161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0117 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_0117  amine oxidase  100 
 
 		 410 aa  810    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6348  squalene-associated FAD-dependent desaturase  54.3 
 
 		 424 aa  391  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0839028  normal  0.102238 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1826  squalene-associated FAD-dependent desaturase  53 
 
 		 437 aa  384  1e-105  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7145  squalene-associated FAD-dependent desaturase  52.05 
 
 		 438 aa  374  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5425  squalene-associated FAD-dependent desaturase  49.64 
 
 		 433 aa  370  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.98696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2219  squalene-associated FAD-dependent desaturase  50.97 
 
 		 433 aa  365  1e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.698048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1943  squalene-associated FAD-dependent desaturase  50.97 
 
 		 433 aa  365  1e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.273475  normal  0.570646 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1834  squalene-associated FAD-dependent desaturase  51.93 
 
 		 433 aa  363  2e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1719  amine oxidase  48.65 
 
 		 418 aa  359  6e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.188576  normal  0.0628779 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2968  putative phytoene dehydrogenase  47.56 
 
 		 416 aa  353  4e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.211765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3574  amine oxidase  47.8 
 
 		 418 aa  343  2e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.119107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0063  amine oxidase  50.84 
 
 		 432 aa  343  4e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1725  amine oxidase  47.55 
 
 		 418 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.299467  normal  0.079846 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3155  squalene-associated FAD-dependent desaturase  47.53 
 
 		 415 aa  334  1e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2683  amine oxidase  45.61 
 
 		 415 aa  332  5e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.446485  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5461  squalene-associated FAD-dependent desaturase  45.67 
 
 		 419 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2270  amine oxidase  45.95 
 
 		 417 aa  325  8.000000000000001e-88  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.160101 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4262  squalene-associated FAD-dependent desaturase  48.04 
 
 		 418 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.822821  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7028  squalene-associated FAD-dependent desaturase  48.4 
 
 		 422 aa  316  4e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000526905 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0011  hypothetical protein  48.29 
 
 		 422 aa  316  5e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3242  squalene-associated FAD-dependent desaturase  46.29 
 
 		 419 aa  312  7.999999999999999e-84  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.179321 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4138  squalene-associated FAD-dependent desaturase  43.83 
 
 		 425 aa  298  9e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0018  amine oxidase  41.65 
 
 		 417 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4952  amine oxidase  41.65 
 
 		 417 aa  272  7e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15769  normal  0.0932773 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5505  squalene-associated FAD-dependent desaturase  41.65 
 
 		 417 aa  271  1e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.342763  normal  0.0220988 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4555  squalene-associated FAD-dependent desaturase  41.16 
 
 		 417 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.160695 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5179  amine oxidase  41.16 
 
 		 417 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5680  amine oxidase  41.16 
 
 		 417 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.799558  hitchhiker  0.00195148 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3174  squalene-associated FAD-dependent desaturase  41.65 
 
 		 417 aa  266  4e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.724661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0307  amine oxidase  33.64 
 
 		 448 aa  173  5.999999999999999e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1470  amine oxidase  31.98 
 
 		 440 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.292882 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2159  squalene-associated FAD-dependent desaturase  33.19 
 
 		 441 aa  122  9.999999999999999e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1523  amine oxidase  31.79 
 
 		 438 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.834861  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2707  amine oxidase  32.47 
 
 		 410 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0288942  hitchhiker  0.00000819833 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2504  squalene-associated FAD-dependent desaturase  31.71 
 
 		 414 aa  105  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.717786  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1513  squalene-associated FAD-dependent desaturase  30.82 
 
 		 444 aa  104  3e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.156187  hitchhiker  0.00817062 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1698  putative squalene/phytoene dehydrogenase  30.7 
 
 		 424 aa  102  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.837953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23100  squalene-associated FAD-dependent desaturase  29.05 
 
 		 439 aa  102  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.620646  normal  0.191871 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2016  amine oxidase  29.18 
 
 		 426 aa  100  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1286  putative squalene/phytoene dehydrogenase  32.29 
 
 		 448 aa  100  4e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.109355 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0821  amine oxidase  28.67 
 
 		 569 aa  100  5e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.147648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2965  amine oxidase  28.84 
 
 		 423 aa  99  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0856614  hitchhiker  0.00607749 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1747  carotene 7,8-desaturase  26.4 
 
 		 481 aa  91.3  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.969616 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2571  squalene-associated FAD-dependent desaturase  30.53 
 
 		 462 aa  88.6  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0585158 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2550  squalene-associated FAD-dependent desaturase  28.24 
 
 		 432 aa  86.3  9e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.005489 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0071  amine oxidase  28.18 
 
 		 452 aa  84.3  0.000000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0365942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5715  amine oxidase  29.66 
 
 		 562 aa  82.8  0.000000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0865614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1590  zeta-carotene desaturase  22.91 
 
 		 455 aa  76.6  0.0000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0916  Carotene 7,8-desaturase  22.58 
 
 		 453 aa  76.3  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1769  Carotene 7,8-desaturase  22.37 
 
 		 453 aa  75.9  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3204  squalene-associated FAD-dependent desaturase  24.73 
 
 		 477 aa  75.5  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.55236  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1415  carotene 7,8-desaturase  22.36 
 
 		 453 aa  75.1  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.979127 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4945  amine oxidase  28.27 
 
 		 452 aa  73.2  0.000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5033  amine oxidase  28.27 
 
 		 452 aa  73.2  0.000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5326  amine oxidase  28.27 
 
 		 452 aa  73.2  0.000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.778847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1455  amine oxidase  27.7 
 
 		 439 aa  71.6  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01311  zeta-carotene desaturase  22.55 
 
 		 478 aa  72  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0941429  normal  0.461178 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0830  zeta-carotene desaturase  21.35 
 
 		 453 aa  71.2  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.762196  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1157  phytoene desaturase  22.22 
 
 		 471 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1524  Carotene 7,8-desaturase  21.29 
 
 		 453 aa  68.2  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000615844  normal  0.187981 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1695  amine oxidase  28.64 
 
 		 486 aa  67  0.0000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.916682  hitchhiker  0.0000276291 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1201  amine oxidase  28.47 
 
 		 434 aa  67.4  0.0000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.269087  normal  0.505468 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6666  squalene-associated FAD-dependent desaturase  27.71 
 
 		 440 aa  66.2  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.393983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3176  carotene 7,8-desaturase  24.05 
 
 		 482 aa  66.2  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1120  squalene-associated FAD-dependent desaturase  28.57 
 
 		 422 aa  65.9  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.454747  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0308  phytoene desaturase  23.27 
 
 		 475 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4788  carotene 7,8-desaturase  21.89 
 
 		 479 aa  65.1  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0949  Carotene 7,8-desaturase  20.43 
 
 		 453 aa  65.1  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0335  carotene 7,8-desaturase  23.01 
 
 		 488 aa  63.5  0.000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01891  zeta-carotene desaturase  22.15 
 
 		 486 aa  63.2  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.905208  normal  0.646889 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0308  phytoene desaturase  22.9 
 
 		 475 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.105357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2440  squalene-associated FAD-dependent desaturase  42.42 
 
 		 447 aa  62.4  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0200  zeta-carotene desaturase  21.76 
 
 		 479 aa  62  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4516  amine oxidase  25.11 
 
 		 432 aa  62  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2875  phytoene desaturase  22.06 
 
 		 479 aa  61.6  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.202948  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4795  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  23.22 
 
 		 479 aa  61.6  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000234203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1983  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  21.91 
 
 		 474 aa  61.2  0.00000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.490957  normal  0.280593 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2356  zeta-carotene desaturase  23.01 
 
 		 488 aa  60.5  0.00000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4193  squalene-associated FAD-dependent desaturase  26.23 
 
 		 447 aa  60.5  0.00000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0679  carotene 7,8-desaturase  21.5 
 
 		 489 aa  60.1  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4188  phytoene desaturase  23.9 
 
 		 477 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.422832  normal  0.265876 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3954  zeta-carotene desaturase  21.24 
 
 		 483 aa  58.9  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.134571  normal  0.596487 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1484  zeta-carotene desaturase  37.66 
 
 		 486 aa  55.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.22429  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4135  carotene 7,8-desaturase  43.84 
 
 		 451 aa  55.5  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.190171  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4011  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  23.58 
 
 		 459 aa  54.3  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0179  hypothetical protein  27.11 
 
 		 448 aa  53.5  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2395  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  22.48 
 
 		 472 aa  53.5  0.000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01291  zeta-carotene desaturase  20.29 
 
 		 484 aa  53.5  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0956  amine oxidase  28.57 
 
 		 434 aa  53.5  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.618507  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0146  three-step phytoene desaturase / zeta-carotene desaturase  22.62 
 
 		 465 aa  52.4  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02161  phytoene desaturase  20.13 
 
 		 462 aa  52.8  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0036  UDP-galactopyranose mutase  24.4 
 
 		 647 aa  51.6  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01721  phytoene desaturase  20.55 
 
 		 473 aa  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.69255  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1512  zeta-carotene desaturase  23.7 
 
 		 481 aa  51.6  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.311968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3289  amine oxidase, flavin-containing  37.84 
 
 		 487 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0435  gamma-carotene desaturase  24.33 
 
 		 639 aa  50.8  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1779  amine oxidase  25.9 
 
 		 420 aa  50.8  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0331909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40191  amine oxidase  23.46 
 
 		 468 aa  50.8  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.389508  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3282  amine oxidase  28.8 
 
 		 451 aa  51.2  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13115  normal  0.103215 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2794  hypothetical protein  32.91 
 
 		 429 aa  50.8  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>