More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1529 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0804  hypothetical protein  97.44 
 
 		 468 aa  945    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.230959  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1495  hypothetical protein  63.41 
 
 		 485 aa  636    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.991128  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1146  hypothetical protein  96.79 
 
 		 468 aa  943    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1151  hypothetical protein  83.73 
 
 		 465 aa  820    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1529  hypothetical protein  100 
 
 		 468 aa  963    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2043  amine oxidase  38.74 
 
 		 476 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0112057  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3017  hypothetical protein  40.33 
 
 		 484 aa  282  1e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.191221  normal  0.019056 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3186  hypothetical protein  42.68 
 
 		 239 aa  145  2e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.834271  hitchhiker  0.00173246 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3185  hypothetical protein  40.88 
 
 		 245 aa  139  8.999999999999999e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29229  hitchhiker  0.00171019 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0137  amine oxidase  22.44 
 
 		 425 aa  69.3  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0394  amine oxidase  22 
 
 		 428 aa  65.1  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0586189 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0772  protoporphyrinogen oxidase  26.42 
 
 		 470 aa  60.1  0.00000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.10101e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00915  CrtI1  54 
 
 		 488 aa  60.1  0.00000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.185647  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2105  FAD dependent oxidoreductase  41.57 
 
 		 554 aa  59.7  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40191  amine oxidase  29.88 
 
 		 468 aa  58.9  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.389508  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1666  protoporphyrinogen oxidase  30.25 
 
 		 469 aa  58.2  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3475  FAD dependent oxidoreductase  36.46 
 
 		 559 aa  55.5  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.621036  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1893  protoporphyrinogen oxidase  51.85 
 
 		 421 aa  55.5  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0966  UDP-galactopyranose mutase  41.56 
 
 		 447 aa  55.5  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1486  FAD dependent oxidoreductase  42.03 
 
 		 554 aa  55.1  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.975068 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1684  phytoene desaturase  22.73 
 
 		 506 aa  55.5  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.127101  normal  0.929667 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2794  amine oxidase  33.06 
 
 		 431 aa  55.1  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304953  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2637  squalene synthase  41.67 
 
 		 502 aa  54.3  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.359925  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2583  squalene synthase  41.67 
 
 		 502 aa  54.3  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.063443  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0144  protoporphyrinogen oxidase  24.44 
 
 		 471 aa  54.3  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000061855  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1701  amine oxidase  21.95 
 
 		 503 aa  54.3  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00066646 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1142  amine oxidase  37.35 
 
 		 428 aa  54.3  0.000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0942  amine oxidase  40 
 
 		 449 aa  53.9  0.000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.15931  normal  0.877558 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5454  phytoene dehydrogenase-related protein  48.28 
 
 		 512 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1076  amine oxidase  46.15 
 
 		 437 aa  52.8  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0436  All-trans-retinol 13,14-reductase  20.16 
 
 		 511 aa  53.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.601478 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26240  monoamine oxidase  45.1 
 
 		 418 aa  53.1  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.67782  normal  0.0649912 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5075  amine oxidase  48.28 
 
 		 512 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5163  phytoene dehydrogenase-related protein  48.28 
 
 		 512 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.134146  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0732  amine oxidase  45.1 
 
 		 437 aa  52.8  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.328082 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4024  FAD dependent oxidoreductase  34.38 
 
 		 547 aa  52.4  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.411315  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0654  amine oxidase  31.43 
 
 		 438 aa  52.4  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.239854 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3030  FAD dependent oxidoreductase  38.46 
 
 		 551 aa  52.4  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.788741  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1827  amine oxidase  44.26 
 
 		 433 aa  52.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0425  All-trans-retinol 13,14-reductase  20.16 
 
 		 511 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3075  putative phytoene desaturase  44.83 
 
 		 506 aa  51.6  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.873802  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1888  carotenoid isomerase, putative  35.8 
 
 		 505 aa  51.2  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26410  UDP-galactopyranose mutase  48.28 
 
 		 507 aa  51.6  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.739873 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5620  phytoene desaturase  46 
 
 		 497 aa  51.6  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.476172 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1137  UDP-galactopyranose mutase  38.16 
 
 		 505 aa  51.2  0.00004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1077  all-trans-retinol 13,14-reductase  37.84 
 
 		 505 aa  51.2  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0805  dehydrogenase  47.92 
 
 		 437 aa  51.2  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0204  amine oxidase  36.84 
 
 		 435 aa  51.2  0.00004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.420312  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1578  phytoene dehydrogenase-related protein  44.83 
 
 		 504 aa  51.2  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0475016 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5128  zeta-phytoene desaturase  43.1 
 
 		 506 aa  51.2  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.146602 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20111  phytoene dehydrogenase and related proteins  38.16 
 
 		 505 aa  51.2  0.00004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.428487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0838  Putrescine oxidase  47.06 
 
 		 463 aa  50.8  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.272774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1556  amine oxidase (flavin-containing)  46.15 
 
 		 450 aa  50.8  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0040  amine oxidase  21.71 
 
 		 463 aa  50.8  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8013  hypothetical protein  46.15 
 
 		 524 aa  50.8  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1580  amine oxidase (flavin-containing)  46.15 
 
 		 450 aa  50.8  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4196  amine oxidase  34.07 
 
 		 496 aa  50.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2030  phytoene desaturase  44 
 
 		 501 aa  50.4  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0544  amine oxidase  36.25 
 
 		 525 aa  50.4  0.00006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00189501  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17731  phytoene dehydrogenase  25.24 
 
 		 501 aa  50.4  0.00006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1874  All-trans-retinol 13,14-reductase  33.78 
 
 		 501 aa  50.4  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1155  hypothetical protein  31.65 
 
 		 495 aa  50.4  0.00007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05910  amine oxidase, putative  41.18 
 
 		 537 aa  50.4  0.00007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0298175  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3390  amine oxidase  43.64 
 
 		 448 aa  50.4  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1637  hypothetical protein  43.14 
 
 		 516 aa  50.4  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.252141 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1707  amine oxidase  46.34 
 
 		 408 aa  50.4  0.00007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.588233  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5081  glucose-inhibited division protein A  37.18 
 
 		 381 aa  50.1  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.880262 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1605  amine oxidase  41.82 
 
 		 426 aa  50.1  0.00008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1160  hypothetical protein  31.65 
 
 		 495 aa  50.1  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2970  phytoene desaturase  32.04 
 
 		 493 aa  49.7  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000576965 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3286  FAD dependent oxidoreductase  35.14 
 
 		 488 aa  49.7  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.370539 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0874  amine oxidase  22.62 
 
 		 503 aa  49.3  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3708  FAD dependent oxidoreductase  41.51 
 
 		 494 aa  49.7  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0275457  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0318  FAD dependent oxidoreductase  28.86 
 
 		 547 aa  49.3  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1278  FAD dependent oxidoreductase  32.61 
 
 		 523 aa  49.7  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17531  phytoene dehydrogenase  25.24 
 
 		 501 aa  49.7  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1378  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  40.98 
 
 		 612 aa  48.9  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3228  Zeta-phytoene desaturase  46.03 
 
 		 519 aa  49.3  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.285222  normal  0.0185992 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3185  zeta-phytoene desaturase  39.06 
 
 		 492 aa  48.9  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00134863  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2861  hypothetical protein  41.82 
 
 		 511 aa  48.5  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.245537 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2320  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  48.08 
 
 		 496 aa  48.9  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.106456  normal  0.283017 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0040  putrescine oxidase  47.06 
 
 		 462 aa  49.3  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2771  protoporphyrinogen oxidase  54.17 
 
 		 491 aa  48.9  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0700296  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2058  NAD/FAD-binding protein-like protein  46.34 
 
 		 408 aa  48.5  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00023874  normal  0.0560685 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1481  FAD dependent oxidoreductase  35.71 
 
 		 341 aa  49.3  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0339  amine oxidase  43.14 
 
 		 423 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.39474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0006  amine oxidase  36.59 
 
 		 556 aa  48.1  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3374  C-3',4' desaturase CrtD  35 
 
 		 499 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13894  glutamate synthase subunit beta  57.89 
 
 		 488 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4465  amine oxidase  44.23 
 
 		 480 aa  48.5  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0956  amine oxidase  33.82 
 
 		 434 aa  48.5  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.618507  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1301  amine oxidase  38.03 
 
 		 425 aa  48.1  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3809  phytoene desaturase  32.71 
 
 		 492 aa  48.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2002  FAD dependent oxidoreductase  38.57 
 
 		 510 aa  48.5  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0374  hypothetical protein  40.74 
 
 		 500 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.10021  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1794  protoporphyrinogen oxidase  20.59 
 
 		 419 aa  48.1  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4898  hypothetical protein  41.51 
 
 		 494 aa  48.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00550747  normal  0.0440629 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2442  amine oxidase  20.42 
 
 		 427 aa  47.8  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2880  hypothetical protein  41.82 
 
 		 511 aa  47.8  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0436694 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5970  FAD dependent oxidoreductase  35.14 
 
 		 534 aa  47.8  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.633554  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>