More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0040 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_0040  amine oxidase  100 
 
 
463 aa  943    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0040  putrescine oxidase  84.79 
 
 
462 aa  766    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0838  Putrescine oxidase  70 
 
 
463 aa  603  1.0000000000000001e-171  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.272774  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10320  monoamine oxidase  57.44 
 
 
510 aa  533  1e-150  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0682  Putrescine oxidase  55.35 
 
 
512 aa  499  1e-140  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.016891  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2259  amine oxidase  38.8 
 
 
459 aa  273  4.0000000000000004e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00770255  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0369  putative flavin-containing monoamine oxidase  37.14 
 
 
484 aa  259  1e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.431172 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0141  amine oxidase (flavin-containing)  34.44 
 
 
452 aa  252  1e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2893  amine oxidase  34.44 
 
 
456 aa  251  2e-65  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1178  amine oxidase  35.76 
 
 
454 aa  250  4e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0392628  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4000  amine oxidase (flavin-containing)  36.52 
 
 
499 aa  243  5e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.812077  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13191  flavin-containing monoamine oxidase aofH  37.86 
 
 
454 aa  238  1e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.28865 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3628  amine oxidase  34.52 
 
 
465 aa  236  7e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.533226  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5578  amine oxidase (flavin-containing)  34.42 
 
 
456 aa  232  1e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0389  amine oxidase  36.08 
 
 
449 aa  232  1e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.22597  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1866  amine oxidase  33.63 
 
 
447 aa  231  2e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.591896  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1230  amine oxidase (flavin-containing)  33.78 
 
 
457 aa  229  9e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.333981  normal  0.164061 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5048  twin-arginine translocation pathway signal  36.95 
 
 
578 aa  223  4e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5812  amine oxidase; FAD dependent oxidoreductase  36.95 
 
 
494 aa  223  4e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.377478  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4367  amine oxidase (flavin-containing)  36.73 
 
 
494 aa  221  3e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2742  twin-arginine translocation pathway signal  35.65 
 
 
490 aa  216  9e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00724146  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6401  twin-arginine translocation pathway signal  34.63 
 
 
493 aa  216  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6833  amine oxidase  34.96 
 
 
532 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.574218  normal  0.40808 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4501  amine oxidase  34.46 
 
 
446 aa  214  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.129259  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4331  Amine oxidase (flavin-containing)  33.63 
 
 
498 aa  207  3e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0789189 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4441  Amine oxidase (flavin-containing)  33.63 
 
 
498 aa  207  3e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.358617 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4452  Amine oxidase (flavin-containing)  34.81 
 
 
498 aa  206  7e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.383006  normal  0.183412 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6829  amine oxidase  33.04 
 
 
492 aa  204  4e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.423551  normal  0.420009 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1556  amine oxidase (flavin-containing)  33.63 
 
 
450 aa  201  3e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1580  amine oxidase (flavin-containing)  33.63 
 
 
450 aa  201  3e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5037  amine oxidase (flavin-containing)  36.06 
 
 
493 aa  200  5e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5823  amine oxidase (flavin-containing)  36.06 
 
 
493 aa  200  5e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105573  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2005  amine oxidase  31.81 
 
 
492 aa  199  1.0000000000000001e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0745  amine oxidase (flavin-containing)  29.98 
 
 
469 aa  198  2.0000000000000003e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4356  amine oxidase  35.6 
 
 
493 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1906  amine oxidase (flavin-containing)  32.22 
 
 
487 aa  192  1e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.46762  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2738  amine oxidase  31.63 
 
 
494 aa  189  1e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1526  amine oxidase (flavin-containing)  33.03 
 
 
439 aa  178  1e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.028024  normal  0.955332 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2065  amine oxidase  31.83 
 
 
458 aa  175  9.999999999999999e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2472  amine oxidase  26.28 
 
 
459 aa  161  3e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5789  amine oxidase  30.89 
 
 
444 aa  155  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05890  conserved hypothetical protein  28.12 
 
 
492 aa  145  1e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.314478  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1822  amine oxidase  28.48 
 
 
445 aa  145  2e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2278  amine oxidase  25.9 
 
 
464 aa  137  4e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.381011  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7453  amine oxidase  30.09 
 
 
438 aa  130  5.0000000000000004e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0863551  normal  0.347937 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03291  flavin-containing amine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00100)  26.74 
 
 
457 aa  124  3e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0113455 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2278  amine oxidase  26.96 
 
 
435 aa  99  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.682646 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0586  amine oxidase  26.81 
 
 
427 aa  99  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1418  polyamine oxidase  24.18 
 
 
436 aa  95.9  1e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.103525  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3508  amine oxidase  30.53 
 
 
435 aa  95.1  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4388  amine oxidase  27.08 
 
 
445 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48846  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05276  Putative monoamine oxidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B2F4]  26.22 
 
 
492 aa  91.7  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2268  amine oxidase  28.29 
 
 
431 aa  91.7  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.284727 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05910  amine oxidase, putative  25.73 
 
 
537 aa  88.2  3e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0298175  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2753  amine oxidase  29.07 
 
 
352 aa  87.8  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.394653  normal  0.0187617 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0946  UDP-galactopyranose mutase  25.22 
 
 
495 aa  87.8  4e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6047  amine oxidase  28.35 
 
 
353 aa  86.3  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.629217  normal  0.078923 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3776  amine oxidase  29.39 
 
 
352 aa  85.1  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.435082 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0521  hypothetical protein  25.11 
 
 
496 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05480  hypothetical protein  24.95 
 
 
496 aa  83.2  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5074  amine oxidase, flavin-containing protein  23.97 
 
 
625 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5286  amine oxidase  23.31 
 
 
592 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.456502  normal  0.921895 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2710  twin-arginine translocation pathway signal  26.73 
 
 
469 aa  82  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2381  amine oxidase  24.79 
 
 
496 aa  82.4  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.325197  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0817  Amine oxidase (flavin-containing)  22.44 
 
 
528 aa  81.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0846  amine oxidase  22.44 
 
 
525 aa  81.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5977  amine oxidase  29.73 
 
 
350 aa  80.9  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4453  amine oxidase  27.91 
 
 
443 aa  79.3  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2074  amine oxidase  24.37 
 
 
479 aa  78.6  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1160  hypothetical protein  23.65 
 
 
495 aa  77.4  0.0000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1280  amine oxidase  26.72 
 
 
433 aa  77.4  0.0000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1155  hypothetical protein  23.89 
 
 
495 aa  77  0.0000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0482  amine oxidase  24.84 
 
 
565 aa  76.6  0.0000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5079  amine oxidase  23.25 
 
 
459 aa  75.1  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.392573 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3473  amine oxidase  21.7 
 
 
516 aa  75.1  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4155  amine oxidase (flavin-containing)  25.63 
 
 
465 aa  74.3  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.326684  normal  0.0591967 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2643  amine oxidase  21.91 
 
 
516 aa  74.3  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.686426 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2361  amine oxidase  26.61 
 
 
419 aa  73.6  0.000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000435651  normal  0.0173751 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0455  amine oxidase  23.06 
 
 
624 aa  73.6  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0266  amine oxidase  31.28 
 
 
361 aa  72.4  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000119304  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42289  amine oxidase  25.42 
 
 
628 aa  72  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.317329  decreased coverage  0.00000000282984 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1150  amine oxidase  24.94 
 
 
491 aa  72.4  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4983  amine oxidase  23.55 
 
 
619 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5032  amine oxidase  23.78 
 
 
616 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1454  amine oxidase  30.91 
 
 
456 aa  70.1  0.00000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.162575  normal  0.372865 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2975  amine oxidase  24.84 
 
 
480 aa  70.1  0.00000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2535  amine oxidase  27 
 
 
429 aa  69.7  0.00000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4856  amine oxidase  23.75 
 
 
619 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.314626  normal  0.125904 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1957  amine oxidase  21.93 
 
 
423 aa  69.3  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0882  flavin monoamine oxidase family protein  28.07 
 
 
387 aa  68.6  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1006  amine oxidase  28.07 
 
 
387 aa  68.6  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.74329  hitchhiker  0.00000000109904 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0981  putative flavin containing amine oxidoreductase  29.71 
 
 
368 aa  67.4  0.0000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1781  amine oxidase  28.33 
 
 
367 aa  67.4  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.524453  normal  0.068532 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1328  L-amino-acid oxidase  24.1 
 
 
531 aa  65.9  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.492445  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6128  L-amino-acid oxidase  23.78 
 
 
524 aa  65.9  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01400  conserved hypothetical protein  26.96 
 
 
470 aa  65.5  0.000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1666  protoporphyrinogen oxidase  26.92 
 
 
469 aa  65.5  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5972  amine oxidase  38.64 
 
 
349 aa  64.7  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.824241  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2955  amine oxidase  23.97 
 
 
413 aa  64.7  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000016357  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_51708  flavin-containing amine oxidase  24.5 
 
 
418 aa  64.7  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.771293  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>