193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1201 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_1120  squalene-associated FAD-dependent desaturase  99.05 
 
 		 422 aa  805    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.454747  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1201  amine oxidase  100 
 
 		 434 aa  838    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.269087  normal  0.505468 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1455  amine oxidase  67.73 
 
 		 439 aa  493  9.999999999999999e-139  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2504  squalene-associated FAD-dependent desaturase  59.81 
 
 		 414 aa  431  1e-120  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.717786  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2571  squalene-associated FAD-dependent desaturase  58.77 
 
 		 462 aa  429  1e-119  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0585158 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2965  amine oxidase  58.97 
 
 		 423 aa  418  1e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0856614  hitchhiker  0.00607749 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0071  amine oxidase  63.29 
 
 		 452 aa  413  1e-114  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0365942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1548  amine oxidase  56.88 
 
 		 434 aa  404  1e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2016  amine oxidase  54.48 
 
 		 426 aa  390  1e-107  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1286  putative squalene/phytoene dehydrogenase  51.79 
 
 		 448 aa  326  5e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.109355 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2550  squalene-associated FAD-dependent desaturase  50 
 
 		 432 aa  308  1.0000000000000001e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.005489 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1470  amine oxidase  40.4 
 
 		 440 aa  238  2e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.292882 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2159  squalene-associated FAD-dependent desaturase  42.86 
 
 		 441 aa  231  2e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2707  amine oxidase  39.08 
 
 		 410 aa  188  2e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0288942  hitchhiker  0.00000819833 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1698  putative squalene/phytoene dehydrogenase  41.35 
 
 		 424 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.837953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1523  amine oxidase  37.14 
 
 		 438 aa  183  6e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.834861  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1513  squalene-associated FAD-dependent desaturase  32.83 
 
 		 444 aa  140  3e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.156187  hitchhiker  0.00817062 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0307  amine oxidase  28.39 
 
 		 448 aa  101  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6348  squalene-associated FAD-dependent desaturase  29.5 
 
 		 424 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0839028  normal  0.102238 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5425  squalene-associated FAD-dependent desaturase  29.61 
 
 		 433 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.98696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3574  amine oxidase  28.15 
 
 		 418 aa  90.1  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.119107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2968  putative phytoene dehydrogenase  27.29 
 
 		 416 aa  90.1  8e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.211765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0117  amine oxidase  29.74 
 
 		 410 aa  88.6  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23100  squalene-associated FAD-dependent desaturase  28.95 
 
 		 439 aa  87.4  4e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.620646  normal  0.191871 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1826  squalene-associated FAD-dependent desaturase  27.61 
 
 		 437 aa  85.1  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1725  amine oxidase  27.95 
 
 		 418 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.299467  normal  0.079846 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1719  amine oxidase  26.82 
 
 		 418 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.188576  normal  0.0628779 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3155  squalene-associated FAD-dependent desaturase  28.54 
 
 		 415 aa  82.4  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0063  amine oxidase  29.32 
 
 		 432 aa  82.4  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5461  squalene-associated FAD-dependent desaturase  25.16 
 
 		 419 aa  80.5  0.00000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2270  amine oxidase  27.82 
 
 		 417 aa  75.5  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.160101 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4952  amine oxidase  27.14 
 
 		 417 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15769  normal  0.0932773 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1695  amine oxidase  29.8 
 
 		 486 aa  75.1  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.916682  hitchhiker  0.0000276291 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7028  squalene-associated FAD-dependent desaturase  28.28 
 
 		 422 aa  72  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000526905 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4555  squalene-associated FAD-dependent desaturase  27.18 
 
 		 417 aa  72  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.160695 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5179  amine oxidase  26.96 
 
 		 417 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5680  amine oxidase  26.96 
 
 		 417 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.799558  hitchhiker  0.00195148 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0018  amine oxidase  26.67 
 
 		 417 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4945  amine oxidase  26.25 
 
 		 452 aa  70.5  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5033  amine oxidase  26.25 
 
 		 452 aa  70.5  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5326  amine oxidase  26.25 
 
 		 452 aa  70.5  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.778847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5505  squalene-associated FAD-dependent desaturase  26.6 
 
 		 417 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.342763  normal  0.0220988 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1834  squalene-associated FAD-dependent desaturase  25.93 
 
 		 433 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1747  carotene 7,8-desaturase  27.78 
 
 		 481 aa  68.9  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.969616 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3174  squalene-associated FAD-dependent desaturase  27.87 
 
 		 417 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.724661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0916  Carotene 7,8-desaturase  29.23 
 
 		 453 aa  67.8  0.0000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3242  squalene-associated FAD-dependent desaturase  28 
 
 		 419 aa  66.6  0.0000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.179321 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4262  squalene-associated FAD-dependent desaturase  28.82 
 
 		 418 aa  65.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.822821  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1415  carotene 7,8-desaturase  27.69 
 
 		 453 aa  66.2  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.979127 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1943  squalene-associated FAD-dependent desaturase  26.15 
 
 		 433 aa  66.2  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.273475  normal  0.570646 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2683  amine oxidase  26.11 
 
 		 415 aa  66.2  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.446485  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2219  squalene-associated FAD-dependent desaturase  25.93 
 
 		 433 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.698048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4138  squalene-associated FAD-dependent desaturase  25.88 
 
 		 425 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0830  zeta-carotene desaturase  28.46 
 
 		 453 aa  64.3  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.762196  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0011  hypothetical protein  25.57 
 
 		 422 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0517  amine oxidase  24.41 
 
 		 647 aa  63.2  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0534  amine oxidase  24.41 
 
 		 647 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.666818  normal  0.352078 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1590  zeta-carotene desaturase  29.77 
 
 		 455 aa  63.2  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0146  three-step phytoene desaturase / zeta-carotene desaturase  21.78 
 
 		 465 aa  62.4  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1769  Carotene 7,8-desaturase  26.15 
 
 		 453 aa  62.4  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0949  Carotene 7,8-desaturase  28.46 
 
 		 453 aa  61.2  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1510  three-step phytoene desaturase / zeta-carotene desaturase  22.11 
 
 		 464 aa  60.5  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01611  phytoene desaturase  21.58 
 
 		 466 aa  60.5  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01631  phytoene desaturase  21.58 
 
 		 466 aa  60.5  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2395  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  22.44 
 
 		 472 aa  60.5  0.00000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01291  zeta-carotene desaturase  24.11 
 
 		 484 aa  60.5  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02161  phytoene desaturase  21.66 
 
 		 462 aa  60.1  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4188  phytoene desaturase  31.34 
 
 		 477 aa  60.1  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.422832  normal  0.265876 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01331  zeta-carotene desaturase  22.62 
 
 		 484 aa  60.1  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0036  UDP-galactopyranose mutase  22.8 
 
 		 647 aa  59.3  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4868  amine oxidase  26.34 
 
 		 645 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1524  Carotene 7,8-desaturase  27.69 
 
 		 453 aa  59.3  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000615844  normal  0.187981 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6666  squalene-associated FAD-dependent desaturase  27.6 
 
 		 440 aa  58.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.393983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01321  zeta-carotene desaturase  22.62 
 
 		 484 aa  58.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4795  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  31.34 
 
 		 479 aa  58.2  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000234203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0118  zeta-carotene desaturase  22.62 
 
 		 499 aa  57  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3954  zeta-carotene desaturase  38.16 
 
 		 483 aa  57  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.134571  normal  0.596487 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1484  zeta-carotene desaturase  38.16 
 
 		 486 aa  56.6  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.22429  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45735  phytoene dehydrogenase  42.11 
 
 		 624 aa  56.6  0.0000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5715  amine oxidase  28.33 
 
 		 562 aa  56.2  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0865614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01891  zeta-carotene desaturase  38.16 
 
 		 486 aa  55.8  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.905208  normal  0.646889 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26651  phytoene desaturase  31.09 
 
 		 472 aa  56.2  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2440  squalene-associated FAD-dependent desaturase  29.23 
 
 		 447 aa  56.2  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0308  phytoene desaturase  29.06 
 
 		 475 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0308  phytoene desaturase  29.06 
 
 		 475 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.105357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2256  Rieske (2Fe-2S) domain protein  23.28 
 
 		 643 aa  55.8  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.429922  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01721  phytoene desaturase  20.94 
 
 		 473 aa  55.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.69255  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0298  carotene 7,8-desaturase  23 
 
 		 472 aa  54.3  0.000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1983  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  31.09 
 
 		 474 aa  54.7  0.000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.490957  normal  0.280593 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38345  predicted protein  40.79 
 
 		 599 aa  53.9  0.000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.526893  normal  0.29017 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01591  phytoene desaturase  30.25 
 
 		 472 aa  53.9  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0335  carotene 7,8-desaturase  39.47 
 
 		 488 aa  53.5  0.000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7245  amine oxidase, flavin-containing  42.11 
 
 		 392 aa  53.5  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147229  normal  0.232939 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2356  zeta-carotene desaturase  38.16 
 
 		 488 aa  53.5  0.000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1091  putative cyclopropane/cyclopropene fatty acid synthesis protein, flavin amine oxidase  25.94 
 
 		 430 aa  53.1  0.000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.432347  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1118  amine oxidase, flavin-containing protein  25.13 
 
 		 415 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0958  amine oxidase, flavin-containing  25.13 
 
 		 415 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2686  carotene 7,8-desaturase  38.16 
 
 		 490 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3176  carotene 7,8-desaturase  39.47 
 
 		 482 aa  53.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3430  carotene 7,8-desaturase  38.16 
 
 		 490 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>