173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2665 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2665  putative phytoene dehydrogenase  100 
 
 		 495 aa  999    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0906  hypothetical protein  31.08 
 
 		 480 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.396685  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1077  all-trans-retinol 13,14-reductase  26.81 
 
 		 505 aa  199  1.0000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1874  All-trans-retinol 13,14-reductase  26.52 
 
 		 501 aa  196  1e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03825  hypothetical protein  26.88 
 
 		 508 aa  186  8e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2002  FAD dependent oxidoreductase  27.26 
 
 		 510 aa  185  2.0000000000000003e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1995  All-trans-retinol 13,14-reductase  27.18 
 
 		 499 aa  177  4e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0318  FAD dependent oxidoreductase  27.29 
 
 		 547 aa  146  8.000000000000001e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09643  hypothetical protein  22.01 
 
 		 535 aa  137  3.0000000000000003e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0783431  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3011  All-trans-retinol 13,14-reductase  26.76 
 
 		 544 aa  124  3e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5970  FAD dependent oxidoreductase  25.14 
 
 		 534 aa  114  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.633554  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1053  all-trans-retinol 13,14-reductase  25.2 
 
 		 501 aa  100  5e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0671242 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1069  FAD dependent oxidoreductase  26.22 
 
 		 496 aa  99.4  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.302171  hitchhiker  0.00376489 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0577  All-trans-retinol 13,14-reductase  22.45 
 
 		 542 aa  98.2  3e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16851  phytoene dehydrogenase and related protein  25.3 
 
 		 503 aa  98.2  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0436  All-trans-retinol 13,14-reductase  22.33 
 
 		 511 aa  97.1  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.601478 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0425  All-trans-retinol 13,14-reductase  22.33 
 
 		 511 aa  96.7  9e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4146  All-trans-retinol 13,14-reductase  25 
 
 		 562 aa  92  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.559453  decreased coverage  0.00452261 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2254  carotene isomerase  24.38 
 
 		 506 aa  89.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000347702 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1174  All-trans-retinol 13,14-reductase  21.58 
 
 		 522 aa  87.8  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1708  hypothetical protein  21.18 
 
 		 509 aa  87.4  5e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.718334  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2059  hypothetical protein  22.03 
 
 		 509 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0409241  normal  0.0351139 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3112  FAD dependent oxidoreductase  24.37 
 
 		 506 aa  84.7  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.270711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1336  carotene isomerase  24.86 
 
 		 512 aa  84.3  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0735245  hitchhiker  0.00100943 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1308  carotene isomerase  24.67 
 
 		 512 aa  82.8  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1137  UDP-galactopyranose mutase  24.45 
 
 		 505 aa  80.9  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1209  conserved hypothetical protein, FAD-binding domain protein  21.26 
 
 		 502 aa  79.3  0.0000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17531  phytoene dehydrogenase  21.7 
 
 		 501 aa  79  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1847  phytoene dehydrogenase-related protein  27.77 
 
 		 503 aa  78.2  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2032  FAD dependent oxidoreductase  21.56 
 
 		 520 aa  77  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.756687 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0845  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  21.7 
 
 		 740 aa  77.4  0.0000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20111  phytoene dehydrogenase and related proteins  22.89 
 
 		 505 aa  75.9  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.428487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05841  putative carotenoid isomerase  24.52 
 
 		 516 aa  74.7  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.515676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03701  phytoene dehydrogenase  21.22 
 
 		 509 aa  74.3  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0640229  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1658  UDP-galactopyranose mutase  22.15 
 
 		 501 aa  73.9  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2330  carotene isomerase  22.7 
 
 		 508 aa  73.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0766  amine oxidase  24.14 
 
 		 522 aa  72.4  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0345  phytoene dehydrogenase  21.03 
 
 		 509 aa  72.4  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12221  putative carotenoid isomerase  22.86 
 
 		 514 aa  71.2  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03711  phytoene dehydrogenase  20.99 
 
 		 509 aa  70.9  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12211  putative carotenoid isomerase  22.85 
 
 		 514 aa  70.5  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1027  C-3',4' desaturase CrtD  24.54 
 
 		 504 aa  69.7  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0760  FAD dependent oxidoreductase  23.4 
 
 		 503 aa  68.6  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.522072 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1126  putative carotenoid isomerase  22.85 
 
 		 514 aa  67.8  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.777729  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0761  hypothetical protein  24.45 
 
 		 510 aa  67.4  0.0000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1898  hypothetical protein  25.1 
 
 		 511 aa  66.6  0.000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.405447  normal  0.754346 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04430  phytoene desaturase  27.91 
 
 		 548 aa  66.6  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03741  phytoene dehydrogenase  22.91 
 
 		 509 aa  66.2  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45243  carotenoid isomerase  24.26 
 
 		 598 aa  65.9  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0755538  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17731  phytoene dehydrogenase  22.09 
 
 		 501 aa  65.5  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14681  putative carotenoid isomerase  22.56 
 
 		 520 aa  65.9  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.314761  normal  0.880307 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3281  FAD dependent oxidoreductase  22 
 
 		 479 aa  64.7  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.463065  normal  0.0612809 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12061  putative carotenoid isomerase  22.92 
 
 		 514 aa  64.3  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.809432  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0626  carotenoid isomerase, putative  23.6 
 
 		 507 aa  64.3  0.000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1701  amine oxidase  21.9 
 
 		 503 aa  63.9  0.000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00066646 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5620  phytoene desaturase  23.5 
 
 		 497 aa  63.5  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.476172 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2151  amine oxidase  24.18 
 
 		 508 aa  63.2  0.000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3185  hypothetical protein  32.43 
 
 		 245 aa  63.2  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29229  hitchhiker  0.00171019 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3286  FAD dependent oxidoreductase  23.55 
 
 		 488 aa  63.2  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.370539 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3017  hypothetical protein  34.07 
 
 		 484 aa  62  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.191221  normal  0.019056 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17571  phytoene dehydrogenase and related protein  21.68 
 
 		 501 aa  62  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.274386  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0636  putative carotenoid isomerase  22.71 
 
 		 520 aa  61.6  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10011  putative carotenoid isomerase  24.19 
 
 		 520 aa  61.6  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.243247 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3734  phytoene desaturase  24.12 
 
 		 508 aa  61.2  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.964384  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6289  FAD dependent oxidoreductase  22.69 
 
 		 510 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00968377  normal  0.473682 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1423  carotenoid isomerase  23.45 
 
 		 518 aa  60.5  0.00000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12111  hypothetical protein  23.99 
 
 		 509 aa  60.5  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22931  phytoene dehydrogenase  23.22 
 
 		 503 aa  60.1  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1681  carotenoid isomerase  23.75 
 
 		 518 aa  59.3  0.0000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.157771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2192  FAD dependent oxidoreductase  22.7 
 
 		 532 aa  59.7  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.285502 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1763  FAD dependent oxidoreductase  20.12 
 
 		 498 aa  59.3  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0970  phytoene dehydrogenase-like  25.35 
 
 		 523 aa  59.3  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.354104  normal  0.67541 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3632  FAD dependent oxidoreductase  23.68 
 
 		 506 aa  58.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2065  FAD dependent oxidoreductase  22.24 
 
 		 484 aa  58.2  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03731  hypothetical protein  23.52 
 
 		 938 aa  58.2  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.968761 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0245  amine oxidase  25.57 
 
 		 491 aa  58.2  0.0000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1711  FAD dependent oxidoreductase  25.39 
 
 		 501 aa  57.4  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000831031  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0811  phytoene dehydrogenase  21.58 
 
 		 523 aa  57.4  0.0000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0324739  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2342  amine oxidase  23.84 
 
 		 505 aa  57.4  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0874  amine oxidase  22.18 
 
 		 503 aa  57.4  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1811  phytoene dehydrogenase-related protein  22.05 
 
 		 502 aa  57.4  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000642179  normal  0.0141145 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2043  amine oxidase  32.22 
 
 		 476 aa  57  0.0000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0112057  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0319  amine oxidase  24.38 
 
 		 489 aa  57  0.0000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.354274 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3200  phytoene desaturase  22.62 
 
 		 508 aa  57  0.0000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.177165  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2157  FAD dependent oxidoreductase  26.48 
 
 		 430 aa  56.6  0.0000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1944  phytoene dehydrogenase related enzyme  26.11 
 
 		 495 aa  56.6  0.0000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_715  FAD dependent oxidoreductase  21.7 
 
 		 500 aa  56.6  0.0000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0489  hypothetical protein  22.62 
 
 		 509 aa  56.6  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0386  phytoene dehydrogenase related enzyme  26.54 
 
 		 500 aa  56.2  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0405  amine oxidase  24.63 
 
 		 711 aa  56.2  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0201487  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4976  FAD dependent oxidoreductase  23.54 
 
 		 515 aa  55.5  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0305  amine oxidase  25.75 
 
 		 492 aa  55.5  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7528  putative phytoene dehydrogenase and related proteins  23.33 
 
 		 708 aa  55.8  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2535  zeta-phytoene desaturase  22.51 
 
 		 491 aa  55.8  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00482984  unclonable  0.000000000435247 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13830  phytoene desaturase  26.8 
 
 		 552 aa  55.1  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000359632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1888  carotenoid isomerase, putative  22.98 
 
 		 505 aa  53.9  0.000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21220  phytoene desaturase  26.77 
 
 		 566 aa  53.5  0.000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0706  FAD dependent oxidoreductase  23.26 
 
 		 717 aa  53.5  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4273  C-3',4' desaturase CrtD  24.14 
 
 		 499 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.938391 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0544  amine oxidase  42.59 
 
 		 525 aa  52.8  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00189501  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>