278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_03825 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_03825  hypothetical protein  100 
 
 		 508 aa  1051    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1077  all-trans-retinol 13,14-reductase  55.58 
 
 		 505 aa  591  1e-167  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1874  All-trans-retinol 13,14-reductase  46.4 
 
 		 501 aa  481  1e-134  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2002  FAD dependent oxidoreductase  45.04 
 
 		 510 aa  468  1.0000000000000001e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1995  All-trans-retinol 13,14-reductase  46.93 
 
 		 499 aa  454  1.0000000000000001e-126  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2665  putative phytoene dehydrogenase  26.88 
 
 		 495 aa  192  1e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0318  FAD dependent oxidoreductase  27.83 
 
 		 547 aa  170  7e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5970  FAD dependent oxidoreductase  23.85 
 
 		 534 aa  159  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.633554  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3011  All-trans-retinol 13,14-reductase  24.47 
 
 		 544 aa  149  8e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09643  hypothetical protein  25.53 
 
 		 535 aa  144  3e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0783431  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2032  FAD dependent oxidoreductase  25.34 
 
 		 520 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.756687 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0425  All-trans-retinol 13,14-reductase  23.81 
 
 		 511 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0436  All-trans-retinol 13,14-reductase  24.4 
 
 		 511 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.601478 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0906  hypothetical protein  20.89 
 
 		 480 aa  124  4e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.396685  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1174  All-trans-retinol 13,14-reductase  22.68 
 
 		 522 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0577  All-trans-retinol 13,14-reductase  25.58 
 
 		 542 aa  101  4e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1701  amine oxidase  24.25 
 
 		 503 aa  99.4  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00066646 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1053  all-trans-retinol 13,14-reductase  22.48 
 
 		 501 aa  99.8  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0671242 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1209  conserved hypothetical protein, FAD-binding domain protein  24.34 
 
 		 502 aa  97.1  7e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0766  amine oxidase  23.24 
 
 		 522 aa  95.9  1e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4146  All-trans-retinol 13,14-reductase  22.22 
 
 		 562 aa  95.9  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.559453  decreased coverage  0.00452261 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0319  amine oxidase  21.61 
 
 		 489 aa  95.5  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.354274 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10011  putative carotenoid isomerase  23.51 
 
 		 520 aa  95.1  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.243247 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1681  carotenoid isomerase  23.12 
 
 		 518 aa  94.4  5e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.157771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0939  amine oxidase  22.62 
 
 		 496 aa  93.6  7e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05841  putative carotenoid isomerase  24.49 
 
 		 516 aa  92.8  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.515676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03741  phytoene dehydrogenase  25.43 
 
 		 509 aa  91.7  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1308  carotene isomerase  24.05 
 
 		 512 aa  91.3  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1336  carotene isomerase  24.05 
 
 		 512 aa  91.3  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0735245  hitchhiker  0.00100943 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0626  carotenoid isomerase, putative  22.06 
 
 		 507 aa  90.5  6e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_54800  carotenoid isomerase-like protein  21.86 
 
 		 923 aa  90.1  8e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0759229  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1898  hypothetical protein  21.29 
 
 		 511 aa  89.7  1e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.405447  normal  0.754346 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3602  FAD dependent oxidoreductase  23.58 
 
 		 497 aa  89  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2151  amine oxidase  23.28 
 
 		 508 aa  88.6  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_54842  carotenoid isomerase  23.44 
 
 		 595 aa  88.2  3e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0845  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  22.52 
 
 		 740 aa  88.2  3e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3281  FAD dependent oxidoreductase  22.46 
 
 		 479 aa  87.8  4e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.463065  normal  0.0612809 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03711  phytoene dehydrogenase  23.64 
 
 		 509 aa  87.8  4e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0761  hypothetical protein  22.2 
 
 		 510 aa  87.4  5e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3726  phytoene dehydrogenase and related proteins-like  22.43 
 
 		 586 aa  87  7e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0760  FAD dependent oxidoreductase  22.72 
 
 		 503 aa  87  8e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.522072 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1423  carotenoid isomerase  23.16 
 
 		 518 aa  86.3  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03701  phytoene dehydrogenase  23.74 
 
 		 509 aa  85.5  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0640229  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0245  amine oxidase  22.57 
 
 		 491 aa  85.5  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03731  hypothetical protein  23.48 
 
 		 938 aa  85.1  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.968761 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3632  FAD dependent oxidoreductase  24.61 
 
 		 506 aa  85.1  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2254  carotene isomerase  24.86 
 
 		 506 aa  84  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000347702 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1027  C-3',4' desaturase CrtD  23.21 
 
 		 504 aa  82.8  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20111  phytoene dehydrogenase and related proteins  22.94 
 
 		 505 aa  82.4  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.428487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0345  phytoene dehydrogenase  24.11 
 
 		 509 aa  82  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2512  FAD dependent oxidoreductase  22.49 
 
 		 497 aa  82.4  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.224928  normal  0.507466 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4578  FAD dependent oxidoreductase  21.44 
 
 		 512 aa  82.4  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1069  FAD dependent oxidoreductase  23.24 
 
 		 496 aa  81.6  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.302171  hitchhiker  0.00376489 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1888  carotenoid isomerase, putative  22.54 
 
 		 505 aa  80.1  0.00000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2843  phytoene desaturase  22.33 
 
 		 507 aa  80.1  0.00000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105114  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2330  carotene isomerase  22.68 
 
 		 508 aa  80.1  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3734  phytoene desaturase  22.1 
 
 		 508 aa  79.7  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.964384  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9210  CRTISO5 carotenoid isomerase 5,phytoene dehydrogenase-related protein  21.19 
 
 		 530 aa  78.2  0.0000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0346  amine oxidase  20.51 
 
 		 494 aa  78.6  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4976  FAD dependent oxidoreductase  22.1 
 
 		 515 aa  78.6  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0874  amine oxidase  23.21 
 
 		 503 aa  78.2  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1137  UDP-galactopyranose mutase  22.05 
 
 		 505 aa  77.8  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2672  amine oxidase  22.57 
 
 		 513 aa  77.8  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2640  amine oxidase  22.01 
 
 		 495 aa  77.8  0.0000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2192  FAD dependent oxidoreductase  24.26 
 
 		 532 aa  77.8  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.285502 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3278  FAD dependent oxidoreductase  22.1 
 
 		 502 aa  76.6  0.0000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.312837 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1763  FAD dependent oxidoreductase  20.52 
 
 		 498 aa  75.9  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1329  FAD dependent oxidoreductase  21.63 
 
 		 501 aa  74.7  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.914458  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4273  C-3',4' desaturase CrtD  21.77 
 
 		 499 aa  73.9  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.938391 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3112  FAD dependent oxidoreductase  22.97 
 
 		 506 aa  73.9  0.000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.270711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2342  amine oxidase  22.65 
 
 		 505 aa  73.2  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14681  putative carotenoid isomerase  23.55 
 
 		 520 aa  71.2  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.314761  normal  0.880307 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3200  phytoene desaturase  20.65 
 
 		 508 aa  70.1  0.00000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.177165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43564  predicted protein  21.47 
 
 		 554 aa  70.1  0.00000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.079373  normal  0.0235879 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0305  amine oxidase  23.41 
 
 		 492 aa  68.9  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1834  FAD dependent oxidoreductase  22.37 
 
 		 504 aa  67.8  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0259899 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17531  phytoene dehydrogenase  43.84 
 
 		 501 aa  67.4  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16851  phytoene dehydrogenase and related protein  22.26 
 
 		 503 aa  67.4  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0706  FAD dependent oxidoreductase  20.42 
 
 		 717 aa  67.4  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1246  carotene isomerase  22.09 
 
 		 504 aa  67  0.0000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2541  putative phytoene dehydrogenase  19.96 
 
 		 530 aa  66.6  0.0000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.553028 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0636  putative carotenoid isomerase  23.08 
 
 		 520 aa  66.2  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0970  phytoene dehydrogenase-like  22.31 
 
 		 523 aa  66.6  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.354104  normal  0.67541 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2737  C-3',4' desaturase CrtD  21.5 
 
 		 499 aa  66.6  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000928862  unclonable  0.00000000408673 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17731  phytoene dehydrogenase  39.73 
 
 		 501 aa  66.6  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5057  FAD dependent oxidoreductase  22.1 
 
 		 564 aa  66.2  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0226  FAD dependent oxidoreductase  21.99 
 
 		 518 aa  65.5  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0635  FAD dependent oxidoreductase  23.75 
 
 		 516 aa  65.9  0.000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.470789 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3185  hypothetical protein  39.02 
 
 		 245 aa  65.9  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29229  hitchhiker  0.00171019 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1658  UDP-galactopyranose mutase  36.84 
 
 		 501 aa  65.9  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1261  amine oxidase  22.08 
 
 		 511 aa  65.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0418037 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1711  FAD dependent oxidoreductase  20.84 
 
 		 501 aa  65.9  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000831031  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1841  FAD dependent oxidoreductase  20.51 
 
 		 512 aa  64.7  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1673  FAD dependent oxidoreductase  18.68 
 
 		 537 aa  65.1  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.0012513  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3766  amine oxidase  22.2 
 
 		 511 aa  64.7  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.918224  hitchhiker  0.0064797 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1270  FAD dependent oxidoreductase  20.92 
 
 		 555 aa  64.7  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4129  FAD dependent oxidoreductase  21.73 
 
 		 504 aa  64.3  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.60213 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17571  phytoene dehydrogenase and related protein  38.36 
 
 		 501 aa  64.3  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.274386  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2065  FAD dependent oxidoreductase  20.78 
 
 		 484 aa  63.5  0.000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2815  FAD dependent oxidoreductase  22.18 
 
 		 522 aa  63.5  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000107827  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>