152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8137 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_8137  Protoporphyrinogen oxidase-like protein  100 
 
 		 491 aa  961    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.163406  normal  0.434149 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7546  FAD dependent oxidoreductase  52.95 
 
 		 489 aa  460  9.999999999999999e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.50279 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4196  amine oxidase  26.22 
 
 		 496 aa  160  4e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3374  amine oxidase  28.42 
 
 		 512 aa  157  5.0000000000000005e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4465  amine oxidase  26.17 
 
 		 480 aa  150  7e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0984  amine oxidase  25.89 
 
 		 520 aa  140  6e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3095  hypothetical protein  26.49 
 
 		 500 aa  140  6e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4898  hypothetical protein  26.99 
 
 		 494 aa  140  7e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00550747  normal  0.0440629 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8013  hypothetical protein  27.99 
 
 		 524 aa  139  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2649  hypothetical protein  27.08 
 
 		 498 aa  135  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0340038  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0902  hypothetical protein  24.48 
 
 		 465 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.787196  normal  0.0359011 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2880  hypothetical protein  28.12 
 
 		 511 aa  134  5e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0436694 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1637  hypothetical protein  28.87 
 
 		 516 aa  133  7.999999999999999e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.252141 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2236  hypothetical protein  27.92 
 
 		 500 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0391032 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2861  hypothetical protein  28.12 
 
 		 511 aa  131  3e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.245537 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0045  hypothetical protein  21.78 
 
 		 472 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00889429  hitchhiker  0.00142526 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0374  hypothetical protein  28.39 
 
 		 500 aa  124  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.10021  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3497  amine oxidase  27.37 
 
 		 507 aa  124  4e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.281636  normal  0.0813869 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0031  Protoporphyrinogen oxidase-like protein  22.62 
 
 		 1033 aa  116  7.999999999999999e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000538665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2036  amine oxidase, flavin-containing  22.92 
 
 		 459 aa  114  5e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0065  protoporphyrinogen oxidase  22.71 
 
 		 459 aa  112  1.0000000000000001e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1706  hypothetical protein  26.35 
 
 		 465 aa  109  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.186838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0991  hypothetical protein  21.8 
 
 		 519 aa  107  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.97338  hitchhiker  0.00393632 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0064  hypothetical protein  21.24 
 
 		 549 aa  105  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2305  glycosyl transferase family 2  22.32 
 
 		 722 aa  100  4e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0138852  normal  0.273361 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1076  amine oxidase  24.04 
 
 		 437 aa  90.5  6e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1418  FAD dependent oxidoreductase  26.67 
 
 		 450 aa  90.1  9e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.804281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0942  amine oxidase  23.46 
 
 		 449 aa  87  6e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.15931  normal  0.877558 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0966  UDP-galactopyranose mutase  21.78 
 
 		 447 aa  86.7  8e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2934  hypothetical protein  20.79 
 
 		 538 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4750  hypothetical protein  26.03 
 
 		 436 aa  85.1  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2101  amine oxidase  24.53 
 
 		 452 aa  84.3  0.000000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3582  hypothetical protein  24.89 
 
 		 463 aa  81.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.932394  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3655  hypothetical protein  24.89 
 
 		 463 aa  81.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3587  hypothetical protein  24.89 
 
 		 463 aa  81.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.584997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0204  amine oxidase  25.22 
 
 		 435 aa  79  0.0000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.420312  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1928  FAD dependent oxidoreductase  30.8 
 
 		 460 aa  77.4  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1201  hypothetical protein  23.69 
 
 		 537 aa  76.6  0.000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1512  amine oxidase, flavin-containing  23.46 
 
 		 454 aa  75.1  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.118585  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0121  amine oxidase  24.37 
 
 		 436 aa  74.7  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.406547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2685  amine oxidase, flavin-containing  24.64 
 
 		 449 aa  73.9  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.327813  normal  0.0635309 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0109  FAD dependent oxidoreductase  21.58 
 
 		 539 aa  73.6  0.000000000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0216  UDP-galactopyranose mutase  23.46 
 
 		 452 aa  69.7  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1446  amine oxidase  22.2 
 
 		 446 aa  67.8  0.0000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.14723  normal  0.0175327 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2150  amine oxidase  22.59 
 
 		 1293 aa  67  0.0000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.017557  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0893  amine oxidase  23.58 
 
 		 431 aa  67  0.0000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000373233 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0481  hypothetical protein  24.07 
 
 		 450 aa  64.7  0.000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.0000175856  decreased coverage  0.00000000723889 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0375  hypothetical protein  23.9 
 
 		 428 aa  59.7  0.0000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.427757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2937  amine oxidase  28.51 
 
 		 448 aa  59.7  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13546  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00060  conserved expressed protein  27.11 
 
 		 538 aa  57.4  0.0000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0591276  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0862  UDP-galactopyranose mutase  25.66 
 
 		 424 aa  55.8  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.804118  normal  0.0706079 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1578  phytoene dehydrogenase-related protein  40.57 
 
 		 504 aa  54.3  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0475016 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4795  hypothetical protein  27.7 
 
 		 419 aa  54.3  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173425  normal  0.558478 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3282  amine oxidase  31.4 
 
 		 451 aa  53.9  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13115  normal  0.103215 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0501  hypothetical protein  25.2 
 
 		 437 aa  53.5  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3185  hypothetical protein  49.06 
 
 		 245 aa  52.8  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29229  hitchhiker  0.00171019 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2043  amine oxidase  34.33 
 
 		 476 aa  53.1  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0112057  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1811  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.23 
 
 		 465 aa  53.1  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.352769 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1831  protoporphyrinogen oxidase  29.41 
 
 		 447 aa  51.6  0.00003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0325  hypothetical protein  42.86 
 
 		 428 aa  51.2  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0592  protoporphyrinogen oxidase  27.73 
 
 		 472 aa  50.8  0.00005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.916026  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0059  hypothetical protein  26.93 
 
 		 453 aa  50.8  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3809  phytoene desaturase  29.66 
 
 		 492 aa  50.8  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4868  amine oxidase  39.68 
 
 		 645 aa  50.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0036  UDP-galactopyranose mutase  22.83 
 
 		 647 aa  50.4  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1143  UDP-galactopyranose mutase  22.82 
 
 		 372 aa  50.4  0.00007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000571156  hitchhiker  0.00000314352 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5454  phytoene dehydrogenase-related protein  40 
 
 		 512 aa  50.4  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26240  monoamine oxidase  46.03 
 
 		 418 aa  50.4  0.00008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.67782  normal  0.0649912 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5620  phytoene desaturase  46.3 
 
 		 497 aa  50.1  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.476172 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1155  hypothetical protein  23.58 
 
 		 423 aa  49.7  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5075  amine oxidase  38.64 
 
 		 512 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0534  amine oxidase  40 
 
 		 647 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.666818  normal  0.352078 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5163  phytoene dehydrogenase-related protein  38.64 
 
 		 512 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.134146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1374  UDP-galactopyranose mutase  38.71 
 
 		 372 aa  50.1  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0517  amine oxidase  40 
 
 		 647 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5128  zeta-phytoene desaturase  43.21 
 
 		 506 aa  49.7  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.146602 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1381  UDP-galactopyranose mutase  46.03 
 
 		 463 aa  48.9  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.399176  normal  0.525187 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1529  hypothetical protein  45.28 
 
 		 468 aa  48.5  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3017  hypothetical protein  45.28 
 
 		 484 aa  48.5  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.191221  normal  0.019056 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0804  hypothetical protein  43.4 
 
 		 468 aa  48.1  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.230959  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5197  phytoene desaturase  29.76 
 
 		 525 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0040  amine oxidase  43.55 
 
 		 463 aa  47.8  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3286  FAD dependent oxidoreductase  35 
 
 		 488 aa  47.8  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.370539 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1666  protoporphyrinogen oxidase  33.12 
 
 		 469 aa  47.4  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6719  Protoporphyrinogen oxidase  28.93 
 
 		 479 aa  47.4  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.141681  normal  0.278597 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4574  HI0933-like protein  37.5 
 
 		 359 aa  47  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3679  glutamate synthase (NADH) small subunit  60.53 
 
 		 471 aa  47  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.15931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0040  putrescine oxidase  43.55 
 
 		 462 aa  47  0.0008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1401  UDP-galactopyranose mutase  28.35 
 
 		 395 aa  47  0.0009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1827  amine oxidase  44.07 
 
 		 433 aa  46.6  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1406  glutamate synthase subunit beta  52.78 
 
 		 479 aa  46.2  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0140  hypothetical protein  36.25 
 
 		 432 aa  46.2  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.63632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5683  hypothetical protein  38.89 
 
 		 491 aa  46.2  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00144248 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1146  hypothetical protein  43.4 
 
 		 468 aa  46.6  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2057  FAD dependent oxidoreductase  47.22 
 
 		 487 aa  46.6  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.548507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1554  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.92 
 
 		 589 aa  46.2  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4135  carotene 7,8-desaturase  43.86 
 
 		 451 aa  46.2  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.190171  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2151  amine oxidase  40 
 
 		 508 aa  45.4  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3361  UDP-galactopyranose mutase  22.65 
 
 		 368 aa  45.8  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.509275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0893  hypothetical protein  32.91 
 
 		 427 aa  45.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>