48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5081 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014211  Ndas_5081  glucose-inhibited division protein A  100 
 
 
381 aa  733    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.880262 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7245  amine oxidase, flavin-containing  60.11 
 
 
392 aa  393  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147229  normal  0.232939 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4656  FAD dependent oxidoreductase  55.37 
 
 
412 aa  315  9e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0793428  normal  0.708054 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0956  amine oxidase  26.84 
 
 
434 aa  91.7  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.618507  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2284  hypothetical protein  24.24 
 
 
436 aa  56.6  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2453  hypothetical protein  24.24 
 
 
436 aa  56.6  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.871456  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2550  hypothetical protein  22.3 
 
 
436 aa  56.2  0.0000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2205  phytoene dehydrogenase related enzyme  23.94 
 
 
436 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2262  amine oxidase  22.77 
 
 
436 aa  54.7  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0239134  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2410  hypothetical protein  23.31 
 
 
436 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2921  hypothetical protein  23.54 
 
 
436 aa  53.5  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0819317 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2247  phytoene dehydrogenase related enzyme  23.54 
 
 
436 aa  50.4  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0299983  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0804  hypothetical protein  37.18 
 
 
468 aa  50.4  0.00005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.230959  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1529  hypothetical protein  37.18 
 
 
468 aa  50.1  0.00006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2471  hypothetical protein  23 
 
 
436 aa  49.7  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0519  hypothetical protein  28.19 
 
 
412 aa  48.9  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.696387  normal  0.911419 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0073  amine oxidase  29.15 
 
 
474 aa  48.5  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1146  hypothetical protein  35.9 
 
 
468 aa  48.1  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5205  amine oxidase  47.37 
 
 
565 aa  47.8  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5425  squalene-associated FAD-dependent desaturase  51.79 
 
 
433 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.98696  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0732  amine oxidase  47.14 
 
 
437 aa  47.4  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.328082 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5620  phytoene desaturase  58.97 
 
 
497 aa  47  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.476172 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1378  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  36.92 
 
 
612 aa  45.4  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1648  heterodisulfide reductase, subunit A  58.33 
 
 
427 aa  45.1  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0282926  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2373  phytoene desaturase  46.51 
 
 
519 aa  44.7  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.145608  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1029  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  43.75 
 
 
509 aa  44.7  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1826  squalene-associated FAD-dependent desaturase  37.76 
 
 
437 aa  44.7  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0639  methyl-viologen-reducing hydrogenase, delta subunit  44.83 
 
 
718 aa  43.9  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3855  2,4-dienoyl-CoA reductase (NADPH)  60.53 
 
 
672 aa  44.3  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.720902  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1584  heterodisulfide reductase, subunit A  41.82 
 
 
412 aa  44.3  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00494789  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0036  methyl-viologen-reducing hydrogenase delta subunit  40.68 
 
 
750 aa  43.9  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00274533  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1327  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  47.92 
 
 
1481 aa  43.9  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0241  amine oxidase  62.86 
 
 
508 aa  43.5  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.363504 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3583  FAD dependent oxidoreductase  49.12 
 
 
609 aa  43.5  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0502256  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0795  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  41.67 
 
 
509 aa  43.5  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.820864  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1899  oxidoreductase  68.75 
 
 
449 aa  43.5  0.006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.152308 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2345  response regulator receiver protein  55.81 
 
 
1143 aa  43.5  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.932515  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2175  NADH oxidase  52.5 
 
 
685 aa  43.1  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1137  UDP-galactopyranose mutase  59.46 
 
 
505 aa  43.5  0.007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20111  phytoene dehydrogenase and related proteins  59.46 
 
 
505 aa  43.1  0.007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.428487  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1287  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  47.27 
 
 
420 aa  43.5  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0317  hypothetical protein  55 
 
 
761 aa  43.1  0.008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5529  FAD dependent oxidoreductase  60.61 
 
 
436 aa  43.1  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2794  amine oxidase  41.67 
 
 
431 aa  43.1  0.009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304953  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2110  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  58.33 
 
 
725 aa  43.1  0.009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.824421  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2265  UDP-galactopyranose mutase  25.96 
 
 
384 aa  43.1  0.009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2043  amine oxidase  36.51 
 
 
476 aa  42.7  0.009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0112057  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16851  phytoene dehydrogenase and related protein  55.26 
 
 
503 aa  42.7  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>