145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0893 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_0893  amine oxidase  100 
 
 
431 aa  887    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000373233 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2150  amine oxidase  31.06 
 
 
1293 aa  237  4e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.017557  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2101  amine oxidase  32.71 
 
 
452 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1512  amine oxidase, flavin-containing  30.89 
 
 
454 aa  218  1e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.118585  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0942  amine oxidase  28.81 
 
 
449 aa  209  8e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.15931  normal  0.877558 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0216  UDP-galactopyranose mutase  30.09 
 
 
452 aa  207  2e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2685  amine oxidase, flavin-containing  30.88 
 
 
449 aa  208  2e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.327813  normal  0.0635309 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4100  Protoporphyrinogen oxidase-like protein  28.96 
 
 
467 aa  189  8e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.105834  normal  0.0160826 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1928  FAD dependent oxidoreductase  29.76 
 
 
460 aa  187  2e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0966  UDP-galactopyranose mutase  30.24 
 
 
447 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1076  amine oxidase  26.97 
 
 
437 aa  184  3e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0121  amine oxidase  29.53 
 
 
436 aa  179  7e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.406547  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0204  amine oxidase  25.74 
 
 
435 aa  176  6e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.420312  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1446  amine oxidase  26.54 
 
 
446 aa  174  2.9999999999999996e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.14723  normal  0.0175327 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0481  hypothetical protein  26.12 
 
 
450 aa  168  1e-40  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.0000175856  decreased coverage  0.00000000723889 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03112  conserved hypothetical protein  25.17 
 
 
532 aa  157  4e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.630535  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0375  hypothetical protein  26.27 
 
 
428 aa  153  4e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.427757  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00060  conserved expressed protein  25.33 
 
 
538 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0591276  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1142  amine oxidase  27.25 
 
 
428 aa  141  1.9999999999999998e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3047  O-antigen synthesis protein WbyH  25.75 
 
 
427 aa  132  9e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0665883  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2901  hypothetical protein  25.5 
 
 
427 aa  132  1.0000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000885481  normal  0.0535803 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0329  Protoporphyrinogen oxidase-like protein  25.88 
 
 
431 aa  129  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0045  hypothetical protein  24.83 
 
 
472 aa  111  3e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00889429  hitchhiker  0.00142526 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0862  UDP-galactopyranose mutase  24.25 
 
 
424 aa  109  8.000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.804118  normal  0.0706079 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3497  amine oxidase  22.73 
 
 
507 aa  98.2  2e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.281636  normal  0.0813869 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2861  hypothetical protein  23.85 
 
 
511 aa  95.5  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.245537 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2880  hypothetical protein  22.54 
 
 
511 aa  95.5  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0436694 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1072  hypothetical protein  21.99 
 
 
421 aa  94  5e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00830956 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4196  amine oxidase  22.94 
 
 
496 aa  93.2  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1637  hypothetical protein  23.2 
 
 
516 aa  89.7  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.252141 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4898  hypothetical protein  22.76 
 
 
494 aa  89.4  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00550747  normal  0.0440629 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3374  amine oxidase  22.13 
 
 
512 aa  89  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4465  amine oxidase  23.03 
 
 
480 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2649  hypothetical protein  22.56 
 
 
498 aa  87.4  4e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0340038  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2236  hypothetical protein  21.91 
 
 
500 aa  87.4  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0391032 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2305  glycosyl transferase family 2  24.42 
 
 
722 aa  85.9  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0138852  normal  0.273361 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3095  hypothetical protein  22.57 
 
 
500 aa  86.3  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8013  hypothetical protein  22.22 
 
 
524 aa  82  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0544  amine oxidase  25.66 
 
 
525 aa  81.3  0.00000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00189501  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0374  hypothetical protein  20.86 
 
 
500 aa  77.4  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.10021  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3587  hypothetical protein  20.96 
 
 
463 aa  70.9  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.584997  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0984  amine oxidase  20.32 
 
 
520 aa  71.2  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1418  FAD dependent oxidoreductase  21.47 
 
 
450 aa  70.9  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.804281  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1706  hypothetical protein  22.39 
 
 
465 aa  70.5  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.186838  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3582  hypothetical protein  20.74 
 
 
463 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.932394  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3655  hypothetical protein  20.74 
 
 
463 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0501  hypothetical protein  25.63 
 
 
437 aa  67.8  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4750  hypothetical protein  20.99 
 
 
436 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0064  hypothetical protein  20.94 
 
 
549 aa  59.3  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0065  protoporphyrinogen oxidase  20.32 
 
 
459 aa  58.2  0.0000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2024  UDP-galactopyranose mutase  24.38 
 
 
375 aa  57.8  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2036  amine oxidase, flavin-containing  20.32 
 
 
459 aa  57.4  0.0000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1201  hypothetical protein  20.12 
 
 
537 aa  55.5  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8137  Protoporphyrinogen oxidase-like protein  23.79 
 
 
491 aa  54.3  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.163406  normal  0.434149 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2149  hypothetical protein  21.52 
 
 
429 aa  53.1  0.000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.226037  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0592  protoporphyrinogen oxidase  22.9 
 
 
472 aa  53.1  0.000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.916026  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0902  hypothetical protein  21.04 
 
 
465 aa  53.1  0.000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.787196  normal  0.0359011 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1885  protoporphyrinogen oxidase  22.95 
 
 
466 aa  52.8  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000633111  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1919  protoporphyrinogen oxidase  22.95 
 
 
466 aa  52.8  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00206772  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0031  Protoporphyrinogen oxidase-like protein  21.43 
 
 
1033 aa  52  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000538665  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26410  UDP-galactopyranose mutase  33.33 
 
 
507 aa  52.4  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.739873 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0826  protoporphyrinogen oxidase  21.99 
 
 
473 aa  51.2  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.981055  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1774  protoporphyrinogen oxidase  22.55 
 
 
466 aa  51.2  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000300096  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1574  protoporphyrinogen oxidase  24.49 
 
 
435 aa  50.8  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.304554  normal  0.228585 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2948  protoporphyrinogen oxidase  22.98 
 
 
463 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000866681  hitchhiker  0.00000000115848 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0112  FAD dependent oxidoreductase  37.33 
 
 
487 aa  50.8  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0699636 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1701  amine oxidase  47.37 
 
 
503 aa  50.4  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00066646 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2934  hypothetical protein  20.91 
 
 
538 aa  50.4  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0626  carotenoid isomerase, putative  44.64 
 
 
507 aa  50.1  0.00007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2330  carotene isomerase  22.87 
 
 
508 aa  49.7  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1454  UDP-galactopyranose mutase  26.01 
 
 
370 aa  49.7  0.00009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2232  protoporphyrinogen oxidase  22.22 
 
 
466 aa  49.7  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.142231  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3069  UDP-galactopyranose mutase  25.4 
 
 
391 aa  48.5  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.998088  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2383  protoporphyrinogen oxidase  22.55 
 
 
463 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000492164  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1552  hypothetical protein  21.81 
 
 
435 aa  48.5  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.113177  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2517  protoporphyrinogen oxidase  22.98 
 
 
466 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000347009  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0521  protoporphyrinogen oxidase  21.02 
 
 
467 aa  48.5  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2450  protoporphyrinogen oxidase  24.07 
 
 
466 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0040978  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2172  protoporphyrinogen oxidase  22.98 
 
 
466 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000233658  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3715  twin-arginine translocation pathway signal  36 
 
 
550 aa  48.1  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.697054  normal  0.0792167 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1666  protoporphyrinogen oxidase  20.73 
 
 
469 aa  48.1  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0851  UDP-galactopyranose mutase  20.45 
 
 
363 aa  48.1  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.435235  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2212  protoporphyrinogen oxidase  22.55 
 
 
466 aa  47.8  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.10551e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0109  FAD dependent oxidoreductase  19.36 
 
 
539 aa  47.8  0.0004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0991  protoporphyrinogen oxidase  20.42 
 
 
473 aa  47.8  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2159  protoporphyrinogen oxidase  23.8 
 
 
465 aa  47.4  0.0005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1399  phytoene desaturase  42.31 
 
 
502 aa  47.4  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4081  amine oxidase  43.14 
 
 
571 aa  47  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.39239 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2436  protoporphyrinogen oxidase  23.85 
 
 
466 aa  47  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.178032 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2253  protoporphyrinogen oxidase  22.55 
 
 
466 aa  47  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000489474  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2418  protoporphyrinogen oxidase  22.55 
 
 
466 aa  47  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0259835  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0986  protoporphyrinogen oxidase  33.33 
 
 
473 aa  46.6  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0988  protoporphyrinogen oxidase  33.33 
 
 
473 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000269776  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1154  protoporphyrinogen oxidase  33.33 
 
 
473 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2043  amine oxidase  36.23 
 
 
476 aa  46.2  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0112057  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0806  amine oxidase  19.54 
 
 
726 aa  46.2  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2574  amine oxidase  30.08 
 
 
455 aa  46.6  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.278816  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3734  phytoene desaturase  33.72 
 
 
508 aa  46.2  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.964384  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0766  amine oxidase  36.36 
 
 
522 aa  46.2  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0760  FAD dependent oxidoreductase  26.35 
 
 
503 aa  45.8  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.522072 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>