268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0394 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0394  amine oxidase  100 
 
 		 428 aa  849    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0586189 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0137  amine oxidase  87.06 
 
 		 425 aa  740    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2442  amine oxidase  56.83 
 
 		 427 aa  447  1.0000000000000001e-124  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0753  amine oxidase  49.88 
 
 		 410 aa  358  9.999999999999999e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1779  amine oxidase  43.1 
 
 		 420 aa  281  2e-74  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0331909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2574  amine oxidase  40.22 
 
 		 455 aa  258  2e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.278816  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0732  amine oxidase  39.33 
 
 		 437 aa  254  3e-66  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.328082 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1312  amine oxidase  41.31 
 
 		 446 aa  245  9.999999999999999e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2885  amine oxidase  40.49 
 
 		 418 aa  238  2e-61  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.748132  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1724  amine oxidase  36.73 
 
 		 470 aa  229  6e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2794  amine oxidase  38 
 
 		 431 aa  225  1e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304953  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40191  amine oxidase  35.86 
 
 		 468 aa  224  2e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.389508  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0654  amine oxidase  36.72 
 
 		 438 aa  223  6e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.239854 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1137  amine oxidase  40.47 
 
 		 436 aa  202  9.999999999999999e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.858264  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5634  amine oxidase, flavin-containing  34.8 
 
 		 407 aa  194  4e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0493824  normal  0.227831 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1605  amine oxidase  34.48 
 
 		 426 aa  184  3e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5169  amine oxidase  35.34 
 
 		 433 aa  162  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26240  monoamine oxidase  31.6 
 
 		 418 aa  158  2e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.67782  normal  0.0649912 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3364  amine oxidase  33.25 
 
 		 414 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.154637  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5071  amine oxidase  33.73 
 
 		 394 aa  146  8.000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.717355  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3418  amine oxidase  31.58 
 
 		 413 aa  140  3e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3795  amine oxidase  31.66 
 
 		 413 aa  140  4.999999999999999e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0121102 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0339  amine oxidase  32.35 
 
 		 423 aa  136  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.39474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3390  amine oxidase  30.95 
 
 		 448 aa  131  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4664  amine oxidase  29.21 
 
 		 418 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.636911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1827  amine oxidase  27.91 
 
 		 433 aa  119  9e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23230  Flavin containing amine oxidoreductase  30.17 
 
 		 415 aa  117  3e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.807494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3282  amine oxidase  30.05 
 
 		 451 aa  116  8.999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13115  normal  0.103215 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_55102  phytoene desaturase  24.13 
 
 		 589 aa  79  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.989776  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0298  carotene 7,8-desaturase  23.98 
 
 		 472 aa  73.9  0.000000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26651  phytoene desaturase  24.42 
 
 		 472 aa  72.8  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1983  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  23.62 
 
 		 474 aa  70.1  0.00000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.490957  normal  0.280593 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2395  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  24.36 
 
 		 472 aa  68.9  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1666  protoporphyrinogen oxidase  26.42 
 
 		 469 aa  66.6  0.0000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23100  squalene-associated FAD-dependent desaturase  27.05 
 
 		 439 aa  66.6  0.0000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.620646  normal  0.191871 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01591  phytoene desaturase  23.47 
 
 		 472 aa  66.2  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1529  hypothetical protein  22 
 
 		 468 aa  65.9  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45735  phytoene dehydrogenase  23.75 
 
 		 624 aa  65.5  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1510  three-step phytoene desaturase / zeta-carotene desaturase  22.59 
 
 		 464 aa  64.7  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4188  phytoene desaturase  25.36 
 
 		 477 aa  64.3  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.422832  normal  0.265876 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_47627  Amine oxidase  22.75 
 
 		 552 aa  64.3  0.000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0599395 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1484  zeta-carotene desaturase  25.26 
 
 		 486 aa  63.9  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.22429  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0146  three-step phytoene desaturase / zeta-carotene desaturase  23.21 
 
 		 465 aa  63.9  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3176  carotene 7,8-desaturase  25.05 
 
 		 482 aa  63.9  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0581  amine oxidase  31.84 
 
 		 413 aa  63.2  0.000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.327293  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02161  phytoene desaturase  22.38 
 
 		 462 aa  63.2  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0804  hypothetical protein  21.41 
 
 		 468 aa  62.4  0.00000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.230959  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1826  squalene-associated FAD-dependent desaturase  27.21 
 
 		 437 aa  62.8  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2694  protoporphyrinogen oxidase  24.11 
 
 		 467 aa  63.2  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.083794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01631  phytoene desaturase  22.74 
 
 		 466 aa  62.8  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2875  phytoene desaturase  23.67 
 
 		 479 aa  62.4  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.202948  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1157  phytoene desaturase  22.98 
 
 		 471 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3041  Carotene 7,8-desaturase  24.95 
 
 		 463 aa  61.6  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000261003 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0651  protoporphyrinogen oxidase  23.27 
 
 		 474 aa  61.2  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0462523  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01611  phytoene desaturase  22.32 
 
 		 466 aa  61.6  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4945  amine oxidase  26.2 
 
 		 452 aa  60.5  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5033  amine oxidase  26.2 
 
 		 452 aa  60.5  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5326  amine oxidase  26.2 
 
 		 452 aa  60.5  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.778847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1146  hypothetical protein  20.96 
 
 		 468 aa  60.1  0.00000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0991  protoporphyrinogen oxidase  22.77 
 
 		 473 aa  60.1  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4795  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  21.85 
 
 		 479 aa  59.7  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000234203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1113  putative amine oxidase  24.02 
 
 		 503 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01891  zeta-carotene desaturase  24.33 
 
 		 486 aa  59.3  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.905208  normal  0.646889 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0826  protoporphyrinogen oxidase  21.22 
 
 		 473 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.981055  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1893  protoporphyrinogen oxidase  28.01 
 
 		 421 aa  58.9  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6445  phytoene dehydrogenase (phytoene desaturase)  28.87 
 
 		 512 aa  58.9  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4135  carotene 7,8-desaturase  26.27 
 
 		 451 aa  58.2  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.190171  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5843  FAD dependent oxidoreductase  42.62 
 
 		 354 aa  57  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0144  protoporphyrinogen oxidase  23.82 
 
 		 471 aa  57  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000061855  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0335  carotene 7,8-desaturase  23.9 
 
 		 488 aa  56.6  0.0000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1169  protoporphyrinogen oxidase  22.72 
 
 		 473 aa  56.6  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3726  phytoene dehydrogenase and related proteins-like  25.27 
 
 		 586 aa  55.8  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01331  zeta-carotene desaturase  22.93 
 
 		 484 aa  55.8  0.000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3950  FAD dependent oxidoreductase  45 
 
 		 330 aa  55.5  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2030  phytoene desaturase  37.78 
 
 		 501 aa  55.8  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1154  protoporphyrinogen oxidase  21.44 
 
 		 473 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2159  protoporphyrinogen oxidase  30.12 
 
 		 465 aa  55.1  0.000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1001  protoporphyrinogen oxidase  21.44 
 
 		 473 aa  55.1  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000915854  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0986  protoporphyrinogen oxidase  21.44 
 
 		 473 aa  55.1  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0988  protoporphyrinogen oxidase  21.44 
 
 		 473 aa  55.1  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000269776  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1467  protoporphyrinogen oxidase  22.8 
 
 		 479 aa  54.7  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1105  protoporphyrinogen oxidase  22.63 
 
 		 473 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01321  zeta-carotene desaturase  23.6 
 
 		 484 aa  54.7  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01291  zeta-carotene desaturase  23.16 
 
 		 484 aa  54.3  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3430  carotene 7,8-desaturase  22.86 
 
 		 490 aa  53.9  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2686  carotene 7,8-desaturase  22.86 
 
 		 490 aa  53.9  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3954  zeta-carotene desaturase  23.16 
 
 		 483 aa  53.9  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.134571  normal  0.596487 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4204  FAD dependent oxidoreductase  42.17 
 
 		 346 aa  53.9  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.429398 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0679  carotene 7,8-desaturase  22.4 
 
 		 489 aa  53.9  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5715  amine oxidase  26.91 
 
 		 562 aa  53.5  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0865614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2493  protoporphyrinogen oxidase  25.8 
 
 		 476 aa  53.9  0.000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000052803 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1160  hypothetical protein  21.62 
 
 		 495 aa  53.5  0.000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2828  protoporphyrinogen oxidase  29.41 
 
 		 488 aa  53.1  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4011  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  21.52 
 
 		 459 aa  53.1  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1155  hypothetical protein  22.22 
 
 		 495 aa  53.1  0.000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0152  amine oxidase  23.34 
 
 		 439 aa  52.8  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4788  carotene 7,8-desaturase  23.42 
 
 		 479 aa  52.8  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1232  protoporphyrinogen oxidase  21.37 
 
 		 473 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0435  FAD dependent oxidoreductase  46.55 
 
 		 347 aa  52  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.164811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1794  protoporphyrinogen oxidase  29.18 
 
 		 419 aa  52  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>