283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_1470 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_1470  amine oxidase  100 
 
 
440 aa  891    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.292882 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2159  squalene-associated FAD-dependent desaturase  44.59 
 
 
441 aa  309  5.9999999999999995e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1523  amine oxidase  41.32 
 
 
438 aa  286  5e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.834861  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1698  putative squalene/phytoene dehydrogenase  41.55 
 
 
424 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.837953  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2707  amine oxidase  43.02 
 
 
410 aa  263  6.999999999999999e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0288942  hitchhiker  0.00000819833 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2016  amine oxidase  38.5 
 
 
426 aa  225  1e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2504  squalene-associated FAD-dependent desaturase  36.57 
 
 
414 aa  223  4.9999999999999996e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.717786  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2965  amine oxidase  37.98 
 
 
423 aa  220  5e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0856614  hitchhiker  0.00607749 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2571  squalene-associated FAD-dependent desaturase  38.51 
 
 
462 aa  217  4e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0585158 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1548  amine oxidase  37.92 
 
 
434 aa  214  3.9999999999999995e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1286  putative squalene/phytoene dehydrogenase  40.8 
 
 
448 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.109355 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1513  squalene-associated FAD-dependent desaturase  36.57 
 
 
444 aa  211  2e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.156187  hitchhiker  0.00817062 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1120  squalene-associated FAD-dependent desaturase  39.39 
 
 
422 aa  205  1e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.454747  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1201  amine oxidase  39.39 
 
 
434 aa  204  2e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.269087  normal  0.505468 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1455  amine oxidase  36.7 
 
 
439 aa  198  2.0000000000000003e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0071  amine oxidase  36.08 
 
 
452 aa  192  1e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0365942  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2550  squalene-associated FAD-dependent desaturase  35.1 
 
 
432 aa  172  9e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.005489 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0307  amine oxidase  33.03 
 
 
448 aa  161  2e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0117  amine oxidase  31.98 
 
 
410 aa  142  1.9999999999999998e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1747  carotene 7,8-desaturase  30.56 
 
 
481 aa  134  5e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.969616 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3204  squalene-associated FAD-dependent desaturase  27.42 
 
 
477 aa  130  5.0000000000000004e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.55236  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23100  squalene-associated FAD-dependent desaturase  29.11 
 
 
439 aa  124  3e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.620646  normal  0.191871 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6348  squalene-associated FAD-dependent desaturase  29.72 
 
 
424 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0839028  normal  0.102238 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1826  squalene-associated FAD-dependent desaturase  29.84 
 
 
437 aa  117  6e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2219  squalene-associated FAD-dependent desaturase  27.63 
 
 
433 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.698048  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1943  squalene-associated FAD-dependent desaturase  27.63 
 
 
433 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.273475  normal  0.570646 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7145  squalene-associated FAD-dependent desaturase  29.46 
 
 
438 aa  114  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5326  amine oxidase  27.8 
 
 
452 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.778847  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1719  amine oxidase  27.85 
 
 
418 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.188576  normal  0.0628779 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4945  amine oxidase  27.8 
 
 
452 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5033  amine oxidase  27.8 
 
 
452 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3574  amine oxidase  28.92 
 
 
418 aa  113  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.119107  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5425  squalene-associated FAD-dependent desaturase  27.25 
 
 
433 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.98696  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2440  squalene-associated FAD-dependent desaturase  28.98 
 
 
447 aa  112  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0063  amine oxidase  28.76 
 
 
432 aa  109  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5461  squalene-associated FAD-dependent desaturase  28.26 
 
 
419 aa  108  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3155  squalene-associated FAD-dependent desaturase  28.1 
 
 
415 aa  106  8e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1834  squalene-associated FAD-dependent desaturase  27.52 
 
 
433 aa  106  9e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3242  squalene-associated FAD-dependent desaturase  30.07 
 
 
419 aa  104  3e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.179321 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5179  amine oxidase  28.76 
 
 
417 aa  100  7e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5680  amine oxidase  28.76 
 
 
417 aa  100  7e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.799558  hitchhiker  0.00195148 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1725  amine oxidase  27.03 
 
 
418 aa  99  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.299467  normal  0.079846 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4516  amine oxidase  25.33 
 
 
432 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5505  squalene-associated FAD-dependent desaturase  29.58 
 
 
417 aa  99  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.342763  normal  0.0220988 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4555  squalene-associated FAD-dependent desaturase  28.54 
 
 
417 aa  97.4  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.160695 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4952  amine oxidase  28.98 
 
 
417 aa  97.1  6e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15769  normal  0.0932773 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2968  putative phytoene dehydrogenase  27.47 
 
 
416 aa  95.5  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.211765  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0821  amine oxidase  27.75 
 
 
569 aa  94.4  4e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.147648  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0018  amine oxidase  28.98 
 
 
417 aa  92.4  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4138  squalene-associated FAD-dependent desaturase  27.21 
 
 
425 aa  92.4  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2875  phytoene desaturase  24 
 
 
479 aa  90.1  6e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.202948  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6666  squalene-associated FAD-dependent desaturase  26.87 
 
 
440 aa  90.1  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.393983  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1157  phytoene desaturase  24.27 
 
 
471 aa  89.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3174  squalene-associated FAD-dependent desaturase  28.45 
 
 
417 aa  88.2  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.724661  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5715  amine oxidase  28.25 
 
 
562 aa  87.4  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0865614  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2270  amine oxidase  24.84 
 
 
417 aa  86.7  7e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.160101 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2683  amine oxidase  25.85 
 
 
415 aa  86.7  7e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.446485  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4262  squalene-associated FAD-dependent desaturase  28.1 
 
 
418 aa  83.2  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.822821  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26651  phytoene desaturase  23.73 
 
 
472 aa  83.2  0.000000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0308  phytoene desaturase  23.33 
 
 
475 aa  82.8  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.105357  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0146  three-step phytoene desaturase / zeta-carotene desaturase  22.25 
 
 
465 aa  82.8  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01611  phytoene desaturase  22.08 
 
 
466 aa  82.4  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01631  phytoene desaturase  22.08 
 
 
466 aa  81.6  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0308  phytoene desaturase  23.33 
 
 
475 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45735  phytoene dehydrogenase  21.39 
 
 
624 aa  81.3  0.00000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1510  three-step phytoene desaturase / zeta-carotene desaturase  22.98 
 
 
464 aa  79.7  0.00000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1415  carotene 7,8-desaturase  20.22 
 
 
453 aa  79.7  0.00000000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.979127 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1695  amine oxidase  27 
 
 
486 aa  79.7  0.00000000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.916682  hitchhiker  0.0000276291 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02161  phytoene desaturase  23.19 
 
 
462 aa  79.7  0.00000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4795  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  23.3 
 
 
479 aa  79  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000234203  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0298  carotene 7,8-desaturase  23.55 
 
 
472 aa  79  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01591  phytoene desaturase  22.53 
 
 
472 aa  78.6  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1524  Carotene 7,8-desaturase  20.56 
 
 
453 aa  78.6  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000615844  normal  0.187981 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01721  phytoene desaturase  22.34 
 
 
473 aa  78.6  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.69255  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4193  squalene-associated FAD-dependent desaturase  27.45 
 
 
447 aa  77.8  0.0000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0916  Carotene 7,8-desaturase  21.17 
 
 
453 aa  77.4  0.0000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01311  zeta-carotene desaturase  22.15 
 
 
478 aa  76.6  0.0000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0941429  normal  0.461178 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1983  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  23.27 
 
 
474 aa  76.3  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.490957  normal  0.280593 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0011  hypothetical protein  25.75 
 
 
422 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0679  carotene 7,8-desaturase  22.04 
 
 
489 aa  74.7  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4011  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  22.86 
 
 
459 aa  74.7  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1484  zeta-carotene desaturase  21.21 
 
 
486 aa  74.3  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.22429  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1590  zeta-carotene desaturase  20.08 
 
 
455 aa  73.9  0.000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7028  squalene-associated FAD-dependent desaturase  25.97 
 
 
422 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000526905 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_53974  zeta-carotene desaturase  21.24 
 
 
591 aa  73.6  0.000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.246168  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38345  predicted protein  23 
 
 
599 aa  73.2  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.526893  normal  0.29017 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4188  phytoene desaturase  23.46 
 
 
477 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.422832  normal  0.265876 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01891  zeta-carotene desaturase  23.26 
 
 
486 aa  72.4  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.905208  normal  0.646889 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2686  carotene 7,8-desaturase  21.91 
 
 
490 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3954  zeta-carotene desaturase  21.27 
 
 
483 aa  72  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.134571  normal  0.596487 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0949  Carotene 7,8-desaturase  20.74 
 
 
453 aa  72.4  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3430  carotene 7,8-desaturase  21.91 
 
 
490 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1188  phytoene desaturase  20.7 
 
 
461 aa  70.5  0.00000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.045363  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1769  Carotene 7,8-desaturase  23.43 
 
 
453 aa  70.5  0.00000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0830  zeta-carotene desaturase  20.87 
 
 
453 aa  70.1  0.00000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.762196  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3041  Carotene 7,8-desaturase  23.97 
 
 
463 aa  68.2  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000261003 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3176  carotene 7,8-desaturase  21.47 
 
 
482 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0335  carotene 7,8-desaturase  22.27 
 
 
488 aa  67  0.0000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2356  zeta-carotene desaturase  21.79 
 
 
488 aa  67  0.0000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4788  carotene 7,8-desaturase  21.71 
 
 
479 aa  66.6  0.0000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>