434  1e-120  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00394808  normal  0.0793604 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08330  UDP-galactopyranose mutase  55.05 
 
 
371 aa  428  1e-119  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0799137  normal  0.20676 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1076  UDP-galactopyranose mutase  55.23 
 
 
370 aa  430  1e-119  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0717  UDP-galactopyranose mutase  53.89 
 
 
365 aa  426  1e-118  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1621  UDP-galactopyranose mutase  54.79 
 
 
367 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0464676  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14770  UDP-galactopyranose mutase  53.19 
 
 
370 aa  411  1e-113  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0269497 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1159  UDP-galactopyranose mutase  43.01 
 
 
425 aa  313  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.183925  normal  0.0936925 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5650  UDP-galactopyranose mutase  44.03 
 
 
413 aa  312  5.999999999999999e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.463461  normal  0.994274 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5108  UDP-galactopyranose mutase  43.54 
 
 
399 aa  310  2e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.302478 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5401  UDP-galactopyranose mutase  43.54 
 
 
399 aa  310  2e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.379754 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5020  UDP-galactopyranose mutase  43.54 
 
 
428 aa  310  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0635  UDP-galactopyranose mutase  44 
 
 
389 aa  310  4e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0161  UDP-galactopyranose mutase  42.42 
 
 
402 aa  304  2.0000000000000002e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0128  UDP-galactopyranose mutase  41.38 
 
 
394 aa  296  3e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13843  UDP-galactopyranose mutase glf  42.04 
 
 
399 aa  295  8e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.286421 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1171  UDP-galactopyranose mutase  41.58 
 
 
395 aa  295  1e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0707003  normal  0.958151 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01310  UDP-galactopyranose mutase  41.87 
 
 
415 aa  294  2e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.18508  normal  0.915549 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20850  UDP-galactopyranose mutase  40.58 
 
 
386 aa  294  2e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0204  UDP-galactopyranose mutase  40.84 
 
 
398 aa  291  2e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.255316  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4319  UDP-galactopyranose mutase  40.91 
 
 
395 aa  290  5.0000000000000004e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.591076  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2533  UDP-galactopyranose mutase  38.85 
 
 
381 aa  285  7e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08860  UDP-galactopyranose mutase  39.84 
 
 
395 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.271109 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2575  UDP-galactopyranose mutase  38.89 
 
 
395 aa  281  2e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1579  UDP-galactopyranose mutase  39.64 
 
 
392 aa  280  4e-74  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0842  UDP-galactopyranose mutase  40.38 
 
 
383 aa  278  8e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000837318 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2694  UDP-galactopyranose mutase  39.28 
 
 
395 aa  277  2e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.42371  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0779  UDP-galactopyranose mutase  40.11 
 
 
383 aa  277  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.110856  normal  0.152549 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0876  UDP-galactopyranose mutase  39.84 
 
 
383 aa  275  8e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.1789 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5043  UDP-galactopyranose mutase  38.75 
 
 
381 aa  274  2.0000000000000002e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1179  UDP-galactopyranose mutase  38.29 
 
 
413 aa  273  4.0000000000000004e-72  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2424  UDP-galactopyranose mutase  39.28 
 
 
409 aa  273  4.0000000000000004e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0628072 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1401  UDP-galactopyranose mutase  38.3 
 
 
395 aa  272  7e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3019  UDP-galactopyranose mutase  39.79 
 
 
381 aa  272  8.000000000000001e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.195146  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0608  UDP-galactopyranose mutase  40.27 
 
 
381 aa  271  1e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3088  UDP-galactopyranose mutase  42.97 
 
 
367 aa  270  2.9999999999999997e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.552299  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3888  UDP-galactopyranose mutase  38.58 
 
 
395 aa  268  1e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00485328 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1637  UDP-galactopyranose mutase  39.37 
 
 
383 aa  267  2e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.56586 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4000  hypothetical protein  39.41 
 
 
383 aa  267  2e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1194  UDP-galactopyranose mutase  37.7 
 
 
379 aa  266  5.999999999999999e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.886744  normal  0.725852 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4165  UDP-galactopyranose mutase  38.48 
 
 
373 aa  266  5.999999999999999e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.367331 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2530  UDP-galactopyranose mutase  38.34 
 
 
399 aa  263  6e-69  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3894  UDP-galactopyranose mutase  40.05 
 
 
391 aa  261  2e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0088  UDP-galactopyranose mutase  37.53 
 
 
390 aa  261  2e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.616523  normal  0.0498418 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2265  UDP-galactopyranose mutase  37.97 
 
 
384 aa  260  3e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2898  UDP-galactopyranose mutase  36.31 
 
 
393 aa  259  6e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373026  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4186  UDP-galactopyranose mutase  38.44 
 
 
399 aa  258  1e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2702  UDP-galactopyranose mutase  36.41 
 
 
393 aa  257  2e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.601095  normal  0.0699705 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2341  UDP-galactopyranose mutase  36.7 
 
 
398 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0445173  normal  0.0301397 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1556  UDP-galactopyranose mutase  40.49 
 
 
383 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3621  UDP-galactopyranose mutase  38.24 
 
 
372 aa  254  2.0000000000000002e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.585126  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4014  UDP-galactopyranose mutase  38.2 
 
 
376 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2020  UDP-galactopyranose mutase  38.34 
 
 
814 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.843123  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4106  UDP-galactopyranose mutase  38.34 
 
 
376 aa  253  6e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3214  UDP-galactopyranose mutase  37.89 
 
 
386 aa  251  1e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0851  UDP-galactopyranose mutase  37.27 
 
 
363 aa  250  2e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.435235  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5685  UDP-galactopyranose mutase  38.07 
 
 
783 aa  248  1e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.649144  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0516  UDP-galactopyranose mutase  39.14 
 
 
383 aa  248  1e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0049322  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2744  UDP-galactopyranose mutase  38.07 
 
 
373 aa  246  4e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1305  UDP-galactopyranose mutase  37.2 
 
 
377 aa  244  9.999999999999999e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.36953  normal  0.672952 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5610  UDP-galactopyranose mutase  37.31 
 
 
783 aa  236  7e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00502091 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3903  UDP-galactopyranose mutase  37.67 
 
 
369 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1454  UDP-galactopyranose mutase  37.98 
 
 
370 aa  229  9e-59  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3069  UDP-galactopyranose mutase  33.16 
 
 
391 aa  228  2e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.998088  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2024  UDP-galactopyranose mutase  37.6 
 
 
375 aa  228  2e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1566  UDP-galactopyranose mutase  34.73 
 
 
382 aa  223  4e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00174985  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2888  UDP-galactopyranose mutase  33.61 
 
 
364 aa  219  5e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.656694  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_4114  predicted protein  34.09 
 
 
391 aa  218  2e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.718701  normal  0.169117 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1727  UDP-galactopyranose mutase  33.67 
 
 
404 aa  215  9.999999999999999e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0324536  normal  0.111313 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42228  predicted protein  33.42 
 
 
460 aa  211  2e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5440  UDP-galactopyranose mutase  35.17 
 
 
369 aa  209  7e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.214475 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0647  UDP-galactopyranose mutase  32.22 
 
 
400 aa  199  7.999999999999999e-50  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000447576  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1602  UDP-galactopyranose mutase  25.77 
 
 
369 aa  82.8  0.000000000000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0347601  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2861  hypothetical protein  25.47 
 
 
511 aa  65.1  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.245537 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14591  UDP-galactopyranose mutase  23.6 
 
 
394 aa  62.4  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4465  amine oxidase  29.94 
 
 
480 aa  56.6  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3374  amine oxidase  28.81 
 
 
512 aa  55.1  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1637  hypothetical protein  26.95 
 
 
516 aa  55.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.252141 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4898  hypothetical protein  27.01 
 
 
494 aa  55.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00550747  normal  0.0440629 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0374  hypothetical protein  26.35 
 
 
500 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.10021  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2236  hypothetical protein  27.38 
 
 
500 aa  53.9  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0391032 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4196  amine oxidase  27.81 
 
 
496 aa  53.5  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2649  hypothetical protein  25.86 
 
 
498 aa  53.1  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0340038  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0204  amine oxidase  26.34 
 
 
435 aa  53.5  0.000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.420312  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8013  hypothetical protein  27.98 
 
 
524 aa  52.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3497  amine oxidase  26.4 
 
 
507 aa  52.8  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.281636  normal  0.0813869 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3017  hypothetical protein  45.61 
 
 
484 aa  51.2  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.191221  normal  0.019056 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2880  hypothetical protein  24.71 
 
 
511 aa  51.2  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0436694 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0307  amine oxidase  27.67 
 
 
448 aa  50.4  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01400  conserved hypothetical protein  31.91 
 
 
470 aa  49.3  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3185  hypothetical protein  43.86 
 
 
245 aa  49.3  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29229  hitchhiker  0.00171019 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3095  hypothetical protein  25.44 
 
 
500 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0991  hypothetical protein  25.13 
 
 
519 aa  48.5  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.97338  hitchhiker  0.00393632 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0902  hypothetical protein  29.89 
 
 
465 aa  48.5  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.787196  normal  0.0359011 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>