185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0902 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_0902  hypothetical protein  100 
 
 		 465 aa  967    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.787196  normal  0.0359011 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4465  amine oxidase  28.91 
 
 		 480 aa  200  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4196  amine oxidase  27.85 
 
 		 496 aa  189  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2236  hypothetical protein  28.48 
 
 		 500 aa  186  8e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0391032 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1637  hypothetical protein  28.6 
 
 		 516 aa  183  6e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.252141 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0374  hypothetical protein  27.43 
 
 		 500 aa  178  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.10021  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3095  hypothetical protein  28.15 
 
 		 500 aa  177  3e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3374  amine oxidase  26.86 
 
 		 512 aa  173  6.999999999999999e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8013  hypothetical protein  26.24 
 
 		 524 aa  167  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2880  hypothetical protein  26.76 
 
 		 511 aa  164  3e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0436694 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0984  amine oxidase  28.45 
 
 		 520 aa  163  5.0000000000000005e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2861  hypothetical protein  27.66 
 
 		 511 aa  162  9e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.245537 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2649  hypothetical protein  27.39 
 
 		 498 aa  161  2e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0340038  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0045  hypothetical protein  26.71 
 
 		 472 aa  156  7e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00889429  hitchhiker  0.00142526 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4898  hypothetical protein  26.97 
 
 		 494 aa  155  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00550747  normal  0.0440629 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3497  amine oxidase  24.68 
 
 		 507 aa  152  1e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.281636  normal  0.0813869 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1201  hypothetical protein  25.05 
 
 		 537 aa  139  1e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0991  hypothetical protein  24.85 
 
 		 519 aa  139  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.97338  hitchhiker  0.00393632 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0064  hypothetical protein  22.62 
 
 		 549 aa  134  3.9999999999999996e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2036  amine oxidase, flavin-containing  25.79 
 
 		 459 aa  130  3e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2934  hypothetical protein  22.88 
 
 		 538 aa  130  7.000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0109  FAD dependent oxidoreductase  24.9 
 
 		 539 aa  129  8.000000000000001e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0065  protoporphyrinogen oxidase  25.58 
 
 		 459 aa  129  1.0000000000000001e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0031  Protoporphyrinogen oxidase-like protein  22.97 
 
 		 1033 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000538665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2305  glycosyl transferase family 2  25.57 
 
 		 722 aa  116  8.999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0138852  normal  0.273361 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8137  Protoporphyrinogen oxidase-like protein  25.1 
 
 		 491 aa  114  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.163406  normal  0.434149 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1706  hypothetical protein  24.29 
 
 		 465 aa  108  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.186838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3587  hypothetical protein  25.42 
 
 		 463 aa  97.8  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.584997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3582  hypothetical protein  25.42 
 
 		 463 aa  97.8  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.932394  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3655  hypothetical protein  25.42 
 
 		 463 aa  97.8  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1418  FAD dependent oxidoreductase  23.37 
 
 		 450 aa  93.2  9e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.804281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0966  UDP-galactopyranose mutase  25 
 
 		 447 aa  90.9  5e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7546  FAD dependent oxidoreductase  21.76 
 
 		 489 aa  88.6  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.50279 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4750  hypothetical protein  23.6 
 
 		 436 aa  89  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0942  amine oxidase  23.37 
 
 		 449 aa  83.2  0.000000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.15931  normal  0.877558 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1076  amine oxidase  23.58 
 
 		 437 aa  82.8  0.00000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2101  amine oxidase  22.59 
 
 		 452 aa  80.1  0.00000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0204  amine oxidase  22.76 
 
 		 435 aa  74.7  0.000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.420312  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00060  conserved expressed protein  23.59 
 
 		 538 aa  72  0.00000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0591276  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2685  amine oxidase, flavin-containing  23.54 
 
 		 449 aa  72  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.327813  normal  0.0635309 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0501  hypothetical protein  22.49 
 
 		 437 aa  70.5  0.00000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2937  amine oxidase  21.76 
 
 		 448 aa  70.1  0.00000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1928  FAD dependent oxidoreductase  23.54 
 
 		 460 aa  69.7  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3903  UDP-galactopyranose mutase  27.36 
 
 		 369 aa  66.6  0.0000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1454  amine oxidase  31.52 
 
 		 456 aa  64.3  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.162575  normal  0.372865 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2150  amine oxidase  22 
 
 		 1293 aa  63.5  0.000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.017557  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0375  hypothetical protein  22.39 
 
 		 428 aa  63.5  0.000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.427757  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1142  amine oxidase  21.03 
 
 		 428 aa  62.4  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1446  amine oxidase  19.91 
 
 		 446 aa  62.4  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.14723  normal  0.0175327 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4000  hypothetical protein  26.34 
 
 		 383 aa  61.6  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1512  amine oxidase, flavin-containing  20.67 
 
 		 454 aa  60.5  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.118585  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0851  UDP-galactopyranose mutase  26.63 
 
 		 363 aa  60.1  0.00000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.435235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0893  amine oxidase  21.37 
 
 		 431 aa  59.7  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000373233 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0216  UDP-galactopyranose mutase  23.26 
 
 		 452 aa  58.5  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0121  amine oxidase  23.02 
 
 		 436 aa  58.5  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.406547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4165  UDP-galactopyranose mutase  28.08 
 
 		 373 aa  57.8  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.367331 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3019  UDP-galactopyranose mutase  24.73 
 
 		 381 aa  57  0.0000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.195146  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1454  UDP-galactopyranose mutase  24.86 
 
 		 370 aa  57  0.0000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03112  conserved hypothetical protein  23.72 
 
 		 532 aa  56.2  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.630535  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0516  UDP-galactopyranose mutase  27.03 
 
 		 383 aa  55.8  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0049322  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1305  UDP-galactopyranose mutase  27.81 
 
 		 377 aa  55.1  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.36953  normal  0.672952 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2020  UDP-galactopyranose mutase  24.34 
 
 		 814 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.843123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1995  All-trans-retinol 13,14-reductase  41.67 
 
 		 499 aa  54.7  0.000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1402  UDP-galactopyranose mutase  21.39 
 
 		 396 aa  53.1  0.000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0219  UDP-galactopyranose mutase  21.18 
 
 		 380 aa  52.8  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2530  UDP-galactopyranose mutase  27.03 
 
 		 399 aa  52  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2357  L-amino-acid oxidase  39.71 
 
 		 532 aa  52  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0956  amine oxidase  41.67 
 
 		 434 aa  52.4  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.618507  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1349  aminomethyltransferase  51.35 
 
 		 961 aa  51.2  0.00003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0486795  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3621  UDP-galactopyranose mutase  26.2 
 
 		 372 aa  51.6  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.585126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4506  cyclohexanone monooxygenase  39.02 
 
 		 661 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.569378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0088  UDP-galactopyranose mutase  27.8 
 
 		 390 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.616523  normal  0.0498418 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2373  phytoene desaturase  48.08 
 
 		 519 aa  50.8  0.00005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.145608  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1150  amine oxidase  36.56 
 
 		 491 aa  50.1  0.00009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1144  protoporphyrinogen oxidase  30.88 
 
 		 441 aa  50.1  0.00009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1077  all-trans-retinol 13,14-reductase  35.94 
 
 		 505 aa  50.1  0.00009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2265  UDP-galactopyranose mutase  24.23 
 
 		 384 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1194  UDP-galactopyranose mutase  25.73 
 
 		 379 aa  48.9  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.886744  normal  0.725852 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08860  UDP-galactopyranose mutase  22.07 
 
 		 395 aa  49.3  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.271109 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1827  twin-arginine translocation pathway signal  28.78 
 
 		 526 aa  49.3  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.959499  normal  0.603483 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1741  UDP-galactopyranose mutase  32.18 
 
 		 391 aa  48.1  0.0003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5043  UDP-galactopyranose mutase  26.74 
 
 		 381 aa  48.5  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0607  cyclohexanone monooxygenase  37.14 
 
 		 550 aa  48.1  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195368 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03825  hypothetical protein  32.81 
 
 		 508 aa  48.1  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5789  amine oxidase  26.24 
 
 		 444 aa  48.5  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1827  amine oxidase  37.04 
 
 		 433 aa  47.8  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1705  hypothetical protein  21.17 
 
 		 436 aa  47.8  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.823957 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0893  hypothetical protein  19.82 
 
 		 427 aa  47.8  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0040  putrescine oxidase  41.18 
 
 		 462 aa  47.4  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1154  hypothetical protein  32.1 
 
 		 337 aa  47.4  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.177743  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1171  UDP-galactopyranose mutase  21.62 
 
 		 395 aa  47.8  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0707003  normal  0.958151 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0481  hypothetical protein  24.48 
 
 		 450 aa  47.4  0.0006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.0000175856  decreased coverage  0.00000000723889 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3088  UDP-galactopyranose mutase  21.83 
 
 		 367 aa  47.4  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.552299  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2262  amine oxidase  39.66 
 
 		 436 aa  47.4  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0239134  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0060  hypothetical protein  25 
 
 		 437 aa  47  0.0007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0073  amine oxidase  37.04 
 
 		 474 aa  47  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6497  protoporphyrinogen oxidase  35.37 
 
 		 442 aa  46.6  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.56742 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5610  UDP-galactopyranose mutase  24.59 
 
 		 783 aa  47  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00502091 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_4114  predicted protein  25.52 
 
 		 391 aa  47  0.0008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.718701  normal  0.169117 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2101  monooxygenase FAD-binding protein  39.22 
 
 		 368 aa  46.6  0.0009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>