17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1023 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1023  hypothetical protein  100 
 
 
396 aa  794    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.486494  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0921  hypothetical protein  94.69 
 
 
396 aa  707    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1760  hypothetical protein  96.02 
 
 
396 aa  719    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0953  hypothetical protein  76.47 
 
 
399 aa  552  1e-156  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1034  hypothetical protein  58.7 
 
 
404 aa  441  9.999999999999999e-123  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1301  amine oxidase  41.94 
 
 
425 aa  291  1e-77  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3414  phytoene dehydrogenase family protein  40.65 
 
 
425 aa  273  5.000000000000001e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.893725 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4976  FAD dependent oxidoreductase  23.28 
 
 
515 aa  53.1  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0143  amine oxidase  24.83 
 
 
519 aa  49.3  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0519  hypothetical protein  23.46 
 
 
412 aa  49.3  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.696387  normal  0.911419 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2794  hypothetical protein  22.05 
 
 
429 aa  47  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2737  C-3',4' desaturase CrtD  41.82 
 
 
499 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000928862  unclonable  0.00000000408673 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00915  CrtI1  31 
 
 
488 aa  44.3  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.185647  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3374  C-3',4' desaturase CrtD  41.82 
 
 
499 aa  43.9  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0874  amine oxidase  23.51 
 
 
503 aa  43.1  0.008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1529  hypothetical protein  25.81 
 
 
468 aa  43.1  0.009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2468  amine oxidase, flavin-containing  38.18 
 
 
422 aa  42.7  0.01  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>