19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1290 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_1290  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 455 aa  944    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1637  hypothetical protein  25.28 
 
 		 516 aa  52.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.252141 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09643  hypothetical protein  23.51 
 
 		 535 aa  50.1  0.00007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0783431  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0984  amine oxidase  21.65 
 
 		 520 aa  49.3  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0544  amine oxidase  38.98 
 
 		 525 aa  48.9  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00189501  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4196  amine oxidase  23.72 
 
 		 496 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4465  amine oxidase  22.94 
 
 		 480 aa  47.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1144  protoporphyrinogen oxidase  26.07 
 
 		 441 aa  47  0.0007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1890  protoporphyrinogen oxidase  28.49 
 
 		 454 aa  45.8  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1928  FAD dependent oxidoreductase  41.82 
 
 		 460 aa  44.7  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1454  UDP-galactopyranose mutase  32.22 
 
 		 370 aa  44.3  0.004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1523  amine oxidase  28.41 
 
 		 438 aa  44.7  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.834861  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1847  phytoene dehydrogenase-related protein  41.18 
 
 		 503 aa  44.7  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3185  hypothetical protein  46.15 
 
 		 245 aa  44.7  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29229  hitchhiker  0.00171019 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00060  conserved expressed protein  20.48 
 
 		 538 aa  44.3  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0591276  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2530  UDP-galactopyranose mutase  41.43 
 
 		 399 aa  43.9  0.006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1429  protoporphyrinogen oxidase  26.2 
 
 		 473 aa  43.5  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0216  UDP-galactopyranose mutase  38.18 
 
 		 452 aa  43.5  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2710  twin-arginine translocation pathway signal  26.03 
 
 		 469 aa  43.5  0.008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>