187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5634 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5634  amine oxidase, flavin-containing  100 
 
 		 407 aa  792    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0493824  normal  0.227831 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5169  amine oxidase  50.51 
 
 		 433 aa  333  4e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3795  amine oxidase  49.88 
 
 		 413 aa  291  2e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0121102 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3418  amine oxidase  50.37 
 
 		 413 aa  289  8e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3364  amine oxidase  48.98 
 
 		 414 aa  276  6e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.154637  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3282  amine oxidase  43.84 
 
 		 451 aa  259  7e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13115  normal  0.103215 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5071  amine oxidase  49.13 
 
 		 394 aa  252  1e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.717355  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1827  amine oxidase  41.83 
 
 		 433 aa  239  9e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1724  amine oxidase  37.07 
 
 		 470 aa  236  4e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40191  amine oxidase  37.86 
 
 		 468 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.389508  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0654  amine oxidase  38.52 
 
 		 438 aa  229  6e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.239854 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1605  amine oxidase  37.83 
 
 		 426 aa  227  3e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0339  amine oxidase  41.01 
 
 		 423 aa  223  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.39474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0137  amine oxidase  37.12 
 
 		 425 aa  214  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3390  amine oxidase  40.27 
 
 		 448 aa  209  5e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0753  amine oxidase  39.56 
 
 		 410 aa  209  6e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4664  amine oxidase  43.04 
 
 		 418 aa  203  3e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.636911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1137  amine oxidase  40.29 
 
 		 436 aa  203  4e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.858264  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26240  monoamine oxidase  36.76 
 
 		 418 aa  192  6e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.67782  normal  0.0649912 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0394  amine oxidase  34.34 
 
 		 428 aa  184  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0586189 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2442  amine oxidase  35.65 
 
 		 427 aa  181  2e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1779  amine oxidase  36.3 
 
 		 420 aa  177  2e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0331909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23230  Flavin containing amine oxidoreductase  38.29 
 
 		 415 aa  173  5e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.807494  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0732  amine oxidase  35.87 
 
 		 437 aa  167  2.9999999999999998e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.328082 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2574  amine oxidase  35.01 
 
 		 455 aa  158  1e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.278816  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2885  amine oxidase  35.14 
 
 		 418 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.748132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2794  amine oxidase  33.64 
 
 		 431 aa  140  6e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304953  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1312  amine oxidase  34.16 
 
 		 446 aa  131  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0581  amine oxidase  37.83 
 
 		 413 aa  82.4  0.00000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.327293  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2159  protoporphyrinogen oxidase  27.72 
 
 		 465 aa  61.2  0.00000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23220  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  31.58 
 
 		 464 aa  61.2  0.00000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2694  protoporphyrinogen oxidase  28.17 
 
 		 467 aa  58.9  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.083794  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2504  squalene-associated FAD-dependent desaturase  27.66 
 
 		 414 aa  56.6  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.717786  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1893  protoporphyrinogen oxidase  31.93 
 
 		 421 aa  56.6  0.0000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4952  amine oxidase  29.63 
 
 		 417 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15769  normal  0.0932773 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1725  amine oxidase  26.41 
 
 		 418 aa  55.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.299467  normal  0.079846 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5179  amine oxidase  29.94 
 
 		 417 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5680  amine oxidase  29.94 
 
 		 417 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.799558  hitchhiker  0.00195148 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1105  protoporphyrinogen oxidase  23.79 
 
 		 473 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0991  protoporphyrinogen oxidase  21.72 
 
 		 473 aa  55.1  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5505  squalene-associated FAD-dependent desaturase  29.63 
 
 		 417 aa  54.7  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.342763  normal  0.0220988 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1666  protoporphyrinogen oxidase  25.29 
 
 		 469 aa  54.3  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4555  squalene-associated FAD-dependent desaturase  29.63 
 
 		 417 aa  54.3  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.160695 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4200  protoporphyrinogen oxidase  23.1 
 
 		 473 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5843  FAD dependent oxidoreductase  45.16 
 
 		 354 aa  52.8  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1794  protoporphyrinogen oxidase  26.29 
 
 		 419 aa  52.8  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4262  squalene-associated FAD-dependent desaturase  27.33 
 
 		 418 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.822821  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01726  lipoprotein, putative  40.51 
 
 		 344 aa  52  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1454  amine oxidase  31.94 
 
 		 456 aa  51.6  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.162575  normal  0.372865 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1232  protoporphyrinogen oxidase  23.18 
 
 		 473 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6497  protoporphyrinogen oxidase  41.51 
 
 		 442 aa  50.8  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.56742 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3574  amine oxidase  25.66 
 
 		 418 aa  51.2  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.119107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3134  amine oxidase  46.3 
 
 		 492 aa  50.4  0.00005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.954476  normal  0.604257 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0517  amine oxidase  25.24 
 
 		 647 aa  50.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4414  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like  33.04 
 
 		 381 aa  50.4  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0288059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0534  amine oxidase  25.24 
 
 		 647 aa  50.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.666818  normal  0.352078 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0018  amine oxidase  27.3 
 
 		 417 aa  50.1  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5461  squalene-associated FAD-dependent desaturase  49.15 
 
 		 419 aa  50.1  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4135  carotene 7,8-desaturase  27.57 
 
 		 451 aa  49.7  0.00009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.190171  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2704  phytoene desaturase  50 
 
 		 498 aa  49.7  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1001  protoporphyrinogen oxidase  22.76 
 
 		 473 aa  48.9  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000915854  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0986  protoporphyrinogen oxidase  22.76 
 
 		 473 aa  48.9  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0988  protoporphyrinogen oxidase  22.76 
 
 		 473 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000269776  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1429  protoporphyrinogen oxidase  32.39 
 
 		 473 aa  49.7  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4388  amine oxidase  58 
 
 		 445 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4196  amine oxidase  40.3 
 
 		 496 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1418  polyamine oxidase  51.02 
 
 		 436 aa  49.7  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.103525  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1169  protoporphyrinogen oxidase  22.95 
 
 		 473 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1781  amine oxidase  39.36 
 
 		 367 aa  48.5  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.524453  normal  0.068532 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1719  amine oxidase  43.33 
 
 		 418 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.188576  normal  0.0628779 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0040  putrescine oxidase  55.77 
 
 		 462 aa  48.9  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3672  protoporphyrinogen oxidase  29.79 
 
 		 460 aa  48.5  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0830935  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4868  amine oxidase  36.92 
 
 		 645 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2159  squalene-associated FAD-dependent desaturase  42.03 
 
 		 441 aa  48.9  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4699  amine oxidase  47.06 
 
 		 445 aa  48.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0922876  normal  0.472473 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5620  phytoene desaturase  44.44 
 
 		 497 aa  47.8  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.476172 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2024  protoporphyrinogen oxidase  28.78 
 
 		 490 aa  47.8  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.364182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4898  hypothetical protein  43.75 
 
 		 494 aa  48.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00550747  normal  0.0440629 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6348  squalene-associated FAD-dependent desaturase  50 
 
 		 424 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0839028  normal  0.102238 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2683  amine oxidase  60.47 
 
 		 415 aa  47.8  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.446485  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0425  putative transmembrane protein  41.67 
 
 		 355 aa  47.8  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.133341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1116  hypothetical protein  55 
 
 		 492 aa  47.4  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.993784 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0204  amine oxidase  41.18 
 
 		 435 aa  47.4  0.0005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.420312  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1578  phytoene dehydrogenase-related protein  50 
 
 		 504 aa  47.4  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0475016 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0410  putative transmembrane protein  41.67 
 
 		 332 aa  47.4  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0126834 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1744  protoporphyrinogen oxidase  27.91 
 
 		 488 aa  47.4  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3573  phytoene desaturase  50.91 
 
 		 509 aa  47  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1847  phytoene dehydrogenase-related protein  52.63 
 
 		 503 aa  47  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3007  amine oxidase, flavin-containing protein  30.63 
 
 		 527 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.306413  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_29633  predicted protein  45.16 
 
 		 949 aa  46.6  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1154  protoporphyrinogen oxidase  21.16 
 
 		 473 aa  46.6  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1155  hypothetical protein  42.86 
 
 		 495 aa  46.6  0.0009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1160  hypothetical protein  42.86 
 
 		 495 aa  46.6  0.0009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3185  hypothetical protein  44 
 
 		 245 aa  46.6  0.0009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29229  hitchhiker  0.00171019 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04430  phytoene desaturase  50.94 
 
 		 548 aa  46.2  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4574  HI0933-like protein  50 
 
 		 359 aa  45.8  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2098  amine oxidase  42.86 
 
 		 415 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1706  hypothetical protein  27.34 
 
 		 465 aa  45.8  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.186838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_47627  Amine oxidase  43.24 
 
 		 552 aa  46.2  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0599395 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1637  hypothetical protein  49.09 
 
 		 516 aa  45.8  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.252141 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>