244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1301 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_1301  amine oxidase  100 
 
 		 425 aa  871    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3414  phytoene dehydrogenase family protein  59.39 
 
 		 425 aa  512  1e-144  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.893725 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1760  hypothetical protein  41.44 
 
 		 396 aa  257  3e-67  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1023  hypothetical protein  40.2 
 
 		 396 aa  252  8.000000000000001e-66  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.486494  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0921  hypothetical protein  39.95 
 
 		 396 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1034  hypothetical protein  39.66 
 
 		 404 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0953  hypothetical protein  40.51 
 
 		 399 aa  225  1e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2254  carotene isomerase  25.9 
 
 		 506 aa  98.2  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000347702 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1308  carotene isomerase  24.85 
 
 		 512 aa  93.2  8e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1336  carotene isomerase  24.85 
 
 		 512 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0735245  hitchhiker  0.00100943 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14681  putative carotenoid isomerase  25.4 
 
 		 520 aa  90.5  4e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.314761  normal  0.880307 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05841  putative carotenoid isomerase  25.79 
 
 		 516 aa  89.4  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.515676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0636  putative carotenoid isomerase  24.7 
 
 		 520 aa  89.4  1e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1246  carotene isomerase  25.1 
 
 		 504 aa  87.4  5e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2330  carotene isomerase  25.73 
 
 		 508 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3112  FAD dependent oxidoreductase  25.15 
 
 		 506 aa  84.7  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.270711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0766  amine oxidase  26.19 
 
 		 522 aa  84.7  0.000000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2192  FAD dependent oxidoreductase  23.9 
 
 		 532 aa  83.2  0.000000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.285502 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1701  amine oxidase  25.39 
 
 		 503 aa  82  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00066646 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1681  carotenoid isomerase  26.87 
 
 		 518 aa  81.3  0.00000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.157771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10011  putative carotenoid isomerase  25 
 
 		 520 aa  80.9  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.243247 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1423  carotenoid isomerase  27.27 
 
 		 518 aa  77.4  0.0000000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12061  putative carotenoid isomerase  25.05 
 
 		 514 aa  77.8  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.809432  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2151  amine oxidase  30.24 
 
 		 508 aa  75.5  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4976  FAD dependent oxidoreductase  24.14 
 
 		 515 aa  75.5  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0874  amine oxidase  23.8 
 
 		 503 aa  74.3  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0760  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 		 503 aa  74.3  0.000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.522072 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12211  putative carotenoid isomerase  25.35 
 
 		 514 aa  72.8  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45243  carotenoid isomerase  25.94 
 
 		 598 aa  70.9  0.00000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0755538  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12221  putative carotenoid isomerase  25.66 
 
 		 514 aa  70.9  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3286  FAD dependent oxidoreductase  24.18 
 
 		 488 aa  69.3  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.370539 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1126  putative carotenoid isomerase  25.96 
 
 		 514 aa  67.8  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.777729  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0761  hypothetical protein  23.55 
 
 		 510 aa  67.4  0.0000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1810  phytoene dehydrogenase family protein  23.21 
 
 		 499 aa  67  0.0000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.149228  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0706  FAD dependent oxidoreductase  27.72 
 
 		 717 aa  66.6  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2128  phytoene desaturase  26.21 
 
 		 504 aa  65.5  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.423753  decreased coverage  0.0000406201 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1607  FAD dependent oxidoreductase  27.11 
 
 		 510 aa  64.3  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1888  carotenoid isomerase, putative  27.15 
 
 		 505 aa  63.9  0.000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3632  FAD dependent oxidoreductase  24.42 
 
 		 506 aa  63.9  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1841  FAD dependent oxidoreductase  24.75 
 
 		 512 aa  63.9  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0319  amine oxidase  26.01 
 
 		 489 aa  63.9  0.000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.354274 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3809  phytoene desaturase  22.54 
 
 		 492 aa  63.5  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0626  carotenoid isomerase, putative  23.66 
 
 		 507 aa  63.5  0.000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2672  amine oxidase  28.48 
 
 		 513 aa  63.2  0.000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0845  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  23.55 
 
 		 740 aa  62.8  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0871  amine oxidase  23.17 
 
 		 512 aa  62  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.598168  normal  0.0715769 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1712  phytoene desaturase  24.66 
 
 		 504 aa  62  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.678565  normal  0.384259 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3278  FAD dependent oxidoreductase  28.03 
 
 		 502 aa  62  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.312837 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0409  phytoene dehydrogenase-related protein  24.67 
 
 		 465 aa  61.6  0.00000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2352  FAD dependent oxidoreductase  20.77 
 
 		 495 aa  60.8  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.125181  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26410  UDP-galactopyranose mutase  25.14 
 
 		 507 aa  60.8  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.739873 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4011  amine oxidase  26.86 
 
 		 511 aa  60.1  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.984835  normal  0.0140967 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1699  phytoene desaturase  24.01 
 
 		 511 aa  59.7  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.258971  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2032  FAD dependent oxidoreductase  21.01 
 
 		 520 aa  59.7  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.756687 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0096  FAD dependent oxidoreductase  27.35 
 
 		 722 aa  59.7  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.490674 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3734  phytoene desaturase  24.65 
 
 		 508 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.964384  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2065  FAD dependent oxidoreductase  21.99 
 
 		 484 aa  59.7  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03741  phytoene dehydrogenase  21.94 
 
 		 509 aa  58.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03731  hypothetical protein  25.53 
 
 		 938 aa  58.9  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.968761 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0116  phytoene dehydrogenase-related protein  24.91 
 
 		 491 aa  58.9  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0006  amine oxidase  26.22 
 
 		 556 aa  58.5  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1598  phytoene desaturase  21.51 
 
 		 505 aa  57.8  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1898  hypothetical protein  26.04 
 
 		 511 aa  57.8  0.0000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.405447  normal  0.754346 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3766  amine oxidase  26.15 
 
 		 511 aa  57  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.918224  hitchhiker  0.0064797 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0346  amine oxidase  27.7 
 
 		 494 aa  56.6  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0648  FAD dependent oxidoreductase  25.35 
 
 		 531 aa  55.8  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6445  phytoene dehydrogenase (phytoene desaturase)  28.21 
 
 		 512 aa  56.2  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2105  FAD dependent oxidoreductase  23.76 
 
 		 554 aa  55.8  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3789  hypothetical protein  23.05 
 
 		 427 aa  55.5  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.673359 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20120  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  25.64 
 
 		 545 aa  55.5  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.191581  hitchhiker  0.00297894 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3026  FAD dependent oxidoreductase  27.17 
 
 		 530 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0893  hypothetical protein  23.36 
 
 		 427 aa  55.5  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3085  FAD dependent oxidoreductase  27.17 
 
 		 530 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.214734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1076  amine oxidase  25.57 
 
 		 437 aa  55.1  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3042  FAD dependent oxidoreductase  26.79 
 
 		 530 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.261396  normal  0.193129 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0036  UDP-galactopyranose mutase  25.19 
 
 		 647 aa  54.7  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1684  phytoene desaturase  24.19 
 
 		 506 aa  54.7  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.127101  normal  0.929667 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3726  phytoene dehydrogenase and related proteins-like  25.09 
 
 		 586 aa  54.7  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3017  hypothetical protein  43.94 
 
 		 484 aa  54.3  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.191221  normal  0.019056 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2043  amine oxidase  42.42 
 
 		 476 aa  54.3  0.000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0112057  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4011  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  24.01 
 
 		 459 aa  54.3  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1487  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  34.21 
 
 		 510 aa  53.9  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000619668 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0318  FAD dependent oxidoreductase  31.54 
 
 		 547 aa  53.9  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5197  phytoene desaturase  26.99 
 
 		 525 aa  53.1  0.000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5454  phytoene dehydrogenase-related protein  49.02 
 
 		 512 aa  53.1  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3185  hypothetical protein  41.79 
 
 		 245 aa  52.4  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29229  hitchhiker  0.00171019 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1053  all-trans-retinol 13,14-reductase  25.67 
 
 		 501 aa  52.4  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0671242 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2268  phytoene desaturase  26.69 
 
 		 497 aa  52.8  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5075  amine oxidase  49.02 
 
 		 512 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5163  phytoene dehydrogenase-related protein  49.02 
 
 		 512 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.134146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12111  hypothetical protein  22.56 
 
 		 509 aa  53.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0537  FAD dependent oxidoreductase  39.08 
 
 		 533 aa  51.6  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0939614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3750  phytoene desaturase  33.68 
 
 		 530 aa  52  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6289  FAD dependent oxidoreductase  30.63 
 
 		 510 aa  52  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00968377  normal  0.473682 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2794  hypothetical protein  24.32 
 
 		 429 aa  52  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0970  phytoene dehydrogenase-like  21.78 
 
 		 523 aa  52  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.354104  normal  0.67541 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2820  phytoene desaturase  45.1 
 
 		 498 aa  52  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0143  amine oxidase  41.46 
 
 		 519 aa  52  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4578  FAD dependent oxidoreductase  25.89 
 
 		 512 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4343  amine oxidase  34.67 
 
 		 517 aa  52.4  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>