More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0956 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_0956  amine oxidase  100 
 
 
434 aa  884    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.618507  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2410  hypothetical protein  34.68 
 
 
436 aa  238  1e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2471  hypothetical protein  34.2 
 
 
436 aa  237  3e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2205  phytoene dehydrogenase related enzyme  34.12 
 
 
436 aa  236  6e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2262  amine oxidase  34.6 
 
 
436 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0239134  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2284  hypothetical protein  34.43 
 
 
436 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2453  hypothetical protein  34.43 
 
 
436 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.871456  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2550  hypothetical protein  34.2 
 
 
436 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2921  hypothetical protein  33.49 
 
 
436 aa  231  2e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0819317 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2247  phytoene dehydrogenase related enzyme  33.49 
 
 
436 aa  229  5e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0299983  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1523  FAD dependent oxidoreductase  37.07 
 
 
402 aa  189  5.999999999999999e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2574  amine oxidase  28.22 
 
 
455 aa  85.5  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.278816  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7245  amine oxidase, flavin-containing  27.74 
 
 
392 aa  81.6  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147229  normal  0.232939 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1312  amine oxidase  26.18 
 
 
446 aa  81.3  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5081  glucose-inhibited division protein A  27.01 
 
 
381 aa  80.1  0.00000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.880262 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0732  amine oxidase  26.41 
 
 
437 aa  71.2  0.00000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.328082 
 
 
-
 
NC_002950  PG2159  protoporphyrinogen oxidase  38.6 
 
 
465 aa  69.7  0.00000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2342  amine oxidase  26.28 
 
 
505 aa  67.4  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2030  phytoene desaturase  23.08 
 
 
501 aa  65.9  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4945  amine oxidase  29.04 
 
 
452 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5033  amine oxidase  29.04 
 
 
452 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5326  amine oxidase  29.04 
 
 
452 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.778847  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0826  protoporphyrinogen oxidase  24.46 
 
 
473 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.981055  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0183  amine oxidase  27.4 
 
 
523 aa  62.4  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4656  FAD dependent oxidoreductase  25.18 
 
 
412 aa  61.2  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0793428  normal  0.708054 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04430  phytoene desaturase  26.97 
 
 
548 aa  61.6  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3573  phytoene desaturase  25.17 
 
 
509 aa  61.6  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1831  protoporphyrinogen oxidase  25 
 
 
447 aa  60.8  0.00000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2704  phytoene desaturase  23.25 
 
 
498 aa  60.5  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1684  phytoene desaturase  23.83 
 
 
506 aa  59.7  0.00000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.127101  normal  0.929667 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2794  amine oxidase  26.74 
 
 
431 aa  59.3  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304953  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1847  phytoene dehydrogenase-related protein  26.54 
 
 
503 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0057  phytoene dehydrogenase-related protein  35.62 
 
 
488 aa  58.9  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00915  CrtI1  33.78 
 
 
488 aa  58.2  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.185647  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1774  protoporphyrinogen oxidase  21.52 
 
 
466 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000300096  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1418  polyamine oxidase  32.23 
 
 
436 aa  57.8  0.0000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.103525  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1779  amine oxidase  28.52 
 
 
420 aa  57.8  0.0000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0331909  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2305  glycosyl transferase family 2  28.17 
 
 
722 aa  57.8  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0138852  normal  0.273361 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1154  protoporphyrinogen oxidase  22.95 
 
 
473 aa  57  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0654  amine oxidase  24.12 
 
 
438 aa  57  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.239854 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2232  protoporphyrinogen oxidase  23.06 
 
 
466 aa  55.8  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.142231  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4196  amine oxidase  48.28 
 
 
496 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0374  hypothetical protein  29.79 
 
 
500 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.10021  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1232  protoporphyrinogen oxidase  23.33 
 
 
473 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0637  putative dehydrogenase  26.45 
 
 
548 aa  55.5  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0715988 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2949  FAD dependent oxidoreductase  26.75 
 
 
517 aa  55.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40191  amine oxidase  46.88 
 
 
468 aa  55.1  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.389508  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0116  phytoene dehydrogenase-related protein  23.6 
 
 
491 aa  55.1  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3185  hypothetical protein  40.74 
 
 
245 aa  54.7  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29229  hitchhiker  0.00171019 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0507  FAD dependent oxidoreductase  36.99 
 
 
342 aa  54.7  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.770202  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5620  phytoene desaturase  41.54 
 
 
497 aa  54.7  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.476172 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1513  squalene-associated FAD-dependent desaturase  28.67 
 
 
444 aa  54.7  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.156187  hitchhiker  0.00817062 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3271  Fe-S oxidoreductase  60.98 
 
 
763 aa  54.3  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3760  FAD dependent oxidoreductase  27.66 
 
 
524 aa  54.3  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00569391 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4200  protoporphyrinogen oxidase  23.2 
 
 
473 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1001  protoporphyrinogen oxidase  22.75 
 
 
473 aa  53.9  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000915854  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0986  protoporphyrinogen oxidase  22.75 
 
 
473 aa  53.9  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0988  protoporphyrinogen oxidase  22.75 
 
 
473 aa  53.9  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000269776  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2236  hypothetical protein  29.26 
 
 
500 aa  53.9  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0391032 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0536  FAD dependent oxidoreductase  36.99 
 
 
342 aa  53.5  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.84854  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21220  phytoene desaturase  28.68 
 
 
566 aa  53.5  0.000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0540  FAD dependent oxidoreductase  36.99 
 
 
342 aa  53.5  0.000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0117  amine oxidase  28.57 
 
 
410 aa  53.5  0.000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2885  amine oxidase  24.82 
 
 
418 aa  53.5  0.000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.748132  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4330  amine oxidase  24 
 
 
500 aa  53.5  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3185  zeta-phytoene desaturase  24 
 
 
492 aa  53.5  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00134863  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3174  squalene-associated FAD-dependent desaturase  26.81 
 
 
417 aa  53.5  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.724661  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1666  protoporphyrinogen oxidase  31.25 
 
 
469 aa  53.5  0.000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3809  phytoene desaturase  25 
 
 
492 aa  53.1  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1605  amine oxidase  27.9 
 
 
426 aa  53.1  0.000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26240  monoamine oxidase  33.98 
 
 
418 aa  53.1  0.000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.67782  normal  0.0649912 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0226  FAD dependent oxidoreductase  25.61 
 
 
518 aa  52.8  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3017  hypothetical protein  38.89 
 
 
484 aa  52.8  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.191221  normal  0.019056 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3599  FAD dependent oxidoreductase  39.47 
 
 
346 aa  52.8  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23230  Flavin containing amine oxidoreductase  46.38 
 
 
415 aa  52.8  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.807494  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1454  amine oxidase  54 
 
 
456 aa  52.8  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.162575  normal  0.372865 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3766  amine oxidase  25.91 
 
 
511 aa  52.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.918224  hitchhiker  0.0064797 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1699  phytoene desaturase  24.19 
 
 
511 aa  52.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.258971  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4441  Amine oxidase (flavin-containing)  29.48 
 
 
498 aa  52.4  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.358617 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0544  amine oxidase  35.37 
 
 
525 aa  52.4  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00189501  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2043  amine oxidase  35.06 
 
 
476 aa  52  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0112057  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4273  C-3',4' desaturase CrtD  25.87 
 
 
499 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.938391 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1578  phytoene dehydrogenase-related protein  46.43 
 
 
504 aa  52  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0475016 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4331  Amine oxidase (flavin-containing)  29.48 
 
 
498 aa  52.4  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0789189 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0902  hypothetical protein  41.67 
 
 
465 aa  52  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.787196  normal  0.0359011 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4064  FAD dependent oxidoreductase  37.31 
 
 
361 aa  51.6  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.521902 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1301  amine oxidase  25.48 
 
 
425 aa  51.2  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1556  amine oxidase (flavin-containing)  27.14 
 
 
450 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2373  phytoene desaturase  35 
 
 
519 aa  51.2  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.145608  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_47627  Amine oxidase  44.16 
 
 
552 aa  51.6  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0599395 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1602  UDP-galactopyranose mutase  44.64 
 
 
369 aa  51.2  0.00003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0347601  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1580  amine oxidase (flavin-containing)  27.14 
 
 
450 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1866  amine oxidase  27.76 
 
 
447 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.591896  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6829  amine oxidase  26.9 
 
 
492 aa  50.8  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.423551  normal  0.420009 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1289  FAD dependent oxidoreductase  25.27 
 
 
516 aa  50.8  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.571457  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3672  protoporphyrinogen oxidase  46.3 
 
 
460 aa  50.8  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0830935  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3734  phytoene desaturase  46.67 
 
 
508 aa  50.8  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.964384  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1146  hypothetical protein  35.29 
 
 
468 aa  50.8  0.00005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2257  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.07 
 
 
520 aa  50.4  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2093  phytoene desaturase  22.63 
 
 
493 aa  50.4  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.456364  decreased coverage  0.00855511 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>