195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3286 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3286  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 488 aa  998    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.370539 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1053  all-trans-retinol 13,14-reductase  26.49 
 
 		 501 aa  107  5e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0671242 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2254  carotene isomerase  21.81 
 
 		 506 aa  87.4  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000347702 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1423  carotenoid isomerase  22.67 
 
 		 518 aa  83.6  0.000000000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1308  carotene isomerase  24.22 
 
 		 512 aa  81.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1336  carotene isomerase  24.22 
 
 		 512 aa  81.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0735245  hitchhiker  0.00100943 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10011  putative carotenoid isomerase  23.73 
 
 		 520 aa  80.9  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.243247 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1174  All-trans-retinol 13,14-reductase  21.81 
 
 		 522 aa  80.1  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14681  putative carotenoid isomerase  21.26 
 
 		 520 aa  79.7  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.314761  normal  0.880307 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03741  phytoene dehydrogenase  20.16 
 
 		 509 aa  75.9  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0636  putative carotenoid isomerase  21.23 
 
 		 520 aa  75.5  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1681  carotenoid isomerase  22.24 
 
 		 518 aa  74.3  0.000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.157771  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5970  FAD dependent oxidoreductase  24.92 
 
 		 534 aa  74.3  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.633554  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1246  carotene isomerase  24.38 
 
 		 504 aa  73.6  0.000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3281  FAD dependent oxidoreductase  24.36 
 
 		 479 aa  73.6  0.000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.463065  normal  0.0612809 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1995  All-trans-retinol 13,14-reductase  22.09 
 
 		 499 aa  72.8  0.00000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4146  All-trans-retinol 13,14-reductase  24.66 
 
 		 562 aa  72  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.559453  decreased coverage  0.00452261 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3011  All-trans-retinol 13,14-reductase  24.03 
 
 		 544 aa  71.2  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03711  phytoene dehydrogenase  21.09 
 
 		 509 aa  70.5  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1069  FAD dependent oxidoreductase  23.48 
 
 		 496 aa  70.9  0.00000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.302171  hitchhiker  0.00376489 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2330  carotene isomerase  21.61 
 
 		 508 aa  70.1  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7528  putative phytoene dehydrogenase and related proteins  26.38 
 
 		 708 aa  70.1  0.00000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1301  amine oxidase  24.18 
 
 		 425 aa  69.3  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2970  phytoene desaturase  26.46 
 
 		 493 aa  69.3  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000576965 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0318  FAD dependent oxidoreductase  21.28 
 
 		 547 aa  69.7  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03701  phytoene dehydrogenase  22.77 
 
 		 509 aa  68.6  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0640229  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3112  FAD dependent oxidoreductase  22.1 
 
 		 506 aa  68.6  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.270711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4976  FAD dependent oxidoreductase  21.9 
 
 		 515 aa  68.2  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12211  putative carotenoid isomerase  21.5 
 
 		 514 aa  68.2  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0760  FAD dependent oxidoreductase  23.87 
 
 		 503 aa  67.8  0.0000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.522072 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1209  conserved hypothetical protein, FAD-binding domain protein  20.27 
 
 		 502 aa  67  0.0000000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0626  carotenoid isomerase, putative  26.55 
 
 		 507 aa  67  0.0000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2065  FAD dependent oxidoreductase  23.63 
 
 		 484 aa  67  0.0000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6289  FAD dependent oxidoreductase  23.91 
 
 		 510 aa  67  0.0000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00968377  normal  0.473682 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2352  FAD dependent oxidoreductase  23.38 
 
 		 495 aa  67  0.0000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.125181  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1874  All-trans-retinol 13,14-reductase  23.39 
 
 		 501 aa  65.9  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1126  putative carotenoid isomerase  20.93 
 
 		 514 aa  65.1  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.777729  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12061  putative carotenoid isomerase  21.17 
 
 		 514 aa  64.7  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.809432  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2105  FAD dependent oxidoreductase  24.09 
 
 		 554 aa  64.7  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0345  phytoene dehydrogenase  23.96 
 
 		 509 aa  63.9  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12221  putative carotenoid isomerase  21.11 
 
 		 514 aa  63.9  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3632  FAD dependent oxidoreductase  21.75 
 
 		 506 aa  63.5  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0766  amine oxidase  23.03 
 
 		 522 aa  63.5  0.000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2665  putative phytoene dehydrogenase  23.55 
 
 		 495 aa  63.2  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1077  all-trans-retinol 13,14-reductase  19.89 
 
 		 505 aa  62.8  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0381  amine oxidase  25.64 
 
 		 510 aa  62.4  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3225  Zeta-phytoene desaturase  26.01 
 
 		 475 aa  62  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.328594  hitchhiker  0.00724213 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1888  carotenoid isomerase, putative  23.45 
 
 		 505 aa  61.2  0.00000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1329  FAD dependent oxidoreductase  26.02 
 
 		 501 aa  61.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.914458  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2192  FAD dependent oxidoreductase  20.53 
 
 		 532 aa  60.8  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.285502 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05841  putative carotenoid isomerase  20.27 
 
 		 516 aa  60.5  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.515676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1834  FAD dependent oxidoreductase  24.61 
 
 		 504 aa  60.1  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0259899 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6445  phytoene dehydrogenase (phytoene desaturase)  26.87 
 
 		 512 aa  60.1  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03731  hypothetical protein  25.08 
 
 		 938 aa  60.1  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.968761 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3185  hypothetical protein  31.37 
 
 		 245 aa  59.7  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29229  hitchhiker  0.00171019 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0143  amine oxidase  24.38 
 
 		 519 aa  59.3  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2151  amine oxidase  23.6 
 
 		 508 aa  59.7  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1701  amine oxidase  22.09 
 
 		 503 aa  58.9  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00066646 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3475  FAD dependent oxidoreductase  23.75 
 
 		 559 aa  59.3  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.621036  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1486  FAD dependent oxidoreductase  23.75 
 
 		 554 aa  59.3  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.975068 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2059  hypothetical protein  20.3 
 
 		 509 aa  58.5  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0409241  normal  0.0351139 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1708  hypothetical protein  21.29 
 
 		 509 aa  58.5  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.718334  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0845  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  22.59 
 
 		 740 aa  58.5  0.0000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3017  hypothetical protein  29.31 
 
 		 484 aa  56.6  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.191221  normal  0.019056 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3278  FAD dependent oxidoreductase  19.45 
 
 		 502 aa  56.6  0.0000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.312837 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1487  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  22.33 
 
 		 510 aa  56.2  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000619668 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1387  amine oxidase  25.33 
 
 		 503 aa  56.6  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.600466  hitchhiker  0.00651843 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0096  FAD dependent oxidoreductase  26.1 
 
 		 722 aa  55.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.490674 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2043  amine oxidase  39.66 
 
 		 476 aa  56.6  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0112057  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12111  hypothetical protein  20.57 
 
 		 509 aa  56.2  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0006  amine oxidase  23.55 
 
 		 556 aa  56.6  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00915  CrtI1  24.75 
 
 		 488 aa  55.8  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.185647  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2512  FAD dependent oxidoreductase  22.85 
 
 		 497 aa  55.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.224928  normal  0.507466 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0706  FAD dependent oxidoreductase  24.16 
 
 		 717 aa  55.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0874  amine oxidase  22.01 
 
 		 503 aa  55.8  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2211  phytoene desaturase  24.5 
 
 		 531 aa  55.1  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.931782  normal  0.130578 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09643  hypothetical protein  38.1 
 
 		 535 aa  55.1  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0783431  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1046  phytoene dehydrogenase  20.13 
 
 		 494 aa  55.1  0.000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.586405  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8013  hypothetical protein  25.08 
 
 		 524 aa  54.7  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03825  hypothetical protein  20.19 
 
 		 508 aa  54.7  0.000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1935  FAD dependent oxidoreductase  23.15 
 
 		 521 aa  53.9  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.790128  normal  0.638974 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0489  hypothetical protein  20.04 
 
 		 509 aa  53.5  0.000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3809  phytoene desaturase  24.36 
 
 		 492 aa  53.9  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2002  FAD dependent oxidoreductase  21.64 
 
 		 510 aa  53.5  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3185  zeta-phytoene desaturase  24.03 
 
 		 492 aa  53.5  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00134863  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1712  phytoene desaturase  24.4 
 
 		 504 aa  53.5  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.678565  normal  0.384259 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39472  predicted protein  26.13 
 
 		 645 aa  53.5  0.000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000845209  normal  0.555705 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2820  phytoene desaturase  26.04 
 
 		 498 aa  53.1  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1898  hypothetical protein  23.37 
 
 		 511 aa  53.1  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.405447  normal  0.754346 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0493  phytoene desaturase  23.76 
 
 		 507 aa  52.8  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.145536  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3766  amine oxidase  23.34 
 
 		 511 aa  53.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.918224  hitchhiker  0.0064797 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0577  All-trans-retinol 13,14-reductase  23.53 
 
 		 542 aa  52.8  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3200  phytoene desaturase  27.24 
 
 		 508 aa  52.8  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.177165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2310  FAD dependent oxidoreductase  24.05 
 
 		 514 aa  52.4  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.6902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2032  FAD dependent oxidoreductase  20.7 
 
 		 520 aa  51.6  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.756687 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2672  amine oxidase  20.72 
 
 		 513 aa  51.6  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5128  zeta-phytoene desaturase  43.64 
 
 		 506 aa  51.6  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.146602 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3573  phytoene desaturase  23.1 
 
 		 509 aa  51.6  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0319  amine oxidase  22.53 
 
 		 489 aa  51.6  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.354274 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2128  phytoene desaturase  26.15 
 
 		 504 aa  51.2  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.423753  decreased coverage  0.0000406201 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>