128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3155 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_3155  squalene-associated FAD-dependent desaturase  100 
 
 		 415 aa  828    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3242  squalene-associated FAD-dependent desaturase  67.49 
 
 		 419 aa  526  1e-148  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.179321 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6348  squalene-associated FAD-dependent desaturase  60.84 
 
 		 424 aa  481  1e-135  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0839028  normal  0.102238 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5425  squalene-associated FAD-dependent desaturase  58.75 
 
 		 433 aa  471  1e-132  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.98696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7145  squalene-associated FAD-dependent desaturase  60 
 
 		 438 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2968  putative phytoene dehydrogenase  54.61 
 
 		 416 aa  449  1e-125  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.211765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1719  amine oxidase  54.52 
 
 		 418 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.188576  normal  0.0628779 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1834  squalene-associated FAD-dependent desaturase  57.83 
 
 		 433 aa  444  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1725  amine oxidase  54.88 
 
 		 418 aa  444  1e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.299467  normal  0.079846 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2219  squalene-associated FAD-dependent desaturase  57.14 
 
 		 433 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.698048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2683  amine oxidase  53.19 
 
 		 415 aa  438  9.999999999999999e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.446485  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1943  squalene-associated FAD-dependent desaturase  57.14 
 
 		 433 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.273475  normal  0.570646 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2270  amine oxidase  53.03 
 
 		 417 aa  433  1e-120  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.160101 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3574  amine oxidase  54.39 
 
 		 418 aa  434  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.119107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4262  squalene-associated FAD-dependent desaturase  56.1 
 
 		 418 aa  425  1e-118  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.822821  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0011  hypothetical protein  50.64 
 
 		 422 aa  393  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7028  squalene-associated FAD-dependent desaturase  52.96 
 
 		 422 aa  394  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000526905 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5461  squalene-associated FAD-dependent desaturase  47.24 
 
 		 419 aa  376  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4138  squalene-associated FAD-dependent desaturase  49.16 
 
 		 425 aa  376  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0117  amine oxidase  47.79 
 
 		 410 aa  355  1e-96  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5505  squalene-associated FAD-dependent desaturase  46.72 
 
 		 417 aa  345  7e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.342763  normal  0.0220988 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0063  amine oxidase  48.43 
 
 		 432 aa  345  1e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4952  amine oxidase  46.47 
 
 		 417 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15769  normal  0.0932773 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0018  amine oxidase  45.74 
 
 		 417 aa  342  5e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3174  squalene-associated FAD-dependent desaturase  46.1 
 
 		 417 aa  342  9e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.724661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4555  squalene-associated FAD-dependent desaturase  45.99 
 
 		 417 aa  340  4e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.160695 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5179  amine oxidase  45.74 
 
 		 417 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5680  amine oxidase  45.74 
 
 		 417 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.799558  hitchhiker  0.00195148 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1826  squalene-associated FAD-dependent desaturase  44.47 
 
 		 437 aa  315  9.999999999999999e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0307  amine oxidase  33.26 
 
 		 448 aa  166  6.9999999999999995e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1523  amine oxidase  29.46 
 
 		 438 aa  127  3e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.834861  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23100  squalene-associated FAD-dependent desaturase  28.77 
 
 		 439 aa  127  4.0000000000000003e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.620646  normal  0.191871 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1513  squalene-associated FAD-dependent desaturase  30.77 
 
 		 444 aa  113  8.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.156187  hitchhiker  0.00817062 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2159  squalene-associated FAD-dependent desaturase  28 
 
 		 441 aa  107  3e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1470  amine oxidase  29.05 
 
 		 440 aa  106  6e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.292882 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4945  amine oxidase  26.46 
 
 		 452 aa  106  8e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5033  amine oxidase  26.46 
 
 		 452 aa  106  8e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5326  amine oxidase  26.46 
 
 		 452 aa  106  8e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.778847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0821  amine oxidase  30.97 
 
 		 569 aa  105  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.147648  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2504  squalene-associated FAD-dependent desaturase  29.36 
 
 		 414 aa  96.7  7e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.717786  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1747  carotene 7,8-desaturase  26.05 
 
 		 481 aa  90.9  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.969616 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2707  amine oxidase  28.22 
 
 		 410 aa  89.4  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0288942  hitchhiker  0.00000819833 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2016  amine oxidase  28.33 
 
 		 426 aa  89  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1695  amine oxidase  28.54 
 
 		 486 aa  85.5  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.916682  hitchhiker  0.0000276291 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1769  Carotene 7,8-desaturase  23.09 
 
 		 453 aa  83.6  0.000000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1415  carotene 7,8-desaturase  24.09 
 
 		 453 aa  83.2  0.000000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.979127 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2965  amine oxidase  26.81 
 
 		 423 aa  83.2  0.000000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0856614  hitchhiker  0.00607749 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0830  zeta-carotene desaturase  23.85 
 
 		 453 aa  82.4  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.762196  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0949  Carotene 7,8-desaturase  23.53 
 
 		 453 aa  81.6  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1590  zeta-carotene desaturase  24.03 
 
 		 455 aa  81.3  0.00000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5715  amine oxidase  30.04 
 
 		 562 aa  81.3  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0865614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3954  zeta-carotene desaturase  23.27 
 
 		 483 aa  79.7  0.00000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.134571  normal  0.596487 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0916  Carotene 7,8-desaturase  23.14 
 
 		 453 aa  79  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0679  carotene 7,8-desaturase  22.27 
 
 		 489 aa  76.3  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2356  zeta-carotene desaturase  23.37 
 
 		 488 aa  75.9  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01291  zeta-carotene desaturase  22.36 
 
 		 484 aa  75.1  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0200  zeta-carotene desaturase  23.06 
 
 		 479 aa  73.9  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6666  squalene-associated FAD-dependent desaturase  27.9 
 
 		 440 aa  73.6  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.393983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1455  amine oxidase  27.38 
 
 		 439 aa  73.6  0.000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2571  squalene-associated FAD-dependent desaturase  26.95 
 
 		 462 aa  73.2  0.000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0585158 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1548  amine oxidase  26.37 
 
 		 434 aa  73.2  0.000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3204  squalene-associated FAD-dependent desaturase  23.96 
 
 		 477 aa  72.8  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.55236  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1484  zeta-carotene desaturase  23.01 
 
 		 486 aa  71.6  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.22429  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3176  carotene 7,8-desaturase  23.9 
 
 		 482 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1157  phytoene desaturase  24.24 
 
 		 471 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01311  zeta-carotene desaturase  22.85 
 
 		 478 aa  71.2  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0941429  normal  0.461178 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0308  phytoene desaturase  26.8 
 
 		 475 aa  70.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.105357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1286  putative squalene/phytoene dehydrogenase  26.97 
 
 		 448 aa  70.1  0.00000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.109355 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0308  phytoene desaturase  26.8 
 
 		 475 aa  70.1  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0071  amine oxidase  24.77 
 
 		 452 aa  69.3  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0365942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01321  zeta-carotene desaturase  20.93 
 
 		 484 aa  69.3  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2875  phytoene desaturase  23.09 
 
 		 479 aa  69.3  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.202948  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1201  amine oxidase  28.27 
 
 		 434 aa  67.8  0.0000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.269087  normal  0.505468 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1524  Carotene 7,8-desaturase  22.41 
 
 		 453 aa  67.4  0.0000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000615844  normal  0.187981 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4011  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  22.94 
 
 		 459 aa  67.4  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1120  squalene-associated FAD-dependent desaturase  27.82 
 
 		 422 aa  66.6  0.0000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.454747  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0335  carotene 7,8-desaturase  23.16 
 
 		 488 aa  66.2  0.000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2686  carotene 7,8-desaturase  22.78 
 
 		 490 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1983  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  23.74 
 
 		 474 aa  65.5  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.490957  normal  0.280593 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3430  carotene 7,8-desaturase  22.78 
 
 		 490 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1698  putative squalene/phytoene dehydrogenase  27.77 
 
 		 424 aa  64.3  0.000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.837953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0118  zeta-carotene desaturase  20.72 
 
 		 499 aa  63.5  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26651  phytoene desaturase  24.45 
 
 		 472 aa  63.5  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01331  zeta-carotene desaturase  20.3 
 
 		 484 aa  63.2  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4788  carotene 7,8-desaturase  21.46 
 
 		 479 aa  62  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2440  squalene-associated FAD-dependent desaturase  39 
 
 		 447 aa  61.2  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4516  amine oxidase  23.64 
 
 		 432 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2550  squalene-associated FAD-dependent desaturase  25.41 
 
 		 432 aa  59.7  0.00000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.005489 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01611  phytoene desaturase  21.37 
 
 		 466 aa  59.3  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01721  phytoene desaturase  21.2 
 
 		 473 aa  58.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.69255  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01631  phytoene desaturase  21.15 
 
 		 466 aa  58.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0884  Carotene 7,8-desaturase  23.77 
 
 		 460 aa  58.5  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000776733  normal  0.0521549 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0146  three-step phytoene desaturase / zeta-carotene desaturase  20.99 
 
 		 465 aa  57  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_55102  phytoene desaturase  22.39 
 
 		 589 aa  57  0.0000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.989776  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4795  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  22.73 
 
 		 479 aa  55.8  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000234203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1188  phytoene desaturase  21.23 
 
 		 461 aa  55.5  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.045363  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2395  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  25.21 
 
 		 472 aa  55.5  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1512  zeta-carotene desaturase  22.9 
 
 		 481 aa  55.1  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.311968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01891  zeta-carotene desaturase  25.7 
 
 		 486 aa  54.7  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.905208  normal  0.646889 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02161  phytoene desaturase  22.05 
 
 		 462 aa  54.7  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>