273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_1174 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_2032  FAD dependent oxidoreductase  75.64 
 
 		 520 aa  824    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.756687 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0436  All-trans-retinol 13,14-reductase  73.52 
 
 		 511 aa  808    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.601478 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1174  All-trans-retinol 13,14-reductase  100 
 
 		 522 aa  1087    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0425  All-trans-retinol 13,14-reductase  73.52 
 
 		 511 aa  809    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1708  hypothetical protein  32.09 
 
 		 509 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.718334  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2059  hypothetical protein  31.96 
 
 		 509 aa  258  2e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0409241  normal  0.0351139 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4146  All-trans-retinol 13,14-reductase  26.48 
 
 		 562 aa  175  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.559453  decreased coverage  0.00452261 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3011  All-trans-retinol 13,14-reductase  27.35 
 
 		 544 aa  167  4e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0318  FAD dependent oxidoreductase  26.23 
 
 		 547 aa  162  1e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09643  hypothetical protein  22.26 
 
 		 535 aa  145  2e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0783431  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5970  FAD dependent oxidoreductase  23.12 
 
 		 534 aa  142  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.633554  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1077  all-trans-retinol 13,14-reductase  25.1 
 
 		 505 aa  139  1e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1874  All-trans-retinol 13,14-reductase  23.22 
 
 		 501 aa  121  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0626  carotenoid isomerase, putative  27 
 
 		 507 aa  116  1.0000000000000001e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2254  carotene isomerase  24.01 
 
 		 506 aa  113  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000347702 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1053  all-trans-retinol 13,14-reductase  24.02 
 
 		 501 aa  113  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0671242 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2330  carotene isomerase  24 
 
 		 508 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03825  hypothetical protein  21.94 
 
 		 508 aa  111  3e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2002  FAD dependent oxidoreductase  22.95 
 
 		 510 aa  109  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0874  amine oxidase  23.81 
 
 		 503 aa  107  5e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1888  carotenoid isomerase, putative  24.26 
 
 		 505 aa  106  9e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_54800  carotenoid isomerase-like protein  21.69 
 
 		 923 aa  105  2e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0759229  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1308  carotene isomerase  22.76 
 
 		 512 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1336  carotene isomerase  22.76 
 
 		 512 aa  104  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0735245  hitchhiker  0.00100943 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0766  amine oxidase  24.06 
 
 		 522 aa  103  1e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0577  All-trans-retinol 13,14-reductase  23.09 
 
 		 542 aa  102  1e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2151  amine oxidase  23.76 
 
 		 508 aa  102  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03701  phytoene dehydrogenase  23.68 
 
 		 509 aa  100  9e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0640229  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03711  phytoene dehydrogenase  23.06 
 
 		 509 aa  100  9e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0845  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  23.8 
 
 		 740 aa  99.4  2e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0706  FAD dependent oxidoreductase  25.48 
 
 		 717 aa  98.6  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03741  phytoene dehydrogenase  24.06 
 
 		 509 aa  96.7  8e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0345  phytoene dehydrogenase  22.82 
 
 		 509 aa  96.7  9e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2192  FAD dependent oxidoreductase  22.46 
 
 		 532 aa  96.7  9e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.285502 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1069  FAD dependent oxidoreductase  23.49 
 
 		 496 aa  96.7  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.302171  hitchhiker  0.00376489 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0871  amine oxidase  25.73 
 
 		 512 aa  95.1  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.598168  normal  0.0715769 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45243  carotenoid isomerase  24.77 
 
 		 598 aa  94  7e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0755538  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1701  amine oxidase  22.71 
 
 		 503 aa  92.4  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00066646 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0405  amine oxidase  26.65 
 
 		 711 aa  92.4  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0201487  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3112  FAD dependent oxidoreductase  22.52 
 
 		 506 aa  91.7  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.270711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1581  FAD dependent oxidoreductase  23.61 
 
 		 565 aa  91.3  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.135472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4976  FAD dependent oxidoreductase  24.68 
 
 		 515 aa  91.3  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12211  putative carotenoid isomerase  22.39 
 
 		 514 aa  90.1  8e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1246  carotene isomerase  22.37 
 
 		 504 aa  88.6  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3278  FAD dependent oxidoreductase  21.87 
 
 		 502 aa  88.2  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.312837 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2665  putative phytoene dehydrogenase  21.58 
 
 		 495 aa  87.8  4e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1995  All-trans-retinol 13,14-reductase  22.26 
 
 		 499 aa  87.4  6e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12221  putative carotenoid isomerase  22.41 
 
 		 514 aa  86.3  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0760  FAD dependent oxidoreductase  22.65 
 
 		 503 aa  84.3  0.000000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.522072 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05841  putative carotenoid isomerase  21.48 
 
 		 516 aa  84.7  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.515676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3650  FAD dependent oxidoreductase  22.55 
 
 		 547 aa  84.7  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12061  putative carotenoid isomerase  22.86 
 
 		 514 aa  83.6  0.000000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.809432  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7528  putative phytoene dehydrogenase and related proteins  24.13 
 
 		 708 aa  83.2  0.000000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0096  FAD dependent oxidoreductase  24.67 
 
 		 722 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.490674 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1723  carotene isomerase  26.56 
 
 		 516 aa  82.4  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3726  phytoene dehydrogenase and related proteins-like  22.68 
 
 		 586 aa  82.4  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10011  putative carotenoid isomerase  22.18 
 
 		 520 aa  81.6  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.243247 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4273  C-3',4' desaturase CrtD  24.18 
 
 		 499 aa  80.9  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.938391 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9210  CRTISO5 carotenoid isomerase 5,phytoene dehydrogenase-related protein  23.09 
 
 		 530 aa  80.1  0.00000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3286  FAD dependent oxidoreductase  21.81 
 
 		 488 aa  80.1  0.00000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.370539 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03731  hypothetical protein  20.95 
 
 		 938 aa  80.1  0.00000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.968761 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2737  C-3',4' desaturase CrtD  24.18 
 
 		 499 aa  79  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000928862  unclonable  0.00000000408673 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1736  FAD dependent oxidoreductase  24.12 
 
 		 556 aa  79  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00685325  normal  0.215441 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0735  FAD dependent oxidoreductase  23.21 
 
 		 563 aa  79.3  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3632  FAD dependent oxidoreductase  21.94 
 
 		 506 aa  79.3  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1898  hypothetical protein  29.89 
 
 		 511 aa  78.2  0.0000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.405447  normal  0.754346 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43564  predicted protein  27.82 
 
 		 554 aa  78.6  0.0000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.079373  normal  0.0235879 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2672  amine oxidase  21.41 
 
 		 513 aa  78.2  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3374  C-3',4' desaturase CrtD  24.09 
 
 		 499 aa  77.8  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1126  putative carotenoid isomerase  21.35 
 
 		 514 aa  77.4  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.777729  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5057  FAD dependent oxidoreductase  21.83 
 
 		 564 aa  77.4  0.0000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1681  carotenoid isomerase  20.9 
 
 		 518 aa  77  0.0000000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.157771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0636  putative carotenoid isomerase  20.84 
 
 		 520 aa  76.6  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1423  carotenoid isomerase  21.46 
 
 		 518 aa  76.6  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1841  FAD dependent oxidoreductase  23.33 
 
 		 512 aa  76.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4343  amine oxidase  23.61 
 
 		 517 aa  75.5  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1027  C-3',4' desaturase CrtD  22.64 
 
 		 504 aa  75.9  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12111  hypothetical protein  23 
 
 		 509 aa  74.7  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14681  putative carotenoid isomerase  20.69 
 
 		 520 aa  74.3  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.314761  normal  0.880307 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_54842  carotenoid isomerase  23.74 
 
 		 595 aa  74.3  0.000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4578  FAD dependent oxidoreductase  23.08 
 
 		 512 aa  73.9  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2342  amine oxidase  23 
 
 		 505 aa  73.2  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0761  hypothetical protein  22.31 
 
 		 510 aa  73.2  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1487  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  23.35 
 
 		 510 aa  73.2  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000619668 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3827  phytoene desaturase  26.91 
 
 		 489 aa  72.4  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.47122  normal  0.0454978 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0381  amine oxidase  23.46 
 
 		 510 aa  71.6  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4888  FAD dependent oxidoreductase  24.15 
 
 		 520 aa  71.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.162383 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1684  phytoene desaturase  24.02 
 
 		 506 aa  71.6  0.00000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.127101  normal  0.929667 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3602  FAD dependent oxidoreductase  20.62 
 
 		 497 aa  70.9  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4505  FAD dependent oxidoreductase  23.96 
 
 		 520 aa  70.9  0.00000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.145075  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4592  FAD dependent oxidoreductase  23.96 
 
 		 520 aa  70.9  0.00000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353805  normal  0.593862 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0988  FAD dependent oxidoreductase  24.16 
 
 		 528 aa  70.9  0.00000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0489  hypothetical protein  22.63 
 
 		 509 aa  70.5  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1711  FAD dependent oxidoreductase  22.72 
 
 		 501 aa  70.5  0.00000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000831031  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2352  FAD dependent oxidoreductase  20.46 
 
 		 495 aa  69.7  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.125181  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3330  C-3',4' desaturase CrtD  23.28 
 
 		 510 aa  68.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2512  FAD dependent oxidoreductase  20.43 
 
 		 497 aa  69.3  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.224928  normal  0.507466 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1209  conserved hypothetical protein, FAD-binding domain protein  22.29 
 
 		 502 aa  67.8  0.0000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1137  UDP-galactopyranose mutase  22.74 
 
 		 505 aa  67.4  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6289  FAD dependent oxidoreductase  24.02 
 
 		 510 aa  67  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00968377  normal  0.473682 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>