234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5071 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5071  amine oxidase  100 
 
 		 394 aa  756    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.717355  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5634  amine oxidase, flavin-containing  49.88 
 
 		 407 aa  273  3e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0493824  normal  0.227831 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3364  amine oxidase  45.92 
 
 		 414 aa  222  9.999999999999999e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.154637  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5169  amine oxidase  41.03 
 
 		 433 aa  209  5e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3282  amine oxidase  40.14 
 
 		 451 aa  207  3e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13115  normal  0.103215 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1779  amine oxidase  40 
 
 		 420 aa  192  7e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0331909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0339  amine oxidase  39.32 
 
 		 423 aa  190  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.39474  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1724  amine oxidase  35.35 
 
 		 470 aa  187  3e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1605  amine oxidase  37.02 
 
 		 426 aa  187  4e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0654  amine oxidase  36.06 
 
 		 438 aa  184  3e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.239854 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40191  amine oxidase  35.14 
 
 		 468 aa  182  9.000000000000001e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.389508  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3418  amine oxidase  45.36 
 
 		 413 aa  181  1e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3795  amine oxidase  42.6 
 
 		 413 aa  179  4.999999999999999e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0121102 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26240  monoamine oxidase  39.07 
 
 		 418 aa  178  1e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.67782  normal  0.0649912 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0137  amine oxidase  35.92 
 
 		 425 aa  172  1e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3390  amine oxidase  38.17 
 
 		 448 aa  171  2e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1827  amine oxidase  36.49 
 
 		 433 aa  169  5e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1137  amine oxidase  39.04 
 
 		 436 aa  163  4.0000000000000004e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.858264  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0394  amine oxidase  34.43 
 
 		 428 aa  162  9e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0586189 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0753  amine oxidase  37.5 
 
 		 410 aa  159  9e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23230  Flavin containing amine oxidoreductase  39.15 
 
 		 415 aa  158  2e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.807494  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4664  amine oxidase  42.57 
 
 		 418 aa  146  5e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.636911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2442  amine oxidase  35.66 
 
 		 427 aa  145  1e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0732  amine oxidase  33.64 
 
 		 437 aa  139  1e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.328082 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2574  amine oxidase  34.9 
 
 		 455 aa  133  6e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.278816  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1312  amine oxidase  35.45 
 
 		 446 aa  132  1.0000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2885  amine oxidase  35.7 
 
 		 418 aa  125  1e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.748132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2794  amine oxidase  33.03 
 
 		 431 aa  120  4.9999999999999996e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304953  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0581  amine oxidase  33.51 
 
 		 413 aa  90.9  4e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.327293  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23220  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  35.84 
 
 		 464 aa  73.9  0.000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1116  hypothetical protein  27.54 
 
 		 492 aa  67  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.993784 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1261  amine oxidase  28.48 
 
 		 511 aa  65.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0418037 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3766  amine oxidase  26.38 
 
 		 511 aa  62.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.918224  hitchhiker  0.0064797 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1113  putative amine oxidase  26.81 
 
 		 503 aa  62  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0073  amine oxidase  29.05 
 
 		 474 aa  62  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4011  amine oxidase  27.13 
 
 		 511 aa  61.2  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.984835  normal  0.0140967 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1454  amine oxidase  33.8 
 
 		 456 aa  60.5  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.162575  normal  0.372865 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6047  amine oxidase  43.24 
 
 		 353 aa  60.1  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.629217  normal  0.078923 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1699  phytoene desaturase  26.07 
 
 		 511 aa  59.7  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.258971  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3672  protoporphyrinogen oxidase  36.26 
 
 		 460 aa  56.2  0.0000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0830935  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1666  protoporphyrinogen oxidase  31.35 
 
 		 469 aa  55.8  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2828  protoporphyrinogen oxidase  32.07 
 
 		 488 aa  56.2  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0838  Putrescine oxidase  60 
 
 		 463 aa  55.8  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.272774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6445  phytoene dehydrogenase (phytoene desaturase)  28.34 
 
 		 512 aa  54.7  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0183  amine oxidase  37.5 
 
 		 523 aa  55.1  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0040  putrescine oxidase  58.18 
 
 		 462 aa  55.1  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1586  protoporphyrinogen oxidase  33.5 
 
 		 482 aa  54.3  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.149602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5454  phytoene dehydrogenase-related protein  30.8 
 
 		 512 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1418  polyamine oxidase  54 
 
 		 436 aa  54.3  0.000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.103525  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1866  amine oxidase  47.76 
 
 		 447 aa  53.9  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.591896  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4699  amine oxidase  27.02 
 
 		 445 aa  53.9  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0922876  normal  0.472473 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2504  squalene-associated FAD-dependent desaturase  29.82 
 
 		 414 aa  53.1  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.717786  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1523  amine oxidase  51.43 
 
 		 438 aa  53.1  0.000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.834861  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2074  amine oxidase  30.18 
 
 		 479 aa  53.1  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3200  phytoene desaturase  28.79 
 
 		 508 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.177165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5075  amine oxidase  30.45 
 
 		 512 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1151  FAD dependent oxidoreductase  53.7 
 
 		 338 aa  52.4  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.493674  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5163  phytoene dehydrogenase-related protein  30.45 
 
 		 512 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.134146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0040  amine oxidase  56.36 
 
 		 463 aa  52.4  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1781  amine oxidase  56.86 
 
 		 367 aa  52  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.524453  normal  0.068532 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2771  protoporphyrinogen oxidase  31.89 
 
 		 491 aa  52  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0700296  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3950  FAD dependent oxidoreductase  42.37 
 
 		 330 aa  52  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3573  phytoene desaturase  31.74 
 
 		 509 aa  51.6  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5843  FAD dependent oxidoreductase  45.76 
 
 		 354 aa  51.2  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1289  FAD dependent oxidoreductase  52.94 
 
 		 516 aa  51.2  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.571457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1556  amine oxidase (flavin-containing)  54.55 
 
 		 450 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1429  protoporphyrinogen oxidase  39.78 
 
 		 473 aa  51.2  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1580  amine oxidase (flavin-containing)  54.55 
 
 		 450 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4388  amine oxidase  58.82 
 
 		 445 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1765  protoporphyrinogen oxidase  31.67 
 
 		 493 aa  51.6  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000124321  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0143  amine oxidase  26.99 
 
 		 519 aa  50.8  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5197  phytoene desaturase  31.48 
 
 		 525 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2843  phytoene desaturase  29.6 
 
 		 507 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105114  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1893  protoporphyrinogen oxidase  29.94 
 
 		 421 aa  50.8  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2278  amine oxidase  61.22 
 
 		 435 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.682646 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2211  phytoene desaturase  48.08 
 
 		 531 aa  50.1  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.931782  normal  0.130578 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5174  protoporphyrinogen oxidase  46.15 
 
 		 470 aa  50.1  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00221395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1826  squalene-associated FAD-dependent desaturase  29.14 
 
 		 437 aa  49.7  0.00009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0117  amine oxidase  28.04 
 
 		 410 aa  49.7  0.00009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1794  protoporphyrinogen oxidase  40.45 
 
 		 419 aa  48.9  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2493  protoporphyrinogen oxidase  50 
 
 		 476 aa  48.9  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000052803 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0204  amine oxidase  34.58 
 
 		 435 aa  49.7  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.420312  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2159  squalene-associated FAD-dependent desaturase  47.62 
 
 		 441 aa  49.3  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1578  phytoene dehydrogenase-related protein  56.36 
 
 		 504 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0475016 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0826  protoporphyrinogen oxidase  24.14 
 
 		 473 aa  48.9  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.981055  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1847  phytoene dehydrogenase-related protein  28.43 
 
 		 503 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0956  amine oxidase  28.57 
 
 		 434 aa  48.9  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.618507  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1008  putative protoporphyrinogen oxidase  30.68 
 
 		 432 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.961775  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2005  amine oxidase  37 
 
 		 492 aa  48.5  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6289  FAD dependent oxidoreductase  28.88 
 
 		 510 aa  48.5  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00968377  normal  0.473682 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1335  protoporphyrinogen oxidase  47.62 
 
 		 471 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.073104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3809  phytoene desaturase  30.92 
 
 		 492 aa  48.9  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2285  FAD dependent oxidoreductase  43.86 
 
 		 314 aa  48.5  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0307  amine oxidase  25.11 
 
 		 448 aa  48.1  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1602  UDP-galactopyranose mutase  30.93 
 
 		 369 aa  48.9  0.0002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0347601  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0286  putative protoporphyrinogen oxidase  30.68 
 
 		 432 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0469337  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1808  putative oxidoreductase  30.68 
 
 		 432 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1724  putative oxidoreductase  30.68 
 
 		 432 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0447228  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1310  putative protoporphyrinogen oxidase  30.68 
 
 		 432 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.643053  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1077  all-trans-retinol 13,14-reductase  22.58 
 
 		 505 aa  47.8  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>